鄭雙 符竣惠 章孟 章靈敏 林峰
結(jié)直腸癌作為最常見(jiàn)的消化道惡性腫瘤之一,在世界范圍內(nèi)有著極高的病死率[1-2]。近年來(lái),結(jié)腸癌外科手術(shù)、化療藥物以及小分子靶向藥物治療方面取得了很大進(jìn)展[3],早期結(jié)腸癌的治療效果得到了一定程度的改善。因此,開(kāi)發(fā)新的結(jié)直腸癌診斷方法,揭示結(jié)直腸癌的發(fā)病機(jī)制是結(jié)直腸癌基礎(chǔ)研究領(lǐng)域現(xiàn)階段的重點(diǎn)問(wèn)題。
長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)通常指長(zhǎng)度超過(guò)200nt的非編碼RNA。LncRNA的堿基在長(zhǎng)度和結(jié)構(gòu)上與信使RNA(messenger RNA,mRNA)非常類(lèi)似,但由于缺少開(kāi)放閱讀框(open reading frame,ORF)而不能被編碼翻譯成蛋白。越來(lái)越多的研究表明,lncRNA非但不是在生物進(jìn)化過(guò)程中的基因冗余,而且在個(gè)體發(fā)育和癌癥等疾病的發(fā)展過(guò)程中發(fā)揮了重要的作用[4]。因此,以lncRNA作為新的腫瘤標(biāo)志物及抗腫瘤藥物靶點(diǎn)的研究成為最近腫瘤生物學(xué)領(lǐng)域的熱點(diǎn)問(wèn)題。AK001058是最近發(fā)現(xiàn)的與癌癥相關(guān)的lncRNA,其在胃癌、結(jié)腸癌組織中表達(dá)上調(diào)[5-6],但在腫瘤發(fā)生(尤其是結(jié)腸癌)中的作用還缺少深入的研究。在本文中,筆者研究lncRNA AK001058在結(jié)腸癌組織中的表達(dá)及其對(duì)結(jié)腸癌細(xì)胞增殖和凋亡的影響。
1.1 材料 收集2017年7月至2018年10月本院3例結(jié)腸癌手術(shù)患者(TNM分期Ⅱ~Ⅲ級(jí),未發(fā)生遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移)的結(jié)腸癌組織和癌旁正常組織(距離腫瘤邊緣≥5cm)。人結(jié)腸癌細(xì)胞系SW480購(gòu)自中國(guó)科學(xué)院上海生命科學(xué)研究院細(xì)胞資源中心;FBS(500ml,批號(hào):10099-141)和 DMEM 培養(yǎng)基(500ml,批號(hào):11965-092)、消化細(xì)胞所用的 PBS(500ml,批號(hào):14190-144)和 0.25%胰蛋白酶(500ml,批號(hào):25200072)、轉(zhuǎn)染細(xì)胞所用的 Opti-MEM 培養(yǎng)基(500ml,批號(hào):31985062)和 Lipofectamine RNAiMAX(0.75ml,批號(hào):13778150)轉(zhuǎn)染試劑均購(gòu)自美國(guó)ThermoFisher Scientific公司。
1.2 方法
1.2.1 細(xì)胞轉(zhuǎn)染 根據(jù)轉(zhuǎn)染試劑說(shuō)明書(shū),轉(zhuǎn)染前1d將細(xì)胞接種于12孔板中,直到細(xì)胞融合度達(dá)到60%~80%時(shí)進(jìn)行轉(zhuǎn)染。在準(zhǔn)備好的2管Opti-MEM中分別加入1μl siRNA和 1μl Lipofectamine RNAiMAX,然后將稀釋的混合液于室溫靜置5min,采用懸滴法將其加入細(xì)胞,48h后進(jìn)行檢測(cè)。根據(jù)AK001058核苷酸序列設(shè)計(jì)了兩條siRNAs即siRNA-1和siRNA-2,并使用靶向熒光素酶(luciferase)的siRNA作為對(duì)照siRNA,其引物序列信息見(jiàn)表1。
表1 siRNAs序列
