何 葉,潘林鑫,張 永,范禮斌,劉曉穎
遲發(fā)性脊椎骨骺發(fā)育不良基因(spondyloepiphyseal dysplasia tarda,SEDL)編碼的Sedlin蛋白在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)-高爾基體中間體(ER-golgi intermediate compartment, ERGIC)囊泡運(yùn)輸中發(fā)揮關(guān)鍵作用[1-2]。分析X-連鎖遲發(fā)性脊椎骨骺發(fā)育不良(spondyloepiphyseal dysplasia tarda,SEDT)病例,結(jié)果顯示患者SEDL發(fā)生多種突變,導(dǎo)致Sedlin蛋白定位異常,且Sedlin蛋白羧基端的完整有利于其在ERGIC的定位,突變最終導(dǎo)致軟骨發(fā)育功能異常[3-4]。
最普遍的調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)活力及功能的方式是蛋白質(zhì)磷酸化,酪氨酸位點(diǎn)的磷酸化除了在變構(gòu)及激活該蛋白的活力外,更重要的是促進(jìn)其和結(jié)合蛋白相互作用而形成多蛋白復(fù)合體[5]。本實(shí)驗(yàn)室前期已證實(shí)Sedlin與視網(wǎng)膜母細(xì)胞瘤蛋白(RB1)在哺乳動(dòng)物細(xì)胞內(nèi)存在相互作用[6],該研究旨在探討Sedlin的C端缺失及磷酸化位點(diǎn)突變是否影響Sedlin的亞細(xì)胞定位及其與RB1的共定位。
1.1 材料
1.1.1細(xì)胞、質(zhì)粒和菌株 本實(shí)驗(yàn)所用的COS7細(xì)胞、HEK 293T細(xì)胞,載體pCDGFP、pGEX-3X,Sedlin相關(guān)質(zhì)粒,TG1、BL21、DH5α菌株等均為本實(shí)驗(yàn)室保存。
1.1.2主要試劑 PrimeSTAR酶(日本TaKaRa公司);BamH I、EcoR I限制性內(nèi)切酶、T4 DNA連接酶、Dpn I酶;DMEM高糖培養(yǎng)基(北京賽默飛世爾科技有限公司);質(zhì)粒提取試劑盒(美國(guó)OMEGA公司);胎牛血清(美國(guó)Hyclone公司);Lipofectamine 2000、Opti-MEM(美國(guó)Invitrogen公司);GFP抗體(美國(guó)Santa Cruz公司);FLAG抗體(美國(guó)Sigma公司);細(xì)胞裂解液(上海碧云天生物技術(shù)有限公司);SuperSignal West Pico顯色試劑盒(美國(guó)Pierce公司);IPTG、PMSF、辣根過(guò)氧化物酶標(biāo)記的山羊抗小鼠IgG和TRITC標(biāo)記山羊抗小鼠IgG(北京中杉金橋生物技術(shù)有限公司);谷胱甘肽瓊脂糖球珠(美國(guó)GE Healthcare公司);熒光封片膠(丹麥DAKO公司);熒光顯微鏡(德國(guó)Carl Zeiss Jena公司)。
1.2 方法
1.2.1Sedlin缺失突變體和點(diǎn)突變體的序列擴(kuò)增[6]以Sedlin全長(zhǎng)cDNA序列為模板,25 μl PCR體系進(jìn)行擴(kuò)增:模板DNA 10 ng(0.5 μl),上下游引物濃度均為20 pmol/μl(0.5 μl),Prime STAR酶12.5 μl,ddH2O 11 μl。
