李磊 韓成 王宵宵
摘要:為了探究鎘脅迫下轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)根際土壤微生物的影響,以抗蟲轉(zhuǎn)基因水稻華恢1號(hào)(HH1)及其親本非轉(zhuǎn)基因水稻明恢63(MH63)為研究材料,設(shè)置不同Cd2+濃度(0、3.5、60.0、240.0 mg/kg)脅迫進(jìn)行盆栽試驗(yàn)。結(jié)果表明:與Cd0相比,Cd3.5處理對(duì)水稻農(nóng)藝性狀無顯著影響;Cd240.0處理顯著降低了株高、產(chǎn)量;與Cd0處理相比,Cd60.0和Cd240.0處理下HH1水稻根際土壤細(xì)菌群落組成中Proteobacteria(變形菌門)、Acidobacteria(酸桿菌門)、Actinobacteria(放線菌門)的相對(duì)豐度顯著降低;MH63水稻中Acidobacteria的相對(duì)豐度顯著升高而Bacteroidetes(擬桿菌門)的相對(duì)豐度顯著降低。Cd脅迫顯著降低了水稻根際土壤細(xì)菌群落豐度及多樣性。環(huán)境因子分析顯示,Cd脅迫后水稻根際土壤pH值、總氮含量、銨態(tài)氮含量的變化是影響根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的主要原因。
關(guān)鍵詞:轉(zhuǎn)基因水稻;細(xì)菌群落;根際土壤;鎘脅迫
中圖分類號(hào): S154.3;Q938.1 ?文獻(xiàn)標(biāo)志碼: A ?文章編號(hào):1002-1302(2019)14-0282-06
近年來,鎘(Cd)污染愈加嚴(yán)重,使得農(nóng)業(yè)的可持續(xù)發(fā)展與人類的生態(tài)環(huán)境受到極大影響。Cd在土壤-植物系統(tǒng)中具有較強(qiáng)的遷移能力,可在作物中富集較高濃度的Cd,經(jīng)食物鏈傳遞進(jìn)入人體危害人類健康[1]。調(diào)查顯示,廣西巖溶地區(qū)自然地理環(huán)境下土壤中的Cd濃度高達(dá)20 mg/kg,遠(yuǎn)高于國(guó)家標(biāo)準(zhǔn),且我國(guó)西南地區(qū)土壤中Cd含量普遍較高[2]。水稻是我國(guó)重要的糧食作物,同時(shí)也是極易富集Cd的作物。近年來,轉(zhuǎn)基因作物迅猛發(fā)展,2017年全球轉(zhuǎn)基因作物種植面積高達(dá)1.9億hm2[3]。來源于蘇云金芽孢桿菌的Bt毒蛋白基因是目前應(yīng)用最為廣泛的抗蟲基因。轉(zhuǎn)入Bt基因的抗蟲轉(zhuǎn)基因水稻,能夠殺死鱗翅類害蟲,大大降低化學(xué)殺蟲劑使用量[4]。在干旱、高鹽及重金屬等逆境脅迫下,與親本水稻相比,轉(zhuǎn)基因水稻具有生長(zhǎng)優(yōu)勢(shì)[5-8]。如在Cd及高溫脅迫下,轉(zhuǎn)基因水稻幼苗中抗氧化酶含量高于親本水稻[5-6];Li等研究發(fā)現(xiàn),在高濃度臭氧脅迫下,抗蟲轉(zhuǎn)基因水稻的光合作用、產(chǎn)量均高于親本水稻[7],且能夠比親本水稻提前適應(yīng)低氮環(huán)境[8]。我國(guó)受重金屬污染較嚴(yán)重地區(qū)土壤Cd污染的平均值達(dá)到3.5 mg/kg,轉(zhuǎn)基因水稻在該濃度Cd脅迫下是否能正常生長(zhǎng)、是否富集Cd目前尚不清楚;而在高Cd濃度脅迫下,與親本水稻相比,轉(zhuǎn)基因水稻是否具有更高的抗Cd能力也有待研究。