1.2.2 癌組織和SW480細(xì)胞AK001058的表達(dá) 采用Trizol法提取組織或細(xì)胞總RNA,測(cè)定濃度之后將其反轉(zhuǎn)錄為 cDNA,然后利用 SYBR Premix Ex Tag(Takara)在A(yíng)BI 7500儀器上進(jìn)行實(shí)時(shí)定量熒光PCR檢測(cè),反應(yīng)程序設(shè)為 95℃預(yù)變性 5min,95℃變性 15s、65℃退火 15s、72℃延伸30s共35個(gè)循環(huán)。AK001058及內(nèi)參基因U6引物見(jiàn)表2。
表2 熒光定量PCR引物序列
1.2.3 細(xì)胞增殖活性檢測(cè) 將消化好的細(xì)胞制成濃度為1×106/ml的細(xì)胞懸液,取100μl加入96孔板中,每個(gè)樣品設(shè)置5個(gè)復(fù)孔。細(xì)胞培養(yǎng)24h待細(xì)胞貼壁后,轉(zhuǎn)染對(duì)照 siRNA 和 siRNA-1、siRNA-2,并在轉(zhuǎn)染 0、24、48、72和96h 5個(gè)時(shí)點(diǎn)加入含CCK-8的培養(yǎng)基(約占原培養(yǎng)基體積的10%),37℃孵育4h,待顏色變橙色后拿出來(lái)放置在酶標(biāo)儀上進(jìn)行檢測(cè)。
1.2.4細(xì)胞凋亡率檢測(cè) 采用Annexin V/PI雙染法。轉(zhuǎn)染對(duì)照siRNA、siRNA-1和siRNA-2的SW480細(xì)胞培養(yǎng)48h后,使用0.25%Tripsin/EDTA消化細(xì)胞,并收集細(xì)胞用PBS重懸,調(diào)整細(xì)胞密度為1×106/ml。然后取500μl樣品加入 5μl Annexin V-FITC 和 5μl碘化丙啶(PI),輕輕混勻后室溫避光孵育10min,隨后使用流式細(xì)胞儀進(jìn)行檢測(cè)。
1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS 17.0統(tǒng)計(jì)軟件。計(jì)量資料以表示,多組間比較采用單因素方差分析,兩兩比較采用LSD-t檢驗(yàn)。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1 結(jié)腸癌組織和癌旁組織中AK001058表達(dá)水平的比較 與癌旁組織中AK001058的表達(dá)水平(1.00±0.12)相比,結(jié)腸癌組織中的(2.58±0.37)明顯上調(diào),差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01)。
2.2 對(duì)照siRNA、siRNA-1和siRNA-2 AK001058表達(dá)水平的比較 與對(duì)照siRNA的細(xì)胞中AK001058的表達(dá)水平(1.00±0.00)相比,siRNA-1(0.62±0.09)和 siRNA-2(0.54±0.05)的均下降,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P<0.05)。
2.3 對(duì)照siRNA、siRNA-1和siRNA-2的SW480細(xì)胞增殖活性比較 與對(duì)照siRNA的細(xì)胞相比,在轉(zhuǎn)染后24、48h,siRNA-1和siRNA-2的細(xì)胞增殖活性相對(duì)較低,但差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P>0.05);而隨著細(xì)胞培養(yǎng)時(shí)間的延長(zhǎng),在轉(zhuǎn)染72、96h,siRNA-1和siRNA-2的細(xì)胞增殖活性均下降,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P<0.05),見(jiàn)表 3。
表3 對(duì)照siRNA、siRNA-1和siRNA-2的SW480細(xì)胞增殖活性比較
2.4 對(duì)照siRNA、siRNA-2和siRNA-2的SW480細(xì)胞凋亡率的比較與對(duì)照siRNA的細(xì)胞凋亡率[(2.60±0.72)%]相比,轉(zhuǎn)染siRNA-1[(6.81±2.01)%]和siRNA-2[(9.23±2.53)%]的均上升,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P<0.05)。
