常振宇,張亞楠,劉婕,丁麗華,劉榮
1.解放軍總醫(yī)院 肝膽外二科,北京 100853;2.軍事科學院 軍事醫(yī)學研究院 生物工程研究所,北京100850
胰腺癌是具有高度惡性的消化系統(tǒng)腫瘤,早期診斷困難,預后極差,總體五年生存率尚不足10%[1]。目前針對胰腺癌的治療手段相對有限,手術(shù)是惟一能達到根治性治療的手段,但僅有10%~15%的病人有機會進行手術(shù)治療,化療仍然是胰腺癌治療的主要手段[2]。以吉西他濱為基礎(chǔ)的方案是臨床上輔助、新輔助、局部晚期以及轉(zhuǎn)移性病變的一線化療方案,吉西他濱可以明顯改善胰腺癌患者的預后,但由于原發(fā)性和繼發(fā)性耐藥的發(fā)生,只有少部分病人能從化療中得到真正的臨床獲益[3]。
microRNA(miRNA)是一類短鏈非編碼RNA,長度為17~25個核苷酸,在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中起著重要的調(diào)控作用[4]。近期研究發(fā)現(xiàn)多種miRNA在腫瘤化療耐藥中也發(fā)揮重要功能,如miR-21在多種腫瘤中調(diào)控細胞對順鉑、紫杉醇、多柔比星等不同化療藥物的敏感性[5-7];miR-34a表達水平下調(diào)會導致結(jié)腸癌細胞對5-氟尿嘧啶的耐藥[8],在前列腺癌細胞中,miR-34a上調(diào)會增加耐藥細胞對紫杉醇的敏感性[9]。相關(guān)研究表明胰腺癌吉西他濱耐藥也同樣受miRNA所調(diào)控,miR-101-3p可以通過抑制核糖核苷還原酶調(diào)節(jié)因子1(RRM1)的表達,增加胰腺癌細胞對吉西他濱的敏感性[10];而miR-320c則可以通過SMARCC1誘導胰腺癌對吉西他濱耐藥[11]。目前多項研究顯示了miRNA與胰腺癌吉西他濱耐藥的相關(guān)性,但吉西他濱耐藥機制復雜,許多miRNA在其中的作用尚不明確,因此探索在耐藥調(diào)控中發(fā)揮功能的新的miRNA,有助于我們了解吉西他濱耐藥的原因,有可能為克服吉西他濱耐藥提供新的思路。
在本研究中,我們通過miRNA測序,篩選發(fā)現(xiàn)在胰腺癌吉西他濱耐藥細胞株中miR-451a表達水平明顯下調(diào),推測miR-451a可能在耐藥過程中發(fā)揮作用。因此,我們進一步通過體外細胞實驗和體內(nèi)動物實驗驗證了miR-451a在胰腺癌吉西他濱耐藥中的功能。
6周齡雌性BALB/c裸鼠購自北京維通利華公司;人胰腺癌細胞系CFPAC-1、PANC-1購自中國醫(yī)學科學院基礎(chǔ)醫(yī)學研究所細胞中心;DMEM、IMDM培養(yǎng)基購自Gibco公司;胎牛血清購自杭州四季青公司;吉西他濱購自上海陶素生化公司;轉(zhuǎn)染試劑RNAimax購自Themo Fisher公司;RNA抽提試劑TRI Reagent購自Sigma公司;反轉(zhuǎn)錄酶MMLV、實時熒光定量PCR試劑TB Green Premix購自TaKaRa公司;CCK8試劑盒購自日本東仁化學公司;細胞凋亡檢測試劑盒購自江蘇凱基生物公司;miR-451a類似物(細胞實驗用mimics和動物實驗用agomir)合成于蘇州吉瑪基因公司;反轉(zhuǎn)錄及qPCR引物由北京博邁德基因技術(shù)公司合成。
采用低濃度梯度遞增法。在CFPAC-1細胞的完全培養(yǎng)基中加入吉西他濱,起始藥物濃度為1 μmol/L,處理48 h后更換為不含藥物的完全培養(yǎng)基,培養(yǎng)48 h后重新加入藥物處理,1周后增加藥物濃度。藥物處理5個月后,在含低濃度(1 μmol/L)吉西他濱的培養(yǎng)基中培養(yǎng)并穩(wěn)定傳代10代以上,獲取耐藥細胞株(CFPAC-1 GemR),并利用細胞存活實驗鑒定耐藥效果。
