李芬 李麗江 徐丹旎 陳春林 王瑋 李梅
(1. 滇西應(yīng)用技術(shù)大學(xué)普洱茶學(xué)院,普洱 665000;2. 云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所,勐海 666201)
咖啡為茜草科(Rubiaceae)咖啡屬(Coffea genus)植物,該屬主要為二倍體和四倍體[1]。主要種植的有小粒種(Coffee arabica)、中粒種(Coffee robusta)和大粒種(Coffee liberica)[2-4]。其中,由于小粒種咖啡品質(zhì)較好,生產(chǎn)規(guī)模較大,其產(chǎn)量達(dá)到全球咖啡產(chǎn)量的73%,已成為很多地區(qū)獨具優(yōu)勢的特色經(jīng)濟(jì)產(chǎn)業(yè)。
咖啡中含有咖啡堿,適量攝入對身體有益,過多則有害。咖啡樹中,咖啡堿主要在嫩葉中合成??Х扔酌绲娜~片和子葉含咖啡堿,而根部和成熟枝條的褐色部分不含咖啡堿[5]。目前,從咖啡樹中已克隆獲得一系列與咖啡堿合成相關(guān)的關(guān)鍵酶基因,包括7-黃嘌呤核苷甲基轉(zhuǎn)移酶基因(7-methylxanthosine synthase,CaXMT1)[6]、可可堿合成酶基因CaMXMT、咖啡堿合成酶基因(Coffee caffeine synthase,CaDXMT1)[7]和雙功能酶基因(Bifunctional coffee coffeine synthase,CCS1)[8]等。盡管這些酶的氨基酸系列組成具有很大的相似性(>80%),但是底物專一性差異性較大[6]。
目前,對小粒咖啡樹不同組織不同發(fā)育時期(嫩葉、成熟葉片、幼果和成熟鮮果)CaXMT1、CaDXMT1、CCS1相對表達(dá)量差異,以及這3個關(guān)鍵基因的表達(dá)與咖啡堿含量關(guān)系的研究報道甚少。
本研究采用qRT-PCR方法測定咖啡樹不同組織中咖啡堿合成途徑3個關(guān)鍵酶基因(CaXMT1、CaDXMT1和CCS1)的相對表達(dá)量,并將其與各組織中的咖啡堿含量進(jìn)行相關(guān)性分析,從而探究這3個基因的mRNA相對表達(dá)量與咖啡堿含量的關(guān)系,進(jìn)一步探討小粒種咖啡豆中咖啡堿合成機(jī)理,為咖啡樹的育種提供理論依據(jù)。
2017年11月,在云南省普洱市南島河進(jìn)行樣品采集,采集生長狀況一致的小粒種(Coffeearabica)咖啡品種植株嫩葉、成熟葉片、幼果和成熟鮮果4個部位。采摘后,每個部位選取部分樣品置于液氮中冷凍,之后于-80℃保存;剩余樣品干燥至恒重,用研磨機(jī)研磨至粉末狀,并過200目篩,聚乙烯自封袋密封備用。
1.2.1 小粒咖啡樹不同部位咖啡堿含量的HPLC測定
(1)樣品提取 按照HPLC測定植物樣中咖啡堿含量的樣品提取方法[9-10],稱取0.167 g粉末狀樣品,放入15 mL離心管中,加入10 mL超純水。將離心管放入水浴鍋中100℃浸提20 min。然后4 000 r/min離心5 min。提取上清液至50 mL容量瓶中,定容至50 mL。經(jīng)0.22 μL水系濾膜過濾,-20℃保存。
(2)HPLC色譜條件 色譜柱:Amethyst C18-H(4.6×250 mm);流動相:甲醇∶水(40∶60);柱溫40℃;進(jìn)樣量10 μL;流速0.5 mL/min;檢測波長280 nm;進(jìn)樣時間:15 min。
1.2.2 關(guān)鍵酶基因的qRT-PCR檢測
(1)RNA提取及cDNA合成 選取小??Х雀鞑课粯悠罚謩e加入PVPP及液氮充分研磨;各取約20 mg研磨試樣,加入900 μL CTAB提取液及50 μL β-巰基乙醇,65℃ 30 min;用 RNA 提取試劑盒提取總RNA。使用PrimeScript 1st Strand cDNA Synthesis Kit(TaKaRa D6110S)合成第一鏈cDNA。
