葉文雨 廖海萍 許鈺瀅 謝序澤 倪明月 胡紅莉 余文英 魯國(guó)東

摘 ?要??為詳細(xì)了解福州菌草基地巨菌草和綠洲一號(hào)2種菌草的根際土壤細(xì)菌群落組成與結(jié)構(gòu)，本研究應(yīng)用高通量測(cè)序技術(shù)，分析了巨菌草和綠洲一號(hào)根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及多樣性。結(jié)果表明，菌草根際土檢測(cè)到細(xì)菌類群主要的優(yōu)勢(shì)菌門為酸桿菌門（Acidobacteria）、變形菌門（Proteobacteria）、放線菌門（Actinobacteria）、厚壁菌門（Firmicutes）、綠彎菌門（Chloroflexi）、芽單胞菌門（Gemmatimonadetes）、硝化螺旋門（Nitrospirae）、疣微菌門（Verrucomicrobia）、浮霉菌門（Planctomycetes）;主要的優(yōu)勢(shì)菌綱為γ-變形菌綱（Gammaproteobacteria）、α-變形菌綱（Alphaproteobacteria）、芽孢桿菌綱（Bacilli）、放線菌綱（Actinobacteria）、酸桿菌綱（Acidobacteria-6）、β-變形菌綱（Betaproteobacteria）、酸桿菌綱（Acidobacteriia）、纖線桿菌綱（Ktedonobacteria）、δ-變形菌綱（Deltaproteobacteria）;主要的優(yōu)勢(shì)屬為葡萄球菌屬（Staphylococcus）、糖多孢菌屬（Saccharopolyspora）、類芽孢桿菌屬（Paenibacillus）、沙雷氏菌屬（Serratia）、鏈球菌屬（Streptococcus）、紅游動(dòng)菌屬（Rhodoplanes）、不動(dòng)細(xì)菌屬（Acinetobacter）、假單胞菌屬（Pseudomonas）。綠洲一號(hào)、巨菌草及其對(duì)照根際土壤細(xì)菌Shannon-Wiener指數(shù)分別為9.05、8.733、7.61;巨菌草、綠洲一號(hào)及其對(duì)照根際土壤細(xì)菌Simpson多樣性指數(shù)分別為0.01、0.014、0.037;巨菌草、綠洲一號(hào)及其對(duì)照根際土壤細(xì)菌Chao1指數(shù)分別為3145.320、3647.482、2329.344。Alpha多樣性指數(shù)分析得出，在3個(gè)土壤樣品中，綠洲一號(hào)根際土Shannon指數(shù)最大，對(duì)照土壤Shannon指數(shù)最小，對(duì)照土壤Simpson指數(shù)最大，綠洲一號(hào)Simpson指數(shù)最小，說(shuō)明菌草根際土壤細(xì)菌群落多樣性高于非根際土土壤細(xì)菌群落多樣性，綠洲一號(hào)根際土土壤細(xì)菌群落多樣性略高于巨菌草根際土壤細(xì)菌群落多樣性，這些結(jié)果為進(jìn)一步研究土壤微生物提供了理論基礎(chǔ)。

關(guān)鍵詞 ?菌草;根際土壤;細(xì)菌群落多樣性;高通量測(cè)序中圖分類號(hào)??S154.3; S54??????文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼??A

Rhizosphere Soil Bacterial Community of Juncao?by High-throughput Sequencing Techniques

YE Wenyu^1，2， LIAO Haiping²， XU Yuying²， XIE Xuze²， NI Mingyue³， HU Hongli³， YU Wenying²，LU Guodong^1，3*

1. National Engineering Research Center of Juncao Technology， Fujian Agriculture and Forestry University， Fuzhou， Fujian 350002， China; 2. College of Life Sciences， Fujian Agriculture and Forestry University， Fuzhou， Fujian 350002， China; 3. College of Plant Protection， Fujian Agriculture and Forestry University， Fuzhou， Fujian 350002， China