土壤微生物是土壤生態(tài)系統(tǒng)中物質(zhì)和能量循環(huán)的主要參與者,其活動(dòng)是衡量生態(tài)系統(tǒng)各種功能是否正常的一個(gè)重要方面。土壤微生物群落與土壤重金屬污染之間的關(guān)系是國(guó)內(nèi)外環(huán)境科學(xué)領(lǐng)域的一個(gè)研究熱點(diǎn),重金屬污染能夠?qū)ν寥赖奈⑸锶郝洚a(chǎn)生影響,如降低土壤微生物量、可培養(yǎng)細(xì)菌菌落數(shù)量等[9],同時(shí)重金屬污染能明顯改變土壤微生物群落結(jié)構(gòu)[10]。轉(zhuǎn)基因作物能通過作物殘?bào)w、作物根系分泌物、作物花粉等方式改變根際土壤微環(huán)境,影響土壤生態(tài)系統(tǒng)。關(guān)于轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)土壤微生物群落的影響,學(xué)者們展開了大量研究,但目前尚未有統(tǒng)一結(jié)論,有學(xué)者通過田間試驗(yàn)監(jiān)測(cè)了轉(zhuǎn)基因水稻與其親本的多樣性,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)土壤根際微生物多樣性無顯著影響[11],也有研究者比較了轉(zhuǎn)基因水稻和常規(guī)水稻根際細(xì)菌類群的數(shù)量和組成,發(fā)現(xiàn)轉(zhuǎn)基因水稻的根際土壤細(xì)菌數(shù)量少于非轉(zhuǎn)基因水稻,同時(shí)發(fā)現(xiàn)2個(gè)品種水稻土壤微生物群落結(jié)構(gòu)不同[12]。根際土壤微生物是轉(zhuǎn)基因作物環(huán)境安全評(píng)價(jià)的重要指標(biāo)之一,其群落豐度、組成易受根際微環(huán)境和水稻生長(zhǎng)影響。但在Cd脅迫下,轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)根際土壤微生物的研究尚未見報(bào)道。
本研究以轉(zhuǎn)基因水稻華恢1號(hào)(HH1)及其親本非轉(zhuǎn)基因水稻明恢63(MH63)為研究對(duì)象,研究不同Cd濃度脅迫下轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)根際土壤微生物的影響,為Cd污染地區(qū)水稻生長(zhǎng)及環(huán)境安全評(píng)價(jià)提供理論依據(jù)。
1 材料與方法
1.1 供試土壤與水稻種子
供試土壤為南京師范大學(xué)仙林校區(qū)(118°55′E、32°06′N)內(nèi)未經(jīng)人為干擾的自然生態(tài)系統(tǒng)土壤,去除表面植被、落葉及顆粒物后,采集0~15 cm深度土壤,室內(nèi)自然風(fēng)干后研磨過篩(2 mm),混勻后備用。土壤基本理化性質(zhì)如下:pH值為7.77,總氮含量為0.41 g/kg,總有機(jī)碳含量為2.7 g/kg,有機(jī)質(zhì)含量為4.65 g/kg,速效磷含量為3.53 mg/kg,銨態(tài)氮含量為0.28 mg/kg,該土壤中未檢測(cè)到Cd等重金屬污染。供試水稻為抗蟲轉(zhuǎn)基因水稻華恢1號(hào)(HH1)及其非轉(zhuǎn)基因親本水稻明恢63(MH63),水稻種子由華中農(nóng)業(yè)大學(xué)植物科技學(xué)院提供。
1.2 盆栽試驗(yàn)
盆栽試驗(yàn)于2017年4—11月在南京師范大學(xué)地理科學(xué)學(xué)院玻璃溫室內(nèi)進(jìn)行。試驗(yàn)選用高×直徑為15 cm×25 cm的聚氯乙烯(PVC)塑料桶作為水稻盆栽用桶,每桶稱取相當(dāng)于5.0 kg干土質(zhì)量的風(fēng)干土壤,添加自來水使得盆栽桶中淹水4~5 cm,并添加不同Cd濃度對(duì)土壤進(jìn)行為期30 d的預(yù)處理,盆栽桶口覆膜以減少水分揮發(fā),膜上有孔以維持通氣狀態(tài)。設(shè)置Cd0、Cd3.5、Cd60.0和Cd240.0共4個(gè)Cd濃度脅迫處理,Cd添加量分別為0、3.5、60.0、240.0 mg/kg,其中Cd3.5為我國(guó)受重金屬污染較嚴(yán)重地區(qū)土壤Cd污染的平均值,本研究具有實(shí)際意義;而Cd60.0和Cd240.0為土壤污染的極端值,擬研究在該高Cd脅迫下轉(zhuǎn)基因水稻的抗Cd潛力。