(2)基因表達(dá)量測定 qRT-PCR反應(yīng)體系(20μL)為 SYBR Premix Ex Taq(TaKaRa DR081A)10.0 μL、PCR forward & reverse primer(10 μmol/L)各 0.8 μL、cDNA 1st Strand(100 ng/μL)2 μL 和 ddH2O 6.4 μL。qRT-PCR 程序為 95℃ 30 s;95℃ 5 s,62℃ 30 s,40個循環(huán)。在65-95℃建立溶解曲線。以GAPDH作為內(nèi)參基因[11],用2-ΔΔCt法計算基因相對表達(dá)量。引物序列見表1。
1.2.3 數(shù)據(jù)處理 采用Microsoft Excel 2013、SPSS及Origin8.5軟件分析處理試驗數(shù)據(jù)。
表1 小粒種咖啡樹咖啡堿合成途徑3個關(guān)鍵酶基因的引物序列
咖啡堿出峰時間為8.85 min。色譜峰面積(y)與濃度(x,mg/mL)的線性回歸方程為y=2.10×105x+6.70×105,r2=0.999 4。云南小粒種咖啡植株中的咖啡含量范圍為0.62%-1.52%,其中,成熟葉片中的咖啡堿含量最低,嫩葉中的最高(表2,圖1),達(dá)到1.22%±0.18%,嫩葉中的咖啡堿含量是成熟葉片中的1.8倍。小粒種咖啡植株不同組織不同發(fā)育時期咖啡堿含量順序表現(xiàn)為嫩葉>幼果>成熟鮮果>成熟葉片,且嫩葉和幼果中的咖啡堿含量分別顯著高于成熟葉片(P=0.001)和成熟鮮果(P=0.007)中的。
由表3可知,云南小粒種咖啡中的CCS1相對表達(dá)量范圍為1.03-2.38,不同組織的CCS1相對表達(dá)量順序為嫩葉<成熟葉片<幼果<成熟鮮果;CaDXMT1的表達(dá)量范圍為1.08-2.82,不同組織的相對表達(dá)量順序為嫩葉<成熟葉片<成熟鮮果<幼果;CaXMT1相對表達(dá)量范圍為1.34-2.29,不同組織的相對表達(dá)量順序為:嫩葉<幼果<成熟葉片<成熟鮮果。CaXMT1和CaDXMT1在嫩葉和成熟葉片中的相對表達(dá)量存在極顯著性差異(P<0.01),而幼果和成熟鮮果之間僅僅只有CaXMT1存在極顯著性差異(P<0.01)。
圖1 小粒種咖啡樹不同組織咖啡堿含量
表3 小粒種咖啡樹咖啡堿合成途徑3個關(guān)鍵酶基因的相對表達(dá)量
由圖2可知,CaXMT1在成熟葉片和成熟鮮果中的相對表達(dá)量隨著咖啡堿含量的增加而增加,其相關(guān)系數(shù)R2分別為0.25和0.15。然而,CaXMT1在嫩葉和幼果中的相對表達(dá)量隨著咖啡堿含量的增加而呈降低趨勢,其相關(guān)系數(shù)分別為0.30和0.93,且在幼果中顯著負(fù)相關(guān)(P=0.004)。
CaDXMT1相對表達(dá)量在嫩葉、成熟葉片、幼果和成熟鮮果中的相對表達(dá)量隨著咖啡堿含量的增加均呈增加趨勢,其相關(guān)系數(shù)R2分別為0.20、0.067、0.33和0.084。
CCS1在嫩葉和成熟鮮果中的相對表達(dá)量隨著咖啡堿含量的增加而呈增加趨勢,其相關(guān)系數(shù)R2分別為0.15和0.32。而在成熟葉片和幼果中則隨著咖啡堿含量的增加呈現(xiàn)降低的趨勢,其相關(guān)系數(shù)R2分別為 0.29和0.24。
圖2 小粒種咖啡樹咖啡堿合成途徑關(guān)鍵酶基因CaXMT1、CaXMT1及CCS1相對表達(dá)量與咖啡堿含量的相關(guān)性