Abstract ?Diversity analyses were investigated by the high-throughput sequencing to study the composition and diversity of bacterial communities in the rhizosphere soil ofPennisetum giganteumandArundo donax cv.?Lvzhou?No. 1. Results showed that the dominant phyla of all samples were Acidobacteria， Proteobacteria， Actinobacteria， Firmicutes， Chloroflexi， Gemmatimonadetes， Nitrospirae， Verrucomicrobia， Planctomycetes. At the class level， nine dominant species were found in all samples， such as Gammaproteobacteria， Alphaproteobacteria， Bacilli， Actinobacteria， Acidobacteria-6， Betaproteobacteria， Acidobacteriia， Ktedonobacteria， Deltaproteobacteria. At the genus level， dominant species were found in all samples， such asStaphylococcus，Saccharopolyspora，Paenibacillus，Serratia，Streptococcus，?Rhodoplanes，Acinetobacter，Pseudomonas. The Shannon-Wiener from the samples was 9.05， 8.733， 7.61， respectively. The Simpson index from the samples was 0.01， 0.014， 0.037， respectively. The Chao1 index from the samples was 3145.320， 3647.482， 2329.344， respectively. The result of Alpha diversity analysis showed that the Shannon index， Simpson index and Chao1 index of Juncao?increased. The diversity index analysis showed that in the soil samples， the lowest bacterial diversity was in the experimental control soil and the highest bacterial diversity was in theA.?donax cv.?Lvzhou?No. 1?rhizosphere soil. The bacterial diversity in theA.?donax cv.?Lvzhou?No. 1?rhizosphere soil was slightly higher than that in thePennisetum giganteumrhizosphere soil.

Keywords Juncao; rhizosphere soil; diversity of bacterial communities; high-throughput sequencing

DOI10.3969/j.issn.1000-2561.2019.09.016

根際（rhizosphere）是指受植物根系活動(dòng)的影響，在物理、化學(xué)和生物學(xué)性質(zhì)上不同于土體的那部分微域土區(qū)^[1-2]。根系和根際土壤微生物形成了互惠的關(guān)系，植物根系分泌物影響根際土壤微生物的群落，反之，根際土壤微生物影響植物根系的生長(zhǎng)、對(duì)營(yíng)養(yǎng)的吸收等^[3-6]。根際土壤微生物還可以增加植物的抗逆境能力及改善土壤酸堿度等^[7-8]。近年來(lái)，諸多學(xué)者對(duì)植物根際土壤微生物開(kāi)展了相關(guān)研究工作^[9]。研究表明，分離自香蕉根際土的芽孢桿菌PAB-1、PAB-2不僅能有效促進(jìn)其苗期植株生長(zhǎng)，還能抑制香蕉枯萎病的發(fā)生^[10]。研究表明，熒光假單胞菌、蠟狀芽孢桿菌及地衣芽孢桿菌對(duì)南方紅豆杉苗期的生長(zhǎng)具有促生作用^[11]。巨菌草和綠洲一號(hào)^[12]是可以作為栽培食用菌、藥用菌的培養(yǎng)基的草本植物，多年研究發(fā)現(xiàn)，菌草營(yíng)養(yǎng)成分豐富，產(chǎn)量高，適應(yīng)性廣，抗逆性強(qiáng)，可以作為動(dòng)物的飼料，種植菌草可以凈化和改良土壤，治理水土流失，防沙治沙，改善生態(tài)環(huán)境等作用。菌草在國(guó)內(nèi)廣泛種植，由于福州是菌草引種的發(fā)源地，福州有許多地方均種植了菌草?；诰莸膹V泛作用及根際微生物的巨大作用，因此研究菌草根際微生物是十分必要的。本文采用高通量測(cè)序技術(shù)，研究巨菌草和綠洲一號(hào)根際土壤中細(xì)菌的物種組成、群落結(jié)構(gòu)及多樣性，為進(jìn)一步探討土壤微生物的功能以及微生物資源的開(kāi)發(fā)利用提供理論依據(jù)。

1??材料與方法

1.1材料

1.1.1??研究區(qū)概況??福州市倉(cāng)山區(qū)菌草基地位于福州市南部南臺(tái)島上，海拔多在600～1000 m，亞熱帶季風(fēng)氣候，年平均氣溫為20～25?℃，年平均降水量為900～2100 mm。

