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        中國(guó)各省、自治區(qū)與直轄市手足口病傳染率分析

        2019-11-05 01:28:10王燕芬王旭峰趙繼軍
        關(guān)鍵詞:東南地區(qū)感者季節(jié)性

        王燕芬,王旭峰,趙繼軍

        (青島大學(xué)復(fù)雜性科學(xué)研究所,山東 青島,266071)

        0 引言

        圖1 2009年~2016年手足口病發(fā)病數(shù)時(shí)間序列圖Fig.1 Time series of the incidence of HFMD from 2009 to 2016

        1 資料與方法

        1.1 數(shù)據(jù)來(lái)源

        本文使用的手足口病監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)為2009年至2016年月報(bào)告發(fā)病數(shù),來(lái)源于公共衛(wèi)生科學(xué)數(shù)據(jù)中心(www.phsciencedata.cn),全國(guó)各省年人口總數(shù)及年出生率來(lái)源于中國(guó)統(tǒng)計(jì)局(www.stats.gov.cn)。氣候數(shù)據(jù)包括月平均氣溫、降雨量和相對(duì)濕度,來(lái)源于中國(guó)氣象信息中心(data.cma.cn)。

        寒暑假時(shí)間的選取參照各省教育廳公布的歷年中小學(xué)開(kāi)學(xué)及放假時(shí)間通知,1月20日至2月20日為寒假時(shí)間,7月、8月為暑假。春運(yùn)共計(jì)40天,一般為春節(jié)前15天和節(jié)后25天,由于每年時(shí)間不同,根據(jù)最早開(kāi)始時(shí)間和最晚結(jié)束時(shí)間,選擇1月中旬至3月中旬作為春運(yùn)期間。

        1.2 方法

        本文首先建立時(shí)間序列SIR (Time Series Susceptible Infected Recovered,TSIR)模型估算各省手足口病月傳染率,模型中的參數(shù)由馬爾科夫蒙特卡洛方法(Markov chain Monte Carlo,MCMC)進(jìn)行估計(jì),然后利用線性回歸模型分析月平均氣溫、降雨量、相對(duì)濕度、開(kāi)學(xué)放假和春運(yùn)對(duì)各省手足口病傳染率的影響。

        (1)

        其中,B(t)為出生人數(shù),Yr(t)為報(bào)告發(fā)病人數(shù),ρ為報(bào)告率,β(t)為傳染率,本文假設(shè)每年同一個(gè)月的傳染率相同。由于經(jīng)疾病監(jiān)測(cè)系統(tǒng)上報(bào)的發(fā)病人數(shù)僅占實(shí)際發(fā)病數(shù)的一定比例,在計(jì)算下一時(shí)刻易感者人數(shù)時(shí)候,需要除去實(shí)際感染者人數(shù),所以需要計(jì)算相應(yīng)報(bào)告率來(lái)糾正發(fā)病人數(shù)。本文使用平滑樣條法對(duì)各地報(bào)告率進(jìn)行估算,模型中自由度選取經(jīng)驗(yàn)值2.5[23,27]。

        實(shí)際生活中,疾病的發(fā)病人數(shù)通常服從泊松分布或負(fù)二項(xiàng)分布[19,25],本文假設(shè)TSIR模型中感染者人數(shù)服從泊松分布:

        Y(t)~Possion(λ)

        (2)

        其中,λ為感染力,且λ的期望值為:

        E(λ)=β(t)Yα(t)X(t)

        (3)

        其中,α(0<α≤1)為人群混合程度,當(dāng)α<1,說(shuō)明人群是不完全混合的,即部分人之間的接觸高于他們與其他人群的接觸;當(dāng)α=1,表示人群是均勻混合。因?yàn)門SIR模型中步長(zhǎng)的選擇(兩周或是一個(gè)月)不影響最終結(jié)果[13],而我們收集的數(shù)據(jù)為月發(fā)病數(shù),所以采用時(shí)間步長(zhǎng)為1個(gè)月。利用TSIR模型,本文估計(jì)了各省、自治區(qū)月手足口病傳染率β(t)、人群混合程度α、易感者人數(shù)X(t)及報(bào)告率ρ共15個(gè)參數(shù)。

