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        江蘇省主栽油菜品種根腫病抗性鑒定及分子標(biāo)記檢測

        2019-08-21 01:13:57彭琦張椿雨費維新
        江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué) 2019年12期
        關(guān)鍵詞:抗性鑒定分子標(biāo)記根腫病

        彭琦 張椿雨 費維新

        摘要:在安徽省休寧縣田間病圃內(nèi),利用根腫菌4號生理小種,對江蘇省主栽的30個油菜品種進行根腫病抗性鑒定。同時,利用已報道的與抗4號生理小種位點PbBa8.1緊密連鎖的分子標(biāo)記A08-300對這30個品種進行分子檢測。結(jié)果顯示,30個品種的病情指數(shù)均在47及以上,都屬于感病或高感品種。此外,分子檢測結(jié)果表明,這30個品種中都不含有抗根腫菌4號生理小種的分子標(biāo)記。目前江蘇省主栽油菜品種中沒有抗根腫病品種,各品種極易受到根腫菌的侵染,應(yīng)引起生產(chǎn)者和育種者的高度重視。

        關(guān)鍵詞:江蘇省;油菜;根腫病;抗性鑒定;分子標(biāo)記

        中圖分類號: S435.654? 文獻標(biāo)志碼: A? 文章編號:1002-1302(2019)12-0149-03

        根腫病是由蕓薹根腫菌(Plasmodiophora brassicae Woronin)侵染引起的一種重要土傳病害,它主要在十字花科植物間進行傳播。根腫病最早發(fā)現(xiàn)于地中海西岸和歐洲南部,現(xiàn)在全世界均有分布,尤以溫帶地區(qū)發(fā)生較嚴重[1]。根腫病的蔓延速度很快,在澳大利亞的每個州根腫病都已上升為嚴重的病害問題;在加拿大阿爾伯特省2003年僅僅發(fā)現(xiàn) 800 hm2 的油菜地感染根腫病,到2010年就有3.5萬hm2土地受到根腫病菌的侵染,其中嚴重發(fā)病地塊油菜產(chǎn)量損失達到30%以上,有的田塊甚至造成絕收[2]。由于該病原菌在土壤中可以存活10年以上,并借助農(nóng)業(yè)機械跨區(qū)作業(yè)、風(fēng)媒、水媒以及種子等途徑進行傳播。近年來,在我國長江流域冬油菜主要產(chǎn)區(qū),油菜根腫病發(fā)生危害逐年加重,尤其是在我國四川、云南、湖北及安徽等地,油菜根腫病危害嚴重[3-4],僅四川省發(fā)病面積就已超過20萬hm2。江蘇省局部地區(qū)已在油菜和其他十字花科蔬菜上發(fā)現(xiàn)根腫病,并存在擴展趨勢。江蘇省屬于長江下游油菜主產(chǎn)區(qū),油菜的常年種植面積在30萬hm2以上,因此開展油菜品種抗根腫病的評價與鑒定對江蘇省油菜產(chǎn)業(yè)的發(fā)展具有重要的科學(xué)意義與應(yīng)用價值。

        本研究擬對江蘇地區(qū)主要栽種的30個油菜品種進行田間根腫病抗性鑒定,同時利用已報道的與抗4號生理小種位點PbBa8.1緊密連鎖的分子標(biāo)記A08-300[5]對這30個品種進行分子檢測,以期了解江蘇省目前主栽油菜品種抗根腫病現(xiàn)狀,并為江蘇省抗病油菜品種選育提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        30個油菜品種均保存于江蘇省農(nóng)業(yè)科學(xué)院種質(zhì)資源圃,含江蘇品種16個、安徽品種2個、浙江品種2個、上海品種2個、湖北品種1個、上游區(qū)品種4個、黃淮區(qū)品種2個和加拿大品種1個;病圃鑒定感病對照中核雜488和抗病對照F4010-4由安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院費維新課題組提供;分子標(biāo)記檢測抗病品種ZHE-226由華中農(nóng)業(yè)大學(xué)張椿雨課題組提供。

