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        小麥缺鐵脅迫苗期相關性狀的聚類分析

        2019-10-25 01:27:00樊慶琦楚秀生隋新霞
        江蘇農業(yè)科學 2019年13期
        關鍵詞:聚類分析苗期根系

        樊慶琦 楚秀生 隋新霞

        摘要:研究小麥品種缺鐵脅迫苗期相關性狀的系統(tǒng)聚類,對山東省小麥種質資源的鑒定篩選和鐵營養(yǎng)高效種質的創(chuàng)新利用具有重要意義。以86個山東省品種為研究對象,通過正常培養(yǎng)和缺鐵營養(yǎng)液培養(yǎng),考察苗期根部和地上部等苗期性狀,進行系統(tǒng)聚類。系統(tǒng)聚類分析結果顯示,按正常培養(yǎng)、缺鐵培養(yǎng)、脅迫指數,將上述品種分別分為4、7、4個類群。研究發(fā)現,缺鐵脅迫可導致小麥生根數量的減少和地上部分生長量的顯著降低,卻可促進根系生長量的增加;小麥品種濟南16、菏麥19應保證栽培苗期的鐵營養(yǎng)供應;濟南8號、煙農15具有較強的鐵耐受能力,可用于鐵營養(yǎng)高效的種質創(chuàng)新和分子機制研究。

        關鍵詞:小麥;苗期;缺鐵脅迫;根系;聚類分析

        中圖分類號: S512.101 ?文獻標志碼: A ?文章編號:1002-1302(2019)13-0081-04

        鐵作為小麥生長發(fā)育必需的營養(yǎng)元素之一,具有重要的生物學功能。小麥根系能分泌脫氧麥根酸的物質,螯合土壤中的Fe3+離子[1-7],經根系細胞的轉運通道吸收至植物體內,參與葉綠素合成、呼吸作用、生物固氮等重要的生理生化反應[8],以維持小麥的正常生長。缺鐵可導致細胞膜變薄、細胞壁疏松、膜囊系統(tǒng)破壞,胞內細胞器如類囊體、葉綠素解體或液泡化,高爾基體膨脹等不利影響[9-12]。從表型性狀來看,可引起新葉的黃化失綠[13-14],影響根系的生長[15]。

        系統(tǒng)聚類主要通過樣本數據經中心化或標準化變換后,計算距離系數利用不同的聚類方法進行聚類,在生物科學中得到廣泛應用。唐啟義教授開發(fā)的DPS數據處理系統(tǒng)根據學者的研究提供了7種聚類距離的算法和9種聚類方法,為聚類分析提供了便利、簡捷的統(tǒng)計學工具[16]。

        山東省農業(yè)科學院作物研究所保存山東省小麥地方品種、育成品種以及國內外引進資源等3 000余份[17]。為更好地加強種質資源系統(tǒng)科學的評價,本研究以保存的山東省1950年以來的86份小麥品種為試驗材料,進行缺鐵脅迫下小麥苗期相關性狀的聚類分析,為小麥種質資源的評價篩選和鐵營養(yǎng)高效種質創(chuàng)新提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 試驗概況

        試驗于2017年在山東省農業(yè)科學院作物研究所濟南試驗基地的人工智能氣候室(浙江求是人工環(huán)境有限公司設計制造)中進行。氣候室面積約20 m2,陽面為透光雙層玻璃,配備空調、LED燈、遮陽棚和降溫水簾等控溫控光設備,由微計算機自動控制光照度12 000 lx,恒溫25 ℃。

        1.2 供試材料

        所用86份小麥材料為山東省農業(yè)科學院作物研究所小麥種質資源庫保存,為1950年后搜集、引進或育成的品種。為盡可能增加小麥種質資源的遺傳豐富度,根據系譜剔除了親緣關系較近的品種(如姊妹系等),供試小麥材料信息見表1。

        1.3 試驗方法

        挑選每份小麥材料籽粒飽滿的種子15粒,3次重復。種子經1.5%次氯酸鈉消毒5 min后,腹股溝朝下,均勻擺放至珍珠棉和紗網縫制的發(fā)芽盤,發(fā)芽盤放入盛有1 L超純水的培養(yǎng)盒(15 mm×15 mm×20 mm)中,在人工智能溫室中發(fā)芽,光/暗周期16 h/8 h,光照度12 000 lx,溫度25 ℃,3 d換水1次。

