閔玉嬌,吳皓杰,王薈,潘子輝,邵啟祥
(1.江蘇大學(xué)醫(yī)學(xué)院免疫學(xué)與免疫學(xué)檢驗(yàn)教研室,江蘇 鎮(zhèn)江212013;2.江蘇大學(xué)生殖醫(yī)學(xué)科學(xué)研究院,江蘇 鎮(zhèn)江212001)
哺乳動(dòng)物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)信號(hào)途徑是普遍存在于細(xì)胞中的一條重要信號(hào)途徑,可調(diào)節(jié)細(xì)胞周期進(jìn)程、細(xì)胞增殖和代謝[1-2]。mTOR 激酶分為雷帕霉素敏感的mTORC1和雷帕霉素不敏感的mTORC2。mTOR和mLST8均存在于兩種mTOR激酶中,此外mTORC1中還包含Raptor、PRAS40等分子。研究表明,mTORC1在個(gè)體、組織和細(xì)胞的生長發(fā)育和退化中發(fā)揮重要作用[3]。mTORC1與T細(xì)胞的發(fā)育分化關(guān)系密切,胸腺上皮細(xì)胞(thymic epithelial cells,TECs)作為構(gòu)成胸腺微環(huán)境的重要組分對(duì)T細(xì)胞的發(fā)育有很大影響。本課題組前期研究發(fā)現(xiàn)mTORC1可能參與TECs的退化過程(未發(fā)表),本研究擬通過構(gòu)建Raptor shRNA慢病毒載體穩(wěn)定轉(zhuǎn)染小鼠胸腺上皮細(xì)胞系(mouse thymic epithelial cell line 1,mTEC1),敲降Raptor基因,觀察mTORC1在TECs中的作用,從而闡明TECs衰老和退化機(jī)制。
慢病毒載體質(zhì)粒pLKO.1-puro由上海交通大學(xué)醫(yī)學(xué)院、上海市免疫學(xué)研究所李斌教授惠贈(zèng);ps-PAX2及PMD2.0G慢病毒包裝質(zhì)粒為我院龔愛華教授贈(zèng)予;感受態(tài)DH5α細(xì)菌由本實(shí)驗(yàn)室杜鳳移老師饋贈(zèng);限制性內(nèi)切酶AgeⅠ和Eco RⅠ購自寶生物工程(大連)有限公司;膠回收試劑盒以及質(zhì)粒提取試劑盒為生工生物工程(上海)股份有限公司產(chǎn)品;DMEM培養(yǎng)液、胎牛血清和Lip2000為美國Thermo公司產(chǎn)品;牛血清白蛋白購自湖州英創(chuàng)生物科技有限公司;哺乳動(dòng)物蛋白抽提試劑RIPA購自上海碧云天生物技術(shù)有限公司;蛋白酶抑制劑混合物為瑞士Roche公司產(chǎn)品;抗磷酸化mTOR(phosphomTOR,p-mTOR)、抗mTOR、抗Raptor、抗磷酸化核糖體S6激酶(phospho-p70S6k,p-p70S6k)、抗核糖體S6激酶總蛋白(t-p70S6k)和HRP偶聯(lián)的羊抗兔IgG抗體均為美國CST公司產(chǎn)品;抗β-肌動(dòng)蛋白抗體為美國Santa Cruz公司產(chǎn)品;ECL檢測(cè)試劑盒為德國Merck公司產(chǎn)品。
從Sigma網(wǎng)站檢索Raptor基因的shRNA序列,并在其5′端和3′端分別加入AgeⅠ和Eco RⅠ限制性核酸酶切位點(diǎn)序列,具體序列如下:正義鏈,5′-CCGGGCCCGAGTCTGTGAATGTAATCTCGAGATT ACATTCACAGACTCGGGCTTTTTG-3′;反義鏈,5′-A ATTCAAAAAGCCCGAGTCTGTGAATGTAATCTCGA GATTACATTCACAGACTCGGG-3′;由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。
慢病毒載體質(zhì)粒pLKO.1-puro經(jīng)感受態(tài)DH5α細(xì)菌擴(kuò)增后,用限制性內(nèi)切酶AgeⅠ和EcoRⅠ進(jìn)行酶切,體系如下:AgeⅠ2.5μL,Eco RⅠ2.5μL,pLKO.1-puro 2.5μg,緩沖液5μL,以無菌雙蒸水補(bǔ)足至50μL。酶切反應(yīng)條件:37℃4 h。
