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        食源性相關(guān)腹瀉患者糞彎曲菌檢測(cè)結(jié)果分析

        2019-07-30 06:16:18李宏杰陳志杭葉斌葛榮躍王海明
        浙江臨床醫(yī)學(xué) 2019年6期
        關(guān)鍵詞:增菌分離法空腸

        李宏杰 陳志杭 葉斌 葛榮躍 王海明

        彎曲菌(Campylobacter spp)是一種重要的人獸共患病的病原體,是引起人胃腸道疾病最主要的病原體之一,使人致病的彎曲菌中99%是空腸彎曲菌,其與沙門(mén)菌、志賀菌并列為人類(lèi)三大腹瀉致病菌,并可帶來(lái)其他一些疾病??漳c彎曲菌為苛養(yǎng)菌,常規(guī)的生化檢測(cè)較為困難,臨床多以經(jīng)驗(yàn)性治療為主,楊峰等[1]研究提示臨床上在治療急性腹瀉時(shí)存在一定的用藥不符和抗菌藥物使用不正確的情況。作者應(yīng)用多重聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(PCR)檢測(cè)200例食源性相關(guān)腹瀉患者糞便標(biāo)本中的彎曲菌,以了解與增菌培養(yǎng)分離法檢測(cè)結(jié)果的關(guān)系,為臨床診療與公衛(wèi)服務(wù)提供技術(shù)支持。

        1 材料與方法

        1.1 菌株來(lái)源 對(duì)2015年1月至2017年12月本系統(tǒng)12家社區(qū)衛(wèi)生服務(wù)中心就診的食源性相關(guān)腹瀉患者糞便(或肛拭子)標(biāo)本采用直接分離與增菌分離相結(jié)合的方法常規(guī)培養(yǎng)分離獲得200株致瀉菌,其中空腸彎曲菌4株、結(jié)腸彎曲菌1株。

        1.2 儀器與耗材 VITEK-2 compact全自動(dòng)微生物分析系統(tǒng)(法國(guó)bioMérieux公司)及其苛養(yǎng)菌(NH)配套鑒定卡,基因擴(kuò)增儀,熒光定量分析儀。

        1.3 主要培養(yǎng)基和試劑 Cary-Blair運(yùn)送培養(yǎng)基(杭州天和微生物試劑有限公司產(chǎn)品),改良木炭-頭孢哌酮-去氧膽酸鹽瓊脂(CCDA)培養(yǎng)基,改良Campy-BAP彎曲菌培養(yǎng)基及藥敏紙片(均為英國(guó)Oxoid公司產(chǎn)品),微需氧袋(法國(guó)bioMérieux公司產(chǎn)品)。2Taq PCR Master Mix與PCR Marker購(gòu)自上海生工生物技術(shù)有限公司;彎曲菌核酸測(cè)定試劑盒(單重、二重與多重?zé)晒釶CR法)購(gòu)自上海之江生物科技股份有限公司。

        1.4 儀器校準(zhǔn)及室內(nèi)質(zhì)控 儀器按廠(chǎng)家要求進(jìn)行校準(zhǔn)并按室內(nèi)質(zhì)控的要求完成室內(nèi)質(zhì)控。室內(nèi)質(zhì)控菌株在直接分離、增菌分離、血清學(xué)凝集試驗(yàn)和生化鑒定上與待檢標(biāo)本同步,空腸彎曲菌(ATCC33291)由浙江省臨床檢驗(yàn)中心提供。