        發(fā)芽7 d后,仔細將種子從幼苗根部去除,加入培養(yǎng)液培養(yǎng)。其中,對照處理營養(yǎng)液配方為:0.7 mmol/L K2SO4、0.1 mmol/L KCl、2 mmol/L Ca(NO3)2、0.5 mmol/L MgSO4、0.1 mmol/L KH2PO4、1 μmol/L H3BO4、0.5 μmol/L MnSO4、0.2 μmol/L CuSO4、0.5 μmol/L ZnSO4、0.01 μmol/L (NH4)6Mo7O24、100 μmol/L FeEDTA。缺鐵脅迫營養(yǎng)液配方除無FeEDTA外,其他如對照處理。營養(yǎng)液3 d換1次,培養(yǎng)15 d。

        小麥幼苗于營養(yǎng)液中培養(yǎng)15 d后,每次挑選長相均勻粗壯的幼苗10株,以單株為單位采集根系數量、根系長度、根干質量和地上部分干質量等性狀。根系數量以根系伸長1 cm為標準采集,根系長度則以根基部至最長根系頂點的長度。從根系基部用剪刀分離,將根系和地上部分干質量分別放置牛皮紙袋中,于烘箱中105 ℃殺青30 min,以85 ℃恒溫烘干48 h至完全干燥,并用稱量精度為0.01 g電子電平稱質量,計算根冠比。根據對照和缺鐵脅迫的相關性狀,計算脅迫指數。公式為:式中:SI為脅迫指數;Fe-為材料缺鐵脅迫營養(yǎng)液培養(yǎng)的性狀值;Fe+為材料正常營養(yǎng)液培養(yǎng)的性狀值。

        1.4 數據處理

        數據利用DPS高級版進行系統(tǒng)聚類分析,聚類后不同類群的平均值計算則在Excel中進行。

        2 結果與分析

        2.1 不同處理及脅迫指數聚類距離和方法的比較

        根據根系數量、根系長度、根干質量、地上部分干質量和根冠比的數據,利用DPS數據處理系統(tǒng)高級版提供的7種距離系數和9種聚類方法,對正常鐵營養(yǎng)、缺鐵脅迫和脅迫指數分別進行系統(tǒng)聚類的模擬。一般情況下,F值的概率低于 0.05 的類群數量被認為是較適合的。

        鐵正常供應下,以卡方距離可變類平均法進行系統(tǒng)聚類,在劃分為4個類群時F值的概率值低于0.05,表明將供試品種分為4個類群比較適宜,其他距離和方法F值的概率均高于0.05。缺鐵脅迫情況下,以歐式平方距離可變類平均法,供試小麥材料在分為7個類群時的F值概率低于0.05,其他距離和聚類方法的模擬均高于0.05。同樣,脅迫指數在卡方距離和可變類平均法將供試小麥品種分為4個類群時,F值概率低于0.05,因此,脅迫指數將品種分為4個類群較為合適。

        2.2 聚類結果

        正常鐵營養(yǎng)可劃分為4個類群。類群1包含32個品種,類群2包含40個品種,類群3包含13個品種,類群4只有1個品種(濟麥19),分別占總樣本的37.21%、46.51%、15.12%、1.16%(圖1-A)。

        缺鐵脅迫可將供試小麥品種劃分為7個類群。類群1包含24個品種,類群2包含34個品種,類群3包含11個品種,類群4包含2個品種(濟南8號和煙農15),類群5包含4個品種(西北60、復壯30、濟南18和山農21),類群6包含2個品種(濟南16和菏麥19),類群7包含9個品種,分別占總樣本的27.91%、39.53%、12.79%、2.33%、4.65%、2.33%、10.47%(圖1-B)。

        脅迫指數可將小麥品種劃分為4個類群。類群1包含16個品種,類群2包含56個品種,類群3包含6個品種,類群4包含8個品種,分別占總樣本的18.60%、65.12%、6.98%、9.30%(圖1-C)。

        2.3 不同類群性狀間平均值比較

        正常鐵營養(yǎng)供應、缺鐵脅迫和脅迫指數系統(tǒng)聚類不同類群小麥品種不同性狀的平均值見表2。在正常鐵營養(yǎng)情況下,超過83.72%的品種屬于類群1、類群2等兩大類群,與其他類群相比,根系數量、根干質量和根冠比位于前2位,根系長度和地上部分干質量也表現為較高。表明這兩大類群代表了山東省品種的普遍特征,即根系數量在8~9條,主根系根長16~18 cm,根干質量主要分布在8~12 mg,地上部分干質量在42~45 mg,根冠比基本為0.2左右。類群4僅有1個品種(濟麥19),表現較為特殊,根系數量和根系長度與其他品種相當,但根干質量偏低,地上部分干質量偏高,說明該品種在苗期地上部分生長量要高于地下部分生長量。