將“1.4”產(chǎn)物行1%瓊脂糖凝膠電泳,并于長波紫外檢測(cè)儀中檢測(cè),切取目的位置相應(yīng)的條帶并稱重。按照生工生物工程(上海)股份有限公司膠回收試劑盒操作步驟進(jìn)行膠回收。
將Raptor基因shRNA目的片段的正義鏈與反義鏈1∶1混合,退火后按下述體系加樣,16℃連接過夜,將shRNA連接到膠回收的pLKO.1-puro載體中。體系如下:10×緩沖液2μL,pLKO.1-puro酶切純化載體1μL,Raptor shRNA目的片段16μL,T4連接酶1μL。
取“1.6”中連接產(chǎn)物1μL加入感受態(tài)DH5α中,輕輕混勻置于冰上孵育30 min;42℃孵育90 s,期間勿搖動(dòng)EP管;休克結(jié)束后迅速移至冰上,加入LB液體培養(yǎng)基400μL,于37℃搖床250 r/min擴(kuò)增2 h;4 000 r/min室溫離心4 min,棄去一半上清液后混勻,將菌液均勻涂布于含有氨芐西林的LB固體平板上,37℃培養(yǎng)16 h;然后挑取單個(gè)菌落接種于含有氨芐西林的LB液體培養(yǎng)基中,于37℃搖床250 r/min孵育過夜。
按照試劑盒說明書提取質(zhì)粒,送生工生物工程(上海)股份有限公司測(cè)序,分析shRNA序列(含AgeⅠ和Eco RⅠ兩個(gè)酶切位點(diǎn))是否正確,確認(rèn)是否成功構(gòu)建pLKO.1-puro-shRNA-Raptor載體。
將HEK-293T細(xì)胞接種于60 mm培養(yǎng)皿中,當(dāng)細(xì)胞生長至匯合度為70%且狀態(tài)良好時(shí),加入6μg質(zhì)粒進(jìn)行轉(zhuǎn)導(dǎo),即pMD2G、psPAX2和pLKO.1-puroshRNA-Raptor載體按質(zhì)量比1∶2∶3比例混勻,加入高糖DMEM至250 mL;同時(shí)另取高糖DMEM 232 mL,加入18μL Lip2000混勻,室溫靜置5 min;最后將含有質(zhì)粒的DMEM 加入至含有Lip 2000的DMEM中,混勻,室溫靜置20 min;加入到HEK-293T細(xì)胞培養(yǎng)皿中,補(bǔ)充培養(yǎng)基體系至3 mL,置于37℃,5% CO2培養(yǎng)箱培養(yǎng)8 h;棄培養(yǎng)液,加入3 mL含10%胎牛血清的無雙抗高糖DMEM繼續(xù)培養(yǎng)24 h;收集培養(yǎng)上清液,用0.22μm除菌濾器過濾,即為病毒懸液;同時(shí)將轉(zhuǎn)染的HEK-293T細(xì)胞更換新鮮培養(yǎng)基孵育24 h,再次收獲病毒懸液。將收獲的病毒懸液和含10%胎牛血清的DMEM以1∶1加入到匯合度為30%左右的mTEC1中,加入聚凝胺(5μg/mL)培養(yǎng)24 h;重復(fù)此步驟再次培養(yǎng)24 h后更換正常的無雙抗DMEM并加入嘌呤霉素(2~5 μg/mL)篩選穩(wěn)定感染的細(xì)胞。待細(xì)胞生長穩(wěn)定,完全抵抗嘌呤霉素后,收集部分細(xì)胞提取蛋白進(jìn)行免疫印跡法鑒定,另一部分繼續(xù)傳代培養(yǎng)。
將野生型mTEC1和穩(wěn)定感染shRNA-Raptor病毒的mTEC1以每孔2×105接種于6孔板,前者接種2孔,后者接種1孔,37℃5% CO2培養(yǎng)24 h,分別記作mTEC1組,shRNA-Raptor組。在其中1孔野生型mTEC1中以1∶1 000加入50μmol/L雷帕霉素,記作mTEC1-雷帕霉素組。繼續(xù)培養(yǎng)12 h,收集各組細(xì)胞提取蛋白;mTEC1-雷帕霉素組作為mTOR及其下游被抑制的陽性對(duì)照。
蛋白行SDS-PAGE,70 V 2 h;350 mA轉(zhuǎn)膜2 h;PVDF膜洗滌后用5% BSA封閉1 h;抗Raptor、mTOR、p-mTOR、p70S6k、p-p70S6k和內(nèi)參β-肌動(dòng)蛋白等一抗按說明書用封閉液按1∶1 000稀釋,4℃孵育過夜;TBST洗膜3次,每次10 min;加入HRP偶聯(lián)的羊抗兔IgG抗體(TBST稀釋,均為1∶10 000),室溫孵育1 h;TBST洗膜3次,每次10 min;采用ECL檢測(cè)試劑盒曝光檢測(cè)各蛋白表達(dá)情況并進(jìn)行灰度掃描,使用Graph-Pad Prism 5軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。
