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        GeneXpert MTB/RIF檢測(cè)MTB及利福平耐藥的應(yīng)用價(jià)值

        2019-10-18 05:15:18郁大偉宋華峰邱文娜薛婧酈芳華胥萍
        結(jié)核與肺部疾病雜志 2019年3期
        關(guān)鍵詞:利福平結(jié)核病例數(shù)

        郁大偉 宋華峰 邱文娜 薛婧 酈芳華 胥萍

        據(jù)WHO統(tǒng)計(jì),新發(fā)結(jié)核病患者中,有10.2%的患者會(huì)出現(xiàn)對(duì)至少一種抗結(jié)核藥物耐藥[1]。中國(guó)每年新增耐多藥結(jié)核病(MDR-TB)患者約12萬(wàn)例,其傳染性更強(qiáng)、治愈率更低,病死率更高,因此,如何更早、更高效地發(fā)現(xiàn)結(jié)核病患者、尤其是MDR-TB患者,成為了控制耐藥結(jié)核病傳播的關(guān)鍵[2]。目前,臨床上常用的一線抗結(jié)核藥品為異煙肼、利福平、乙胺丁醇及鏈霉素,與其他抗結(jié)核藥品相比,利福平單耐藥的發(fā)生率較低,可把利福平耐藥作為診斷MDR-TB的指征[3]。目前檢測(cè)耐藥結(jié)核病的方法中,傳統(tǒng)的BACTEC MGIT 960液體培養(yǎng)(簡(jiǎn)稱“MGIT 960”)及改良羅氏藥物敏感性試驗(yàn)(簡(jiǎn)稱“藥敏試驗(yàn)”)結(jié)果雖準(zhǔn)確可靠,但檢測(cè)周期長(zhǎng),易造成診斷延誤。亟需尋求能夠快速、準(zhǔn)確、安全的檢測(cè)結(jié)核分枝桿菌(MTB)及其耐藥性的分子診斷技術(shù)。筆者對(duì)GeneXpert MTB/RIF(簡(jiǎn)稱“GeneXpert”)檢測(cè)痰標(biāo)本中MTB及其耐藥性的效能進(jìn)行分析與探討。

        資料和方法

        1.研究材料:收集2018年1—12月蘇州市第五人民醫(yī)院收治的疑似肺結(jié)核患者的痰標(biāo)本414份。痰標(biāo)本由患者按要求自行采集,留痰前先用清水漱口,從肺部深處用力咳出痰液,收集于一次性無(wú)菌痰瓶之中,痰液量約3~5 ml。分別采用GeneXpert和MGIT 960技術(shù)進(jìn)行檢測(cè)。

        2.儀器與試劑:GeneXpert試劑盒(美國(guó)Cepheid公司),GeneXpert檢測(cè)系統(tǒng)(美國(guó)Cepheid公司);MGIT 960培養(yǎng)管(美國(guó)BD公司),MTB快速培養(yǎng)系統(tǒng)(美國(guó)BD公司),分枝桿菌羅氏培養(yǎng)管(珠海貝索生物技術(shù)有限公司)。

        3.痰涂片抗酸染色:采用珠海貝索生物技術(shù)有限公司生產(chǎn)的抗酸染色液試劑盒,按照《結(jié)核病實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)化操作與網(wǎng)絡(luò)建設(shè)》[4]中的檢測(cè)要求和操作步驟進(jìn)行檢測(cè)。