本研究中 Cd(Ⅱ) 的添加形態(tài)為CdCl2·2.5H2O,每個(gè)Cd濃度處理設(shè)置4個(gè)重復(fù)。重金屬預(yù)處理后,每桶施入N ∶ P ∶ K質(zhì)量比為 1 ∶ 1 ∶ 1 的復(fù)合肥作基肥,添加量為1.0 g/kg。將培養(yǎng)20 d后的HH1和MH63水稻幼苗分別移栽至桶中,每桶3株。水稻生長(zhǎng)期間盆內(nèi)保持4~5 cm淹水層,于移栽后20 d追施尿素(0.05 g/kg),于移栽后30 d(水稻分蘗后期)進(jìn)行曬田,其他管理措施與田間相同。成熟期破壞性采樣前,采用微電極分析儀(Unisense Microsensor Multimeter Version 2.01)測(cè)定各處理水稻盆栽水-土界面下3.8 cm處水稻根際土壤氧化還原電位值,測(cè)定方法參考文獻(xiàn)[13]。于移栽后112 d(水稻成熟期),對(duì)水稻植株進(jìn)行破壞性采樣,并測(cè)定株高、生物量、籽粒重金屬含量等水稻農(nóng)藝性狀。采集土樣時(shí),根據(jù)土壤在植物根系表面抖落和黏著程度來區(qū)分根際土和非根際土,具體采用抖落法收集[14],將采集的水稻根際土壤的一部分立即裝入2 mL離心管中于 -80 ℃ 保存,用于微生物分子生態(tài)學(xué)分析;一部分根際土用于土壤理化性質(zhì)分析。
1.3 分析方法
1.3.1 土壤理化指標(biāo)的測(cè)定 土壤pH值的測(cè)定采用蒸餾水浸提法,以2.5 mL ∶ 1 g的水土比浸提,振蕩10 min并靜置30 min,采用臺(tái)式pH計(jì)(Mettler-Toledo)測(cè)定懸濁液pH值。植物樣品使用HNO3+HClO4消煮后,采用火焰原子吸收分光光度法測(cè)定,土壤有效Cd含量采用土壤養(yǎng)分狀況系統(tǒng)研究法(ASI法)浸提后,采用火焰原子吸收分光光度法測(cè)定;土壤總有機(jī)碳(total soil organic,簡(jiǎn)稱TOC)含量采用日本島津TOC儀測(cè)定;土壤有效磷(AP)含量采用氟化銨-鹽酸提取-鉬銻抗比色法測(cè)定;總氮含量采用凱氏蒸餾法測(cè)定,無機(jī)氮采用2 mol/L KCl按體積比5 ∶ 1水土比浸提,在20 ℃、200 r/min 條件下振蕩1 h后過濾,濾液無機(jī)氮含量用流動(dòng)分析儀(Skalar San Plus,Netherlands)測(cè)定。檢測(cè)方法參考鮑士旦的《土壤農(nóng)化分析》[15]。
1.3.2 土壤總DNA的提取 土壤微生物群落與土壤微環(huán)境及營(yíng)養(yǎng)水平密切相關(guān),本研究發(fā)現(xiàn),Cd3.5處理對(duì)根際土壤理化性質(zhì)幾乎無影響,因此僅選取Cd60.0和Cd240.0處理根際土壤,作為水稻根際土壤微生物的研究材料,并以Cd0處理為對(duì)照。土壤微生物總DNA采用FastDNA SPIN Kit for Soil(MP,Biomedicals,USA)試劑盒提取。稱取于-80 ℃保存的新鮮土壤樣品0.5 g,按試劑盒的試驗(yàn)步驟提取土壤微生物總DNA。DNA溶液的濃度和純度采用NanoDrop 2000(Thermo,USA)進(jìn)行測(cè)定,提取好的DNA樣品稀釋10倍后保存于 -20 ℃[16]。
