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        小分子前體物對(duì)巴弗洛霉素A1生物合成的影響

        2019-07-26 09:10:34周劍孫菲方志鍇江紅
        生物技術(shù)通報(bào) 2019年6期
        關(guān)鍵詞:纈氨酸弗洛前體

        周劍 孫菲 方志鍇 江紅

        (福建省微生物研究所 福建省新藥(微生物)篩選重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,福州 350007)

        巴弗洛霉素(Bafliomycins)是一類化學(xué)結(jié)構(gòu)上極為特殊的多烯16元環(huán)內(nèi)脂類抗生素,其大部分衍生物的側(cè)鏈結(jié)構(gòu)中都含有一個(gè)六元環(huán)的半縮醛結(jié)構(gòu)[1-2]。其中巴弗洛霉素A1(Bafilomycin A1)是一種空泡H+-ATP酶(V-ATPase)的特異性抑制劑,能夠抑制自噬體和溶酶體結(jié)合而抑制自噬[3]。V-ATPase廣泛分布于真核生物的液泡,溶酶體,反式高爾基體,分泌顆粒,核內(nèi)體等細(xì)胞內(nèi)膜系統(tǒng)中,根據(jù)細(xì)胞器官的微小酸性差別,各自發(fā)揮獨(dú)立機(jī)能,是一種新的藥物靶點(diǎn)[4-5]。另外,巴弗洛霉素類化合物還具有抗細(xì)菌[6]、抗真菌[7]、殺蟲[8]、除草[9]、抗腫瘤[10]以及免疫抑制等多種生物活性[11]。

        在大環(huán)內(nèi)酯類抗生素的生物合成中,低級(jí)脂肪酸、氨基酸、小分子有機(jī)酸/醇等可以作為前體單元構(gòu)成內(nèi)酯環(huán),但部分前體物不易被菌體合成,因而成為大環(huán)內(nèi)酯類抗生素生物合成的限制性因素[12]。安絲菌素發(fā)酵過(guò)程中添加前體物纈氨酸、異丁醇等均能有效提高主組分安絲菌素P-3含量[13-14];紅霉素發(fā)酵過(guò)程中添加甘氨酸、植物油等也可以促進(jìn)紅霉素產(chǎn)量,使主組分紅霉素A比例提高,降低紅霉素C含量[14,16];那他霉素生產(chǎn)過(guò)程中添加0.6%的丙酸鈉,可以使發(fā)酵效價(jià)提高1.8倍[17]。由此可見,在發(fā)酵培養(yǎng)基中加入適量的前體物質(zhì),通過(guò)發(fā)酵代謝調(diào)控,就有可能縮短其生物合成周期,提高大環(huán)內(nèi)酯類抗生素發(fā)酵產(chǎn)量。根據(jù)巴弗洛霉素的化學(xué)結(jié)構(gòu)特點(diǎn)和生物合成途徑[18-19],本文選取乙酸鈉、丙酸鈉、異亮氨酸、亮氨酸、纈氨酸、甲硫氨酸、異丁醇、異丁酸等考察外源性前體物對(duì)巴弗洛霉素生物合成的影響,以期通過(guò)前體物質(zhì)的添加提高巴弗洛霉素A1的產(chǎn)量。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 實(shí)驗(yàn)菌株 菌種鏈霉菌FIM-B0711由本研究室篩選保藏。

        1.1.2 培養(yǎng)基 斜面培養(yǎng)基:ISP2。分離平板培養(yǎng)基:ISP2。種子培養(yǎng)基:麥芽浸粉 2.0%;蛋白胨 2.0%;CaCO31.0%。(pH為7.2)。發(fā)酵培養(yǎng)基:可溶性淀粉4.0%、蛋白胨3.0%、酵母粉2.0%、玉米漿1.5%、碳酸鈣0.2%(pH為7.0)

