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        基于表型的櫻桃番茄種質(zhì)遺傳多樣性分析

        2019-07-23 08:36:04史建磊宰文珊陳依凱洪遠(yuǎn)王海龍
        熱帶作物學(xué)報(bào) 2019年6期
        關(guān)鍵詞:櫻桃番茄表型性狀遺傳多樣性

        史建磊 宰文珊 陳依凱 洪遠(yuǎn) 王海龍

        摘 ?要 ?為研究櫻桃番茄種質(zhì)的遺傳多樣性,科學(xué)評(píng)價(jià)種質(zhì),以21份自交系為材料,對(duì)其12個(gè)表型性狀進(jìn)行遺傳變異、主成分和聚類分析。結(jié)果表明:各性狀的變異系數(shù)為14.97%~216.48%,Shannon多樣性指數(shù)為0.66~1.34。選取累積貢獻(xiàn)率為76.619%的前4個(gè)主成分,所包含的9個(gè)表型性狀是種質(zhì)評(píng)價(jià)的主要指標(biāo),5份材料綜合表現(xiàn)優(yōu)良(F>0.8)。進(jìn)一步系統(tǒng)聚類,在歐氏距離8~11之間將供試種質(zhì)分為四類,分別包含6、10、4和1份材料,可用于不同類型品種的選育。21份櫻桃番茄種質(zhì)具有較豐富的遺傳多樣性,為相關(guān)資源的利用及品種選育提供了參考。

        關(guān)鍵詞 ?櫻桃番茄;表型性狀;聚類分析;遺傳多樣性

        中圖分類號(hào) ?S330 ?????文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼 ?A

        Abstract ?In order to study the genetic diversity of cherry tomatoes and evaluate the germplasms scientifically, twelve phenotypic characters were analyzed by genetic variation, principal component and cluster analysis in 21 inbred lines. The results showed that the variation coefficient ranged from 14.97% to 216.48%, and the diversity indices ranged from 0.66 to 1.34 in different traits. Considering the first four principal components which had a cumulative contribution rate of 76.619%, five germplasms had excellent comprehensive performance (F>0.8) with 9 main phenotypic indices for germplasm evaluation. By further systematic cluster analysis, the germplasms were classified into 4 clusters between 8 and 11 in euclidean distance, including 6, 10, 4 and 1 germplasms respectively, which could be used to breed different varieties. In brief, 21 cherry tomato germplasms had rich genetic diversity, which would provide a reference for the resource utilization and variety breeding.

        Keywords ?cherry tomato; phenotypic trait; cluster analysis; genetic diversity

        DOI ?10.3969/j.issn.1000-2561.2019.06.009

        番茄(Solanum lycopersicum Mill.)為一年或多年生草本植物,原產(chǎn)南美洲厄瓜多爾至智利北部的安第斯山脈西麓太平洋沿岸,是世界重要園藝和經(jīng)濟(jì)作物。櫻桃番茄(Solanum lycopersicum Mill. var. cerasiforme Alef.)是番茄的一個(gè)變種,又名小西紅柿、圣女果,是一種水果型蔬菜,目前設(shè)施栽培廣泛,深受消費(fèi)者喜愛(ài)[1]。遺傳多樣性是作物品種改良及選育的基礎(chǔ),但櫻桃番茄屬自花授粉作物,經(jīng)歷了長(zhǎng)期的育種實(shí)踐,遺傳背景較為狹窄。因此,櫻桃番茄種質(zhì)研究與利用意義重大。