        4.MTB培養(yǎng)及藥敏試驗(yàn):將痰瓶中痰液轉(zhuǎn)移1~2 ml至50 ml離心管中,加入等體積的4%氫氧化納(NaOH)進(jìn)行充分液化,漩渦振蕩、混勻,靜置30 min,加入40 ml pH 6.8的磷酸鹽緩沖液(PBS)中和、離心,棄上清。在棄去上清的離心管中加入0.5 ml生理鹽水,吹打、混勻。吸取 0.5 ml標(biāo)本加入MGIT 960培養(yǎng)管中,將接種好的培養(yǎng)管放入儀器中進(jìn)行培養(yǎng)。MGIT 960培養(yǎng)報(bào)陽(yáng)后,挑取生長(zhǎng)良好的菌落,與磨菌管底部的PBS緩沖液混合均勻,配備不同濃度的菌懸液。用接種環(huán)沾取1滿環(huán)約為0.01 ml不同稀釋倍數(shù)的菌懸液,用劃線法均勻涂布于各培養(yǎng)基表面。37 ℃培養(yǎng),至4周報(bào)告結(jié)果。若藥敏試驗(yàn)培養(yǎng)管上有菌落生長(zhǎng)則在4周內(nèi)可報(bào)告結(jié)果;若4周內(nèi)對(duì)照培養(yǎng)管上長(zhǎng)滿菌落而藥敏試驗(yàn)培養(yǎng)管內(nèi)無(wú)細(xì)菌生長(zhǎng),不能輕易報(bào)告“敏感”,因耐藥菌常較敏感菌生長(zhǎng)緩慢,故需延長(zhǎng)培養(yǎng)約1~2周,再觀察結(jié)果。

        5.GeneXpert檢測(cè):痰液標(biāo)本加入2倍樣本體積的樣本處理液進(jìn)行液化,擰緊瓶蓋,漩渦振蕩至少20 s,將混勻后的樣本于室溫下靜置15 min;用無(wú)菌移液管吸取液化的樣品,直至彎月面在移液管的最低標(biāo)記之上(注意避免形成氣溶膠),由檢測(cè)匣的加樣孔緩慢加入,蓋上檢測(cè)匣蓋子,上機(jī)檢測(cè)。

        6.統(tǒng)計(jì)學(xué)處理:應(yīng)用SPSS 19.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,計(jì)數(shù)資料以“率(%)”表示,組間差異的比較采用χ2檢驗(yàn),以P<0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。以痰培養(yǎng)藥敏試驗(yàn)結(jié)果為參照,計(jì)算GeneXpert的檢測(cè)效能指標(biāo),各項(xiàng)指標(biāo)計(jì)算方法:敏感度=真陽(yáng)性例數(shù)/(真陽(yáng)性例數(shù)+假陰性例數(shù))×100%;特異度=真陰性例數(shù)/(真陰性例數(shù)+假陽(yáng)性例數(shù))×100%;陽(yáng)性預(yù)測(cè)值=真陽(yáng)性例數(shù)/(真陽(yáng)性例數(shù)+假陽(yáng)性例數(shù))×100%;陰性預(yù)測(cè)值=真陰性例數(shù)/(真陰性例數(shù)+假陰性例數(shù))×100%;符合率=(真陽(yáng)性例數(shù)+真陰性例數(shù))/總檢測(cè)人數(shù)×100%。一致性檢驗(yàn)采用Kappa檢驗(yàn),即:Kappa值≥0.75為一致性較好;0.40≤Kappa值<0.75為一致性一般;Kappa值<0.40為一致性較差。

        結(jié) 果

        1.痰標(biāo)本陽(yáng)性檢出情況:通過(guò)檢測(cè)414份痰標(biāo)本,痰涂片陽(yáng)性檢出率為18.6%(77/414),MGIT 960培養(yǎng)的陽(yáng)性檢出率為31.4%(130/414),GeneXpert檢測(cè)的陽(yáng)性檢出率為35.3%(146/414)。GeneXpert和MGIT 960培養(yǎng)的陽(yáng)性檢出率明顯高于痰涂片(χ2=29.22,18.09,P值均<0.001),而GeneXpert的陽(yáng)性檢出率與MGIT 960培養(yǎng)相比,差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=1.39,P=0.238)。