        1.5 檢測(cè)方法 (1)標(biāo)本采集:采集食源性相關(guān)腹瀉患者糞便(或肛拭子)標(biāo)本,用2支滅菌棉拭子沾取患者糞便后,分別插入2管Carry-Blair運(yùn)送培養(yǎng)基中,盡快送實(shí)驗(yàn)室檢測(cè),樣品采集遵循統(tǒng)計(jì)學(xué)要求。(2)多重PCR檢測(cè)糞彎曲菌:多重PCR方法參照何蕊等的方法引物設(shè)計(jì)[2],單重、二重和多重PCR用相應(yīng)試劑盒或自行引物組合設(shè)計(jì)進(jìn)行熒光PCR檢測(cè)。(3)菌株分離鑒定:①菌株分離培養(yǎng):實(shí)驗(yàn)室收到待檢糞便標(biāo)本后立即接種于改良CCDA培養(yǎng)基(并用于PCR 檢測(cè)),置微需氧袋(5%O2、10%CO2、85%N2)42℃48h,挑取可疑菌落再接種到改良CCDA培養(yǎng)基或哥倫比亞血瓊脂進(jìn)行純培養(yǎng),繼續(xù)42℃微需氧培養(yǎng)24~48h;另1份待檢糞便標(biāo)本置微需氧袋42℃增菌培養(yǎng)24~48h后接種于改良CCDA培養(yǎng)基(并用于PCR檢測(cè)),同直接分離培養(yǎng)法獲取純培養(yǎng)。②菌株常規(guī)生化鑒定:將疑似彎曲菌的純培養(yǎng)物在VITEK-2 compact上使用配套苛養(yǎng)菌(NH)鑒定卡進(jìn)行菌種鑒定。③菌株P(guān)CR鑒定:根據(jù)常規(guī)生化鑒定結(jié)果,再次以PCR(單重、二重與多重?zé)晒釶CR法)檢測(cè)復(fù)核(也包括培養(yǎng)陰性的樣本盲刮平板用PCR再次檢測(cè)),單重PCR檢測(cè)16S rRNA,二重PCR檢測(cè)16S rRNA與map A基因,多重PCR檢測(cè)16S rRNA、map A與ceu E基因。

        1.6 菌株藥敏試驗(yàn) 采用CLSI推薦使用的瓊脂紙片擴(kuò)散法即Kirby-Bauer(K-B)法。將被檢菌制成0.5麥?zhǔn)蠁挝坏木鷳乙海鶆蛲磕ㄔ诤穸葹?mm的Campy-BAP培養(yǎng)基上,42℃平衡10~15min,貼抗菌藥敏紙片,置微需氧袋42℃孵育48h后按照CLSI標(biāo)準(zhǔn)判讀結(jié)果。

        1.7 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 采用SPSS 13.0統(tǒng)計(jì)軟件。計(jì)數(shù)資料采用χ2檢驗(yàn)(結(jié)合確切概率法)分析,P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 增菌前后彎曲菌檢出率 糞便標(biāo)本直接培養(yǎng)分離法的檢出率為1.50%(3/200),PCR法(多重PCR、單重PCR或二重PCR)直接檢測(cè)糞便標(biāo)本彎曲菌的檢出率均為2.50%(5/200)。由于陽(yáng)性病例偏少,增菌培養(yǎng)前,二類(lèi)方法的檢出率無(wú)明顯差異(χ2=0.5102,P>0.05)。增菌后,培養(yǎng)分離法的檢出率為2.00%(4/200),PCR法的檢出率為2.00%(4/200),二類(lèi)方法的檢出率無(wú)明顯差異(χ2=0.0000,P>0.05)(見(jiàn)表 1),有1例未能分離出菌落但平板盲刮PCR法仍可檢出。

        表1 200份糞便標(biāo)本增菌培養(yǎng)前后彎曲菌的檢出率

        2.2 菌種鑒定結(jié)果 多重PCR的檢出空腸彎曲菌4例,結(jié)腸彎曲菌1例(在二重PCR檢測(cè)僅有16S rRNA熒光曲線(xiàn),在多重PCR檢測(cè)有16S rRNA和ceu E兩條熒光曲線(xiàn));增菌培養(yǎng)分離法菌種生化鑒定菌種結(jié)果與多重PCR一致。

        2.3 菌株藥敏結(jié)果 所有菌株對(duì)碳青霉烯類(lèi)、氨基糖苷類(lèi)和-內(nèi)酰胺類(lèi)/酶抑制劑復(fù)合制劑多敏感,對(duì)其他抗菌素可耐藥。

        3 討論

        在發(fā)展中國(guó)家,彎曲菌是嬰幼兒感染性腹瀉最常見(jiàn)的病原菌[3]。盡管彎曲菌的流行已引起各界廣泛關(guān)注,但由于其暴發(fā)少,病死率低,加上培養(yǎng)條件苛刻,許多監(jiān)測(cè)機(jī)構(gòu)(尤其是基層結(jié)構(gòu))尚未建立起對(duì)彎曲菌的監(jiān)測(cè)系統(tǒng),缺乏有力的控制手段。因此探索適宜的空腸彎曲菌檢測(cè)方法顯得尤為重要。