        1.2 油菜品種病圃(根腫菌4號小種)的鑒定

        2015年,品種鑒定試驗安排在安徽休寧根腫病鑒定試驗病圃,病圃生理小種經(jīng)Williams系統(tǒng)鑒定為4號小種。品種共30份,感病對照為中核雜488,抗病對照為F4010-4。1個品種種5行,1行20株苗,行寬2 m,3次重復(fù),按照隨機區(qū)組排列。油菜出苗后1周可在水溝灌溉1次保持田間有充足的水分。油菜苗期保持病圃土壤的含水量充足,以保證油菜根腫病的發(fā)病穩(wěn)定性。出苗90 d后,拔出植株,洗凈根部的泥土,調(diào)查記載油菜根腫病的發(fā)病情況。調(diào)查標(biāo)準(zhǔn)采用0~3級來分級,苗期油菜根腫病分級標(biāo)準(zhǔn)如下:0級為根部無病;1級為根部有細小腫瘤,體積少于根的1/3;2級為根部有中等腫瘤,體積是根的1/3~2/3;3級為根部有異常大腫瘤,體積超過根的2/3[6]。分別計算病株率及病情指數(shù):

        病株率=發(fā)病株數(shù)/調(diào)查總株數(shù)×100%;

        病情指數(shù)=∑(病株數(shù)×相應(yīng)病害級別)/(調(diào)查總株 數(shù)× 最高級別)×100;

        校正系數(shù)K=50/對照品種的實際病情指數(shù);

        相對病情指數(shù)=K×鑒定材料的病情指數(shù)。

        品種資源的抗病性差異根據(jù)相對病情指數(shù)進行分類:免疫(I)=0;0<高抗(HR)≤5;5<抗病(R)≤10;10<中抗(MR)≤20;20<中感(MS)≤30;30<感?。⊿)≤50;50<高感(HS)≤100[7]。

        1.3 分子標(biāo)記檢測

        合成InDel(堿基缺失標(biāo)記)A08-300標(biāo)記引物[5],引物序列如下:

        正向引物(Rcr4F):5′-GTAGTGCGGGCCACAAAAT-3′;

        反向引物(Rcr4R):5′-CACAATGGAGTGTTGAAATTCACT-3′。

        利用十六烷基三甲基溴化銨(CTAB)法提取30個主栽品種及華農(nóng)抗病品種ZHE-226幼嫩葉片DNA,10 μL的PCR反應(yīng)體系為0.5 μL DNA模板,正向/反向引物(10 μmol/L)各0.2 μL,0.5 μL dNTP(0.25 nmol/L),1 μL Taq酶,加H2O補齊到10 μL。PCR反應(yīng)條件為:94 ℃預(yù)變性4 min;94 ℃變性40 s,55 ℃退火40 s,72 ℃延伸30 s,35個循環(huán);72 ℃延伸10 min,結(jié)束后10 ℃保存。PCR產(chǎn)物在6%變性聚丙烯酰胺中進行凝膠電泳,銀染顯影。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 油菜品種病圃(根腫菌4號小種)的鑒定評價結(jié)果

        2015年在安徽休寧病圃鑒定了江蘇主栽品種及資源材料30份,鑒定結(jié)果表明,這30份材料對安徽休寧的根腫病4號小種都不具有抗性。由表1可知,田間病圃鑒定根腫病病株率為57%~100%;病情指數(shù)為47~100。相對病情指數(shù)分析結(jié)果表明,30個品種中有13個品種對根腫菌4號小種感?。⊿),其他17個品種都達到了高感(HS)。

        2.2 抗性標(biāo)記檢測結(jié)果

        聚丙烯酰胺凝膠電泳結(jié)果(圖1)表明,利用InDel標(biāo)記A08-300引物進行分子標(biāo)記檢測時,抗病對照目的片段序列比待檢測品種的目的片段都要小,也就是說待檢測的30個品種中都不含有抗根腫菌4號生理小種的分子標(biāo)記。

        2.3 抗性標(biāo)記測序結(jié)果

        為了更直觀看出分子標(biāo)記的序列差異,筆者對抗病品種和感病品種的A08-300標(biāo)記的測序結(jié)果進行比對分析(圖2)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),抗性標(biāo)記序列全長132 bp,而在感病品種中的標(biāo)記序列長度為139 bp。差異序列位于49 bp處,抗性標(biāo)記缺失了7個堿基,即CTGTTGC。