        TSIR模型中的參數(shù)由馬爾科夫蒙特卡洛方法(Markov chain Monte Carlo,MCMC)進(jìn)行估計(jì)[28],馬爾科夫鏈用Gibbs采樣法產(chǎn)生,各地區(qū)初始易感者人數(shù)X(0)、人群混合程度α和傳染率β(t)的先驗(yàn)參數(shù)都服從均勻分布,初始易感者人數(shù)X(0)取值范圍為總?cè)丝诘?%~40%,人群混合程度α取值范圍為[0.5, 0.999]。為了保證各省相應(yīng)的基本再生數(shù)在1至100范圍內(nèi),其傳染率初值的取值范圍不同。在初始迭代1 000次后,馬爾科夫鏈迭代1 000萬(wàn)次,再對(duì)最后5 000個(gè)有效參數(shù)進(jìn)行采樣,為了避免采樣結(jié)果自相關(guān),采樣間隔取50。由于手足口病疫苗于2016年才投入使用,且對(duì)發(fā)病數(shù)影響并不明顯,所以TSIR模型中可以不考慮免疫措施的影響。

        最后,在獲得各省傳染率的基礎(chǔ)上,估算各省手足口病基本再生數(shù),利用線性回歸模型分析月平均氣溫、降雨量、相對(duì)濕度、開(kāi)學(xué)放假和春運(yùn)期間對(duì)各省傳染率的影響。氣候因素為月數(shù)據(jù)變量,開(kāi)學(xué)放假(“學(xué)期”、“寒假”或“暑假”)和春運(yùn)(“春運(yùn)期間”或“平常時(shí)期”)均為分類變量。由于估計(jì)的傳染率為月數(shù)值,所以本文選用2月作為寒假時(shí)間,7月、8月作為暑假時(shí)間。每年春運(yùn)時(shí)間并不固定,考慮到人群接觸后疾病的傳播存在一定的時(shí)間滯后,本文選取有兩個(gè)星期滯后的2月和3月作為線性回歸模型中的春運(yùn)期間。我們首先只選取氣候因素進(jìn)行線性回歸,為了避免各因素之間相關(guān)性導(dǎo)致的模型中多重共線性問(wèn)題,對(duì)變量進(jìn)行篩選,將方差膨脹因子(方差膨脹因子越大,共線性越嚴(yán)重)大于5的因素依次去掉后,再找出對(duì)手足口病具有顯著影響的氣候因素。其次,應(yīng)用包括具有顯著影響的氣候因素、開(kāi)學(xué)放假和春運(yùn)期間在內(nèi)的線性回歸模型,分析各因素對(duì)手足口病傳染率的影響。

        2 結(jié)論

        2.1 MCMC-TSIR模型采樣結(jié)果

        利用馬爾科夫蒙特卡洛方法估算TSIR模型中的參數(shù),對(duì)最后5 000個(gè)有效參數(shù)進(jìn)行采樣(圖2),傳染率β(t)、人群混合度α和易感者人數(shù)X(t)收斂在一定區(qū)間內(nèi)。

        圖2 以湖南省為例,MCMC-TSIR模型最后5 000次迭代采樣結(jié)果Fig.2 Taking Hunan Province as an example, the results of the last 5 000 iterations of the MCMC-TSIR model

        2.2 MCMC-TSIR模型估算結(jié)果及模型驗(yàn)證

        中國(guó)各省手足口病傳染率的峰值有明顯的季節(jié)性(見(jiàn)圖3),且在2月都有較大的增幅,這可能與春運(yùn)期間大規(guī)模人口流動(dòng)引起的人群接觸率快速增加有關(guān),因?yàn)闆](méi)有發(fā)現(xiàn)氣候因素在2月有所變化。在暑假期間,多數(shù)省的傳染率處于較低水平。為了更好進(jìn)行描述,根據(jù)傳染率峰值發(fā)生時(shí)間,可以將全國(guó)各省歸類到為4個(gè)區(qū)域(見(jiàn)表1):

        圖3 全國(guó)各省手足口病傳染率峰值分布及各區(qū)域傳染率偏移值Fig.3 Peak distribution of HFMD transmission rate and the deviance of β(t) in each region