開(kāi)發(fā)新的腫瘤標(biāo)志物和藥物靶點(diǎn)是當(dāng)前結(jié)腸癌基礎(chǔ)研究領(lǐng)域的熱點(diǎn)問(wèn)題。近年來(lái),lncRNA在腫瘤發(fā)生中的作用受到越來(lái)越多的關(guān)注。在結(jié)腸癌的研究中,已經(jīng)發(fā)現(xiàn)了一系列具有重要作用的lncRNA會(huì)在腫瘤發(fā)生過(guò)程中出現(xiàn)異常表達(dá),有些(如 CCAT1[7]、CCAT2[8]、MYLKP1[9]等)在結(jié)腸癌組織中表達(dá)上調(diào),表現(xiàn)出原癌基因的特性,促進(jìn)癌細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)移,而有些則在癌組織中呈現(xiàn)低表達(dá),發(fā)揮抑癌基因的作用[4]。Niu等[6]發(fā)現(xiàn)了AK001058在人結(jié)腸癌組織中表達(dá)水平上調(diào),但其在腫瘤發(fā)生中的作用卻沒(méi)有進(jìn)行深入的研究。在本研究中,筆者同樣使用結(jié)腸癌病理組織樣品,采用實(shí)時(shí)定量熒光PCR法驗(yàn)證了AK001058在結(jié)腸癌組織中的表達(dá)水平,結(jié)果顯示AK001058在結(jié)腸癌組織中的表達(dá)水平明顯高于癌旁組織,該結(jié)果提示AK001058可能在結(jié)腸癌發(fā)生、發(fā)展過(guò)程中具有重要的生理意義。進(jìn)一步以結(jié)腸癌細(xì)胞系SW480為研究對(duì)象,發(fā)現(xiàn)下調(diào)AK001058的表達(dá)會(huì)抑制結(jié)腸癌細(xì)胞的增殖并促進(jìn)細(xì)胞走向凋亡。這些結(jié)果表明在結(jié)腸癌腫瘤發(fā)生的過(guò)程中,AK001058發(fā)揮了促進(jìn)細(xì)胞增殖、抑制細(xì)胞凋亡的作用。
lncRNA并不具有轉(zhuǎn)錄活性,卻可以通過(guò)與特定的蛋白、DNA或RNA結(jié)合,調(diào)控靶基因的轉(zhuǎn)錄活性或者作為骨架聯(lián)系多種蛋白形成核糖核蛋白復(fù)合體,從而實(shí)現(xiàn)對(duì)細(xì)胞生理功能的調(diào)控[10]。已有的研究表明,在腫瘤發(fā)生過(guò)程中,lncRNA可以直接參與基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控腫瘤相關(guān)基因的表達(dá),如DNA損傷活化P21相關(guān)非編碼RNA(P21 associated ncRNA DNA damage activated,PANDA)可以與轉(zhuǎn)錄因子NF-YA結(jié)合從而抑制DNA損傷引起的細(xì)胞凋亡[11]。而在肝癌中,過(guò)表達(dá)PANDA也促進(jìn)了癌細(xì)胞的增殖[12]。lncRNA還可以在轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控基因的表達(dá),如基因間長(zhǎng)非編碼RNA-RoR(Linc-RoR)可以與核不均一核糖核蛋白(hnRNP)及AU富集元件RNA結(jié)合蛋白1(AUF1)相互作用,影響癌基因c-myc mRNA的穩(wěn)定性[13]。此外,越來(lái)越多的研究也發(fā)現(xiàn)了lncRNA參與了諸如 p53[14]、NF-κB[15-16]、PI3K/AKT[17]及 Notch[18]等多條腫瘤相關(guān)的信號(hào)通路的調(diào)控作用,表明lncRNA可以多維度參與腫瘤發(fā)生的調(diào)控。
本研究結(jié)果提示了lncRNA AK001058對(duì)結(jié)腸癌細(xì)胞增殖和凋亡的調(diào)控作用,但未深入研究其調(diào)控的下游基因以及信號(hào)通路,因此AK001058在結(jié)腸癌細(xì)胞中具體作用的分子機(jī)制還有待進(jìn)一步探究。