        3 討論與結(jié)論

        根腫病是近年來從歐洲、澳洲、加拿大等地迅速蔓延至我國的一種非常嚴重的十字花科植物病害,已經(jīng)嚴重影響到我國大部分地區(qū)油菜產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。江蘇省地處長江下游,是我國油菜的重要產(chǎn)區(qū)之一。與之相鄰的安徽、浙江省均已有了對油菜根腫病的大量報道。因此,了解江蘇地區(qū)現(xiàn)有油菜品種的根腫病抗性將有助于應(yīng)對根腫病的蔓延。

        我國目前發(fā)現(xiàn)的油菜根腫菌生理小種類型主要有2、4、5、7、9、13號6種[1,8-9]。其中,以4號生理小種存在的范圍最廣,造成的危害最大。在Williams鑒定系統(tǒng)中,4個鑒別寄主對4號生理小種均表現(xiàn)為感病。因此,在本研究中主要利用4號小種來鑒定江蘇油菜主栽品種的根腫病抗性。遺憾的是,病圃鑒定結(jié)果表明,江蘇目前的栽培種都不具備對根腫菌4號生理小種的抗性,大部分品種甚至對根腫菌高感病,說明應(yīng)當(dāng)加快開展抗根腫病油菜品種選育。

        目前,戰(zhàn)宗祥等通過種間雜交和分子標(biāo)記輔助選擇,已經(jīng)在國內(nèi)率先育成一系列抗根腫病油菜新品系和品種,并已開發(fā)了相關(guān)分子標(biāo)記[5]。為了將這些抗病材料用于江蘇等地區(qū)抗根腫病油菜品種改良,本研究首先對江蘇油菜品種進行分子標(biāo)記檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)江蘇品種不具備根腫病抗性的原因在于不含有相關(guān)抗性分子標(biāo)記。通過雜交,可以使江蘇的品種帶上抗性標(biāo)記,而通過分子標(biāo)記輔助選擇則可以加快育種進程。為此,本研究對抗性標(biāo)記進行測序和序列比對分析,并發(fā)現(xiàn)抗性標(biāo)記序列缺少了7個堿基。研究結(jié)果將有助于開發(fā)新的標(biāo)記用于油菜根腫病抗性品種選育。

        參考文獻:

        [1]費維新,Hwang S F,王淑芬,等. 根腫菌生理小種鑒定與甘藍型油菜品種資源的抗性評價[J]. 中國油料作物學(xué),2016(5):626-639.

        [2]Strelkov S E,Hwang S F,Howard R J,et al. Progress towards the sustainable management of clubroot (Plasmodiophora brassicae) of canola on the Canadian prairies[J]. Prairie Soils Crops,2011(4):114-121.

        [3]馬淑青,黃 云,王錚一,等. 油菜根腫病菌形態(tài)及生物學(xué)特性研究[J]. 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報,2006,24(2):161-165.

        [4]Ren L,Jia J G,Li M,et al. Distribution of rapeseed clubroot disease in Hubei Province and evaluation of yield loss[J]. Agricultural Science & Technology,2012,13(4):775-777.

        [5]戰(zhàn)宗祥,江瑩芬,朱紫媛,等. 與位點PbBa8.1緊密連鎖分子標(biāo)記的開發(fā)及甘藍型油菜根腫病抗性育種[J]. 中國油料作物學(xué)報,2015,37(6):766-771.

        [6]Rahman H,Shakir A,Jakir H M. Breeding for clubroot resistant spring canola (Brassica napus L.) for the Canadian prairies:can the European winter canola cv. Mendel be used as a source of resistance?[J]. Canadian Journal of Plant Science,2011,91(3):447-458.

        [7]四川省農(nóng)業(yè)科學(xué)院植物保護研究所. 油菜根腫病抗性鑒定技術(shù)規(guī)程:DB51/T 1192—2011[S]. 成都:四川省質(zhì)量技術(shù)監(jiān)督局,2011.

        [8]汪 春,李凱旋,彭衍彪,等. 安徽油菜根腫病菌生理小種鑒定及品種抗病性評價[J]. 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報,2014,41(5):772-776.

        [9]季海雯,任 莉,陳坤榮,等. 油菜根腫病病原主要生理小種和品種抗性鑒定[J]. 中國油料作物學(xué)報,2013,35(3):301-306.陳艷麗,姚愛梅,徐 義,等. 土壤化學(xué)性質(zhì)和微生物群落結(jié)構(gòu)與姜瘟發(fā)生相關(guān)性分析[J]. 江蘇農(nóng)業(yè)科學(xué),2019,47(12):152-157.

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