1.2.2Sedlin缺失突變體的構(gòu)建[6]對(duì)上述擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行電泳,凝膠試劑盒進(jìn)行回收,將得到的PCR產(chǎn)物用限制性內(nèi)切酶BamH I和EcoR I進(jìn)行雙酶切,并同樣雙酶切pCDGFP載體、pGEX-3X載體,將酶切后的產(chǎn)物用T4 DNA連接酶連接(16 ℃ 連接約12 h),然后轉(zhuǎn)化TG1感受態(tài)細(xì)胞并平板培養(yǎng); 10 h后選取單克隆挑菌,37 ℃恒溫振蕩培養(yǎng)12 h進(jìn)行質(zhì)粒抽提,最后用BamH I和EcoR I進(jìn)行酶切鑒定;選酶切鑒定正確的質(zhì)粒送公司測(cè)序。
1.2.3Sedlin點(diǎn)突變體的構(gòu)建[6]20 μl擴(kuò)增產(chǎn)物加入Dpn I酶1.5 μl,37 ℃ 水浴2 h,轉(zhuǎn)化DH5α感受態(tài)細(xì)胞,平板培養(yǎng)約12~16 h后,挑取單克隆37 ℃振蕩過(guò)夜培養(yǎng);最后抽提質(zhì)粒并進(jìn)行雙酶切鑒定,選取酶切鑒定正確的質(zhì)粒送公司測(cè)序。
1.2.4細(xì)胞培養(yǎng)及轉(zhuǎn)染 用含有100 U/ml青、鏈霉素及5%胎牛血清的DMEM高糖培養(yǎng)基于37 ℃、5%CO2的恒溫培養(yǎng)箱中培養(yǎng)COS7細(xì)胞、HEK 293T細(xì)胞。細(xì)胞長(zhǎng)滿單層時(shí)傳代,次日將重組質(zhì)粒(μg) ∶Lipofectamine 2000按1 ∶2的比例轉(zhuǎn)染至HEK 293T細(xì)胞,用于檢測(cè)蛋白表達(dá);將重組質(zhì)粒(μg):Lipofectamine 2000按1 ∶1.5轉(zhuǎn)染至COS7細(xì)胞,用于免疫熒光實(shí)驗(yàn)。
1.2.5GST-SedlinN、GST-Sedlin-Y115A、GST-Sedlin-Y115F融合蛋白的表達(dá)及純化 把pGEX-3X-SedlinN/Y115A/Y115F重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)化至BL21感受態(tài)細(xì)胞,挑取單克隆至含有氨芐抗性的2 ml LB培養(yǎng)基中,37 ℃ 振蕩培養(yǎng)12 h;取50 μl菌液到含有氨芐抗性5 ml LB中擴(kuò)大培養(yǎng),當(dāng)OD600值達(dá)0.4~0.6范圍時(shí)再按照GST-Sedlin融合蛋白的最佳誘導(dǎo)條件摸索制備GST-SedlinN、GST-Sedlin-Y115A、GST-Sedlin-Y115F的誘導(dǎo)條件,按照最佳條件誘導(dǎo)(pGEX-3X-SedlinN為0.05 mmol/L的IPTG,16 ℃誘導(dǎo)12 h,pGEX-3X-Sedlin-Y115A、pGEX-3X-Sedlin-Y115F為0.01 mmol/L的IPTG,30 ℃ 誘導(dǎo)4 h),誘導(dǎo)結(jié)束后收集細(xì)菌并用含終濃度0.1 mmol/L的PMSF和DTT的細(xì)菌裂解液裂解約30 min,再適當(dāng)超聲以促進(jìn)細(xì)胞裂解;4 ℃ 、14 000 r/min離心20 min,取上清液,每管1 ml分裝至1.5 ml EP管,保存于-80 ℃。取1份制備好的融合蛋白用谷胱甘肽瓊脂糖球珠對(duì)其進(jìn)行純化并制成樣品,SDS-PAGE電泳,考馬斯亮藍(lán)染色后凝膠成像儀拍照,檢測(cè)融合蛋白是否成功誘導(dǎo)表達(dá)。