1.1.2??試驗(yàn)材料??巨菌草（Pennisetum giganteum）和綠洲一號(hào)（Arundo donax cv.?Lvzhou?No. 1）的根際土壤和非根際土壤。由于巨菌草和綠洲一號(hào)生長(zhǎng)在同一試驗(yàn)基地，因此對(duì)照采用了合并2個(gè)非根際土樣的方法。具體樣品編號(hào)為：FSLV（綠洲一號(hào)根際土）;FSJU（巨菌草根際土）;FSCK（對(duì)照非根際土）。土壤樣品采集采用全妙華等^[13]的取樣方法。本試驗(yàn)3次生物學(xué)重復(fù)。

1.1.3 ?儀器與設(shè)備??NanoDrop 2000c型超微量分光光度計(jì)，美國(guó)Thermo Fisher Scientific公司。EDC810型PCR儀，北京東勝創(chuàng)新生物科技有限公司。

1.2 方法

1.2.1 ?土壤總DNA提取??采用Fast DNA Spin Kit for Soil試劑盒（美國(guó)MP Biomedicals），參照提取說(shuō)明進(jìn)行土壤總DNA的提取^[14]，用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)DNA的質(zhì)量，同時(shí)采用超微量分光光度計(jì)檢測(cè)提取DNA的濃度，提取合格的DNA于?20 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

1.2.2??16S rRNA PCR擴(kuò)增及高通量測(cè)序??以稀釋后的土壤微生物基因組DNA為模板，采用16S rRNA基因V4區(qū)特異性引物515F（GTGCC AGCMGCCGCGGTAA）和806R（GGACTACHV GGGTWTCTAAT）進(jìn)行擴(kuò)增^[15-16];PCR反應(yīng)體系為Phusion Master Mix（2×）15 μL、Primer（2?μmol/L）3 μL、DNA模板10 μL（5～10 ng）、ddH₂O 2 μL。反應(yīng)程序：98?℃預(yù)變性1 min;30個(gè)循環(huán)包括（98?℃，10 s;50?℃，30 s;72?℃，30 s）;72?℃，5 min。同時(shí)每個(gè)樣品做3個(gè)技術(shù)重復(fù)，將同一樣品PCR產(chǎn)物混合后經(jīng)電泳檢測(cè)、割膠純化、濃度檢測(cè)等操作后，將樣品送到諾禾致源生物有限公司，使用New England Biolabs公司的NEB Next^?Ultra? DNA Library Prep Kit for Illumina建庫(kù)試劑盒進(jìn)行文庫(kù)的構(gòu)建，構(gòu)建好的文庫(kù)經(jīng)過(guò)Qubit定量和文庫(kù)檢測(cè)，合格后，使用HiSeq進(jìn)行上機(jī)測(cè)序。

1.2.3??序列生物信息學(xué)分析??測(cè)序得到的原始數(shù)據(jù)（raw data）^[17]，進(jìn)行拼接、過(guò)濾，得到有效數(shù)據(jù)（clean data）?；谟行?shù)據(jù)進(jìn)行OTUs（ope ra ti onal taxonomic units）聚類和物種分類分析，根據(jù)OTUs聚類結(jié)果，一方面對(duì)每個(gè)OTU的代表序列做物種注釋，得到對(duì)應(yīng)的物種信息和基于物種的豐度分布情況。同時(shí)，對(duì)OTUs進(jìn)行豐度、Alpha多樣性、Venn圖等分析，以得到樣品內(nèi)物種豐富度和均勻度信息、不同樣品或分組間的共有和特有OTUs信息等。

2??結(jié)果與分析

2.1 ?2種菌草土壤微生物群落結(jié)構(gòu)變化

2.1.1 ?門水平群落結(jié)構(gòu)分析??由圖1可知，巨菌草和綠洲一號(hào)根際土壤細(xì)菌群落在門類水平上主要類群為酸桿菌門（Acidobacteria）、變形菌門（Proteobacteria）、放線菌門（Actinobacteria）、厚壁菌門（Firmicutes）、綠彎菌門（Chloroflexi）、芽單胞菌門（Gemmatimonadetes）、硝化螺旋菌門（Nitrospirae）、疣微菌門（Verrucomicrobia）、浮霉菌門（Planctomycetes），相對(duì)豐度分別為87.60%、97.67%、31.70%、21.39%、13.28%、10.46%、5.98%、7.59%、7.01%。巨菌草和綠洲一號(hào)根際土變形菌門（Proteobacteria）是優(yōu)勢(shì)菌門，其非根際土放線菌門（Actinobacteria）是優(yōu)勢(shì)菌門。