1.3.3 實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析 采用基于SYBR Green染料法的實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)測(cè)定土壤細(xì)菌16S rRNA基因豐度來表征細(xì)菌群落豐度。測(cè)定儀器為Biorad CFX96 Real-time PCR system(Biorad,USA),SYBR Green試劑選用2×SYBR Premix Ex Taq(TaKaRa,Japan),細(xì)菌16S rRNA基因擴(kuò)增引物為515F(5′-GTGCCAGCMGCCGCGGTAA-3′)/907R(5′-CCGTCAATTCMTTTRAGTTT-3′)。反應(yīng)體系為20.0 μL,包括10.0 μL的2×SYBR Premix Ex Taq、上、下游引物(20 μmol/L)各0.3、1.0 μL樣品DNA模版(9.3~23.9 ng/μL)及8.4 μL滅菌超純水。反應(yīng)程序如下:94 ℃預(yù)變性5 min; 94 ℃變性30 s,52 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,40個(gè)循環(huán),每個(gè)循環(huán)結(jié)束后采集熒光數(shù)據(jù);采用溶解曲線分析擴(kuò)增產(chǎn)物的特異性,分析程序如下:溫度從65 ℃上升到95 ℃,每上升0.5 ℃采集1次熒光數(shù)據(jù)。以含有細(xì)菌16S rRNA基因的重組質(zhì)粒作為標(biāo)準(zhǔn)DNA模版,根據(jù)質(zhì)粒濃度和阿伏伽德羅常數(shù)計(jì)算該基因的拷貝數(shù),分別以10倍梯度稀釋各模板,制作標(biāo)準(zhǔn)曲線,其濃度范圍為9.61×102~9.61×108 copies/μL。每個(gè)樣品做3個(gè)技術(shù)重復(fù),擴(kuò)增效率為99.6%(R2為0.992)。每輪反應(yīng)設(shè)置3個(gè)無模板陰性對(duì)照。
1.3.4 高通量測(cè)序分析 16S rRNA基因擴(kuò)增與Illumina Hiseq高通量測(cè)序分析:16S rRNA基因擴(kuò)增的引物采用515F/907R(V4~V5區(qū))。高通量測(cè)序委托廣東美格基因有限公司執(zhí)行,測(cè)序平臺(tái)為Illumina Hiseq 2500。測(cè)序數(shù)據(jù)處理:采用FLASH(v1.2.7,https://ccb.jhu.edu/software/FLASH/)軟件對(duì)每對(duì)PE reads進(jìn)行拼接,將成對(duì)的reads拼成1條序列,最小的overlap(重疊)長(zhǎng)度設(shè)置為10 bp,拼接序列的overlap區(qū)允許的最大錯(cuò)配比率為0.1,過濾不符合的Tags(標(biāo)簽),獲得原始的拼接序列。利用Mothur軟件對(duì)拼接后的序列進(jìn)行質(zhì)量控制及過濾,最終得到有效的拼接片段。利用USEARCH軟件(v8.0.1517,http://www.drive5.com/usearch/)對(duì)所有樣品的全部Clean Tags進(jìn)行聚類,將相似度≥97%的序列歸為同一類操作單元(OTUs),利用Qiime(http://qiime.org/)從每個(gè)OTU所屬的序列中,選取OTU序列中排在第1位的序列作為OTU的代表序列,為避免測(cè)序深度不同導(dǎo)致的誤差,每個(gè)樣本隨機(jī)抽取17 998條序列參與統(tǒng)計(jì)分析,將代表序列與GreenGene數(shù)據(jù)庫進(jìn)行對(duì)比完成對(duì)各OTU的注釋,得到每個(gè)OTU的分類學(xué)信息[17]。根據(jù)樣品中包含的物種信息,在門(Phylum)水平上將相對(duì)豐度<1%細(xì)菌類群以及無法分類的細(xì)菌類群合并在Others。
1.4 數(shù)據(jù)處理與統(tǒng)計(jì)分析
本研究采用SPSS 16.0(IBM,USA)對(duì)試驗(yàn)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,采用單因素方差分析法來比較不同Cd濃度脅迫處理間的差異性(P<0.05)。
