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        一種新型纖維蛋白原β鏈錯(cuò)義突變導(dǎo)致的遺傳性低纖維蛋白原血癥

        2019-06-03 07:11:36朱麗青張海月羅莎莎方薇薇劉斯奇蘇看看楊麗紅王明山
        關(guān)鍵詞:分析檢測(cè)

        朱麗青,張海月,羅莎莎,方薇薇,劉斯奇,蘇看看,楊麗紅,王明山

        (溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院 醫(yī)學(xué)檢驗(yàn)中心,浙江 溫州 325015)

        遺傳性纖維蛋白原缺陷癥(congenital fibrinogen deficiency,CFD)是一種少見(jiàn)的出血性疾病,分為I型和II型2 種類型。I型患者血漿中纖維蛋白原(fibrinogen,F(xiàn)g)數(shù)量減少,包括低纖維蛋白原血癥和無(wú)纖維蛋白原血癥;II型患者血漿中Fg數(shù)量正常,但出現(xiàn)功能缺陷,主要包括異常纖維蛋白原血癥和異常低纖維蛋白原血癥[1]。基因突變是導(dǎo)致CFD的分子基礎(chǔ),可發(fā)生于Fg Aα鏈、Bβ鏈和γ鏈,突變類型包括錯(cuò)義突變、移碼突變、無(wú)義突變及大片段缺失等[2]。本研究對(duì)1例遺傳性低纖維蛋白原血癥進(jìn)行了表型檢測(cè)和基因分析,并且運(yùn)用Swiss-PdbViewer等生物信息學(xué)工具對(duì)突變進(jìn)行預(yù)測(cè)分析,初步探討引起遺傳性低纖維蛋白原血癥的機(jī)制。

        1 對(duì)象和方法

        1.1 對(duì)象

        1.1.1 病例資料:先證者,女,30歲,此次因乳腺小葉增生來(lái)溫州醫(yī)科大學(xué)附屬第一醫(yī)院就診。術(shù)前常規(guī)凝血功能檢查發(fā)現(xiàn)凝血酶原時(shí)間(prothrombin time,PT)和凝血酶時(shí)間(thrombin time,TT)輕度延長(zhǎng),纖維蛋白原活性(fibrinogen activity,F(xiàn)g:C)和血漿纖維蛋白原的抗原(fibrinogen antigen,F(xiàn)g:Ag)明顯降低,分別為0.82 g/L和1.19 g/L,其他凝血指標(biāo)均無(wú)明顯異常,肝腎功能正常?;颊邿o(wú)訴鼻衄、出血難止、自發(fā)性出血等癥狀,亦無(wú)血栓病史。該家系的系譜圖見(jiàn)圖1。

        圖1 遺傳性低纖維蛋白原血癥家系圖

        1.1.2 正常對(duì)照:選取我院體檢中心150名健康體檢者為正常對(duì)照,用以排除基因多態(tài)性。其中男78名,女72名,年齡26~59(38.6±24.8)歲。健康對(duì)照確認(rèn)無(wú)肝腎功能疾病,無(wú)出血與血栓史,采樣前均已知情同意。

        1.2 方法

        1.2.1 儀器:STA-R全自動(dòng)凝血功能分析儀(法國(guó)STAGO公司)、Beckman Coulter LX20PRO全自動(dòng)生化分析儀(美國(guó)Beckman公司)、PCR擴(kuò)增儀(ABI Thermal cycler 2720,美國(guó)ABI公司)、凝膠電泳儀(上海BIO-RAD公司)、凝膠成像系統(tǒng)(上海天能公司)。

        1.2.2 引物:共包括29對(duì)引物(由上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬瑞金醫(yī)院檢驗(yàn)科王學(xué)鋒教授饋贈(zèng))[3],覆蓋了纖維蛋白原基因FGA、FGB、FGG所有外顯子及側(cè)翼序列和啟動(dòng)子區(qū),其基因序列分別為:GenBank M64982、M64983、M10014。

        1.2.3 試劑:常規(guī)凝血項(xiàng)目試劑盒為法國(guó)STAGO公司原裝配套試劑,F(xiàn)g:Ag檢測(cè)試劑盒購(gòu)自浙江伊利康生物技術(shù)有限公司,血液基因組DNA提取試劑盒及PCR擴(kuò)增試劑盒均購(gòu)自北京天根生化科技有限公司。

        1.2.4 樣本采集:本研究已通過(guò)本院倫理委員會(huì)批準(zhǔn),并已簽訂先證者及其家系成員的知情同意書(shū)。共采集該家系2代6名成員及正常對(duì)照組的外周血標(biāo)本,用109 mmol/L枸櫞酸鈉以1:9抗凝,3 000 r/min離心10 min后,上層血漿于2 h內(nèi)進(jìn)行凝血指標(biāo)檢測(cè);下層血細(xì)胞-40 ℃凍存,用于DNA抽提。