2.1.2 ?綱水平群落結(jié)構(gòu)分析??由圖2可知，巨菌草和綠洲一號(hào)根際土壤細(xì)菌群落在綱類水平上主要類群為γ-變形菌綱（Gammaproteobacteria）、α-變形菌綱（Alphaproteobacteria）、芽孢桿菌綱（Bacilli）、放線菌綱（Actinobacteria）、酸桿菌綱（Acidobacteria-6）、β-變形菌綱（Betaprote obacteria）、酸桿菌綱（Acidobacteriia）、纖線桿菌綱（Ktedonobacteria）、δ-變形菌綱（Deltapro teobacteria）相對(duì)豐度分別為34.08%、29.58%、19.70%、16.30%、16.30%、17.63%、12.00%、7.25%、15.87%。巨菌草和綠洲一號(hào)根際土γ-變形菌綱（Gammaproteobacteria）是優(yōu)勢(shì)菌綱，其非根際土DA052是優(yōu)勢(shì)菌綱。

2.1.3??屬水平群落結(jié)構(gòu)分析??由圖3可知，巨菌草和綠洲一號(hào)根際土壤細(xì)菌群落在屬水平上主要類群為葡萄球菌屬（Staphylococcus）、糖多孢菌屬（Saccharopolyspora）、類芽孢桿菌屬（Paeni bacillus）、沙雷氏菌屬（Serratia）、鏈球菌屬（Strep tococcus）、紅游動(dòng)菌屬（Rhodoplanes）、不動(dòng)細(xì)菌屬（Acinetobacter）、未確定屬（Candidatus Solib acter）、未確定屬（Candidatus Koribacter）、假單胞菌屬（Pseudomonas），相對(duì)豐度分別為8.92%、5.49%、1.71%、2.93%、5.52%、4.89%、2.01%、3.61%、3.31%、0.98%。巨菌草和綠洲一號(hào)根際土葡萄球菌屬（Staphylococcus）是優(yōu)勢(shì)菌屬，其非根際土未確定屬（Candidatus Koribacter）是優(yōu)勢(shì)菌屬。

2.2 ?2種菌草土壤細(xì)菌群落豐度和多樣性估計(jì)

Alpha多樣性指數(shù)可以反映各群落內(nèi)微生物多樣性的豐富度。表1是不同處理土壤樣本的Alpha多樣性指數(shù)統(tǒng)計(jì)表，ACE指數(shù)和Chao1指數(shù)是2種用于估計(jì)群落中含OTU數(shù)目的微生物多樣性指數(shù)的方法，在生態(tài)學(xué)中常用來(lái)估計(jì)物種的總數(shù)。由表1可以看出，巨菌草和綠洲一號(hào)根際土壤樣本的ACE指數(shù)和Chao1指數(shù)均高于對(duì)照，表明巨菌草和綠洲一號(hào)根際土壤樣本中土壤的細(xì)菌豐度高于非根際土。巨菌草根際土壤樣本的ACE指數(shù)和Chao1指數(shù)均高于綠洲一號(hào)，表明巨菌草根際土壤樣本中細(xì)菌總數(shù)高于綠洲一號(hào)根際土細(xì)菌總數(shù)。菌草根際土與非根際土的覆蓋率都在90%以上，能較好的反映樣本的真實(shí)情況。綠洲一號(hào)土壤樣本的Shannon-Wiener指數(shù)最大，說(shuō)明細(xì)菌群落多樣性程度越高，Simpson指數(shù)最低的為綠洲一號(hào)，Simpson指數(shù)值越小，說(shuō)明細(xì)菌群落多樣性越大。綜合以上分析結(jié)果說(shuō)明，菌草根際土壤細(xì)菌的多樣性和豐度都比非根際土壤細(xì)菌的高。巨菌草和綠洲一號(hào)根際土壤細(xì)菌的多樣性和豐度也略有不同，綠洲一號(hào)的細(xì)菌群落多樣性略高于巨菌草。