2 結(jié)果與分析
2.1 Cd脅迫對(duì)土壤理化性質(zhì)及水稻農(nóng)藝性狀的影響
由表1可知,不同Cd濃度脅迫下HH1水稻根際土壤理化性質(zhì)存在顯著不同。與Cd0處理相比,Cd3.5處理水稻根際土壤pH值、氧化還原電位(Eh)值顯著降低,Cd60.0處理Eh值顯著降低而總氮與銨態(tài)氮含量顯著升高,Cd240.0處理Eh值與總有機(jī)碳含量顯著降低而總氮與銨態(tài)氮含量顯著增加;與Cd3.5處理相比,Cd60.0與Cd240.0處理的pH值、銨態(tài)氮含量顯著增加,Cd240.0處理的總氮含量顯著增加,總有機(jī)碳含量顯著降低;與Cd60.0處理相比,Cd240.0處理下總有機(jī)碳含量顯著降低而有效鎘含量顯著增加。
不同Cd濃度脅迫下MH63水稻根際土壤理化性質(zhì)也顯著不同。與Cd0處理相比,Cd3.5、Cd60.0處理水稻根際土壤的pH值顯著升高,Cd240.0處理水稻根際土壤的pH值、總氮含量、銨態(tài)氮含量均顯著升高;與Cd3.5處理相比,Cd240.0處理的總氮與銨態(tài)氮含量顯著增加;與Cd60.0處理相比,Cd240.0處理下有效鎘含量顯著升高。在Cd0處理下,HH1根際土壤pH值顯著高于MH63;在Cd3.5處理下,HH1根際土壤pH值、Eh值顯著低于MH63;在Cd60.0處理下,HH1的Eh值顯著低于MH63;在Cd240.0處理下,HH1的Eh值顯著低于MH63,總有機(jī)碳含量顯著低于MH63。雙因素方差分析顯示,水稻根際土壤Eh值顯著受Cd濃度脅迫及水稻品種的獨(dú)立影響及交互影響,而土壤pH值、總有機(jī)碳含量顯著受Cd濃度脅迫的獨(dú)立影響及Cd濃度與水稻品種的交互影響,水稻根際土壤總氮、銨態(tài)氮、有效鎘含量?jī)H受Cd濃度脅迫影響。可見,Cd濃度增加了水稻根際土壤總氮、銨態(tài)氮、有效Cd含量而種植轉(zhuǎn)基因水稻降低了水稻根際土壤Eh值。
由表2可知,不同Cd濃度脅迫下HH1水稻成熟期農(nóng)藝性狀顯著不同。與Cd0、Cd3.5處理相比,Cd60.0處理生物量顯著降低,Cd240.0處理株高、生物量、產(chǎn)量顯著降低;與Cd60.0處理相比,Cd240.0處理的株高與產(chǎn)量均顯著降低。不同Cd濃度脅迫下MH63水稻的農(nóng)藝性狀也顯著不同。與Cd0處理相比,Cd3.5處理農(nóng)藝性狀無顯著差異,Cd240.0處理下水稻株高、產(chǎn)量均顯著降低;與Cd3.5相比,Cd60.0處理株高與產(chǎn)量顯著降低;與Cd60.0處理相比,Cd240.0處理下水稻株高、產(chǎn)量均顯著降低。雙因素方差分析顯示,水稻株高、生物量顯著受Cd濃度脅迫及水稻品種的獨(dú)立影響及兩者的交互影響,水稻產(chǎn)量顯著受Cd脅迫獨(dú)立影響及Cd脅迫與水稻品種的交互影響??梢?,水稻農(nóng)藝性狀顯著受Cd脅迫抑制。
重金屬處理的成熟期水稻各器官中Cd顯著富集,無重金屬處理的各器官中未檢測(cè)到Cd。2個(gè)品種水稻根部Cd含量均隨Cd脅迫濃度增加而顯著上升。單因素方差分析結(jié)果顯示,在Cd3.5、Cd60、Cd240處理下,水稻根中的Cd含量在同一濃度的不同品種間無顯著差異,而同一品種的不同濃度處理間具有顯著差異;在Cd240處理下,HH1、MH63莖中的Cd含量具有顯著差異;在Cd60、Cd240處理下,水稻葉和谷粒中的Cd含量在同一濃度的不同品種間無顯著差異,而不同濃度的同一品種間具有顯著差異。雙因素方差分析顯示,水稻根、葉、谷粒Cd含量顯著受Cd濃度影響??梢?,水稻根部比莖、葉、谷粒更易富集Cd。
2.2 Cd脅迫下轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)根際土壤細(xì)菌群落豐度及Alpha多樣性的影響
