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        基于ISSR標(biāo)記的大花三色堇遺傳多樣性分析

        2019-08-16 07:11:02王夢(mèng)圓宋亞男
        新農(nóng)民 2019年2期
        關(guān)鍵詞:分析

        段 磊,王 霞,王夢(mèng)圓,宋亞男

        (吉林農(nóng)業(yè)科技學(xué)院,吉林吉林 132101)

        大花三色堇(Viola × wittrockiana.Gams.)又名貓臉花、蝴蝶花,其品種豐富、花色艷麗、抗凍性強(qiáng)等優(yōu)點(diǎn),深受人們喜歡,并被譽(yù)為“花壇皇后”。大花三色堇在歐洲、美國和日本非常盛行,這些國家自19世紀(jì)便開始了大花三色堇的品種選育工作,現(xiàn)已取得了顯著的成效,培育出了多種新奇的優(yōu)良品種[1]。而我國針對(duì)大花三色堇品種選育方面的研究尚處于起步階段,栽種的多為進(jìn)口F1代種子,這些種子不僅成本高,而且對(duì)我國生境的適應(yīng)能力差,因此,隨著市場(chǎng)需求量的增加,選育適應(yīng)中國生境、植株健壯、抗性強(qiáng)、具有中國知識(shí)產(chǎn)權(quán)的優(yōu)良品種已是當(dāng)務(wù)之急。

        種質(zhì)資源遺傳多樣性研究是進(jìn)行新品種選育的重要內(nèi)容。目前,我國針對(duì)大花三色堇遺傳多樣性方面的研究較少,僅有2例DNA分子標(biāo)記方面研究的報(bào)道[1,2],尚無利用簡(jiǎn)單序列重復(fù)區(qū)間擴(kuò)增(inter-simple sequence repeat,簡(jiǎn)稱ISSR)技術(shù)研究大花三色堇種質(zhì)資源分類方面的報(bào)道。本試驗(yàn)利用ISSR技術(shù)分析24份大花三色堇材料的遺傳多樣性分析,為大花三色堇優(yōu)良種質(zhì)資源的收集、分類和良種繁育奠定基礎(chǔ)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料及處理

        24份供試材料分別購自甘肅酒泉金秋園藝種業(yè)有限公司、美國泛美種子公司、英國弗倫諾瓦公司和北京花仙子農(nóng)業(yè)有限公司(見表1)。

        將種子消毒后接種于不添加任何激素的MS培養(yǎng)基中進(jìn)行無菌培養(yǎng),至三葉期取其葉片,于-20℃冷凍保存,備用。

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 基因組DNA的提取

        參照王健[2]的方法,采用改良的SDS法提取大花三色堇葉片基因組DNA,然后分別利用核酸分析儀和1%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)基因組DNA的純度和濃度,稀釋DNA濃度至50 ng/μl,-20 ℃貯存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.2 試劑

        taq DNA聚合酶、dNTPs、SDS等藥品均購自北京全式金生物技術(shù)有限公司,引物由生工生物工程(上海)有限公司合成。

        注:a:甘肅酒泉金秋園藝種業(yè)有限公司;b:美國泛美種子公司;c:英國弗倫諾瓦公司;d:北京花兒朵朵花仙子農(nóng)業(yè)有限公司。

        1.2.3 ISSR-PCR擴(kuò)增

        在前期試驗(yàn)的基礎(chǔ)上,選用10條擴(kuò)增條帶清晰、穩(wěn)定、多態(tài)性強(qiáng)的引物擴(kuò)增24份材料的基因組DNA,20μl的ISSRPCR反應(yīng)體系,包括Mg2+2.5 mmol·L-1、Taq DNA聚合酶1.2U、dNTPs 0.2 mmol·L-1、引物0.4 umol·L-1、DNA模板50ng。擴(kuò)增程序?yàn)椋?4 ℃預(yù)熱5 min;94 ℃變性40s,51℃退火50 s,72 ℃延伸1 min,39個(gè)循環(huán);72 ℃再延伸10 min;4℃保溫。擴(kuò)增產(chǎn)物用2%的瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行檢測(cè)分析。

        1.2.4 數(shù)據(jù)處理及分析

        統(tǒng)計(jì)擴(kuò)增條帶,有帶記為1,無帶記為0,建立0、1矩陣圖,利用NTSY-pc2.1軟件計(jì)算不同樣品間的遺傳相似系數(shù),并作聚類分析。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 基因組DNA質(zhì)量檢測(cè)

        24份材料基因組DNA的電泳條帶清晰、明亮、無拖尾現(xiàn)象,核酸分析儀檢測(cè)顯示OD260/OD280值均在1.8-1.9范圍內(nèi),DNA質(zhì)量濃度在155-295 ug/mL范圍內(nèi),所提基因組DNA純度較高,可用作ISSR分析。

        2.2 ISSR-PCR擴(kuò)增結(jié)果多態(tài)性分析

        10條引物擴(kuò)增24份材料樣品基因組DNA,擴(kuò)增總片段數(shù)為91,其中多態(tài)性條帶數(shù)為79,多態(tài)性比率為86.81%。

        2.3 聚類分析

        將24份材料基因組DNA 的擴(kuò)增條帶轉(zhuǎn)化為0、1二元矩陣圖,計(jì)算遺傳相似系數(shù),并在此基礎(chǔ)上構(gòu)建 UPGMA 聚類圖,結(jié)果如圖1所示,可知在遺傳相似系數(shù)0.44處,24份材料可以分為2大類群,分別是美國泛美的XXL-YB和英國弗倫諾瓦的PAN575R聚為I類,其余為第II類,遺傳相似系數(shù)為0.47時(shí),第II類又可以分為2個(gè)亞類,其中酒泉金秋園藝公司的229.04與美國泛美種子公司的M-YC為A亞類,酒泉金秋園藝公司的其余品種與花仙子農(nóng)業(yè)公司的2個(gè)品種為B亞類,且B亞類中顏色相近者、同一系列品種多聚在一起,可見,材料地理來源、顏色以及品系是影響大花三色堇遺傳多樣性的重要因素。

        圖1 24份大花三色堇的ISSR聚類圖

        3 討論

        ISSR技術(shù)是顯性標(biāo)記,它結(jié)合了RAPD的優(yōu)點(diǎn),同時(shí)克服了RAPD、SSR、RFLP等技術(shù)的缺點(diǎn),不需要預(yù)先知道靶標(biāo)DNA序列,具有高效、快速、穩(wěn)定、易操作、成本低等優(yōu)點(diǎn),現(xiàn)已廣泛用于指紋圖譜構(gòu)建、親緣關(guān)系鑒定、遺傳多樣性分析等領(lǐng)域[3]。本研究通過分析24份大花三色堇材料的遺傳多樣性,發(fā)現(xiàn)國內(nèi)材料遺傳距離較近,結(jié)果同RAPD標(biāo)記[2]和基于主成分的聚類分析[4]結(jié)果一致,說明現(xiàn)有國內(nèi)栽培品種來源相近,種質(zhì)交流受地域限制,這可能是由于大花三色堇的優(yōu)良品種多為歐美、德國和日本等國研發(fā),這些國家為了保護(hù)自身利益,限制了國際間的流通品種而造成的。為滿足我國大花三色堇的市場(chǎng)需求,必須加快大花三色堇新品種選育的步伐。研究中還發(fā)現(xiàn),花色與品系是影響大花三色堇遺傳距離的重要因素,尤以花色最為明顯,故可以推測(cè)不同花色的遺傳基礎(chǔ)是不同的。

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