        缺鐵脅迫下,供試小麥品種則分為7個類群,品種間存在較大差異,表明在缺鐵情況下,明顯影響了品種的苗期發(fā)育。在七大類群中,前3個類群品種占總樣本的80.32%,與正常對照相比,根系數量、根系長度和根干質量相差不大,地上部分干質量有所下降,根冠比略微上升。值得注意的是,類群4的2個品種(濟南8號、煙農15)雖然根系數量增加不明顯,但根系長度、根系干質量和地上部分干質量與其他類群平均值相比表現最高,表明在缺鐵脅迫下,濟南8號、煙農15等2個品種地下部分和地上部分的生長均較為明顯,似乎并不受脅迫的影響,可理解為具有較強的耐受能力;類群6的2個品種(濟南16、菏麥19)與其他類群性狀平均值相比,除根冠比表現最高,其他4個性狀均表現最低,說明缺鐵嚴重影響了根系和地上部分的發(fā)育,根冠比較高是由于地上部分干質量顯著降低的原因所導致。

        脅迫指數反映缺鐵脅迫后苗期性狀的變化。根據系統(tǒng)聚類各類群性狀的平均值,發(fā)現缺鐵脅迫后,小麥根系數量、地上部分干質量和根冠比全部為降低(負值),根系長度除類群1無變化外,類群2降低,類群3和類群4略有升高。根干質量4個類群均有不同程度的增加,以類群1和類群4升高較為明顯。

        3 討論與結論

        歐式距離是系統(tǒng)聚類應用最為廣泛的距離[18],即2點之間的實際距離;卡方距離則是利用列聯表的方法得到1個卡方統(tǒng)計量來衡量2個個體之間的差異性,它被認為比歐式距離等常用的距離系數有更強的分辨能力[16]。根據本研究的數據結構計算歐式距離系數、歐式平方距離系數和卡方距離系數,利用可變類平均法可以較好地進行系統(tǒng)聚類,合適類群數目F值的概率達極顯著水平。

        聚類分析的結果顯示,供試小麥品種中多數品種(超過80%)被聚為特定的2類和3類,這些品種無論在正常情況下還是在缺鐵脅迫下,各性狀的數值也較為接近,表明上述品種具有相似的發(fā)育規(guī)律和特點。而從脅迫指數可以看出,雖然被劃分為不同類群,通過平均值分析,不同類群間也具有相似的特征,即缺鐵脅迫可以影響根系數量的增加,有助于根系干物質的增加,不利于地上部分干物質的積累,對主根系的伸長則因品種而異。

        然而,個別小麥品種卻具有不同的發(fā)育特點,如濟麥19,苗期地上部分的發(fā)育顯著快于地上部分的生長。這種特點在苗期表現為繁茂性較好,然而在生長后期的抗倒性能并不特別突出,可能與苗期的這種發(fā)育特點有關。濟南8號、煙農15在缺鐵脅迫下表現出較好的耐受能力,缺鐵可能會誘導體內一系列的生理生化反應,促進根系的伸長和根總量的增加來應對脅迫;而濟南16、菏麥19,在缺鐵情況下生長受到明顯抑制,根系數量的發(fā)生、主根系的伸長和干物質積累均處于較低水平,表明這2個品種對缺鐵較為敏感。

        通過本研究的聚類分析,對山東省小麥品種苗期的地下部分和地上部分的生長發(fā)育有了更為清晰的了解,同時,缺鐵對小麥品種的影響也有了更為深入的認識。對缺鐵耐受的濟南8號和煙農15,可通過基因組、轉錄組和蛋白組等研究方法進一步探討缺鐵響應的分子機制;對缺鐵敏感型小麥品種如濟南16、菏麥19,在推廣種植中應避開缺鐵的干旱、半干旱地區(qū)。

        綜上所述,正常鐵供應下,利用卡方距離可變類平均法可將86個小麥品種分為4個類群;缺鐵脅迫下,利用歐式平方距離可變類平均法可將其分為7個類群;對于脅迫指數,利用歐式距離可變類平均法可將其分為4個類群。缺鐵可影響小麥根系數量的增加,促進根系干物質積累,但阻礙地上部分干物質的積累。

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