天津市河西區(qū)疾病預(yù)防控制中心(300211)高揚(yáng) 尹嘯冰
天津醫(yī)院(300211)王彤
隨著人們生活水平和健康意識的不斷提高,食品安全逐漸得到關(guān)注,食源性病原菌為導(dǎo)致食品健康的關(guān)鍵問題,目前也引起醫(yī)學(xué)界的高度重視[1],加強(qiáng)食品安全監(jiān)控,越來越受到各國衛(wèi)生專家的重視。自1973年以來,關(guān)于食品安全中微生物的快速檢驗(yàn)國際研討會每3年舉辦一次。傳統(tǒng)致病菌檢測方法包括:生理檢測、生化檢測、血清水平檢測等,但傳統(tǒng)檢測方法檢測時(shí)間長、靈敏度低[2]。因此,應(yīng)尋找一種操作簡便、靈敏度高、檢測速度快的檢測方式,多重PCR檢測為目前臨床關(guān)注的焦點(diǎn)。多重PCR反應(yīng)在相同反應(yīng)體系中加入多種基因引物,經(jīng)一次反應(yīng)擴(kuò)增多重目的基因,因反應(yīng)體系不同引物及基因組的相互干預(yù),必須經(jīng)多重PCR體系優(yōu)化,測定腸道病原菌種類,為臨床診斷及治療提供重要依據(jù)。研究顯示[3],多重PCR可快速、正確區(qū)分腸道致病菌,為臨床診斷提供重要依據(jù)。本文通過應(yīng)用PCR檢測4種致病菌,討論臨床檢測效果,現(xiàn)報(bào)告如下。
1.1臨床資料 蠟樣芽胞桿菌、普通變形桿菌和副溶血性弧菌來源于北京蘭博瑞公司,大腸桿菌、金黃色葡萄球菌、單核細(xì)胞增生李斯特菌來源于疾病防控中心。試劑包括:營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基、PCR試劑、血平板培養(yǎng)基、革蘭陰性增菌液培養(yǎng)基、溶菌肉湯培養(yǎng)基。儀器包括:離心機(jī)、梯度PCR儀、電泳儀、EC紫外成像系統(tǒng)。
1.2方法 ①菌株培養(yǎng)、DNA培養(yǎng):應(yīng)用營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基培養(yǎng)變形桿菌、大腸桿菌,置于37℃,可選擇3個(gè)~5個(gè)菌種,菌種接種至LB液體培養(yǎng)基,其他菌株采用相同培養(yǎng)方式,在DNA提取過程中保證正規(guī)提取?;蛐蛄幸锞唧w情況見附表。②引物設(shè)計(jì)及合成:4種細(xì)菌依照基因序列提取,篩選特異基因?yàn)榘行蛄校行蛄性O(shè)計(jì)引物。③單重PCR擴(kuò)增、多重PCR建立:上述細(xì)菌單獨(dú)擴(kuò)增,表現(xiàn)為反應(yīng)體系,擴(kuò)增條件為90℃條件下預(yù)變性2.5min,相同條件變性30s,在65℃條件下退火30s,在75℃延伸30s,共36個(gè)循環(huán),在75℃條件下延伸10min。建立多重PCR在單重基礎(chǔ)完成,多2個(gè)循環(huán),按照電泳亮度確定退火溫度。④多重PCR特異性檢測:將菌株置入相同反應(yīng)體系,同時(shí)加入對應(yīng)特異性引物,多重PCR擴(kuò)增。多重PCR靈敏性檢測,細(xì)菌培養(yǎng)24h后,取出懸液,梯度稀釋,按照1∶3∶2比例提取DNA,優(yōu)化后體系反應(yīng)。細(xì)菌檢測模擬果汁進(jìn)行,選擇多種樣式果汁,作為樣品,混合一定量的菌懸液,過夜培養(yǎng),沉淀物取1ml,按照比例提取河段,進(jìn)行多種PCR檢測。菌株及來源均由疾病預(yù)防控制中心提供。儀器包括:DNA提取試劑盒、PCR試劑、血平板、營養(yǎng)瓊脂培養(yǎng)基、梯度PCR儀器。
多重PCR檢測效果顯著,可擴(kuò)大致病菌目的基因片段,表現(xiàn)特定結(jié)果形式。大腸桿菌擴(kuò)增片段357bp、普通變形桿菌片段518bp、副溶血性弧菌187bp、單核細(xì)胞增生李斯特菌片段165bp,特異性強(qiáng),目標(biāo)菌檢測靈敏度為102FU/mL,可隨機(jī)接種其中3個(gè)細(xì)菌。
附表 基因序列引物
本研究顯示,通過濃度、退火溫度以優(yōu)化PCR體系,正交實(shí)驗(yàn)把握各個(gè)組有效濃度和退火溫度,同時(shí)針對多種PCR檢測特異性,多體現(xiàn)在引物同模板匹配度,有效匹配是保證特異性的必要條件,同時(shí)在研究過程中,一次性加入不同菌群引物,擴(kuò)增細(xì)菌基因片段,可實(shí)現(xiàn)一次性檢測,充分體現(xiàn)檢測時(shí)效性,靈敏度及模擬果汁檢測方面,同文獻(xiàn)報(bào)道結(jié)果,基本一致。
總之,多重PCR可快速、正確區(qū)分大腸桿菌、普通變形桿菌、副溶血性弧菌、單核細(xì)胞增生李斯特菌4種腸道致病菌,具有準(zhǔn)確度高、檢測速度快、效率高、特異性強(qiáng)等特點(diǎn),在保證檢測水平的同時(shí),提高病原菌檢測效率,值得推廣應(yīng)用。