收取目的細胞,用1×PBS清洗1次,加入TRI Reagent 1 mL吹打裂解,室溫靜置5 min,加入200 μL氯仿充分混勻,靜置 5 min,4℃、12 000 r/min離心15 min,可見分層,吸取上層液體至新的EP管中,加入400 μL異丙醇混勻,室溫靜置10 min,4℃、12 000 r/min離心10 min,可見RNA沉淀,去上清,依次用75%乙醇、無水乙醇清洗,室溫充分干燥后加入40 μL DEPC處理水溶解,Nanodrop測定RNA濃度及純度,電泳鑒定降解情況,質(zhì)量合格后用于下游反轉(zhuǎn)錄或測序。野生型CFPAC-1及耐藥細胞株的miRNA測序及數(shù)據(jù)分析由北京諾禾致源公司完成。
miRNA的反轉(zhuǎn)錄采用莖環(huán)法,通用莖環(huán)序列為GTCGTATCCAGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCA CTGGATACGAC。取RNA 2 μg、miRNA特異性反轉(zhuǎn)錄引物 0.5 μg,加水稀釋至16 μL,70℃結(jié)合 5 min后置于冰上,加入MMLV反轉(zhuǎn)錄酶和對應緩沖液、dNTP及RNase抑制劑,42℃反應1 h,95℃5 min滅活,得到cDNA第一鏈,稀釋至100μL,用于下游qPCR反應。miRNA特異性反轉(zhuǎn)錄引物見表1。
采用 20 μL qPCR 體系(TB Green Premix 10 μL,上、下游引物各 0.4 μL,cDNA 模板 9.2 μL),每組設3個重復孔,在Bio-Rad CFX96PCR儀上進行反應,下游引物為通用反向引物,U6作為內(nèi)參,用2-ΔΔCt法計算miRNA的相對表達量。
表1 miRNA特異性反轉(zhuǎn)錄引物
表2 qPCR引物
將CFPAC-1和PANC-1細胞接種于6孔板,轉(zhuǎn)染密度達50%~70%為宜。取7.5 μL RNAimax試劑,用無血清無雙抗的DMEM稀釋至150 μL;miRNA mimics(20 μmol/L)3 μL,無血清無雙抗的DMEM稀釋至150 μL;將稀釋后的轉(zhuǎn)染試劑和miRNA mimics充分混勻后室溫孵育5 min,逐滴加入細胞培養(yǎng)液中,48~72 h后收取細胞進行后續(xù)實驗。
將各組別細胞分別接種于96孔板,10 000/孔,細胞貼壁伸展后,將培養(yǎng)基更換為含不同濃度吉西他濱的完全培養(yǎng)基,各組各濃度分別設置3個重復孔,藥物處理48 h后將培養(yǎng)基更換為含10%CCK8的完全培養(yǎng)基,37℃溫箱孵育1~2 h,酶標儀測定D450nm值,以未加藥孔作為對照,計算細胞存活率。
將對照及miR-451a轉(zhuǎn)染組細胞接種于6孔板,加入吉西他濱(CFPAC-1 1 μmol/L;PANC-1 5 μmol/L)處理24 h后消化,重懸計數(shù)后接種于新的6孔板中,1500/孔,10~14 d后鏡下觀察克隆形成情況,多數(shù)克隆含有50個細胞以上時終止培養(yǎng),PBS清洗后加入4%多聚甲醛固定20 min,0.1%結(jié)晶紫染液染色20 min,自來水沖洗后自然風干,掃描圖像后用Image J統(tǒng)計克隆個數(shù)。
將對照及miR-451a轉(zhuǎn)染組細胞接種于6孔板,加入吉西他濱后處理48 h,用不含EDTA的胰酶消化、收集細胞,用AnnexinⅤ-FITC/PI凋亡檢測試劑盒進行染色,上機檢測凋亡情況。