1.2.6Western blot法檢測(cè)蛋白表達(dá) 轉(zhuǎn)染48 h后收集細(xì)胞,加適量細(xì)胞裂解液,4 ℃ 孵育25~30 min,4 ℃ 、14 000 r/min離心20 min,取適量蛋白樣品進(jìn)行SDS-PAGE電泳;100 V電轉(zhuǎn)1 h;PVDF膜于5%脫脂奶粉中封閉1.5 h,TBST洗膜(10 min、3次),GFP兔抗(1 ∶1 000)4 ℃ 孵育過(guò)夜,TBST洗膜(10 min、3次),二抗(1 ∶5 000)室溫孵育2 h,TBST洗膜(10 min、3次),ECL顯影。
1.2.7免疫熒光實(shí)驗(yàn) 轉(zhuǎn)染后約24 h取出COS7細(xì)胞爬片,用PBS清洗細(xì)胞(5 min、3次),-20 ℃的甲醇固定5 min,再用70%乙醇溶液固定細(xì)胞5 min,PBS清洗(5 min、3次);1%脫脂奶粉封閉30 min,F(xiàn)LAG一抗室溫孵育2 h,TRITC標(biāo)記的山羊抗小鼠IgG孵育1 h;DAPI染核2 min,PBS清洗細(xì)胞(5 min、3次),DAKO封片膠封片;熒光顯微鏡下觀察、拍攝。
2.1 Sedlin突變體重組質(zhì)粒的酶切鑒定和測(cè)序結(jié)果分別對(duì)重組質(zhì)粒pGEX-3X-SedlinN/Y115A/Y115F和pCDGFP-SedlinN/Y115A/Y115F進(jìn)行雙酶切(BamH I、EcoR I),結(jié)果見(jiàn)圖1A、1B。各重組質(zhì)粒均被切成兩條帶,一條帶與載體大小一致(A載體為pGEX-3X,約4 900 bp;B載體為pCDGFP,約6 100 bp),另一條帶與目的片段大小一致(SedlinN為330 bp,Sedlin-Y115A/Y115F為420 bp)。上述質(zhì)粒的測(cè)序結(jié)果經(jīng)比對(duì),證實(shí)各質(zhì)粒成功構(gòu)建,見(jiàn)圖1C、1D。
2.2 Sedlin突變體在原核細(xì)胞中的表達(dá)分別轉(zhuǎn)化pGEX-3X-SedlinN/Y115A/Y115F質(zhì)粒至BL21菌株,經(jīng)IPTG誘導(dǎo)培養(yǎng)后,收集菌體進(jìn)行裂解,經(jīng)谷胱甘肽瓊脂糖珠子純化后進(jìn)行SDS-PAGE電泳,考馬斯亮藍(lán)染色結(jié)果顯示,純化后的樣品分別在約37 ku(圖2A)和40 ku(圖2B)的位置出現(xiàn)很強(qiáng)的蛋白條帶,大小符合GST-SedlinN、GST-Sedlin-Y115A、GST-Sedlin-Y115F融合蛋白,表明融合蛋白表達(dá)成功。
2.3 Sedlin突變體在HEK 293T細(xì)胞中的表達(dá)轉(zhuǎn)染后約48 h,收集細(xì)胞并進(jìn)行裂解,將細(xì)胞總蛋白進(jìn)行Western blot檢測(cè),結(jié)果顯示轉(zhuǎn)染了pCDGFP-SedlinN/Y115A/Y115F的細(xì)胞裂解液均能檢測(cè)到條帶,與預(yù)染的蛋白Marker對(duì)比,過(guò)表達(dá)的pCDGFP-SedlinN分子量為39 ku,點(diǎn)突變體pCDGFP-Sedlin-Y115A、pCDGFP-Sedlin-Y115F的分子量約為42 ku,與野生型pCDGFP-Sedlin的分子量一致,表明Sedlin突變體在HEK 293T細(xì)胞中正常表達(dá)。見(jiàn)圖3。