        地區(qū)包含省份東南地區(qū)海南、廣東、廣西、浙江、江蘇、上海、安徽、云南、四川、重慶、貴州、山西、陜西、北京、天津、山東、江西、湖北、湖南、福建、河北、河南北部地區(qū)內(nèi)蒙古、吉林、遼寧和沈陽(yáng)西北地區(qū)新疆、青海、甘肅和寧夏西藏西藏

        屬于東南地區(qū)的各省(除山東省和北京市外)的手足口病傳染率峰值集中于2月~3月;屬于西北地區(qū)的省份傳染率峰值在4月;東南地區(qū)和西北地區(qū)各省的手足口病傳染率在秋季還有一個(gè)小高峰。北方地區(qū)傳染率峰值在5月;西藏傳染率峰值則在8月,這可能是因?yàn)槲鞑氐貐^(qū)手足口病的平均感染年齡在5歲左右,即學(xué)齡兒童更易感染疾病,因此學(xué)校開(kāi)學(xué)、放假導(dǎo)致的學(xué)生間接觸率的變化能夠影響其傳染率的季節(jié)性。

        根據(jù)模型估計(jì)的結(jié)果(見(jiàn)圖4):全國(guó)多數(shù)省份手足口病基本再生數(shù)在15至35之間,只有廣東省的手足口病基本再生數(shù)高于40,貴州省基本再生數(shù)則小于10;手足口病報(bào)告率在各地區(qū)也有較大差異,從整體上看,處于東南地區(qū)的省份手足口病報(bào)告率高于北部、西北地區(qū),其中山西省、青海省、新疆和西藏自治區(qū)的報(bào)告率不足5%,廣西省和海南省的報(bào)告率卻高達(dá)35%,其余省份的報(bào)告率多處于10%至25%之間;各省手足口病易感者比例則集中在10%至35%之間。

        圖4 MCMC-TSIR模型估算各省參數(shù)結(jié)果Fig.4 Results of estimated parameters in different province of MCMC-TSIR model

        利用MCMC-TSIR模型所得參數(shù)估計(jì)發(fā)病數(shù),對(duì)實(shí)際報(bào)告發(fā)病數(shù)和預(yù)測(cè)發(fā)病數(shù)取對(duì)數(shù)后進(jìn)行分析。模型預(yù)測(cè)的發(fā)病數(shù)和實(shí)際發(fā)病數(shù)之間的關(guān)系為圖5。

        2.3 手足口病傳染率季節(jié)性影響因素

        手足口病傳染率季節(jié)性在不同地區(qū)受不同因素影響(見(jiàn)表2):東南地區(qū)各省份傳染率季節(jié)性僅與春運(yùn)有關(guān);北部地區(qū)手足足病傳染率季節(jié)性則受平均氣溫(解釋貢獻(xiàn)率20.10%)、暑假(解釋貢獻(xiàn)率49.42%)和春運(yùn)(解釋貢獻(xiàn)率8.11%)的影響;西北地區(qū)傳染率季節(jié)性主要受到相對(duì)濕度(解釋貢獻(xiàn)率31.27%)和春運(yùn)(解釋貢獻(xiàn)率9.80%)的影響;西藏省手足口病傳染率季節(jié)性既不受氣候因素影響,也不受春運(yùn)的影響。

        圖5 模型估計(jì)發(fā)病數(shù)及報(bào)告發(fā)病數(shù)關(guān)系Fig.5 The relationship between the estimated number of cases and the number of reported cases

        影響因素估計(jì)值平均溫度相對(duì)濕度暑假春運(yùn)期間R2東南地區(qū)回歸系數(shù)---1.204e-060.642 2P值-< 2.2e-16北部地區(qū)回歸系數(shù) 7.565e-08--1.944e-069.748e-070.420 3P值4.93e-06-0.000 1630.075 522西北地區(qū)回歸系數(shù)--1.141e-07 -1.710e-060.414 9P值-0.010 85-0.068 26西藏回歸系數(shù)-----P值----