將1×107PANC-1細胞接種于裸鼠右側(cè)腋窩皮下,10 d后形成肉眼可見的腫瘤后開始給藥,對照組僅給予吉西他濱,miR-451a治療組同時給予miR-451a agomir和吉西他濱。吉西他濱50mg/kg腹腔注射,每周2次;miR-451a agomir 10 nmol瘤內(nèi)注射,每周2次。3周后處死小鼠,解剖腫瘤,量取腫瘤體積。本實驗經(jīng)生物工程研究所實驗動物管理和使用委員會批準。
采用SPSS 21.0軟件進行統(tǒng)計學分析;連續(xù)變量用x±s表示,組間比較使用t檢驗;細胞存活曲線采用重復測量方差分析比較;生存資料采用Kaplan-Miere法繪制生存曲線,用Log-Rank檢驗分析差異。P<0.05認為差異具有統(tǒng)計學意義。
親本細胞株CFPAC-1和耐藥細胞株CFPAC-1 GemR在不同濃度吉西他濱作用下的細胞存活率如圖1A所示,CFPAC-1 GemR存活率高于其親本細胞株,說明耐藥細胞株對吉西他濱的敏感性明顯降低。將CFPAC-1和CFPAC-1 GemR進行miRNA測序,選取其中變化較明顯的miRNA用RT-PCR驗證,結(jié)果見圖1B,miR-451a在耐藥細胞株中的表達水平明顯下調(diào)。
圖1 耐藥細胞株鑒定及差異miRNA表達驗證
對照組和miR-451a過表達組用梯度濃度的吉西他濱處理,48 h后利用CCK8測定細胞存活情況,并繪制存活曲線。結(jié)果表明,在CFPAC-1(圖 2A)和 PANC-1(圖 2B)細胞中,轉(zhuǎn)染 miR-451a mimics后細胞存活率下降,說明miR-451a負向調(diào)控胰腺癌細胞吉西他濱耐藥。
圖2 miR-451a過表達影響胰腺癌細胞吉西他濱耐藥
對照組細胞和miR-451a過表達組細胞用同樣濃度的吉西他濱處理24 h后,接種于6孔板行克隆形成實驗,結(jié)果顯示,在CFPAC-1(圖3A)和PANC-1(圖3B)細胞中,轉(zhuǎn)染miR-451a mimics后克隆形成明顯少于對照組,表明miR-451a過表達使吉西他濱抑制細胞增殖的作用增強。
吉西他濱處理48 h后流式細胞檢測對照組和miR-451a過表達組的細胞凋亡情況,結(jié)果如圖4,miR-451a過表達組細胞凋亡比例高于對照,差異具有統(tǒng)計學意義。該結(jié)果提示,miR-451a對吉西他濱誘導的細胞凋亡有促進作用。
圖3 miR-451a過表達使吉西他濱抑制細胞增殖作用增強
圖4 miR-451a增強吉西他濱誘導細胞凋亡的作用
基于體外實驗結(jié)果,我們進一步在裸鼠體內(nèi)驗證了miR-451a對胰腺癌耐藥的調(diào)控作用。將PANC-1細胞注射裸鼠皮下成瘤后,給予吉西他濱治療,結(jié)果如圖5,miR-451a agomir給藥組的腫瘤體積明顯小于對照組,說明miR-451a增加了裸鼠體內(nèi)腫瘤對吉西他濱的敏感性。
圖5 miR-451a誘導裸鼠體內(nèi)腫瘤對吉西他濱敏感
從以上結(jié)果可以看出,miR-451a在胰腺癌細胞和裸鼠腫瘤中與胰腺癌吉西他濱耐藥相關(guān),我們進一步探究了miR-451a與胰腺癌病人預后的關(guān)系。利用在線工具Oncolnc調(diào)取腫瘤基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫中胰腺癌病人的生存資料和miR-451a表達水平,并進行Kaplan-Miere生存分析,結(jié)果表明,miR-451a表達水平較低的胰腺癌患者預后更差(圖6)。
圖6 miR-451a表達水平與胰腺癌患者預后的關(guān)系