由圖1可知,土壤細(xì)菌16S rRNA基因數(shù)量可以反映土壤細(xì)菌群落豐度。隨著Cd濃度的增加,HH1和MH63水稻根際土壤細(xì)菌群落豐度呈下降趨勢(shì)。單因素方差分析顯示,部分Cd濃度脅迫下HH1水稻根際土壤細(xì)菌16S rRNA基因豐度顯著不同,與Cd0處理相比,Cd60.0與Cd240.0處理根際土壤細(xì)菌群落豐度顯著降低。MH63水稻根際土壤細(xì)菌群落豐度間無顯著差異。雙因素方差分析結(jié)果顯示,根際土壤細(xì)菌16S rRNA基因豐度僅受Cd濃度脅迫顯著影響和親本水稻根際土壤細(xì)菌群落多樣性。
土壤16S rRNA基因在分類水平上的相對(duì)豐度能反映土壤中的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)和組成(圖2)。本研究中的3個(gè)處理共獲取16個(gè)相對(duì)豐度高于1%的門水平上的細(xì)菌類群。各處理中,Proteobacteria(變形菌門)、Chloroflexi(綠彎菌門)、Acidobacteria(酸桿菌門)、Actinobacteria(放線菌門)Bacteroidetes(擬桿菌門)共5個(gè)優(yōu)勢(shì)細(xì)菌群落,占總細(xì)菌群落的70%以上。其中,Proteobacteria的相對(duì)豐度最高,占總細(xì)菌群落的28.72%~46.63%;Chloroflexi其次,占9.57%~24.72%。
單因素方差分析顯示,HH1水稻根際土壤細(xì)菌群落組成顯著不同,與Cd0處理相比,Cd60.0處理中Proteobacteria(變形菌門)、Acidobacteria、Actinobacteria、Firmicutes(厚壁菌門)的相對(duì)豐度顯著降低,Bacteroidetes、Fibrobacteres(纖維桿菌門)的相對(duì)豐度顯著升高;Cd240.0處理中Proteobacteria、Acidobacteria、Actinobacteria、Fibrobacteres、Nitrospirae(硝化螺旋菌門)的相對(duì)豐度顯著降低而Chloroflexi、Spirochaetes(螺旋體門)的相對(duì)豐度顯著升高;與Cd60.0處理相比,Cd240.0處理中Chloroflexi、Bacteroidetes的相對(duì)豐度顯著升高而OP11、Spirochaetes、Fibrobacteres的相對(duì)豐度顯著降低。單因素方差分析顯示,MH63水稻根際土壤細(xì)菌群落組成也顯著不同,與Cd0處理相比,Cd60.0處理中Acidobacteria、Firmicutes、Actinobacteria的相對(duì)豐度顯著升高而Fibrobacteres、Bacteroidetes、OP11的相對(duì)豐度顯著降低,Cd240.0處理中Proteobacteria、Acidobacteria、OP11、Nitrospirae、Actinobacteria、Fibrobacteres的相對(duì)豐度顯著升高而Bacteroidetes、Spirochaetes的相對(duì)豐度顯著降低;與Cd60.0處理相比,Cd240處理的Bacteroidetes、OD1的相對(duì)豐度顯著升高而Fibrobacteres、OP11的相對(duì)豐度顯著降低。雙因素方差分析顯示,水稻根際土壤中Acidobacteria、Actinobacteria、Chloroflexi等11個(gè)細(xì)菌門的相對(duì)豐度受Cd濃度脅迫影響,水稻根際土壤中Other、OP11、Spirochaetes的相對(duì)豐度受水稻品種影響,Chloroflexi、OD1、OP11、Spirochaetes的相對(duì)豐度受水稻品種和Cd濃度的影響??梢姡珻d濃度脅迫和水稻品種能顯著影響水稻根際土壤細(xì)菌群落組成。
2.3 Cd脅迫對(duì)轉(zhuǎn)基因水稻根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)及其與環(huán)境因子的影響