        1.2.5 凝血項(xiàng)目分析:在Stago-R全自動(dòng)血凝儀上檢測(cè)活化部分凝血活酶時(shí)間(activated partial thromboplastin time,APTT)、PT、TT、Fg:C、D-二聚體(D-dimer,D-D)和纖維蛋白(原)降解產(chǎn)物 (fibrinogen degradation product,F(xiàn)DP);Beckman Coulter LX20全自動(dòng)生化分析儀上檢測(cè)Fg:Ag。

        1.2.6 Fg突變位點(diǎn)篩查:用全血DNA抽提試劑盒提取先證者及其家系成員外周血DNA。PCR法擴(kuò)增先證者FGA、FGB、FGG基因所有外顯子及側(cè)翼序列和啟動(dòng)子區(qū)。PCR反應(yīng)總體積為50 μL,包括PCR Master Mix 25 μL、雙蒸水18 μL、DNA模板3 μL和上下游引物各2 μL。反應(yīng)條件為:94 ℃預(yù)變性5 min; 94 ℃ 30 s,56~60 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min; 30個(gè)循環(huán)后72 ℃延伸10 min。PCR產(chǎn)物經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳鑒定后,送上海桑尼生物科技有限公司測(cè)序分析(所用測(cè)序儀為ABI PRISM 3730)。測(cè)序結(jié)果用Chromas軟件與GeneBank中的相應(yīng)序列進(jìn)行比對(duì)(M64982、M64983、M10014),并對(duì)150名健康對(duì)照者進(jìn)行該位點(diǎn)檢測(cè),以排除基因多態(tài)性的可能。

        1.2.7 生物信息學(xué)分析:基于已知的Fg結(jié)構(gòu)模型(http://www.rcsb.org/pdb,PDB ID:1FZA),分別用Swiss-PDViewer、在線分析系統(tǒng)(http://www.uniprot.org/align)對(duì)突變蛋白的結(jié)構(gòu)、突變位點(diǎn)的保守性進(jìn)行預(yù)測(cè)分析。

        2 結(jié)果

        2.1 凝血指標(biāo)檢測(cè) 先證者PT和TT均輕度延長(zhǎng),F(xiàn)g:C和Fg:Ag明顯降低。先證者父親和兒子的Fg:C和Fg:Ag也均有不同程度降低,TT也延長(zhǎng),他們的D-D和FDP均在正常范圍;其他家系成員的Fg:C、Fg:Ag及相關(guān)凝血指標(biāo)均在正常范圍(見(jiàn)表1)。

        2.2 基因檢測(cè) 先證者FGB基因發(fā)現(xiàn)第3外顯子存在c.425T>G雜合突變(見(jiàn)圖2),導(dǎo)致Fg第121位亮氨酸被替換為精氨酸(Leu121Arg)。通過(guò)分析其家系成員,發(fā)現(xiàn)其父親和兒子FGB基因也攜帶有c.425T>G雜合突變。針對(duì)該突變位點(diǎn),我們對(duì)150名健康體檢者的相應(yīng)位點(diǎn)進(jìn)行篩查,均未發(fā)現(xiàn)該突變,排除了基因多態(tài)性的可能性。檢索突變數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.geht.org/databaseang/fibrinogen)及查閱文獻(xiàn)顯示:該突變類型為國(guó)際上尚未見(jiàn)報(bào)道的新突變。

        表1 先證者及其家系成員凝血指標(biāo)及表型檢測(cè)結(jié)果

        圖2 纖維蛋白原FGB 基因第3外顯子的測(cè)序結(jié)果

        2.3 Fg Leu121Arg突變蛋白的模型預(yù)測(cè)分析 Leu121 位于FgBβ鏈三股螺旋的初始部位,緊挨著卷曲螺旋結(jié)構(gòu)域,為非極性疏水氨基酸,當(dāng)突變?yōu)锳rg后,改變了氨基酸的極性。Swiss-PDViewer模型預(yù)測(cè)分析發(fā)現(xiàn),當(dāng)Leu121突變?yōu)锳rg后,在Arg121和Try117、Met118、Trp125之間新增了氫鍵(見(jiàn)圖3)。ClustalX-2.1-win軟件蛋白同源性分析發(fā)現(xiàn):Leu121在小鼠、人類、黑猩猩、犬、牛等多種脊椎動(dòng)物間有較高的保守性(見(jiàn)表2)。

