亚洲免费av电影一区二区三区,日韩爱爱视频,51精品视频一区二区三区,91视频爱爱,日韩欧美在线播放视频,中文字幕少妇AV,亚洲电影中文字幕,久久久久亚洲av成人网址,久久综合视频网站,国产在线不卡免费播放

        ?

        4 例禽戊型肝炎病例的實(shí)驗(yàn)室診斷及ORF2 基因遺傳進(jìn)化分析

        2019-08-08 02:29:12劉豐波宋姍姍劉紅祥王群義欒棟祖邵三敏
        中國(guó)動(dòng)物檢疫 2019年8期
        關(guān)鍵詞:檢測(cè)

        張 翔,劉豐波,馬 冬,宋姍姍,劉 東,劉紅祥,李 彬,王群義,欒棟祖,劉 平,邵三敏

        (青島易邦生物工程有限公司,山東青島 266000)

        禽戊型肝炎病毒(avian hepatitis E virus,aHEV)屬于肝炎病毒科、正戊肝病毒屬B 種,是一種無(wú)囊膜的單股正鏈RNA 病毒,病毒顆粒呈圓球狀,為二十面體對(duì)稱結(jié)構(gòu),直徑為27~32 nm[1]。世界范圍內(nèi)分離到的aHEV 主要流行4 個(gè)基因型:澳大利亞和韓國(guó)的基因1 型、美國(guó)的基因2 型、中國(guó)和歐洲的基因3 型、匈牙利和中國(guó)臺(tái)灣的基因4 型[2]。aHEV 基因組包含3 個(gè)開(kāi)放閱讀框(open reading frame,ORF),分 別 為ORF1、ORF2 和ORF3。有研究指出,使用針對(duì)ORF2 設(shè)計(jì)的引物,擴(kuò)增序列構(gòu)建的進(jìn)化樹(shù)與全基因組序列構(gòu)建的進(jìn)化樹(shù)一致[3]。

        2018 年山東、遼寧、吉林、陜西的4 個(gè)產(chǎn)蛋期雞群發(fā)病,臨床表現(xiàn)為:大群精神良好,采食飲水正常,但持續(xù)出現(xiàn)打蔫,每天出現(xiàn)零星死淘,日死淘率為0.1%~0.2%,病程可持續(xù)1~2 個(gè)月,累計(jì)死亡率為5.0%~15.0%。采集病雞肝臟和脾臟提取RNA,利用RT-PCR 對(duì)aHEV-ORF2 基因進(jìn)行擴(kuò)增并測(cè)序,以期為aHEV 的診斷和深入研究提供分子生物學(xué)依據(jù),為我國(guó)禽戊型肝炎防控措施的制定提供參考。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 病料 采集自山東、遼寧、吉林、陜西4個(gè)地區(qū)雞場(chǎng)中疑似aHEV 感染的肝臟和脾臟樣品,無(wú)菌處理后,置于-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.1.2 試劑 RNAout 提取試劑盒:購(gòu)自天恩澤生物公司;HiScript?II One Step RT-PCR Kit:購(gòu)自諾唯贊生物公司;DL 2 000 bp DNA Marker:購(gòu)于寶生物工程(大連)有限公司。

        1.2 方法

        1.2.1 引物設(shè)計(jì) 參照GenBank 已公布的aHEV-ORF2 基因核苷酸序列,利用Oligo 6.0 引 物 設(shè) 計(jì) 軟 件,設(shè) 計(jì) 擴(kuò) 增aHEV-ORF2 基因的特異性引物。上游引物:aHEV-ORF2-F:5'-F CCCAGCCGGAAGCAGGCGCGG-3;'下游引物:aHEVORF2-R:5'-GGGTGGTGAGGGGAATGTCCTAC-3'。引物由北京華大基因科技有限公司合成,預(yù)期擴(kuò)增目的片段為1 700 bp。

        1.2.2 核酸提取 按核酸提取試劑盒和核酸提取儀說(shuō)明書(shū)提取組織RNA。

        1.2.3 核酸擴(kuò)增 用 RT-PCR 一步法試劑盒擴(kuò)增cDNA:45 ℃反轉(zhuǎn)錄30 min;94 ℃預(yù)變性3 min;94 ℃變性40 s;53 ℃退火30 s;72 ℃延伸1 min,共30 個(gè)循環(huán),72 ℃再延伸10 min;4 ℃保存10 min。PCR 產(chǎn)物用1.0% 瓊脂糖凝膠進(jìn)行電泳,置于凝膠成像系統(tǒng)中觀察結(jié)果。