基于細(xì)菌OTU相對(duì)豐度的CCA分析結(jié)果顯示,各處理細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)發(fā)生顯著變化(圖3)。在各Cd濃度脅迫處理下,HH1和MH63根際土壤細(xì)菌群落分布明顯不同,ANOSIM相似度分析表明,各Cd濃度脅迫下根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)存在顯著差異。但在相同Cd濃度脅迫處理下,HH1和MH63水稻根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)無顯著差異。土壤環(huán)境因子分析顯示,根際土壤pH值、總氮含量、銨態(tài)氮含量、總有機(jī)碳含量和Eh值影響了根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)(圖3),其中pH值、總氮含量和銨態(tài)氮含量顯著改變了水稻根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)。
3 結(jié)論與討論
3.1 Cd脅迫對(duì)水稻生長(zhǎng)及土壤微生物的影響
本研究結(jié)果顯示,Cd脅迫能對(duì)水稻生長(zhǎng)及土壤微生物產(chǎn)生顯著影響。Cd60、Cd240與Cd0處理相比,MH63品種水稻的株高、生物量、產(chǎn)量隨著Cd濃度的增加而降低。余飛宇通過對(duì)水稻添加60、180 mg/kg 2個(gè)Cd濃度脅迫,以不添加Cd脅迫為對(duì)照,結(jié)果顯示,低濃度Cd脅迫下產(chǎn)量比對(duì)照增加了6.71%,高濃度條件下,產(chǎn)量比對(duì)照下降了9.52%,具有顯著差異[18]。王錦文等的研究顯示,Cd脅迫顯著抑制水稻幼苗芽和根的生長(zhǎng),對(duì)根的生長(zhǎng)影響最為顯著[19]。而龍思斯等的研究結(jié)果顯示,3種不同污染源中,Cd含量對(duì)水稻株高以及稻谷的質(zhì)量無顯著影響[20]。與本研究結(jié)果不一致,這可能與水稻品種、土壤理化性質(zhì)及水稻生長(zhǎng)條件有關(guān)。已有研究顯示,Cd在低濃度時(shí)對(duì)植物有積極的“刺激作用”,在高濃度時(shí)則抑制植物生長(zhǎng)[21-22]。有研究者表示,在重金屬作用下,一方面植物應(yīng)激產(chǎn)生保護(hù)作用,通過加速生理生化活動(dòng)產(chǎn)生大量代謝物與重金屬締合以解毒;另一方面,激活的代謝系統(tǒng)也加速了重金屬的進(jìn)入,進(jìn)而抑制植物的代謝活動(dòng),對(duì)植物產(chǎn)生毒害作用[23]。
本研究結(jié)果顯示,隨著Cd濃度的增加,土壤細(xì)菌16S rRNA基因豐度沒有顯著變化,而不同Cd脅迫下MH63水稻根際土壤細(xì)菌Shannon指數(shù)顯著不同,與Cd0處理相比,Cd60.0與Cd240.0處理的Shannon指數(shù)顯著降低,與Cd60.0處理相比,Cd240.0處理的Shannon指數(shù)顯著降低,表明Cd濃度對(duì)土壤細(xì)菌群落多樣性有顯著影響。ANOSIM相似度分析表明,各Cd脅迫下根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)存在顯著差異。研究發(fā)現(xiàn),高濃度的Cd可減少土壤細(xì)菌、真菌和放線菌數(shù)量,Cd對(duì)土壤微生物三大菌的抑制效果是細(xì)菌>放線菌>真菌。王秀麗等研究發(fā)現(xiàn),Cd對(duì)土壤微生物的毒害作用導(dǎo)致土壤微生物數(shù)量和種群減少,說明Cd的加入導(dǎo)致土壤微生物群落結(jié)構(gòu)發(fā)生顯著變化[24]。本研究發(fā)現(xiàn),Cd濃度是影響水稻株高、生物量、產(chǎn)量及根際土壤微生物群落組成、結(jié)構(gòu)的主要因素,同時(shí)土壤pH值、總氮含量、銨態(tài)氮含量顯著影響了水稻根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)。