2.3細(xì)菌群落的相關(guān)性分析

圖4為巨菌草和綠洲一號(hào)根際土壤細(xì)菌的OTU Venn圖由圖4可知，巨菌草和綠洲一號(hào)及其對(duì)照的土壤樣本中分別檢測(cè)到3701、3610、2947個(gè)OTU，其中共有的OTU為2310個(gè)，特有的OTU依次為427、322、157個(gè)，分別占巨菌草、綠洲一號(hào)及其對(duì)照土壤樣本中總OTU的11.54%、8.92%、5.33%。

2.4基于OTUs的主坐標(biāo)分析

為了更清晰地了解不同菌草間土壤微生物群落組成結(jié)構(gòu)的特征，通過(guò)分析不同樣本OTU組成，對(duì)樣地的土壤細(xì)菌群落數(shù)據(jù)實(shí)施了主坐標(biāo)分析（PCoA），不同菌草根際土間的樣本表現(xiàn)出分散或聚集的分布情況，結(jié)果如圖5所示，以兩坐標(biāo)軸的零基準(zhǔn)線為參考進(jìn)行PCoA分析。圖5中綠洲一號(hào)與PC2軸相距均較近，說(shuō)明綠洲一號(hào)中細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)受主成分PC2的影響大，PC2一種主成分對(duì)樣品中菌群結(jié)構(gòu)的影響達(dá)到總影響因子的11.97%，圖5中巨菌草與PC1軸相距均較近，說(shuō)明巨菌草中細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)受主成分PC1的影響大，PC1一種主成分對(duì)樣品中菌群結(jié)構(gòu)的影響達(dá)到總影響因子的80.91%;而對(duì)照與PC1、PC2軸相距較遠(yuǎn)，說(shuō)明對(duì)照樣品中細(xì)菌菌群結(jié)構(gòu)受主成分PC1和PC2的影響不大。因此，通過(guò)主坐標(biāo)分析可見(jiàn)，細(xì)菌群落PC1和PC2分別解釋80.91%和11.97%差異性，綠洲一號(hào)、巨菌草及對(duì)照沒(méi)有聚在一起，說(shuō)明微生物差異大。

2.5優(yōu)勢(shì)細(xì)菌的系統(tǒng)發(fā)育分析

選取相對(duì)豐度排名前10的屬所對(duì)應(yīng)的OTUs數(shù)據(jù)進(jìn)行多序列比對(duì)，并繪制了系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化圖（圖6）。圖6展示了菌草根際與非根際土壤樣品中相對(duì)豐度排名前10的屬細(xì)菌所對(duì)應(yīng)的OTUs系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系數(shù)據(jù)，表明菌草根際與非根際土壤樣品中主要分布于以下10個(gè)屬：葡萄球菌屬（Sta phy lococcus）、鏈球菌屬（Streptococcus）、糖多孢菌屬（Saccharopolyspora）、紅游動(dòng)菌屬（Rhod o pl anes）、暫定菌屬（Candidatus Solibacter）、暫定菌屬（Candidatus Koribacter）、沙雷氏菌屬（Serr at ia）、硫酸鹽還原菌屬（Desulfovibrio）、不動(dòng)細(xì)菌屬（Acinetobacter）、類芽孢桿菌屬（Paen iba cillus），其中有2個(gè)暫定菌屬。

3??討論

近年來(lái)，高通量測(cè)序技術(shù)已廣泛用于植物根際微生物群落的研究。本研究采用高通量測(cè)序技術(shù)對(duì)巨菌草和綠洲一號(hào)根際土壤及其非根際土細(xì)菌群落多樣性進(jìn)行了研究，得出了巨菌草和綠洲一號(hào)根際土壤及其非根際土細(xì)菌群落所屬的門、綱、目、科、屬、種不同分類水平上的優(yōu)勢(shì)類群及其相對(duì)豐度。本研究結(jié)果表明，在門的水平上，巨菌草和綠洲一號(hào)根際土壤及其非根際土細(xì)菌群落前3優(yōu)勢(shì)菌門為酸桿菌門（Acidobacteria）、變形菌門（Proteobacteria）、放線菌門（Actin oba cteria）;放線菌是植物根際土中一類重要的微生物，在促進(jìn)植物生長(zhǎng)方面，防治病害方面起到重要作用^[18-19]。在綱水平上，其前3優(yōu)勢(shì)菌綱為g-變形菌綱（Gammaproteobacteria）、a-變形菌綱（Alpha proteobacteria）、芽孢桿菌綱（Bacilli）;研究表明，玉米根際細(xì)菌中g(shù)-變形菌綱（Gamm a proteobacteria）、a-變形菌綱（Alphaprot eobacteria）和酸桿菌（Acidobacteria）所占比例較高^[20-21]。在屬水平上，其前3優(yōu)勢(shì)菌屬為葡萄球菌屬（Staphylococcus）、鏈球菌屬（Strep tococcus）、糖多孢菌屬（Sacchar opo lyspora）。研究結(jié)果說(shuō)明，巨菌草和綠洲一號(hào)根際土及非根際土菌落多樣性不同，可能是由于不同植物根系對(duì)根際土細(xì)菌群落影響不同，根系分泌物的數(shù)量與質(zhì)量是影響根際細(xì)菌群落的重要因素。