        1.2.4 序列分析 挑取陽(yáng)性樣品產(chǎn)物送上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司進(jìn)行測(cè)序。用MegAlign 和Mega 6.0 軟件對(duì)測(cè)定的aHEV-ORF2基因序列與GenBank 中部分代表性毒株序列進(jìn)行同源性比較和遺傳進(jìn)化分析。

        1.2.5 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì) 統(tǒng)計(jì)不同地區(qū)發(fā)病雞群的品種、日齡、日死淘率以及檢測(cè)樣品的PCR 陽(yáng)性率。

        2 結(jié)果

        2.1 病雞剖檢變化

        剖檢病雞可見(jiàn):肝臟腫大、出血、輕微黃染,有小的或斑狀的壞死點(diǎn)或壞死斑;肝臟易碎如泥,被膜下有凝血塊(圖1-A)。脾臟腫大,為正常的2~3 倍,破裂出血(圖1-B)。腹部出現(xiàn)卵黃性腹膜炎(圖1-C),卵泡萎縮、變形,有的呈“鐘擺狀”(圖1-D)。

        圖1 臨床發(fā)病雞剖檢變化

        2.2 RT-PCR 檢測(cè)

        對(duì)送檢樣品處理后進(jìn)行RT-PCR 檢測(cè),發(fā)現(xiàn)送檢的4 份樣品檢測(cè)到的目的條帶大小均約1 700 bp,與目的片段大小一致(圖2)。將測(cè)序結(jié)果與GenBank 比對(duì),結(jié)果均為aHEV 陽(yáng)性。

        圖2 分離株的RT-PCR 鑒定結(jié)果

        2.3 統(tǒng)計(jì)分析

        4 個(gè)地區(qū)的雞群均在產(chǎn)蛋期(196~480 d)發(fā)病,品種為蛋雞和肉種雞,日死淘數(shù)量為10~30只(表1)。

        2.4 ORF2 核苷酸序列同源性分析

        對(duì)4 個(gè)分離毒株的ORF2 核苷酸序列,利用MegAlign 進(jìn)行同源性比較。結(jié)果(圖2)顯示,分離株間的ORF2 基因同源性為84.5%~94.5%,分離株與基因1 型的澳大利亞株和韓國(guó)株同源性為81.6%~82.8%,與基因2 型的美國(guó)原型株和無(wú)毒株同源性為80.9%~82.8%,與基因3 型的歐洲株和中國(guó)株同源性為80.8%~82.5%,與基因4 型的匈牙利株和中國(guó)臺(tái)灣株同源性為81.4%~82.6%。4 株分離毒株ORF2 核苷酸與已報(bào)道的4 個(gè)基因型同源性均較低(<84%)。

        表1 4 個(gè)地區(qū)發(fā)病雞群RT-PCR 檢測(cè)情況統(tǒng)計(jì)

        2.5 ORF2 基因遺傳進(jìn)化分析

        利用Mega 6.0 對(duì)4 株分離株的ORF2 基因進(jìn)行序列比較,繪制遺傳進(jìn)化樹(shù)。結(jié)果(圖3)顯示:4 株aHEV 均屬于戊型肝炎B 種,形成獨(dú)立的基因分支,但不屬于已報(bào)道的4 個(gè)基因型。

        3 討論

        上世紀(jì)八九十年代開(kāi)始,澳大利亞、美國(guó)、加拿大等陸續(xù)報(bào)道了雞的大肝大脾病(big liver and spleen disease,BLS)或肝炎脾大綜合征(hepatitis-splenomegaly,HS)[4-5],2001 年 分 離到病毒并將其命名為aHEV[6]。早在1994 年我國(guó)就有該病抗體陽(yáng)性的報(bào)告,2010 年從肉種雞群中分離到aHEV[7],2014 年從海蘭褐雞群中分離到基因3 型aHEV[8]。血清學(xué)調(diào)查發(fā)現(xiàn),我國(guó)南方雞群aHEV 血清陽(yáng)性率約為33.0%[9],廣東、山東、黑龍江等地的雞群血清陽(yáng)性率約為28.3%。這些血清學(xué)調(diào)查結(jié)果均顯示,我國(guó)已有aHEV 的廣泛流行[10]。但血清學(xué)調(diào)查結(jié)果只能反映雞群的抗體水平,無(wú)法確定雞群的帶毒情況。因病毒分離難度較大,而分子生物學(xué)方法操作簡(jiǎn)單、結(jié)果直觀、敏感性高、特異性強(qiáng)、重復(fù)性好,已被廣泛應(yīng)用于臨床檢測(cè)。ORF2 基因編碼蛋白是aHEV 的結(jié)構(gòu)蛋白,其擴(kuò)增序列構(gòu)建的進(jìn)化樹(shù)與全基因組序列構(gòu)建的進(jìn)化樹(shù)一致,是目前國(guó)內(nèi)外主要的分型依據(jù)。