        表型是基因型與環(huán)境共同作用的結(jié)果,與分子標(biāo)記相比,具有經(jīng)濟(jì)、直觀等優(yōu)點(diǎn),是種質(zhì)鑒定評(píng)價(jià)等研究最基本的方法和最直接的途徑[2]。近年來(lái),分子標(biāo)記技術(shù)已用于櫻桃番茄種質(zhì)研究[3-4],表型性狀遺傳多樣性研究在葉用芥菜[5]、辣椒[6]、黃瓜[7]、苦瓜[8]、胡蘿卜[9]、番茄[10-11]、蘿卜[12]、甜瓜[13]等作物上也多見(jiàn)報(bào)道,但針對(duì)櫻桃番茄、特別是應(yīng)用多元統(tǒng)計(jì)法的相關(guān)研究較少。李軍等[14]對(duì)49個(gè)櫻桃番茄品種進(jìn)行遺傳多樣性分析,發(fā)現(xiàn)果實(shí)外觀、果穗性狀表現(xiàn)出不同程度的多樣性,其中6對(duì)性狀之間呈顯著正相關(guān),8對(duì)性狀呈顯著負(fù)相關(guān)。

        本研究以21份櫻桃番茄自交系為材料,通過(guò)對(duì)12個(gè)表型性狀的變異分析、主成分分析和聚類分析,研究其遺傳多樣性,以期為櫻桃番茄核心種質(zhì)篩選、利用及品種選育提供依據(jù)。

        1 ?材料與方法

        1.1 ?材料

        供試的21份櫻桃番茄種質(zhì),由溫州市農(nóng)業(yè)科學(xué)研究院茄果類蔬菜課題組收集整理,經(jīng)多年(6~13代)提純復(fù)壯、分離純化而來(lái),現(xiàn)已基本純合穩(wěn)定(表1)。

        1.2 ?方法

        各種質(zhì)于2018年2月22日播種于32孔穴盤(pán)中,3月25日定植于溫州市種子種苗科技園塑料大棚,雙行栽植,株行距為40 cm×80 cm,每份種質(zhì)定植20株,常規(guī)田間管理。

        按照《番茄種質(zhì)資源描述規(guī)范和數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)》[15]進(jìn)行始花節(jié)、花序間隔葉、節(jié)間長(zhǎng)、成熟果色、果面棱溝、商品果縱徑、商品果橫徑、果形、果梗洼大小、單果重、心室數(shù)、可溶性固形物等12個(gè)性狀的調(diào)查和數(shù)據(jù)采集。用直尺和游標(biāo)卡尺測(cè)量長(zhǎng)度,電子天平進(jìn)行稱重,折光儀測(cè)定可溶性固形物含量。

        1.3 ?數(shù)據(jù)處理

        采用Excel 2013軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)的基本處理與相關(guān)計(jì)算。Shannon多樣性指數(shù)H′=–∑PilnPi(Pi表示某性狀第i級(jí)樣品頻率)。數(shù)據(jù)采用離差標(biāo)準(zhǔn)化,用SPSS 16.0軟件進(jìn)行方差、主成分和聚類分析,用組間連接(類間平均距離)和歐氏距離繪制聚類圖。

        2 ?結(jié)果與分析

        2.1 ?不同表型性狀變異分析

        對(duì)21份櫻桃番茄種質(zhì)的12個(gè)表型性狀進(jìn)行方差分析,并基于LSD法進(jìn)行多重比較,結(jié)果見(jiàn)表2。除成熟果色、果面棱溝、心室數(shù)等少數(shù)性狀外,所用材料表型差異明顯,達(dá)到了顯著或極顯著水平。

        由表3可知,不同種質(zhì)在各表型性狀上存在較大差異,變異系數(shù)為14.97%~216.48%,表現(xiàn)出豐富的遺傳多樣性。變異系數(shù)由大到小依次為:果面棱溝>果梗洼大小>成熟果色>花序間隔葉>始花節(jié)>單果重>節(jié)間長(zhǎng)>心室數(shù)>商品果縱徑>果形>商品果橫徑>可溶性固形物,果面棱溝和果梗洼大小分別達(dá)216.48%和53.85%,果形、商品果橫徑和可溶性固形物均小于20%。各性狀多樣性指數(shù)為0.66~1.34,始花節(jié)和果梗洼大小較大,成熟果色、心室數(shù)和果面棱溝均小于1。說(shuō)明21份櫻桃番茄種質(zhì)表型差異明顯,絕大多數(shù)性狀具有較大的選擇潛力。