本研究中云南小粒種咖啡植株葉片咖啡堿含量范圍為0.62%-1.52%,均值為0.94%±0.32%;果實中為0.84%-1.18%,均值為0.98%±0.10%;前人研究結(jié)果表明,小??Х鹊拇蠖鄶?shù)品種的咖啡豆中咖啡堿含量約為1.0%。本研究結(jié)果與前人報道的含量相符[12]。植物中的咖啡堿99%存在于葉片中[13-15],且植物中咖啡堿合成的主要部位是葉綠體,合成后的咖啡堿與綠原酸結(jié)合成復(fù)合物儲存在細(xì)胞液泡中[16-17],根和莖中幾乎不能合成咖啡堿[18],植物中咖啡堿不同組織含量分布規(guī)律為幼嫩新梢>莖梗>花果[19]。葉片中咖啡堿的合成主要在幼葉中進(jìn)行,隨著葉齡的增加,合成速率降低[15]。
本研究發(fā)現(xiàn)除了CaXMT1在嫩葉和幼果中的相對表達(dá)量分別顯著低于成熟葉片和鮮果(P<0.01)中的,且在幼果中相對表達(dá)量與咖啡堿含量顯著負(fù)相關(guān)(R2=0.93,P<0.01)以外,其他基因的相對表達(dá)量在嫩葉和成熟葉片、幼果和成熟鮮果中的差異性不明顯。3個關(guān)鍵酶基因在不同組織不同發(fā)育時期表達(dá)的差異性,可能與這3個酶的特性以及咖啡堿合成途徑中關(guān)鍵酶基因調(diào)控機(jī)制的復(fù)雜性相關(guān)[6-8,20-21]。在咖啡堿合成過程中,主要包括4個反應(yīng)步驟(表4)、3個甲基化反應(yīng)步驟及一個脫核苷反應(yīng)步驟。咖啡堿合成過程中,首先是在N7甲基轉(zhuǎn)移酶(CmXRS1和CaXMT1)的催化下,由S-腺苷甲硫氨酸提供甲基,黃嘌呤核苷合成7-甲基黃嘌呤核苷[21]。其次是在脫核苷酶的催化下,7-甲基黃嘌呤核苷脫核苷,目前,脫核苷酶基因未被克隆[22-23],估計7-甲基轉(zhuǎn)移酶在催化黃嘌呤核苷甲基化的同時,催化7-甲基黃嘌呤核苷脫除核苷[24]。然后,在N3甲基轉(zhuǎn)移酶基因CTS和CaMXMT的調(diào)控下,7-甲基黃嘌呤合成可可堿(3,7-二甲基黃嘌呤)[20-21]。最后,可可堿在N1甲基轉(zhuǎn)移酶基因(CCS1和CaDMXT1)的調(diào)控下合成咖啡堿[6]。
這些咖啡堿合成關(guān)鍵酶基因的氨基酸序列相似性(>80%)較大,且其分子量及編碼的多肽氨基酸組成個數(shù)差異性小,底物專一性卻差異較大[6]。如黃嘌呤核苷甲基轉(zhuǎn)移酶基因(XMT/CmXRS),其編碼的多肽由372個氨基酸組成,且分子量為41.8 kD??煽蓧A合成酶基因MXMT1(42.7 kD)、MXMT2及CTS2(43.4 kD),其編碼的多肽分別由378、384個氨基酸組成,多肽分子量及氨基酸組成個數(shù)相似,但催化特性差異性大??赡芘c不同的酶具有不同的催化特性有關(guān),而酶的催化特性與其動力學(xué)參數(shù)Km相關(guān)性較大。如咖啡堿合成酶DXMT和CCS1,其編碼的多肽分子量(43 kD)及氨基酸個數(shù)(384)相同,但其動力學(xué)參數(shù)差異性較大,在調(diào)控可可堿合成咖啡堿的過程中,其動力學(xué)參數(shù)Km值分別為1 200和 157 μmol/L,DXMT的Km值 是CCS1的 8倍[8,20-21]。而且,CCS1能夠利用7-甲基黃嘌呤、3,7-二甲基黃嘌呤及1,7-二甲基黃嘌呤合成咖啡堿,具有N1及N3甲基化的雙功能[21],其中,1,7-二甲基黃嘌呤為其最活躍的底物,對1,7-二甲基黃嘌呤的催化活性是對可可堿的3倍[26-27]。但在咖啡植物中1,7-二甲基黃嘌呤的含量較少。因此,咖啡堿的合成主要是7-甲基黃嘌呤通過合成可可堿而合成咖啡堿。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn)咖啡堿合成途徑中的幾個關(guān)鍵酶基因在細(xì)胞中既可以形成同源二聚體,也可形成異源二聚體,且檢測異源二聚體有雙重活性,這可能是有利于咖啡堿的快速合成[28]。通過咖啡堿合成途徑中幾個關(guān)鍵酶特性的差異性,可知咖啡堿的合成途徑是一個復(fù)雜的過程,與酶底物的可利用性以及濃度等密切相關(guān)[6-8,20-21]。