研究表明，沙雷氏菌屬、假單孢菌屬、芽孢桿菌屬可以產(chǎn)生生長(zhǎng)素、赤霉素等促進(jìn)植物生長(zhǎng)，可以固氮、溶磷等促進(jìn)植物對(duì)養(yǎng)分的吸收，進(jìn)而改善根系構(gòu)型、減少肥料的施用^[22-26];假單孢菌屬可以提高植物的耐鹽性^[27-28];總之，根際微生物可以調(diào)節(jié)和改善土壤的微生態(tài)環(huán)境。多樣性分析結(jié)果表明，巨菌草和綠洲一號(hào)根際土細(xì)菌群落的多樣性與豐富度均略高于非根際土細(xì)菌群落的多樣性與豐富度。綠洲一號(hào)根際土細(xì)菌群落多樣性略高于巨菌草根際土細(xì)菌群落，在同樣的生長(zhǎng)環(huán)境條件下，這可能與植物根系分泌物不同有關(guān)。本研究結(jié)果為進(jìn)一步深入研究菌草根際土微生物功能提供了理論數(shù)據(jù)。

參考文獻(xiàn)

[1]?Philippot L， Raaijmakers J M， Lemanceau P，et al.Going back to the roots： the microbial ecology of the rhizosphere[J]. Nature Reviews Microbiology， 2013， 11（11）： 789-799.

[2]?肖艷紅， 李??菁， 劉祝祥， 等. 藥用植物根際微生物研究進(jìn)展[J]. 中草藥， 2013， 44（4）： 497-504.

[3]?Ushio M， Wagai R， Balser T C，et al. Variations in the soil microbial community composition of a tropical montane forest ecosystem： Does tree species matter？[J]. Soil Biology and Biochemistry， 2008， 40（10）： 2699-2702.

[4]?周文杰， 呂德國(guó)， 楊丹丹， 等. 根際優(yōu)勢(shì)細(xì)菌對(duì)甜櫻桃幼樹(shù)光合及根系活力的影響[J]. 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)， 2015， 37（5）： 555-561.

[5]?李欣玫， 左易靈， 薛子可， 等. 不同荒漠植物根際土壤微生物群落結(jié)構(gòu)特征[J]. 生態(tài)學(xué)報(bào)， 2018， 38（8）： 2855-2863.

[6]?朱美娜， 梁月明， 劉??暢， 等. 巖溶石灰土微生物豐度的影響因素及其指示意義[J]. 生態(tài)環(huán)境學(xué)報(bào)， 2018， 27（3）： 484-490.

[7]?董??艷， 董??坤， 楊智仙， 等. AM真菌控制蠶豆枯萎病發(fā)生的根際微生物效應(yīng)[J]. 應(yīng)用生態(tài)學(xué)報(bào)， 2016， 27（12）： 4029-4038.

[8]?陳建愛(ài)， 杜方嶺. 黃綠木霉T1010對(duì)櫻桃番茄橫向土壤環(huán)境性狀改良效果研究[J]. 農(nóng)學(xué)學(xué)報(bào)， 2011， 1（8）： 36-41.

[9]?蔡茜茜， 袁??勇， 余??震， 等. 錳化廠土壤重金屬污染及微生物群落結(jié)構(gòu)特征[J]. 生態(tài)環(huán)境學(xué)報(bào)， 2018， 27（6）： 1160-1166.