圖1 重組質(zhì)粒的酶切鑒定及測(cè)序結(jié)果圖
A、B:重組質(zhì)粒的酶切鑒定圖;C、D:重組質(zhì)粒的測(cè)序結(jié)果圖;M1:Lambda DNA/EcoR I+HindⅢ Marker;M2:TaKaKa DL2000 Marker;1:pGEX-Sedlin的酶切鑒定結(jié)果;2:pGEX-SedlinN的酶切鑒定結(jié)果及測(cè)序圖;3:pGEX-Sedlin-Y115A的酶切鑒定結(jié)果及測(cè)序圖;4:pGEX-Sedlin-Y115F的酶切鑒定結(jié)果及測(cè)序圖;5:pCDGFP-Sedlin的酶切鑒定結(jié)果;6:pCDGFP-SedlinN的酶切鑒定結(jié)果及測(cè)序圖;7:pCDGFP-Sedlin-Y115A的酶切鑒定結(jié)果及測(cè)序圖;8:pCDGFP-Sedlin-Y115F的酶切鑒定結(jié)果及測(cè)序圖
圖2 考馬斯亮藍(lán)染色檢測(cè)谷胱甘肽瓊脂糖球珠純化后的融合蛋白
M:標(biāo)準(zhǔn)蛋白Marker梯度;1:GST的細(xì)菌裂解液;2:GST-SedlinN的細(xì)菌裂解液;3:GST的純化蛋白;4:GST-SedlinN的純化蛋白;5:GST-Sedlin-Y115A的細(xì)菌裂解液;6:GST-Sedlin-Y115F的細(xì)菌裂解液;7:GST-Sedlin-Y115A的純化蛋白;8:GST-Sedlin-Y115F的純化蛋白
圖3 Sedlin突變體蛋白在哺乳動(dòng)物細(xì)胞中的表達(dá)
1:轉(zhuǎn)染pCDGFP-Sedlin的HEK 293T細(xì)胞裂解液;2:轉(zhuǎn)染pCDGFP-SedlinN的HEK 293T細(xì)胞裂解液;3:轉(zhuǎn)染pCDGFP-Sedlin-Y115A的HEK 293T細(xì)胞裂解液;4:轉(zhuǎn)染pCDGFP-Sedlin-Y115F的HEK 293T細(xì)胞裂解液
2.4 Sedlin突變體蛋白在COS7細(xì)胞中的定位分別單轉(zhuǎn)Sedlin突變體pCDGFP-SedlinN/Y115A/Y115F至COS7細(xì)胞中,然后進(jìn)行免疫熒光制片、顯微拍攝,結(jié)果顯示它們?cè)诩?xì)胞核與細(xì)胞質(zhì)中均有表達(dá),且細(xì)胞核表達(dá)量較高,見(jiàn)圖4A,這一結(jié)果與野生型Sedlin的定位基本一致,見(jiàn)圖4B。表明Sedlin的C端缺失后,以及C端磷酸化位點(diǎn)突變后并未影響其亞細(xì)胞定位。
2.5 Sedlin突變體蛋白與RB1蛋白的共定位分別共轉(zhuǎn)Sedlin突變體質(zhì)粒pCDGFP-SedlinN/Y115A/Y115F與pcDNA3.1-FLAG-RB1至COS7細(xì)胞中,進(jìn)行免疫熒光制片、顯微拍攝,結(jié)果顯示它們與RB1蛋白在核內(nèi)均存在明顯的共定位,表明Sedlin的C端缺失后,以及C端磷酸化位點(diǎn)突變后并未影響其與RB1的共定位(圖5A、5B),提示Sedlin的N端可能是與RB1相互結(jié)合的重要結(jié)構(gòu)域。
