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        環(huán)狀RNA hsa_circ_0010985對(duì)胃癌細(xì)胞增殖與凋亡的影響

        2019-10-16 06:41:44劉文博趙奇紅顧康生
        關(guān)鍵詞:細(xì)胞株標(biāo)志物試劑盒

        高 敏,劉文博,趙奇紅,王 華,顧康生

        胃癌(gastric cancer,GC)的發(fā)病率、死亡率在我國(guó)高居第二位[1]。GC患者早期缺乏特異性癥狀,往往明確診斷時(shí)已處于進(jìn)展期,其5年生存率不足30%[2]。所以,GC的早期診斷尤為重要,目前臨床常用于GC輔助診療的腫瘤標(biāo)志物[癌胚抗原(carcinoembryonic antigen,CEA)、糖類抗原CA199(carbohydrate antigen 19-9,CA19-9)]等特異性、敏感性不強(qiáng)[3],因此,迫切需要尋找新的腫瘤標(biāo)志物,用于GC的早期診斷及預(yù)后評(píng)估。近年來(lái),隨著對(duì)非編碼RNA的研究深入,微小RNA(microRNA,miRNA)、長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long noncoding RNA, lncRNA)、環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)在GC中的作用逐漸被揭曉[4-5]。其中,circRNA以其普遍性、穩(wěn)定性、高度保守性以及組織特異性等優(yōu)勢(shì)[6],有望成為理想的腫瘤早期診斷的分子標(biāo)志物。課題組前期通過(guò)circRNA芯片測(cè)序發(fā)現(xiàn)hsa_circ_0010985在GC耐藥患者血漿中高表達(dá),提示其可能參與GC的化療耐藥,而其對(duì)GC細(xì)胞的生物學(xué)功能及其臨床意義尚不清楚(待發(fā)表)。該研究主要探討hsa_circ_0010985在GC細(xì)胞和組織中的表達(dá)以及對(duì)GC細(xì)胞增殖和凋亡的影響和臨床意義。

        1 材料與方法

        1.1 組織標(biāo)本收集2017年3月~2017年7月安徽醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院胃腸外科共43例GC組織標(biāo)本及距腫瘤邊緣>5 cm處癌旁正常組織標(biāo)本,離體后立即液氮灌運(yùn)輸并長(zhǎng)期保存至-196 ℃液氮中備用。

        1.2 主要試劑人GC細(xì)胞系、人正常胃黏膜細(xì)胞均為安徽醫(yī)科大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院營(yíng)養(yǎng)與食品衛(wèi)生學(xué)系實(shí)驗(yàn)室保存;細(xì)胞培養(yǎng)基RPMI-1640及胎牛血清購(gòu)自美國(guó)Gibco公司;RNA提取試劑TRIzol、Lipofectamine 2000轉(zhuǎn)染試劑盒購(gòu)自美國(guó)Invitrogen公司;逆轉(zhuǎn)錄試劑盒購(gòu)自大連TaKaRa公司;SYBR Green熒光定量PCR試劑盒購(gòu)自北京全式金生物技術(shù)有限公司;細(xì)胞計(jì)數(shù)方法(cell counting kit-8,CCK-8)試劑盒購(gòu)自合肥白鯊生物科技有限公司;AnnexinV-FITC凋亡檢測(cè)試劑盒購(gòu)自美國(guó)BD公司;siRNA設(shè)計(jì)與合成由上海吉瑪制藥技術(shù)公司完成;引物設(shè)計(jì)及合成由上海生物工程有限公司完成。

        1.3 細(xì)胞培養(yǎng)正常胃黏膜細(xì)胞株GES-1和GC中分化細(xì)胞株SGC7901和AGS以及低分化細(xì)胞株BGC823均使用含10%胎牛血清的RPMI-1640培養(yǎng)液,在含5%CO2、37 ℃的培養(yǎng)箱中培養(yǎng),每天觀察細(xì)胞生長(zhǎng)狀態(tài),常規(guī)2~3 d更換培養(yǎng)基,當(dāng)細(xì)胞匯合度達(dá)70%~80%時(shí)進(jìn)行實(shí)驗(yàn)。