        2.2 ?不同表型性狀主成分分析

        通過(guò)對(duì)櫻桃番茄種質(zhì)12個(gè)表型性狀的計(jì)算,得到了其因子載荷矩陣,提取特征值大于1的前4個(gè)主成分,累計(jì)貢獻(xiàn)率達(dá)到了76.619%。由表4

        可知,第1主成分特征值為4.074,貢獻(xiàn)率為33.952%,果形、果梗洼大小、商品果橫徑、商品果縱徑、始花節(jié)和果面棱溝是主要指標(biāo),特征向量分別為0.916、–0.876、–0.845、0.646、0.645和0.517。第2主成分特征值為2.342,貢獻(xiàn)率為19.517%,單果重、成熟果色、心室數(shù)和始花節(jié)是主要指標(biāo),特征向量分別為0.698、0.614、0.569和0.564。第3主成分特征值為1.548,貢獻(xiàn)率為12.901%,可溶性固形物和果面棱溝是主要指標(biāo),特征向量分別為–0.668和0.522。第4主成分特征值為1.230,貢獻(xiàn)率為10.248%,花序間隔葉、節(jié)間長(zhǎng)和心室數(shù)是主要指標(biāo),特征向量分別為–0.738、0.577和0.505。前4個(gè)主成分主要包括果形、果梗洼大小、商品果橫徑、花序間隔葉、單果重、可溶性固形物、商品果縱徑、始花節(jié)、成熟果色等9個(gè)性狀,可作種質(zhì)評(píng)價(jià)的主要指標(biāo),且要注意果梗洼大小、可溶性固形物和花序間隔葉的影響。

        綜上,第1~4主成分基本保留了所有指標(biāo)信息,用4個(gè)變量Y1~Y4代替原來(lái)的12個(gè)指標(biāo),得出線性組合(其中x1~x12均為標(biāo)準(zhǔn)化后的變量):Y=∑cx(c:特征向量,x:性狀值)。同時(shí),以各貢獻(xiàn)率作權(quán)重,構(gòu)建綜合評(píng)價(jià)模型:F=0.33952Y1+0.19517Y2+0.12901Y3+0.10248Y4,應(yīng)用該模型計(jì)算不同種質(zhì)的綜合評(píng)價(jià)值F。由表5可知,139、100、52、152、57等5份材料綜合表現(xiàn)優(yōu)良(F>0.8)。

        2.3 ?不同種質(zhì)表型聚類分析

        在歐氏距離8~11之間,可將21份櫻桃番茄種質(zhì)聚為四類(圖1)。第Ⅰ類包含6份種質(zhì),主要表現(xiàn)為始花節(jié)位低、節(jié)間長(zhǎng),成熟果橘黃色、果肩部光滑無(wú)棱、果形高圓、單果重較小,可用于早熟、黃果品種選育;第Ⅱ類包含10份種質(zhì),占了聚類材料的47.6%,主要表現(xiàn)為成熟果紅到深紅、果肩部光滑、橫徑小、果形高圓、單果重小、可溶性固形物含量較高,可用于紅色小果型品種選育;第Ⅲ類包含4份種質(zhì),主要表現(xiàn)為節(jié)間短,成熟果粉紅色、果肩部有少數(shù)小淺棱、果形高圓、單果重較大、多心室,可用于粉果品種選育;第Ⅳ類僅含編號(hào)40這一份種

        3 ?討論

        運(yùn)用科學(xué)的研究方法對(duì)作物種質(zhì)進(jìn)行表型遺傳多樣性分析,可為優(yōu)異基因發(fā)掘和資源利用提供有利信息。本研究對(duì)21份櫻桃番茄種質(zhì)的12個(gè)表型性狀進(jìn)行了遺傳變異、主成分和聚類分析,發(fā)現(xiàn)不同種質(zhì)差異明顯,具有豐富的遺傳多樣性。結(jié)果可為育種中核心種質(zhì)篩選、親本選配、雜種優(yōu)勢(shì)利用及品種改良提供重要參考。