SEDT是一種軟骨發(fā)育功能障礙疾病,病變主要累及身體承重大關(guān)節(jié),以退行性大關(guān)節(jié)炎和短軀干性侏儒為主要臨床表現(xiàn)[1]。SEDT為X-連鎖隱性遺傳,具有高度遺傳性[7]。高度保守的Sedlin蛋白,在心臟、腎臟、骨骼肌等組織中均有分布。相關(guān)定位研究[8]表明Sedlin蛋白在哺乳動(dòng)物細(xì)胞COS7中與ERGIC在細(xì)胞核周?chē)胁糠止捕ㄎ滑F(xiàn)象。現(xiàn)階段研究普遍認(rèn)為SEDT的發(fā)病原因可能是SEDL基因突變導(dǎo)致Sedlin功能異常,軟骨細(xì)胞不能正常分泌細(xì)胞外基質(zhì),進(jìn)而引起骨骼發(fā)育異常。SEDT相關(guān)的Sedlin突變不會(huì)導(dǎo)致亞細(xì)胞定位的異常,但涉及疏水核心內(nèi)殘基的突變會(huì)導(dǎo)致其與轉(zhuǎn)錄因子MBP1、PITX1和SF1相互作用的喪失[9]。Sedlin的二聚化及其核定位表明哺乳動(dòng)物Sedlin的其他作用;據(jù)報(bào)道其與酵母中的Sedlin同源物Trs20p已經(jīng)作為T(mén)RAPP復(fù)合物中的單體存在[10],其中Sedlin在內(nèi)質(zhì)網(wǎng)-高爾基體的膜泡轉(zhuǎn)運(yùn)中發(fā)揮重要作用。人Rb1基因全長(zhǎng)178 143 bp,定位于染色體13q14,編碼約104~110 ku的核內(nèi)磷酸化蛋白pRb[11]。RB1蛋白幾乎在所有正常細(xì)胞中表達(dá),但表達(dá)量存在組織和發(fā)育階段的差異,在視網(wǎng)膜、心臟和肌肉中較高,肝臟、胸腺和腦中較低,且隨年齡的增長(zhǎng),表達(dá)量在各組織中均有顯著下降。RB1蛋白具有包括參與細(xì)胞周期、細(xì)胞分化、細(xì)胞凋亡的調(diào)控等功能,RB1的抑癌作用與這些功能的正常發(fā)揮密不可分[12]。
圖4 Sedlin及其突變體蛋白在COS7細(xì)胞中的定位
A:Sedlin突變體蛋白(SedlinN/Y115A/Y115F)在COS7細(xì)胞中的定位;B:Sedlin蛋白在COS7細(xì)胞中的定位;GFP:顯示含GFP標(biāo)簽的蛋白;DAPI:顯示染色的細(xì)胞核;Merge:疊加效果
圖5 Sedlin突變體蛋白與RB1蛋白在COS7細(xì)胞中的共定位
A:Sedlin突變體蛋白(SedlinN/Y115A/Y115F)與RB1蛋白在COS7細(xì)胞中的共定位;B:Sedlin蛋白與RB1蛋白在COS7細(xì)胞中的共定位;TRITC:含F(xiàn)LAG標(biāo)簽的RB1蛋白;GFP:顯示含GFP標(biāo)簽的蛋白;DAPI:顯示染色的細(xì)胞核;Merge:疊加效果
本研究通過(guò)構(gòu)建pCDGFP-SedlinN、pCDGFP-Sedlin-Y115A、pCDGFP-Sedlin-Y115F真核表達(dá)質(zhì)粒,并將其分別轉(zhuǎn)染至COS7、HEK 293T細(xì)胞,比較 Sedlin突變體相對(duì)于野生型在真核細(xì)胞內(nèi)的表達(dá)和定位改變。鑒于本課題組前期已證實(shí)野生型Sedlin蛋白與RB1蛋白存在共定位,所以又分別將上述幾個(gè)質(zhì)粒與FLAG-RB1質(zhì)粒共轉(zhuǎn)至COS7細(xì)胞中,了解Sedlin突變體蛋白與RB1蛋白的共定位情況。將Sedlin的三個(gè)突變體構(gòu)建到原核表達(dá)載體pGEX-3X中,誘導(dǎo)表達(dá)GST融合蛋白,通過(guò)SDS-PAGE電泳檢測(cè)融合蛋白表達(dá)情況。