胰腺癌惡性程度高、診斷治療困難、預后極差。2018年全球癌癥統(tǒng)計數(shù)據(jù)顯示,胰腺癌新發(fā)與死亡病例分別為458 918例和432 242例,是為數(shù)不多的死亡例數(shù)接近新發(fā)例數(shù)的癌癥之一[12]。目前治療手段的匱乏是預后差的主要原因。吉西他濱是少數(shù)對胰腺癌治療效果較好的化療藥物之一,但仍然存在顯著的耐藥問題,尋找新的治療靶標克服耐藥至關(guān)重要[2]。
miRNA作為具有多樣性和高度保守性的調(diào)節(jié)因子,在腫瘤耐藥中發(fā)揮重要的調(diào)控作用[4]。研究發(fā)現(xiàn)miRNA可以通過不同的通路調(diào)控胰腺癌對吉西他濱耐藥,如miR-34、miR-1246等可以通過腫瘤干細胞通路調(diào)節(jié)胰腺癌細胞對吉西他濱的耐藥性[13-14],miR-125b、miR-365 等則是通過凋亡通路調(diào)控胰腺癌吉西他濱耐藥[15-16]。本研究中我們構(gòu)建了胰腺癌耐藥細胞系作為吉西他濱耐藥的模型,對其進行了miRNA測序,并對測序結(jié)果中部分miRNA進行了表達水平驗證,發(fā)現(xiàn)miR-451a、miR-122-5p、miR-129-5p等多個 miRNA在耐藥細胞系中表達下調(diào),miR-1-3p、miR-206等多個miRNA在耐藥細胞系中表達上調(diào)。其中,miR-129-5p、miR-206有相關(guān)文獻報道與吉西他濱耐藥相關(guān),且變化趨勢與本研究一致[17-18]。
miR-451a位于染色體17q11.2,在多種腫瘤中表達異常[19]。多項研究表明miR-451a與腫瘤的發(fā)生發(fā)展相關(guān),在肺癌、乳腺癌、胃癌、結(jié)腸癌、膠質(zhì)瘤及白血病中均有報道,與多種腫瘤的復發(fā)、轉(zhuǎn)移和預后也有關(guān)系[20-22]。miR-451a與耐藥的相關(guān)性也有相關(guān)研究,在FLT3-ITD陽性的急性髓細胞白血病中,miR-451a可以逆轉(zhuǎn)細胞對化療藥物的耐藥[23];Liu等報道m(xù)iR-451a過表達可以增加乳腺癌細胞對他莫昔芬的敏感性[24]。在胰腺癌吉西他濱耐藥中miR-451a的功能尚無相關(guān)研究。我們發(fā)現(xiàn)在吉西他濱耐藥細胞株中miR-451a水平下調(diào)明顯,接下來探究了miR-451a在胰腺癌吉西他濱耐藥中的調(diào)控作用,發(fā)現(xiàn)在體外和裸鼠體內(nèi),miR-451a可以促進胰腺癌細胞對吉西他濱的敏感性。
miRNA主要通過與靶基因mRNA的3'非翻譯區(qū)(UTR)序列發(fā)揮轉(zhuǎn)錄后調(diào)控作用,通常一條miRNA可以調(diào)控多個基因。已證實的miR-451a靶基因有 ABCB1、AKT1、c-MYC、BCl-2等[25-27],其中許多基因都與多藥耐藥相關(guān)。因此,我們推測miR-451a可能通過這些基因調(diào)控胰腺癌細胞對吉西他濱耐藥,但須進行后續(xù)的篩選和驗證。
同時,我們對TCGA數(shù)據(jù)庫中胰腺癌患者生存資料進行了分析,發(fā)現(xiàn)miR-451a低表達與胰腺癌患者不良預后相關(guān)。由于數(shù)據(jù)庫臨床資料并沒有收集患者復發(fā)情況及化療史,所以并不能對miR-451a和吉西他濱耐藥的關(guān)系做具體分析,但從這個結(jié)果中可以推斷,miR-451a可能與胰腺癌的進展相關(guān)。
綜上,我們篩選了與吉西他濱耐藥相關(guān)的miRNA,并通過體外和動物實驗驗證了miR-451a在胰腺癌吉西他濱耐藥中的調(diào)控作用,有助于進一步解析胰腺癌吉西他濱耐藥產(chǎn)生的機制,為克服胰腺癌耐藥提供新的思路。