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        新城疫病毒熒光RT-PCR檢測(cè)方法的建立

        2019-09-26 02:06:54郭瑩瑩王世狀
        中國(guó)畜禽種業(yè) 2019年9期
        關(guān)鍵詞:離心管新城疫試劑盒

        郭瑩瑩 王世狀

        (黑龍江省前進(jìn)農(nóng)場(chǎng) 156331)

        新城疫是由新城疫病毒起地對(duì)家禽養(yǎng)殖業(yè)危害較大的一種傳染性疾病。該病毒傳播速度快,比較難控制,是檢驗(yàn)檢疫中要求嚴(yán)格檢驗(yàn)控制的一種病毒。PCR 技術(shù)克服了傳統(tǒng)的病原分離及常規(guī)血清學(xué)診斷等方法的費(fèi)時(shí)、費(fèi)力、敏感性和特異型較差的缺點(diǎn),已被應(yīng)用與多種病原微生物的鑒定和檢測(cè)。為了適應(yīng)活禽、禽肉制品中,快速、特異的特點(diǎn),本實(shí)驗(yàn)采用“新城疫病毒熒光RT-PCR 檢測(cè)試劑盒”,建立快速檢測(cè)NDV 的熒光RT-PCR 方法。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        RT-PCR 新城疫診斷試劑盒由北京出入境檢驗(yàn)檢疫局技術(shù)中心和深圳市匹基生物工程股份有限公司聯(lián)合生產(chǎn)。

        試劑:PBS 溶液、氯仿、無(wú)水乙醇、異丙醇。

        樣品A:新城疫病毒,分離自接種病毒雞體。

        樣品B:新城疫標(biāo)準(zhǔn)陰性對(duì)照,來(lái)自試劑盒。

        樣品CDEFG:新城疫疑似病毒,分離自農(nóng)戶(hù)家甲、乙、丙、丁、戊病死雞體。

        樣品H:新城疫標(biāo)準(zhǔn)陽(yáng)性對(duì)照,來(lái)自試劑盒。

        1.2 試驗(yàn)設(shè)備

        小型離心機(jī)、混勻器、冰箱(4℃,-20℃)、熒光PCR 檢測(cè)儀、臺(tái)式高速離心機(jī)、吸頭、1.5mL 滅菌離心管、移液器、記號(hào)筆、吸水紙、微量板、鑷子。

        1.3 方法

        1.3.1 病毒RNA 的提取

        (1)分別向每瓶樣品中加入2mLPBS 溶液,使其充分溶解。

        (2)取8 個(gè)1.5ml 滅菌離心管,做好標(biāo)記。

        (3)每個(gè)離心管加入600μL 裂解液,然后分別加入待測(cè)樣品、陰陽(yáng)對(duì)照各200μL; 再加入氯仿200μL,混勻器上振蕩混勻5s。

        (4)在4℃條件下,12000g 離心15min。

        (5)取與步驟1 中相同數(shù)量的1.5ml 離心管,加入400μL異丙醇(-20℃預(yù)冷),做好標(biāo)記。吸取步驟4 各管中的上清液相轉(zhuǎn)移至相應(yīng)的管中,顛倒混勻。

        (6)12000g 離心15min。輕輕倒去上清,倒置于濾紙上,沾干液體; 加入75%乙醇600μL,顛倒洗滌。

        (7)12000g 離心10min。輕輕倒去上清,倒置于上吸水紙上,盡量沾干液體。

        (8)4000g 離心15min。將管壁上的殘余液體甩到管底部,用微量加樣器盡量將其吸干,室溫干燥3min。

        (9)加入11μL DEPC 水輕輕混勻,溶解管壁上的RNA,2000g 離心5s,冰上保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.3.2 擴(kuò)增試劑準(zhǔn)備