        1.2 方法

        1.2.1 培養(yǎng)方法 斜面28℃培養(yǎng)10-12 d待孢子生長(zhǎng)成熟以后,刮取新鮮孢子接于種子培養(yǎng)基,置于28℃培養(yǎng)、搖床轉(zhuǎn)速為220 r/min,培養(yǎng)48 h左右;按5%的接種量接種到發(fā)酵培養(yǎng)基,后置于28℃、搖床轉(zhuǎn)速220 r/min,振蕩培養(yǎng)120 h。

        1.2.2 巴弗洛霉素A1的高效液相色譜(HPLC)檢測(cè)法 樣品處理:發(fā)酵液加入2倍體積乙醇,混勻、超聲20 min,10 000 r/min離心10 min,取上清液即為待測(cè)液。

        HPLC分析方法:Agilent 1200 series高效液相色譜儀,Syncronis C18 分析柱(4.6 mm×250 mm,填料粒徑5 μm),流動(dòng)相為甲醇:水=85∶15,進(jìn)樣量為10 μL,流速1.0 mL/min,檢測(cè)波長(zhǎng)248 nm,柱溫:40℃。根據(jù)樣品峰面積/標(biāo)準(zhǔn)液峰面積×標(biāo)準(zhǔn)液濃度計(jì)算產(chǎn)量。

        1.2.3 菌絲濃度測(cè)定 采用PMV(Packed Mass Volume)法,取發(fā)酵液10 mL于10 mL刻度試管中,于5 000 r/min離心 15 min,記錄沉淀物毫升數(shù)。依下列計(jì)算菌絲濃度:菌絲濃度=(沉淀物毫升數(shù)/10)×100%。

        1.2.4 總糖的測(cè)定 斐林試劑測(cè)定法[20]

        1.2.5 氨基氮的測(cè)定 甲醛法[21]

        1.2.6 不同前體對(duì)巴弗洛霉素A1生物合成的影響 在發(fā)酵培養(yǎng)24 h后分別向發(fā)酵培養(yǎng)基中加入0.1%的醋酸鈉、丙酸鈉、異亮氨酸、亮氨酸、纈氨酸、甲硫氨酸、異丁醇、異丁酸,繼續(xù)培養(yǎng),在發(fā)酵120 h時(shí)測(cè)定發(fā)酵液中巴弗洛霉素A1產(chǎn)量及菌絲濃度,確定最佳前體物質(zhì)。以無(wú)添加前體物的基礎(chǔ)發(fā)酵培養(yǎng)基為對(duì)照。

        1.2.7 前體添加濃度對(duì)巴弗洛霉素A1生物合成的影響 在發(fā)酵培養(yǎng)24 h后分別向發(fā)酵培養(yǎng)基中添加0.025%、0.05%、0.1%、0.2%、0.3%、0.4%、0.5%的最佳前體物,發(fā)酵結(jié)束后測(cè)定巴弗洛霉素A1產(chǎn)量、菌絲濃度及pH值,確定最佳添加濃度。以無(wú)添加前體物的基礎(chǔ)發(fā)酵培養(yǎng)基為對(duì)照。

        1.2.8 前體加入時(shí)間的考察 分別在發(fā)酵培養(yǎng)的第0、12、24、36、48、60、72 h時(shí),向發(fā)酵培養(yǎng)基中加入最佳前體,發(fā)酵結(jié)束后測(cè)定巴弗洛霉素A1產(chǎn)量、菌絲濃度及pH值,確定最佳加入時(shí)間,以無(wú)添加前體物的基礎(chǔ)發(fā)酵培養(yǎng)基為對(duì)照。

        1.2.9 發(fā)酵罐上補(bǔ)料實(shí)驗(yàn) 新鮮斜面接入裝量為80 mL/500 mL搖瓶種子培養(yǎng)基中,28℃,220 r/min培養(yǎng)48 h后合并種子液,按5.0%左右的接種量移種到20 L發(fā)酵罐中培養(yǎng)。在發(fā)酵培養(yǎng)過(guò)程中,通過(guò)攪拌及通氣量控制發(fā)酵液DO值在30%-60%之間,一般通氣為1∶0.8-1.5 vvm,攪拌轉(zhuǎn)速在200-500 r/min之間。在發(fā)酵進(jìn)行到36 h時(shí)一次性加入發(fā)酵液體積0.2%的纈氨酸溶液。