3.2 轉(zhuǎn)基因作物對(duì)根際土壤微生物的影響
本研究發(fā)現(xiàn),與親本水稻MH63相比,HH1水稻的根際土壤細(xì)菌群落豐度、多樣性、群落組成與結(jié)構(gòu)均沒有顯著變化。而Dunfield等研究了在加拿大的4個(gè)不同田塊連續(xù)2年種植4種轉(zhuǎn)抗除草劑基因的油菜和4種常規(guī)油菜品種對(duì)根際微生物多樣性的影響,通過分析表明,轉(zhuǎn)基因油菜品種的根內(nèi)和根際細(xì)菌群落與常規(guī)品種有差異[25]。Heuer等研究了轉(zhuǎn)T4溶菌酶馬鈴薯,指出T4溶菌酶表達(dá)的馬鈴薯與對(duì)照相比沒有發(fā)現(xiàn)根際群落有偏差[26]。劉明等在溫室試驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)CryIAb基因玉米(NK4640Bt)和非轉(zhuǎn)基因玉米根際土壤中或添加玉米組織的土壤可培養(yǎng)細(xì)菌、放線菌和真菌數(shù)量沒有顯著差異[27-28]。此后,研究者通過SSCP(單鏈構(gòu)象多態(tài)性)、CLPP(微生物群落生理代謝指紋)、PLFA(磷脂脂肪酸圖譜)技術(shù)均證實(shí),轉(zhuǎn)Cry1Ab基因玉米系并未引起土壤微生物群落多樣性的顯著變化。Lin等研究發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)抗黃瓜花葉病毒的番茄和野生型番茄對(duì)土壤微生物數(shù)量的影響沒有顯著差異,而且取樣位置比轉(zhuǎn)基因番茄的影響更大[29]。還有研究者發(fā)現(xiàn),影響因素可能是季節(jié)、天氣、土壤類型、地理位置等環(huán)境因子[30]。環(huán)境因子也是根際微生物群落變化的重要驅(qū)動(dòng)力。本研究發(fā)現(xiàn),外源基因的轉(zhuǎn)入不會(huì)影響水稻根際土壤細(xì)菌群落豐度、多樣性及群落組成與結(jié)構(gòu)。同時(shí)Cd脅迫能顯著影響轉(zhuǎn)基因水稻的基因豐度、多樣性及群落組成與結(jié)構(gòu)。同時(shí),根際土壤pH值、總氮含量、銨態(tài)氮含量顯著影響了轉(zhuǎn)基因水稻根際土壤細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)。另外,研究者還發(fā)現(xiàn)植物根際土壤微生物的變化是復(fù)雜且長(zhǎng)期的過程,因此評(píng)估轉(zhuǎn)基因作物對(duì)根際土壤微生物的影響時(shí),應(yīng)該同時(shí)監(jiān)測(cè)轉(zhuǎn)基因作物、親本非轉(zhuǎn)基因作物的長(zhǎng)期效應(yīng)[31]。
綜上所述,本研究采用分子生態(tài)學(xué)技術(shù)研究Cd脅迫下轉(zhuǎn)基因水稻對(duì)根際土壤微生物的影響,發(fā)現(xiàn)Cd脅迫對(duì)轉(zhuǎn)基因水稻和親本水稻農(nóng)藝性狀及根部Cd吸收富集有顯著影響,Cd60.0與Cd240.0脅迫能顯著降低轉(zhuǎn)基因水稻根際土壤群落豐度和多樣性,同時(shí)對(duì)土壤細(xì)菌群落組成及結(jié)構(gòu)產(chǎn)生顯著影響,該結(jié)果可為轉(zhuǎn)基因水稻環(huán)境安全評(píng)價(jià)提供試驗(yàn)數(shù)據(jù)。
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