        各地區(qū)手足口病均不受降雨量影響,因此表中去除了降雨量這一項(xiàng)。地區(qū)內(nèi)各省存在差異性,對(duì)各省的手足口病傳染率季節(jié)性影響因素進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn)東南地區(qū)各省傳染率季節(jié)性都與春運(yùn)有顯著相關(guān),其中廣東省傳染率季節(jié)性還與相對(duì)濕度有關(guān),北京、天津傳染率季節(jié)性還與相對(duì)濕度和溫度相關(guān);北部地區(qū)各省的傳染率季節(jié)性都與相對(duì)濕度有關(guān),吉林、遼寧和黑龍江省傳染率季節(jié)性還受平均溫度影響;屬于西北地區(qū)的寧夏、甘肅手足口病傳染率季節(jié)性與相對(duì)濕度、溫度有關(guān),青海省傳染率僅與春運(yùn)有關(guān),新疆自治區(qū)傳染率季節(jié)性則與相對(duì)濕度和降雨量有關(guān)。

        3 討論

        手足口病傳染率在中國(guó)各省都有明顯的季節(jié)性,且在2月都有大幅度增加,這與春運(yùn)期間,整體人群接觸率變化有關(guān)。根據(jù)傳染率峰值的時(shí)間分布,可以將全國(guó)各省歸類為四個(gè)區(qū)域:東南地區(qū)、西北地區(qū)、北部地區(qū)及西藏。東南地區(qū)的多數(shù)省份傳染率高峰集中在2月和3月,西北地區(qū),包括新疆、青海、甘肅和寧夏,手足口病傳染率高峰發(fā)生在4月,北方地區(qū),包括內(nèi)蒙古、遼寧、吉林和沈陽(yáng)的傳染率在5月達(dá)到最大值,而西藏地區(qū)的傳染率在8月達(dá)到峰值。

        根據(jù)MCMC-TSIR模型,全國(guó)多數(shù)省份手足口病基本再生數(shù)在15至35之間,這可能與人口密度、易感者比例等因素有關(guān)。根據(jù)估算的基本再生數(shù),手足口病的免疫覆蓋率應(yīng)高于93.3%。從整體上看,多數(shù)省份的報(bào)告率在10%至25%之間,處于東南地區(qū)的省份手足口病報(bào)告率高于北部地區(qū)和西北地區(qū),而西藏自治區(qū)報(bào)告率僅2.5%,這可能與當(dāng)?shù)蒯t(yī)療水平、公共衛(wèi)生健康監(jiān)測(cè)系統(tǒng)的完善程度有關(guān);各省手足口病易感者比例則集中在10%至35%之間。

        手足口病傳染率的季節(jié)性影響因素主要分為兩類:社會(huì)因素及氣候因素。東南地區(qū)的大多數(shù)省份的手足口病傳染率季節(jié)性僅受春運(yùn)期間的顯著影響。東南地區(qū)多數(shù)省份經(jīng)濟(jì)發(fā)達(dá),流動(dòng)人口數(shù)目高于其他地區(qū),春運(yùn)期間,人口遷移量更是急劇增加,使得各年齡組的接觸率遠(yuǎn)高于平常時(shí)間,封閉、擁擠的旅途環(huán)境使得疾病的傳播可能性大大增加。北方地區(qū)的傳染率季節(jié)性則與平均溫度和暑假相關(guān),西北地區(qū)的傳染率季節(jié)性受到相對(duì)濕度和春運(yùn)的影響;這可能是因?yàn)槲鞅薄⒈辈康貐^(qū)的月氣候變化較為顯著,氣候變化會(huì)影響病毒在環(huán)境中的生存率,還會(huì)在一定程度上影響人的行為方式,間接影響人群接觸率變化。西藏地區(qū)傳染率不受氣候、學(xué)期和春運(yùn)的影響。在寒暑假期間,各省的手足口病傳染率也有所增加,尤其西藏地區(qū),其手足口病傳染率峰值在8月。這可能是因?yàn)橹袊?guó)各省手足口病平均感染年齡不同,西藏地區(qū)手足口病的平均感染年齡在5歲左右,學(xué)齡兒童更易感染疾病[4],因此學(xué)校開(kāi)學(xué)、放假導(dǎo)致的兒童間接觸率的變化對(duì)其傳染率的季節(jié)性的影響較其他省更加顯著。

        為了更好了解手足口病傳染率的季節(jié)性及其影響因素,需要更進(jìn)一步研究,在未來(lái)研究中,我們將具體分析不同年齡組手足口病傳染率季節(jié)性及其影響因素,并將影響因素代入模型中,通過(guò)曲線下的面積(Area Under Curve,AUC)來(lái)進(jìn)行評(píng)估。

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