        1.4 實(shí)時(shí)熒光定量PCR(quantificational real-time polymerase chain reaction, qRT-PCR)用TRIzol提取細(xì)胞和組織中的總RNA,用逆轉(zhuǎn)錄試劑盒將總RNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,然后通過(guò)SYBR Green熒光定量PCR試劑盒進(jìn)行PCR擴(kuò)增,GAPDH作為內(nèi)參基因,引物序列為:hsa_circ_0010985 F:5′-CT GATGGGCACCTCTGTTGG-3′,R: 5′-GCTCATAGTCT GCCAATGGAAC-3′;GAPDH F:5′-AATGAAGGGGT CATTGATGG-3′,R:5′-AAGGTGAAGGTCGGAGTCA A-3′;反應(yīng)條件為:95 ℃、5 s,55 ℃、30 s,72 ℃、20 s,共40個(gè)循環(huán)。

        1.5 細(xì)胞轉(zhuǎn)染取對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的細(xì)胞,經(jīng)清洗、消化、重懸后,在轉(zhuǎn)染前1 d接種于6孔板內(nèi),接種密度約為60%~70%,在培養(yǎng)箱中培養(yǎng)24 h后進(jìn)行轉(zhuǎn)染。第2天,將10 μl siRNA溶于250 μl Opti-mem減血清培養(yǎng)基,輕輕混勻后,室溫孵育5 min,將8 μl lipofectamine 2000TM溶于另一250 μl Opti-mem減血清培養(yǎng)基中,輕輕混勻后,室溫孵育5 min,然后將兩管溶液混合后,室溫靜置20 min后將其加入6孔板的相應(yīng)孔中,補(bǔ)足培養(yǎng)基至2 ml,6~8 h后根據(jù)細(xì)胞狀態(tài)決定是否換液。

        1.6 CCK-8實(shí)驗(yàn)檢測(cè)GC細(xì)胞增殖將實(shí)驗(yàn)分為陰性對(duì)照(negative control,si-NC )組、siRNA-hsa_circ_0010985-1(si-circ0010985-1)和siRNA-hsa_circ_0010985-2(si-circ0010985-2)組,將對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期細(xì)胞按照實(shí)驗(yàn)分組分別接種于96孔板,每孔約為1 000個(gè)細(xì)胞,每組設(shè)置6個(gè)復(fù)孔,24 h后進(jìn)行轉(zhuǎn)染,轉(zhuǎn)染后0、1、2、3 d分別加入10 μl CCK8繼續(xù)培養(yǎng)2 h后檢測(cè)450 nm處各孔的吸光度(optical density,OD)值。

        1.7 流式細(xì)胞儀檢測(cè)GC細(xì)胞凋亡率將細(xì)胞均勻接種于6孔板,轉(zhuǎn)染48 h后用不含EDTA的胰酶消化,離心后收集細(xì)胞,用預(yù)冷PBS洗滌細(xì)胞2次后,加入400 μl 1×Annexin V結(jié)合液懸浮細(xì)胞,濃度約為1×106個(gè)/ml,將其移至流式管中,加入5 μl Annexin V-FITC染色液,輕輕混勻后于4 ℃避光條件孵育15 min后,再加入10 μl PI染色液輕輕混勻后4 ℃避光條件孵育5 min,立即用流式細(xì)胞儀檢測(cè)。

        2 結(jié)果

        2.1 hsa_circ_0010985在GC細(xì)胞及組織中的表達(dá)qRT-PCR檢測(cè)結(jié)果顯示,不同細(xì)胞組間hsa_circ_0010985表達(dá)水平差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=33.372,P=0.000),hsa_circ_0010985在GC細(xì)胞中顯著高表達(dá),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。見(jiàn)圖1。癌旁正常組織及GC組織比較,hsa_circ_0010985在GC組織中高表達(dá),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=2.487,P<0.05)。見(jiàn)圖2。

        圖1 hsa_circ_0010985在不同GC細(xì)胞中的表達(dá)

        圖2 hsa_circ_0010985在GC組織及癌旁正常組織中的表達(dá)

        2.2 GC組織中hsa_circ_0010985的表達(dá)與GC患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系GC組織中hsa_circ_0010985的表達(dá)與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移之間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),而與患者性別、年齡、腫瘤直徑、TNM分期、CEA、CA199、腫瘤位置之間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。見(jiàn)表1。