        表1 GeneXpert檢測(cè)以MGIT 960藥敏試驗(yàn)結(jié)果為參照檢測(cè)MTB利福平耐藥的效能分析

        2.耐藥檢測(cè)情況:GeneXpert檢出的146份陽(yáng)性標(biāo)本中利福平耐藥檢出率為9.6%(14/146),MGIT 960培養(yǎng)陽(yáng)性的130份痰標(biāo)本中利福平耐藥檢出率為9.2%(12/130),兩者之間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.01,P=0.919)。

        3.耐藥檢測(cè)效能評(píng)價(jià):99份痰標(biāo)本同時(shí)具有GeneXpert檢測(cè)和MGIT 960培養(yǎng)的藥敏結(jié)果,以MGIT 960培養(yǎng)藥敏結(jié)果為參照,GeneXpert檢測(cè)MTB利福平耐藥的敏感度為81.8%、特異度為98.9%、符合率為97.0%、Kappa值為0.84,見(jiàn)表1。

        討 論

        隨著分子生物學(xué)診斷技術(shù)的迅猛發(fā)展,PCR 等核酸擴(kuò)增技術(shù)在臨床檢驗(yàn)中起著越來(lái)越關(guān)鍵的作用,這類檢測(cè)方法具有速度快、敏感度高、效率高等優(yōu)點(diǎn),尤其對(duì)于結(jié)核病的早期診斷具有獨(dú)特優(yōu)勢(shì)。但傳統(tǒng)的PCR操作過(guò)程較復(fù)雜、易出現(xiàn)交叉污染,而出現(xiàn)假陽(yáng)性的情況,容易使臨床對(duì)患者的病情出現(xiàn)誤診[5]。此外,PCR 檢測(cè)對(duì)設(shè)備的要求高,對(duì)操作人員要求也比較高,需經(jīng)過(guò)PCR檢測(cè)技術(shù)的崗前培訓(xùn)。因此,將其在大多數(shù)基層醫(yī)院普及還需要一個(gè)過(guò)程。目前,隨著科技的不斷進(jìn)步,檢測(cè)設(shè)備及手段同步得到發(fā)展,GeneXpert檢測(cè)在全球的開(kāi)展及接受程度相當(dāng)廣泛和快速,是唯一受到WHO推薦的,用于MTB及利福平耐藥快速檢測(cè)的手段。該方法不易產(chǎn)生氣溶膠、不易污染、可檢測(cè)多種類型的樣本、報(bào)告周期短、敏感度高、特異度強(qiáng),一般實(shí)驗(yàn)室條件均可滿足其要求[6-7]。

        本研究結(jié)果顯示,與痰涂片結(jié)果相比,GeneXpert檢測(cè)和MGIT 960培養(yǎng)陽(yáng)性檢出率明顯升高,但兩者之間沒(méi)有差異。進(jìn)一步分析耐藥檢測(cè)發(fā)現(xiàn),GeneXpert檢測(cè)和MGIT 960培養(yǎng)對(duì)MTB利福平耐藥檢出率也沒(méi)有差異,與文獻(xiàn)報(bào)道結(jié)果一致[8-9]。以MGIT 960培養(yǎng)藥敏檢測(cè)結(jié)果為參照,GeneXpert檢測(cè)MTB利福平耐藥的敏感度和特異度均較高,分別為81.8%和98.9%,且具有較好的一致性,與文獻(xiàn)報(bào)道一致[10-12]。

        綜上,本研究結(jié)果表明,GeneXpert在快速檢測(cè)MTB及利福平耐藥方面具有較好的效能。值得注意的是,由于該技術(shù)的檢測(cè)原理是基因擴(kuò)增技術(shù),擴(kuò)增的模板是核酸,因此其檢測(cè)結(jié)果不能區(qū)分死菌和活菌。所以,在臨床檢測(cè)中會(huì)存在GeneXpert檢測(cè)陽(yáng)性而培養(yǎng)陰性的相互矛盾結(jié)果??傮w而言,GeneXpert在早期篩查MTB及利福平耐藥時(shí)具有較好的效能,且檢測(cè)時(shí)間快,是一種快速、可靠的輔助診斷方法。

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