        2 結(jié)果

        2.1 不同前體對(duì)巴弗洛霉素A1生物合成的影響

        圖1顯示,添加0.1%纈氨酸可促進(jìn)菌體生長(zhǎng)及有效提高巴弗洛霉素A1發(fā)酵產(chǎn)量,達(dá)217.6 mg/mL,比對(duì)照組提高約36.0%;添加0.1%甲硫氨酸對(duì)菌體生長(zhǎng)影響不大,但可提高巴弗洛霉素A1發(fā)酵產(chǎn)量,達(dá)到184.2 mg/mL,比對(duì)照組提高了約15.0%;添加0.1%的乙酸鈉和丙酸鈉對(duì)巴弗洛霉素A1產(chǎn)量和生物量沒有明顯影響;而添加0.1%的異丁醇和異丁酸可以提高巴弗洛霉素效價(jià),但效果不明顯且會(huì)抑制菌體生長(zhǎng);而亮氨酸、異亮氨酸可以促進(jìn)菌體生長(zhǎng),但會(huì)降低巴弗洛霉素A1的產(chǎn)量;由此可見纈氨酸為最佳的外源前體物,后續(xù)實(shí)驗(yàn)選擇纈氨酸進(jìn)行最適添加量及添加時(shí)間的研究。

        圖1 不同前體物對(duì)巴弗洛霉素A1生物合成的影響

        2.2 纈氨酸添加濃度對(duì)巴弗洛霉素A1生物合成的影響

        圖2顯示,在發(fā)酵24 h左右往培養(yǎng)基中添加纈氨酸濃度為0-0.1%時(shí),菌體濃度持續(xù)增加,巴弗洛霉素效價(jià)也增加;當(dāng)纈氨酸濃度達(dá)到0.2%時(shí),菌體濃度開始下降,但此時(shí)巴弗洛霉素A1效價(jià)達(dá)到最高;繼續(xù)加大氨基酸添加量后菌體濃度持續(xù)下降,巴弗洛霉素A1效價(jià)也跟著下降。有可能是因?yàn)楦邼舛壤i氨酸對(duì)菌體產(chǎn)生抑制作用,導(dǎo)致生物量的減少進(jìn)而降低發(fā)酵效價(jià)。因此,確定前體纈氨酸的最佳添加量為0.2%,此條件下巴弗洛霉素A1產(chǎn)量為264.5 mg/mL,比對(duì)照提高了65.3%。

        2.3 纈氨酸添加時(shí)間的選擇

        圖3顯示,在第36 h添加纈氨酸時(shí),巴弗洛霉素A1產(chǎn)量及菌絲濃度均比對(duì)照組有所提高,此時(shí)添加纈氨酸效果最好,巴弗洛霉素A1產(chǎn)量高達(dá)285.5 mg/mL,比對(duì)照組提高了78.4%。

        圖2 纈氨酸添加量對(duì)巴弗洛霉素A1生物合成的影響

        從圖3上生物量的變化可以看出,在培養(yǎng)0-24 h時(shí)加入纈氨酸,菌絲濃度逐漸增加,發(fā)酵效價(jià)也升高,可能是由于部分纈氨酸作為細(xì)胞生長(zhǎng)的碳源而促進(jìn)生長(zhǎng),另外纈氨酸也會(huì)誘導(dǎo)次級(jí)代謝的酶活從而提高效價(jià);而第36 h是處在鏈霉菌FIM-B0711開始進(jìn)入次級(jí)代謝產(chǎn)物巴弗洛霉素合成的階段,此時(shí)加入纈氨酸,大部分能作為次級(jí)代謝前體物質(zhì)直接轉(zhuǎn)化為丙酰CoA合成巴弗洛霉素A1,因此發(fā)酵效價(jià)最高。