構(gòu)建的兩個(gè)點(diǎn)突變體在DNA水平條帶大小相對(duì)于野生型而言無(wú)明顯變化,只是DNA序列中對(duì)應(yīng)位置堿基種類發(fā)生變化,而總的堿基數(shù)不變,除了Tyr115Phe、Tyr115Ala突變體以外,常見(jiàn)的Sedlin突變體還有Asp47Tyr、Ser73Leu、Phe83Ser和Val130Asp,根據(jù)相關(guān)文獻(xiàn)[9]中對(duì)Sedlin三維結(jié)構(gòu)分析得知,Sedlin突變體(Ser73Leu、Phe83Ser、Val130Asp)位于Sedlin的疏水核心結(jié)構(gòu)域內(nèi),因此可能會(huì)影響 Sedlin的結(jié)構(gòu)完整性以及與其他蛋白的相互作用。例如,極性Ser73到Leu73的突變將導(dǎo)致疏水性溝槽的破壞從而導(dǎo)致氫鍵的損失。類似地,Phe83和Val130殘基處于疏水區(qū)域內(nèi)蛋白質(zhì)的內(nèi)部,這些非極性殘基突變?yōu)闃O性殘基(分別為絲氨酸和天冬氨酸)可能會(huì)破壞疏水核心內(nèi)的相互作用,導(dǎo)致Sedlin的錯(cuò)誤折疊,這將破壞蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用[9]。
pCDGFP-SedlinN、pCDGFP-Sedlin-Y115A、pCDGFP-Sedlin-Y115F幾個(gè)突變體在HEK 293T細(xì)胞里均有表達(dá),且缺失突變體的蛋白分子量低于野生型及其點(diǎn)突變體,但是分子量變化不大,這是因?yàn)镾EDL基因的編碼區(qū)423 bp,而編碼Sedlin的缺失突變體(N端)的基因有339 bp,結(jié)果證明缺失了Sedlin的C端以后Sedlin的缺失突變體(N端)依然能正常表達(dá)。免疫熒光結(jié)果顯示突變體pCDGFP-SedlinN/Y115A/Y115F在細(xì)胞質(zhì)與細(xì)胞核中均有表達(dá),與野生型Sedlin的定位情況基本一致,表明上述突變均不會(huì)改變Sedlin蛋白的亞細(xì)胞定位,結(jié)合本文中上述免疫熒光實(shí)驗(yàn)結(jié)果證明的RB1蛋白與SedlinN/Y115A/Y115F突變體蛋白在COS7中均存在共定位,說(shuō)明Sedlin的第115位氨基酸(磷酸化位點(diǎn))突變后(Tyr115Phe、Tyr115Ala)并不會(huì)導(dǎo)致其與RB1蛋白共定位的改變;同時(shí)由于RB1蛋白與SedlinN蛋白存在共定位情況,可以得出初步結(jié)論:Sedlin蛋白與RB1蛋白相互作用的部位可能是Sedlin蛋白的N端。
本研究重點(diǎn)關(guān)注Sedlin的3個(gè)突變體蛋白的表達(dá)及其與RB1蛋白在細(xì)胞內(nèi)的共定位情況,將為本課題組后續(xù)研究Sedlin與RB1相互作用的詳細(xì)機(jī)制提供依據(jù),為進(jìn)一步揭示人類Sedlin蛋白在細(xì)胞中的作用機(jī)制、與相關(guān)疾病的關(guān)系等奠定一定的基礎(chǔ)。
安徽醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào)2019年10期