表4 咖啡堿合成途徑中的N-甲基轉(zhuǎn)移酶及編碼基因[25]
咖啡堿合成途徑中的3個甲基化反應(yīng),需要有嘌呤環(huán)、甲基供體以及甲基載體四氫葉酸。植物中咖啡堿的量,除了與這3個關(guān)鍵酶基因的相對表達(dá)量,可能還與嘌呤環(huán)、甲基供體以及甲基載體四氫葉酸的合成量相關(guān)??Х葔A結(jié)構(gòu)中的甲基和黃嘌呤核苷分別經(jīng)過不同的途徑組合,目前已發(fā)現(xiàn)的黃嘌呤核苷的合成可通過4條途徑[29],分別是核糖-5-磷酸途徑、腺嘌呤核苷酸途徑、鳥嘌呤核苷酸途徑和S-腺苷甲硫氨酸循環(huán)途徑。其嘌呤環(huán)的合成途徑中受多種酶基因的調(diào)控,F(xiàn)ujimori等[30]研究表明,腺嘌呤核苷脫氨酶促進(jìn)腺嘌呤核苷酸合成嘌呤環(huán)進(jìn)而提高咖啡堿的合成量。咖啡堿結(jié)構(gòu)中的3個甲基由S-腺苷蛋氨酸提供[31],且在嘌呤環(huán)甲基化的過程中,四氫葉酸接受來自S-腺苷蛋氨酸的甲基,變成N5-甲基四氫葉酸,在甲基轉(zhuǎn)移酶的作用下,攜帶甲基的四氫葉酸將甲基轉(zhuǎn)移到嘌呤環(huán)上去,從而完成甲基化作用[32],而這一轉(zhuǎn)甲基的過程中,受到蛋白質(zhì)代謝的影響[33],這與蛋白質(zhì)代謝旺盛的嫩葉中咖啡堿含量最多的現(xiàn)象也相符。
然而,小粒咖啡樹中不同部位咖啡堿的含量除受基因的調(diào)控外,還受到光照、溫度、氮素、鉀離子濃度、季節(jié)等環(huán)境因子的影響。前人應(yīng)用碳同位素示蹤技術(shù)發(fā)現(xiàn),光通過溫度間接影響酶的活性,強(qiáng)光和大量日照,通過加速氨基酸的分解,進(jìn)而抑制咖啡堿的合成[34-35]。關(guān)于季節(jié),研究表明,秋季茶樹新稍中的咖啡堿含量低于春夏兩季[36]。氮肥通過增加氨基酸的含量來增加咖啡堿的合成量[37-38]。鉀肥則通過提高酶的活性來增加咖啡堿的含量[39-42]。海拔也影響咖啡堿的合成,Owuor等[43]研究表明,隨著海拔的增加,茶葉中的咖啡堿含量增加。劉建軍等[44]通過對茶葉進(jìn)行不同遮陰方式的處理,發(fā)現(xiàn)遮陰能夠增加茶葉氨基酸、咖啡堿含量,且不同遮陰方式的增加效果不一樣,其中黑色雙層遮陽網(wǎng)遮蔭效果最好。而鄭高云等[45-46]研究也表明,植物為了預(yù)防蟲害,會釋放更多的咖啡堿。
同時,咖啡堿在植物體內(nèi)的分解也影響咖啡堿在植物體內(nèi)的含量??Х葔A在植物體內(nèi)的代謝,一方面是合成,一方面是分解??Х葔A的分解先脫去環(huán)上的基團(tuán),變成黃嘌呤,脫下的甲基又通過四氫葉酸載體轉(zhuǎn)移到其他化合物中[32],黃嘌呤有兩種去向,一種是繼續(xù)分解,一種是轉(zhuǎn)化為其它嘌呤核苷酸再被利用。黃嘌呤在茶樹體內(nèi)的分解主要是在老葉中進(jìn)行,分解產(chǎn)物主要是尿酸和尿囊素。研究報道,夏季高溫加速蛋白質(zhì)以及咖啡堿的分解[34],導(dǎo)致植物體內(nèi)的咖啡堿含量降低。
咖啡堿在幼齡組織中的合成量顯著高于成熟組織中的合成量;合成途徑中的CaXMT1、CaDXMT1、CCS13個關(guān)鍵酶基因,在不同組織不同發(fā)育時期表達(dá)具有差異性。