        2.3 GC組織中hsa_circ_0010985的表達(dá)與GC診斷的相關(guān)性分析受試者工作特征曲線(receiver operating characteristic curve,ROC)曲線下面積(area under curve,AUC)為0.631(95%CI:0.513~0.748,P<0.05),特異度和靈敏度分別為0.814和0.419。見(jiàn)圖3。

        表1 GC組織中hsa_circ_0010985的表達(dá)與GC患者臨床病理參數(shù)的關(guān)系

        圖3 hsa_circ_0010985 ROC曲線及AUC

        2.4 siRNA轉(zhuǎn)染效率的檢測(cè)鑒于hsa_circ_0010985在低分化細(xì)胞株BGC-823中顯著高表達(dá),故選擇該細(xì)胞株進(jìn)行小干擾RNA(small interfering RNA,siRNA)轉(zhuǎn)染以敲低hsa_circ_0010985表達(dá),研究其對(duì)GC細(xì)胞增殖與凋亡的影響。siRNA轉(zhuǎn)染BGC823細(xì)胞48 h后,經(jīng)過(guò)qRT-PCR檢測(cè),不同組之間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=24.627,P=0.000),其中與si-NC組比較,siRNA組可顯著降低細(xì)胞內(nèi)hsa_circ_0010985表達(dá),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01)。見(jiàn)圖4。

        圖4 qRT-PCR檢測(cè)hsa_circ_0010985在BGC823細(xì)胞中轉(zhuǎn)染后的差異表達(dá)

        2.5 CCK8檢測(cè)敲低hsa_circ_0010985后對(duì)GC細(xì)胞增殖的影響CCK-8實(shí)驗(yàn)分別檢測(cè)si-NC、si-circ0010985-1和si-circ0010985-2組在不同時(shí)間點(diǎn)的細(xì)胞增殖情況,實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示:與si-NC組比較,si-circ0010985-1和siRNA-circ0010985-2組細(xì)胞增殖能力顯著降低,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。見(jiàn)圖5。

        圖5 CCK-8檢測(cè)敲低BGC823細(xì)胞中hsa_circ_0010985的表達(dá)后對(duì)GC細(xì)胞增殖的影響

        2.6 流式細(xì)胞儀檢測(cè)敲低hsa_circ_0010985對(duì)GC細(xì)胞凋亡的影響流式細(xì)胞儀分別檢測(cè)si-NC、si-circ0010985-1和si-circ0010985-2組的細(xì)胞凋亡情況。結(jié)果顯示,不同組之間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(F=13.594,P=0.006),與si-NC組比較,si-circ0010985-1和si-circ0010985-2組的細(xì)胞凋亡率明顯增高,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01)。見(jiàn)圖6。