        3.1 ?21份櫻桃番茄的遺傳多樣性

        方差分析發(fā)現(xiàn)21份櫻桃番茄種質(zhì)的絕大多數(shù)表型性狀差異顯著或極顯著。變異系數(shù)是遺傳變異潛力大小的標(biāo)志,表示群體中直接選 ?擇的范圍。對(duì)21份櫻桃番茄種質(zhì)的12個(gè)表 ??型性狀分析發(fā)現(xiàn),變異系數(shù)最大達(dá)216.48%,最小為14.97%,平均42.09%,大于李軍等[14]的研究結(jié)果,說(shuō)明所用種質(zhì)表型差異明顯,具有豐富的遺傳多樣性。各性狀多樣性指數(shù)為0.66~1.34,但與變異系數(shù)所揭示的遺傳多樣性并非完全一致,如果面棱溝的變異系數(shù)達(dá)216.48%,但多樣性指數(shù)僅0.85,可能與取值及兩者所反映變異的角度不同有關(guān)[9]。絕大多數(shù)表型性狀具有較大的選擇潛力,可根據(jù)育種目標(biāo)進(jìn)行充分配組。

        3.2 ?12個(gè)表型性狀的主成分構(gòu)成

        將主成分分析用于種質(zhì)評(píng)價(jià)與篩選,既能把握綜合性狀表現(xiàn),又能簡(jiǎn)化程序、提高效率。將櫻桃番茄的12個(gè)表型性狀綜合為4個(gè)主成分,原性狀簡(jiǎn)化為9個(gè),反映了76.619%的信息量,主要涉及果實(shí)產(chǎn)量和外觀特征兩大因子,同時(shí)揭示了各性狀間的相互關(guān)系。在品種選育過(guò)程中,應(yīng)根據(jù)育種目標(biāo),適當(dāng)調(diào)整各主成分大小,且要注意果梗洼大小和花序間隔葉的影響。果肩部越光滑無(wú)棱,果實(shí)可溶性固形物含量是否越高,有待進(jìn)一步驗(yàn)證[10]。通過(guò)計(jì)算綜合評(píng)價(jià)值F,獲得5份綜合性狀優(yōu)良的材料(F>0.8)。

        3.3 ?21份櫻桃番茄的遺傳聚類

        聚類分析可探究不同種質(zhì)的起源、分布及親緣關(guān)系,根據(jù)遺傳距離進(jìn)行雜種優(yōu)勢(shì)預(yù)測(cè),在一定程度上減少雜交配組的盲目性[5]。本研究將21份櫻桃番茄種質(zhì)聚為四類,第Ⅰ類包含6份材料,可用于早熟、黃果品種選育;第Ⅱ類包含10份材料,可用于紅色小果型品種選育;第Ⅲ類包含4份材料,可用于粉果品種選育;第Ⅳ類僅含1份材料,可用于紅果高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)育種。經(jīng)主成分分析篩選的5份優(yōu)良種質(zhì)除52外均聚在第Ⅱ類。這些種質(zhì)表型差異較大,是豐富櫻桃番茄種質(zhì)和雜種優(yōu)勢(shì)利用的良好材料。

        表型性狀是田間育種工作最為直接的評(píng)價(jià)指標(biāo),實(shí)踐中應(yīng)針對(duì)不同育種目標(biāo)選擇具有代表性和穩(wěn)定性的性狀。表型性狀的遺傳變異、主成分和聚類分析,為在育種中合理利用雜種優(yōu)勢(shì)及品種改良提供了科學(xué)依據(jù)。但表型性狀易受環(huán)境影響,具有復(fù)雜和不穩(wěn)定的特點(diǎn),同時(shí),鑒于本研究在種質(zhì)材料和性狀指標(biāo)選擇上的局限性,需進(jìn)一步結(jié)合分子標(biāo)記輔助手段,增強(qiáng)種質(zhì)評(píng)價(jià)的準(zhǔn)確性。

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