        由于陽(yáng)性病例偏少,可能導(dǎo)致增菌培養(yǎng)前,二類(lèi)方法的檢出率無(wú)明顯差異(χ2=0.5102,P>0.05),但PCR直接檢測(cè)的陽(yáng)性率還是有高于直接培養(yǎng)分離法的趨勢(shì)。RantsiouK等[4]報(bào)道,在增菌前定量PCR的檢測(cè)靈敏度明顯高于培養(yǎng)分離法,定量PCR的檢測(cè)率高達(dá)87%(42/48),而培養(yǎng)分離法的檢測(cè)率31.25%(15/48)。這可能與標(biāo)本中的目標(biāo)菌含量太低(低于培養(yǎng)分離法的檢測(cè)限)、“活的非可培養(yǎng)(viable but noncultureable,VBNC)”狀態(tài)、營(yíng)養(yǎng)與培養(yǎng)條件以及抗生素的使用等因素有關(guān)。同時(shí),培養(yǎng)基和培養(yǎng)條件的不穩(wěn)定改變也可能導(dǎo)致菌種生化鑒定失真。增菌可能有利于提高標(biāo)本中低劑量成活目標(biāo)菌的培養(yǎng)分離法的檢出率。Lund等[5]實(shí)驗(yàn)時(shí)發(fā)現(xiàn)有11份雞糞便標(biāo)本直接接種CCDA平板鑒定結(jié)果為陰性,而增菌后再接種CCDA平板時(shí)鑒定結(jié)果則為陽(yáng)性。而本資料使用的改良CCDA平板在糞便標(biāo)本直接接種與增菌后培養(yǎng)分離法的檢測(cè)率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=0.1454,P>0.05),可能觀(guān)察例數(shù)太少,但也說(shuō)明提高彎曲菌選擇性培養(yǎng)基性能的重要性,建議酌情使用改良CCDA平板或改良的Skirrow血瓊脂平板等,并可直接接種。與此相反,增菌后可能導(dǎo)致PCR法的檢出率有所降低,可能是由于增菌液顯著稀釋了部分標(biāo)本中目標(biāo)菌或目標(biāo)菌的DNA相對(duì)濃度而導(dǎo)致檢出率下降。

        目前公認(rèn),PCR法檢測(cè)彎曲菌的敏感度明顯高于培養(yǎng)分離法,特異性強(qiáng),簡(jiǎn)便快速。其中,多重PCR技術(shù)特異性更強(qiáng),也可具有鑒別診斷的作用;培養(yǎng)分離法雖然操作繁瑣,但仍是獲取菌株鑒定、藥敏的基本途徑。因此,應(yīng)根據(jù)檢測(cè)目的、自身?xiàng)l件等因素選擇合適的檢測(cè)方法和分離程序。多重PCR比較適合于食源性相關(guān)腹瀉患者糞彎曲菌的快速檢測(cè),也應(yīng)重視培養(yǎng)分離法對(duì)鑒定與藥敏的地位,努力優(yōu)化選擇性培養(yǎng)基及培養(yǎng)條件。在VITEK-2 compact全自動(dòng)微生物分析系統(tǒng)苛養(yǎng)菌(NH)鑒定菌種數(shù)據(jù)庫(kù)里,有空腸彎曲菌、結(jié)腸彎曲菌、胎兒彎曲菌等菌種供系統(tǒng)判定,能夠滿(mǎn)足臨床需要。PCR法是目前對(duì)彎曲菌分離菌株進(jìn)行鑒定的通用參比方法[6],實(shí)際工作中可以根據(jù)需要使用單一的或不同的基因組合來(lái)檢測(cè),以判定彎曲菌屬種[7-8],盡可能保留16S rRNA基因檢測(cè)在彎曲菌分子診斷與菌屬種鑒定中的基礎(chǔ)作用。而已經(jīng)發(fā)展起來(lái)的環(huán)介導(dǎo)恒(等)溫?cái)U(kuò)增(loop-mediated isothermal amplification,LAMP)技術(shù)[9]有望得到一致的認(rèn)可與評(píng)價(jià),工作中應(yīng)做好LAMP檢測(cè)多項(xiàng)單一指標(biāo)的復(fù)合評(píng)判,為臨床診療提供及時(shí)的有用的信息。

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