        圖6 流式細(xì)胞儀檢測(cè)敲低hsa_circ_0010985表達(dá)后對(duì)GC細(xì)胞凋亡的影響

        3 討論

        近年來(lái),circRNA不斷地受到科學(xué)界的關(guān)注,因而越來(lái)越多的circRNA被發(fā)現(xiàn),其生物學(xué)功能也被逐漸認(rèn)識(shí)[7-8]。circRNA是前體RNA(pre-mRNA)在形成mRNA過(guò)程中,通過(guò)反向剪接,并以共價(jià)鍵首尾連接形成,由于其特殊的閉合環(huán)狀結(jié)構(gòu),使得其不易被核酸外切酶降解,因而相較于miRNA和lncRNA更加穩(wěn)定,說(shuō)明其有望成為疾病診斷及預(yù)后的生物標(biāo)志物[9]。通常,circRNA在機(jī)體內(nèi)的表達(dá)水平較低,但是隨著研究的不斷地深入,發(fā)現(xiàn)circRNA可以在特定的細(xì)胞或組織中異常表達(dá),可以與miRNA結(jié)合影響轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié),或是調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄,影響剪切等[10]。在腫瘤領(lǐng)域中,對(duì)于circRNA的研究主要集中在腫瘤診斷與預(yù)后評(píng)估,以及其與miRNA結(jié)合發(fā)揮分子海綿的作用機(jī)制等方面。Zhang et al[11]研究發(fā)現(xiàn)circRNA La相關(guān)蛋白4 (circular RNA La-associated protein 4, circLARP4)在GC組織中表達(dá)下調(diào),并且通過(guò)海綿miR-424和上調(diào)大腫瘤抑制激酶1抑制GC細(xì)胞增殖和侵襲,表明circLARP4可能作為腫瘤抑制因子抑制腫瘤發(fā)生發(fā)展。此外,Chen et al[12]研究表明hsa_circ_0000190在GC組織和血漿中下調(diào),其表達(dá)水平與腫瘤大小、淋巴轉(zhuǎn)移、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移、TNM分期以及CA199水平顯著相關(guān),并通過(guò)ROC曲線分析表明hsa_circ_0000190可能是一種用于GC診斷的新型非侵入性生物標(biāo)志物。亦有研究[13]報(bào)道,與正常組織及細(xì)胞相比,circ-0067934在肝癌組織和細(xì)胞系中高表達(dá),敲低circ-0067934顯著抑制肝癌細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲,并誘導(dǎo)其凋亡;在機(jī)制研究方面,發(fā)現(xiàn)circ-0067934通過(guò)調(diào)節(jié)miR-1324/卷曲蛋白-5(frizzled-5, FZD5)基因激活細(xì)胞外因子/b-連環(huán)蛋白(b-catenin)通路,從而促進(jìn)肝癌的發(fā)生發(fā)展,所以circ-0067934/miR-1324/FZD5/b-catenin信號(hào)軸有希望成為肝癌的治療干預(yù)靶點(diǎn)。由此可見(jiàn),circRNA在惡性腫瘤中異常表達(dá),參與腫瘤細(xì)胞的增殖與凋亡等生物學(xué)過(guò)程,并與腫瘤的發(fā)生發(fā)展、預(yù)后以及疾病診斷密切相關(guān)。目前為止,本課題所研究的hsa_circ_0010985的生物學(xué)功能及臨床意義在國(guó)內(nèi)外報(bào)導(dǎo)尚未被研究闡明,因而具有極大的探索意義。

        hsa_circ_0010985是mRNA前體在形成SH3結(jié)構(gòu)域結(jié)合富含谷氨酸蛋白基因的剪接過(guò)程中,由1號(hào)染色體的3號(hào)外顯子通過(guò)反向剪接形成的長(zhǎng)度為465個(gè)核苷酸的環(huán)狀RNA分子。在本課題中,前期通過(guò)circRNA芯片發(fā)現(xiàn)其在GC化療耐藥患者血漿中高表達(dá),可能參與其GC耐藥的發(fā)生發(fā)展,但是是否參與GC的發(fā)生發(fā)展以及是否具有臨床意義尚不清楚。本研究通過(guò)qRT-PCR檢測(cè)了1株胃黏膜正常細(xì)胞和3株GC細(xì)胞,以及43例GC患者的癌組織及癌旁正常組織中has_circ_0010985的相對(duì)表達(dá)水平,表明has_circ_0010985在GC細(xì)胞和組織中均高表達(dá),通過(guò)進(jìn)一步分析顯示hsa_circ_0010985與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移具有一定的相關(guān)性,而與患者的性別、年齡、腫瘤直徑、TNM分期、CEA、CA199、腫瘤位置之間無(wú)相關(guān)性。接下來(lái),通過(guò)siRNA干擾hsa_circ_0010985在GC細(xì)胞中的表達(dá)后通過(guò)CCK8及流式細(xì)胞儀分析其生物學(xué)功能,結(jié)果表明下調(diào)hsa_circ_0010985的表達(dá)可抑制GC細(xì)胞的增殖并誘導(dǎo)其凋亡。

        總之,實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明hsa_circ_0010985可能充當(dāng)促癌基因發(fā)揮作用,并且具有一定的臨床意義,將來(lái)有望成為GC診斷的分子標(biāo)志物。但是,hsa_circ_0010985究竟通過(guò)何種機(jī)制與途徑發(fā)揮促癌作用,還有待進(jìn)一步研究及闡明其作用機(jī)制。

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