        在培養(yǎng)48 h之后加入纈氨酸,巴弗洛霉素A1產(chǎn)量下降,而生物量反而有所上升,這可能是由于纈氨酸是初級(jí)代謝產(chǎn)物有可能引起菌體二次生長(zhǎng)而改變生物合成進(jìn)程從而降低發(fā)酵效價(jià)。所以最佳的前體物補(bǔ)料時(shí)機(jī)為在發(fā)酵培養(yǎng)36 h時(shí)加入0.2%的纈氨酸。

        圖 3 纈氨酸添加時(shí)間對(duì)巴弗洛霉素A1生物合成的影響

        2.4 發(fā)酵過(guò)程考察

        在20 L發(fā)酵罐進(jìn)行發(fā)酵試驗(yàn),在培養(yǎng)36 h左右,往發(fā)酵罐加入總量0.2%的纈氨酸溶液,對(duì)照組為不添加纈氨酸發(fā)酵罐。

        由圖4可以看出,添加纈氨酸發(fā)酵時(shí)總糖消耗速率較快,說(shuō)明纈氨酸可以提高菌體的代謝合成。氨基氮曲線的變化可以看到,沒有添加前體物的發(fā)酵過(guò)程,前36 h由于菌體細(xì)胞的生長(zhǎng)和繁殖消耗了大量的氨基氮,導(dǎo)致氨基氮含量下降較快,同時(shí)伴隨著pH值的下降;之后氨基氮消耗緩慢,此時(shí)pH值有所回升;在發(fā)酵后期(發(fā)酵72 h后),氨基氮緩慢回升,而pH值也在升高,可能是由于發(fā)酵后期菌體開始衰老、自溶,釋放部分氨基氮。而在36 h時(shí)添加纈氨酸可以看到氨基氮在36-48 h恢復(fù)到較高水平,然后再下降,在60 h后又開始緩慢上升;這可能是由于添加氨基酸后促進(jìn)菌體生長(zhǎng)和代謝合成,隨著發(fā)酵的進(jìn)行氨基酸被大量消耗而導(dǎo)致氨基氮減少,發(fā)酵后期產(chǎn)物大量合成,菌體開始自溶,氨基氮又緩慢回升。

        圖4 發(fā)酵曲線對(duì)比

        由于發(fā)酵過(guò)程控制發(fā)酵罐轉(zhuǎn)速以盡量保證菌體對(duì)氧的需求,所以兩種發(fā)酵方式的溶氧曲線變化基本一致。在發(fā)酵0-36 h隨著菌體的快速生長(zhǎng),DO值迅速下降到30%左右,此時(shí)提高轉(zhuǎn)速增加發(fā)酵液中氧氣含量,在發(fā)酵中后期菌體進(jìn)入次級(jí)代謝合成期對(duì)氧的需求開始下降,此時(shí)可以適當(dāng)降低轉(zhuǎn)速,以減少攪拌剪切力對(duì)菌絲體的損傷。

        從菌絲濃度變化的曲線可以看出,巴弗洛霉素A1發(fā)酵過(guò)程中存在兩個(gè)階段(菌體生長(zhǎng)期和產(chǎn)物合成期),發(fā)酵前期(0-36 h)菌體生長(zhǎng)、繁殖較快,為菌體生長(zhǎng)期,36-96 h菌絲濃度增長(zhǎng)緩慢,此時(shí)開始大量合成次級(jí)代謝產(chǎn)物巴弗洛霉素A1;在發(fā)酵后期,96-120 h菌體細(xì)胞開始衰亡自溶,巴弗洛霉素A1累積速度變慢,發(fā)酵120 h時(shí)巴弗洛霉素A1產(chǎn)量達(dá)到峰值。在發(fā)酵36 h時(shí)添加纈氨酸可以明顯促進(jìn)菌絲體生長(zhǎng)和大大提高巴弗洛霉素A1的生物合成速率和產(chǎn)量,120 h是巴弗洛霉素A1產(chǎn)量達(dá)到282.5 mg/L。