        通過(guò)RT-PCR 方法,對(duì)山東、遼寧、吉林、陜西4 個(gè)地區(qū)發(fā)病雞群采集的肝臟和脾臟進(jìn)行檢測(cè),均檢測(cè)到aHEV 陽(yáng)性,此疾病在蛋雞和肉種雞的產(chǎn)蛋期均易流行,持續(xù)時(shí)間較長(zhǎng),累計(jì)死淘率較高,應(yīng)引起養(yǎng)雞企業(yè)的高度重視。

        圖2 aHEV-ORF2 基因部分序列同源性分析結(jié)果

        圖3 aHEV-ORF2 基因遺傳進(jìn)化樹(shù)

        測(cè)序分析發(fā)現(xiàn),檢出的4 株aHEV 均屬于戊型肝炎B 種,不屬于現(xiàn)已報(bào)道的4 個(gè)基因型,為新亞型。核苷酸同源性比對(duì)分析發(fā)現(xiàn),4 株aHEV與已報(bào)道的4 個(gè)基因型代表株同源性均較低(<84%),4 株分離株之間同源性為84.55~94.5%。目前尚無(wú)關(guān)于aHEV 新亞型的相關(guān)報(bào)道,本研究為我國(guó)進(jìn)一步的aHEV 研究提供了基礎(chǔ)和依據(jù)。

        雖有報(bào)道稱,可采用免疫亞單位疫苗防控aHEV[11],但目前尚無(wú)商品化疫苗可用,因此養(yǎng)雞場(chǎng)只能通過(guò)加強(qiáng)生物安全防止本病傳入。

        4 結(jié)論

        本研究確診了山東、遼寧、吉林、陜西4 個(gè)地區(qū)引起雞群異常死淘的病因?yàn)閍HEV 感染;通過(guò)ORF2 基因序列比較,發(fā)現(xiàn)分離株均屬于戊型肝炎B 種,形成獨(dú)立的基因分支,為新亞型。本試驗(yàn)為我國(guó)的aHEV 深入研究提供了基礎(chǔ)和依據(jù)。

        猜你喜歡
        檢測(cè)
        QC 檢測(cè)
        “不等式”檢測(cè)題
        “一元一次不等式”檢測(cè)題
        “一元一次不等式組”檢測(cè)題
        “幾何圖形”檢測(cè)題
        “角”檢測(cè)題
        “有理數(shù)的乘除法”檢測(cè)題
        “有理數(shù)”檢測(cè)題
        “角”檢測(cè)題
        “幾何圖形”檢測(cè)題
        亚洲永久国产中文字幕| 国产最新一区二区三区天堂| 中文字幕偷拍亚洲九色| 亚洲熟女乱一区二区三区| 国产欧美成人一区二区a片| 国产精品亚洲综合色区韩国| 亚洲人成网站久久久综合 | 狠狠97人人婷婷五月| 综合无码一区二区三区| 久久中文字幕日韩无码视频| 香蕉蜜桃av一区二区三区| 色窝窝亚洲av网在线观看| 久久av高潮av无码av喷吹| 日韩五十路| 亚洲国产精品av麻豆一区| 亚洲国产精品成人久久久| 久久精品国产亚洲av蜜臀| 一个人免费观看在线视频播放| 亚洲国产综合精品一区 | 成人无码α片在线观看不卡| 国产精品自在线免费| 成人在线视频自拍偷拍| av网站在线观看入口| 亚洲色欲色欲综合网站| 三级国产女主播在线观看| 亚洲av区一区二区三区| 亚洲中文字幕久久精品蜜桃| 亚洲国产综合精品 在线 一区| 亚洲av永久青草无码精品| 日产一区日产2区日产| 小sao货水好多真紧h无码视频 | 91精品国产闺蜜国产在线| 国产精品视频白浆免费视频| 久久天天躁狠狠躁夜夜2020一| 久久国产精品国产精品日韩区 | 无码人妻人妻经典| 久久夜色撩人精品国产小说| 亚洲麻豆av一区二区| 妺妺窝人体色www在线| 亚洲欧洲无码av不卡在线| 国产一区二区三区免费精品|