[10]?李文英， 彭智平， 楊少海， 等. 植物根際促生菌對(duì)香蕉幼苗生長(zhǎng)及抗枯萎病效應(yīng)研究[J]. 園藝學(xué)報(bào)， 2012， 39（2）： 234-242.

[11]?任嘉紅， 劉??輝， 吳曉蕙， 等. 南方紅豆杉根際溶無(wú)機(jī)磷細(xì)菌的篩選、鑒定及其促生效果[J]. 微生物學(xué)報(bào)， 2012， 52（3）： 295-303.

[12]?林占熺. 菌草學(xué)[M]. 3版. 北京： 國(guó)家行政學(xué)院出版社， 2013.

[13]?全妙華， 佘朝文， 陳東明， 等. 基于高通量測(cè)序的兩種典型忽地笑栽培土壤根際真菌群落多樣性[J]. 微生物學(xué)通報(bào)， 2018， 45（10）： 2105-2111.

[14]?付亞娟， 張江麗， 侯曉強(qiáng). 大花杓蘭根際與非根際土壤真菌多樣性的高通量測(cè)序分析[J]. 西北農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào)， 2019， 28（2）： 253-259.

[15]?李金融， 侯湖平， 王??琛， 等. 基于高通量測(cè)序的復(fù)墾土壤細(xì)菌多樣性研究[J]. 環(huán)境科學(xué)與技術(shù)， 2018， 41（12）： 148-157.

[16]?李??麗， 蔣景龍， 徐??皓， 等. 基于高通量測(cè)序的西洋參根際土壤細(xì)菌群落分析[J]. 中藥材， 2019， 42（1）： 7-12.

[17]?Caporase J G， Kucyznski J， Stombaugh J，et al. QIIME allows analysis of high-throughput community sequencing data[J]. Nature Methods， 2010， 7（5）： 335-336.

[18]?Doumbou C L， Sallove M K H， Crawford D L，et al.Actinomycetes， promising tools to control plant diseases and to promote plant growth[J]. Phytoprotection， 2001， 82（3）： 85-102.

[19]?楊美玲， 張??霞， 王紹明， 等. 基于高通量測(cè)序的裕民紅花根際土壤細(xì)菌群落特征分析[J]. 微生物學(xué)通報(bào)， 2018， 45（11）： 2429-2438.

[20]?Garcia-Salamanca A， Molina-Henares M A， Dillewijn P，et al. Bacterial diversity in the rhizosphere of maize and the surrounding carbonate-rich bulk soil[J]. Microbial Biotechnology， 2013， 6（1）： 36-44.

[21]?劉泉成， 張茜茜， 田雪亮， 等. 玉米根際細(xì)菌群落特征及生防菌篩選[J]. 中國(guó)生物防治學(xué)報(bào)， 2018， 34（5）： 771-778.

[22]?王召娜， 于雪云， 楊合同， 等. 微生物解磷機(jī)理的研究進(jìn)展[J]. 山東農(nóng)業(yè)科學(xué)， 2008， 2： 88-91.

[23]?Babalola O O. Beneficial bacteria of agricultural importance[J]. Biotechnology Letters， 2010， 32（11）： 1559-1570.

[24]?Nosheen A， Bano A， Ullah F，et al. Effect of plant growth promoting rhizobacteria on root morphology of Safflower （Carthamus tinctoriusL.）[J]. African Journal of Biotechnology， 2011， 10（59）： 12669-12679.

[25]?陳偉立， 李??娟， 朱紅惠， 等. 根際微生物調(diào)控植物根系構(gòu)型研究進(jìn)展[J]. 生態(tài)學(xué)報(bào)， 2016， 36（17）： 5285-5297.

[26]?周文杰， 呂德國(guó)， 秦嗣軍. 植物與根際微生物相互作用關(guān)系研究進(jìn)展[J]. 吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào)， 2016， 38（3）： 253-260.

[27]?Nadeem S M， Zahir Z A， Naveed M，et al. Preliminary investigations on inducing salt tolerance in maize through inoculation with rhizobacteria containing ACC deaminase activity[J]. Canadian Journal of Microbiology， 2007， 53（10）： 1141-1149.

[28]?劉少芳， 王若愚. 植物根際促生細(xì)菌提高植物耐鹽性研究進(jìn)展[J]. 中國(guó)沙漠， 2019， 39（2）： 1-12.