        (1)從試劑盒中取出相應(yīng)的RT-PCR 反應(yīng)液,Taq 酶,在室溫下融化后,在2000r/min 離心5s,則所需的PCR 數(shù)為16,每個(gè)測(cè)試體系配制如下,把RT-PCR 反應(yīng)液和Taq 酶按每個(gè)PCR 反應(yīng)管加15μL 的PCR 和1/4 顆(即一顆加4 個(gè)孔)的比例配成反應(yīng)液。

        (2)把試劑盒中的PCR 板條取出,放在微量板上,在各設(shè)定的PCR 板條管中分別加入上述病毒提取步驟(9)中制備的RNA 溶液各10μL,蓋緊管,使用臺(tái)式離心機(jī)在17℃下9600g離心20min,取出板條,放入熒光PCR 熒光檢測(cè)儀內(nèi),記錄樣本擺放順序。

        (3)循環(huán)條件設(shè)置。

        表1 PCR 循環(huán)條件程序

        儀器檢測(cè)通道選擇F1 通道

        (4)結(jié)果分析條件設(shè)定

        讀取F1 通道的檢測(cè)結(jié)果。閾值設(shè)定原則以閾值線(xiàn)剛好超過(guò)正常陰性對(duì)照品擴(kuò)增曲線(xiàn)的最高點(diǎn),結(jié)果顯示陰性為準(zhǔn),或可根據(jù)儀器噪音情況進(jìn)行調(diào)整。

        2 判定依據(jù)

        CT 值無(wú)數(shù)值的為陰性,CT 值≤40.0 的樣本為陽(yáng)性樣本。同時(shí),陰性對(duì)照的檢測(cè)結(jié)果為陰性,陽(yáng)性對(duì)照的檢測(cè)結(jié)果為陽(yáng)性。

        3 結(jié)果

        熒光RT-PCR 儀對(duì)試驗(yàn)樣品的檢測(cè)結(jié)果見(jiàn)表2 和附圖。

        從表2 和附圖可以看出,接種的新城疫病毒,新城疫陽(yáng)性(試劑盒)為陽(yáng)性,因?yàn)橹灰顷?yáng)性就有對(duì)數(shù)增長(zhǎng)期。所選的幾種疑似病例中以農(nóng)戶(hù)家里的曲線(xiàn)走的好,從圖上的順序來(lái)看,其曲線(xiàn)中較高的一條(C1)高于新城疫接種病毒的較低的一條(A2)。其兩條曲線(xiàn)(C1,C2)均高于新城疫陽(yáng)性對(duì)照(H1,H2),這說(shuō)明它是致病性較強(qiáng)的毒株。而樣品D、E、F、G 均為陰性。從本試驗(yàn)中可以得出,疑似病例中只有農(nóng)戶(hù)家甲為強(qiáng)毒株,而由其他農(nóng)戶(hù)家的疑似病例產(chǎn)生的新城疫病毒均為弱毒株或無(wú)毒性。

        4 實(shí)驗(yàn)結(jié)論

        通過(guò)采用RT-PCR 方法來(lái)檢測(cè)新城疫病毒毒性強(qiáng)弱程度的同時(shí)發(fā)現(xiàn),該檢測(cè)方法具備了多項(xiàng)操作優(yōu)勢(shì):

        (1)快速:與雞胚病毒分離方法相比,在時(shí)間上來(lái)講,從至少需要21d 縮短為4h;

        (2)靈敏:針對(duì)感染性雞胚尿囊液,人工感染SPF 雞等方面有與雞胚病毒分離方法的敏感性基本一致;

        (3)準(zhǔn)確:與雞胚病毒分離相比,特異性基本一致;閾值為:0.172

        表2 熒光RT-PCR 對(duì)試驗(yàn)樣品的檢測(cè)結(jié)果

        附圖 試驗(yàn)樣品的熒光RT-PCR 圖

        (4)操作簡(jiǎn)單:本試劑盒給檢測(cè)者提供了質(zhì)量?jī)?yōu)異的試劑及優(yōu)化的操作程序,經(jīng)過(guò)簡(jiǎn)單的培訓(xùn),檢測(cè)者可勝任該項(xiàng)工作。

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