        3 討論

        圖3 Leu121Arg突變模型分析

        Fg又稱為凝血因子I,由Aα、Bβ、γ 3條多肽鏈構(gòu)成,是血漿中含量最高的凝血因子,在凝血和止血過(guò)程中均起到了非常重要的作用。Fg的3條多肽鏈以對(duì)稱性二聚體(Aα、Bβ、γ)2的形式存在,分別由FGA、FGB、FGG3個(gè)獨(dú)立的基因編碼[4]。這3個(gè)基因的缺陷可導(dǎo)致Fg含量或(和)功能異常,分別導(dǎo)致遺傳性無(wú)纖維蛋白原血癥、遺傳性低纖維蛋白原血癥、遺傳性異常纖維蛋白原血癥及遺傳性異常低纖維蛋白原血癥[5]。目前已報(bào)道的位于Fg基因(FGA、FGB和FGG)的突變類型共有300余種,包括錯(cuò)義突變、無(wú)義突變、剪切突變以及移碼突變。這些突變主要發(fā)生在Aα鏈上,其次為γ鏈,而B(niǎo)β鏈最為少見(jiàn)。查閱突變數(shù)據(jù)庫(kù)(HGMD,http://www.hgmd.cf.ac.uk/ac/all.php),到目前為止,發(fā)生在Bβ鏈上的突變類型僅報(bào)道有97種,大都位于Bβ鏈的C端[6]。

        本研究中,我們發(fā)現(xiàn)1例位于β鏈三股螺旋初始部位的Leu121Arg錯(cuò)義突變,引起遺傳性低纖維蛋白原血癥:先證者Fg:C和Fg:Ag分別為0.82 g/L和1.19 g/L,其父親和兒子的Fg:C和Fg:Ag也明顯降低?;蚍治霭l(fā)現(xiàn):他們?cè)贔GB基因第3外顯子的425位均有T>G雜合突變,導(dǎo)致Leu121Arg錯(cuò)義突變。蛋白同源性分析顯示:Leu121在脊椎動(dòng)物中有較高的保守性,提示該位點(diǎn)對(duì)于Fg正常結(jié)構(gòu)和功能非常重要。Leu121Arg突變,有可能影響了Fg的結(jié)構(gòu),導(dǎo)致蛋白穩(wěn)定性下降。此外,PDViewer蛋白預(yù)測(cè)分析軟件發(fā)現(xiàn):非極性疏水氨基酸Leu121突變?yōu)闃O性氨基酸Arg121,一方面改變了氨基酸的疏水性;另一方面,導(dǎo)致Arg121和Try117、Met118、Trp125之間新增了氫鍵。因而,該突變有可能影響了突變蛋白的二級(jí)結(jié)構(gòu),導(dǎo)致其折疊、構(gòu)象及穩(wěn)定性改變,引起血漿Fg水平降低。

        查閱文獻(xiàn)和檢索Fg基因突變數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.geht.org/databaseang/fibrinogen)發(fā)現(xiàn),Leu121Arg為首次發(fā)現(xiàn)的新突變。Leu121位于Fg Bβ鏈三股螺旋的初始部位,緊挨Bβ鏈的卷曲螺旋結(jié)構(gòu)域。以往研究表明:Bβ鏈的合成被認(rèn)為是Fg合成組裝的限速步驟[6-7]。其中,卷曲螺旋結(jié)構(gòu)域?qū)τ贔g Aα、Bβ、γ鏈的正常組裝至關(guān)重要[8];而C端則與Fg分泌密切相關(guān)[6]。HANSS等[9]曾報(bào)道1例由Fg Met118Lys突變引起的低纖維蛋白原血癥,該突變因?yàn)楦淖兞税被針O性,導(dǎo)致Fg分子構(gòu)像發(fā)生改變,先證者伴有出血表現(xiàn)及流產(chǎn)病史。Leu121鄰近Met118,兩者均位于Bβ鏈毗鄰卷曲螺旋結(jié)構(gòu)域的區(qū)域,因此,我們推測(cè),Leu121Arg突變也有可能通過(guò)影響該結(jié)構(gòu)域的穩(wěn)定性,導(dǎo)致Fg的組裝異常,引起低纖維蛋白原血癥。

        綜上所述,本研究發(fā)現(xiàn)了一個(gè)位于B β 鏈Leu121Arg錯(cuò)義突變引起的遺傳性低纖維蛋白原血癥家系,該突變可能通過(guò)改變氨基酸極性,影響氫鍵形成等影響突變體的穩(wěn)定性,導(dǎo)致遺傳性低纖維蛋白原血癥。其具體機(jī)制有待進(jìn)一步的體外表達(dá)研究。

        表2 蛋白同源性分析結(jié)果

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