        3 討論

        目前已有公開報(bào)道的巴弗洛霉素發(fā)酵產(chǎn)量都不高。魏剛等[11]報(bào)道從海洋放線菌Y12-26發(fā)酵獲得bafilomycin A1,效價(jià)極低。潘華奇等[22]報(bào)道卡伍爾鏈霉菌經(jīng)發(fā)酵產(chǎn)生的bafilomycin B1和bafilomycin C1含量分別達(dá)23.45 mg/L 和6.603 mg/L。楊巍民等[23]報(bào)道在40 L海洋放線菌Y-0117發(fā)酵液中獲得 bafilomycin D 純 品 約 0117A(14.7 mg)。Werner等[6]報(bào)道從100 L灰色鏈霉菌的發(fā)酵液中分離獲得 bafliomycins A1 45 mg、A2 36 mg、C1 120 mg,Yu等[24]從鏈霉菌YIM56209的9.6 L發(fā)酵液中獲得bafliomycins C1 1.8mg。Carr等[25]從海洋放線菌發(fā)酵液中分離到bafilomycin F。Lee等[26]報(bào)道在發(fā)酵過(guò)程添加80 mmol/L 纈氨酸添加可以使 bafilomycin產(chǎn)量達(dá)到35 mg/L。由此可見已有報(bào)道巴弗洛霉素發(fā)酵產(chǎn)量均太低,生產(chǎn)成本高,不足以實(shí)現(xiàn)工業(yè)化應(yīng)用。

        巴弗洛霉素A1大環(huán)內(nèi)酯核心由I型PKS系統(tǒng)組裝,其聚酮延伸前體物為甲基丙二酰輔酶A、丙二酰輔酶A、甲氧基丙二酰輔酶A等[27-28]。這些短鏈脂肪酸?;鵆oA可以通過(guò)脂肪酸或支鏈氨基酸等物質(zhì)代謝獲得[29]。因此在發(fā)酵培養(yǎng)過(guò)程中加入適量前體物質(zhì),通過(guò)代謝調(diào)控,可能縮短其生物合成周期,提高巴弗洛霉素的產(chǎn)量。但如果外源前體在發(fā)酵液中的殘留濃度過(guò)高,又會(huì)使生產(chǎn)菌中毒,而不利于產(chǎn)物的生物合成。因此,研究適當(dāng)?shù)那绑w添加策略對(duì)有些次級(jí)代謝產(chǎn)物的高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)有重要意義。

        添加纈氨酸可以提高巴弗洛霉素產(chǎn)量的原因可能是纈氨酸在菌體內(nèi)代謝可得異丁酸,其是巴弗洛霉素生物合成的起始單元[26],外源性地增加巴弗洛霉素生物合成起始單元可以大大地促進(jìn)其生物合成。而添加亮氨酸或異亮氨酸抑制會(huì)乙酰羧酸合成酶(受單個(gè)末端產(chǎn)物抑制),使得胞內(nèi)合成的纈氨酸減少[30],從而降低產(chǎn)量。

        4 結(jié)論

        本文研究表明,纈氨酸作為前體物對(duì)巴弗洛霉素A1生物合成的促進(jìn)作用優(yōu)于甲硫氨酸、異丁醇及異丁酸,是較適宜的前體。在發(fā)酵培養(yǎng)36 h時(shí)添加0.2%纈氨酸,巴弗洛霉素A1產(chǎn)量高達(dá)285.5 mg/L,比對(duì)照組提高了78.4%。且這一實(shí)驗(yàn)在20 L發(fā)酵罐上得以實(shí)現(xiàn),為下一步菌株選育及發(fā)酵放大實(shí)驗(yàn)提高基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

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