將野生型mTEC1與穩(wěn)定感染shRNA-Raptor病毒的mTEC1以每孔5 000個(gè)細(xì)胞的初始密度接種于12孔板,各接種7個(gè)復(fù)孔。每天各計(jì)數(shù)兩種細(xì)胞其中一個(gè)孔的細(xì)胞數(shù),計(jì)數(shù)7 d;重復(fù)3次。
將野生型mTEC1與穩(wěn)定感染shRNA-Raptor病毒的mTEC1以5 000個(gè)/孔接種于96孔板,5% CO237℃培養(yǎng)48 h,根據(jù)羅氏公司Tunel試劑盒說明書染色。主要步驟如下:棄去96孔板中培養(yǎng)基,PBS洗2次;每孔加100μL 4%低聚甲醛(pH=7.4),室溫固定20 min;PBS洗2次;加入新鮮配制的滲透液100μL置于冰上破膜10 min;PBS洗滌2次;將標(biāo)記溶液與酶濃縮液以9∶1比例混合,每孔加入50 μL,37℃孵育1 h;PBS洗滌2次,滴加1滴PBS置于熒光顯微鏡下觀察,陽性細(xì)胞可見綠色熒光。最后計(jì)算出陽性細(xì)胞比例。
所有實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)采用GraphPad Prism 5軟件行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,計(jì)量數(shù)據(jù)采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,3組間均數(shù)比較采用單因素方差分析,進(jìn)一步兩兩比較采用SNK-q檢驗(yàn);2組間均數(shù)比較采用t檢驗(yàn),以P<0.05判斷差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
pLKO.1-puro慢病毒載體經(jīng)酶切后,瓊脂糖凝膠電泳顯示在1 900 bp和7 000 bp左右處出現(xiàn)條帶,表明載體質(zhì)粒酶切成功。見圖1。
測(cè)序結(jié)果與插入的Raptor基因的shRNA序列5′-CCGGGCCCGAGTCTGTGAATGTAAT-CTCGAGATTACATTCACAGACTCGGGCTTTTTG-3′完全一致(第261~318位),表明成功構(gòu)建pLKO.1-puro-shRNARaptor載體。見圖2。
由圖3可見,與mTEC1組相比,shRNA-Raptor組Raptor蛋白、p-mTOR以及p-p70S6k表達(dá)量均明顯降低(P均<0.05);與mTEC1組相比,mTEC1-雷帕霉素組p-mTOR以及p-p70S6k表達(dá)量也明顯降低,但二者間Raptor蛋白表達(dá)差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。由此進(jìn)一步說明,shRNA-Raptor組pmTOR以及p-p70S6k表達(dá)降低是由Raptor基因抑制造成的。
圖1 p LKO.1-puro載體酶切電泳鑒定
圖2 pLKO.1-puro-shRNA-Raptor載體鑒定
圖3 免疫印跡檢測(cè)各組細(xì)胞相關(guān)蛋白的表達(dá)
如圖4所示,mTEC1-shRNA-Raptor和mTEC1培養(yǎng)7 d,2種細(xì)胞同一天的細(xì)胞數(shù)間差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P均>0.05)。
圖4 mTEC1-shRNA-Raptor和mTEC1細(xì)胞計(jì)數(shù)
如圖5所示,mTEC1-shRNA-Raptor和野生型mTEC1細(xì)胞Tunel試驗(yàn)陽性率均很低,二者差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(t=1.27,P>0.05),表明2種細(xì)胞正常培養(yǎng)時(shí)很少發(fā)生凋亡。由此說明,Raptor基因敲降并不引起mTEC1明顯的凋亡。
圖5 mTEC1與mTEC1-shRNA-Raptor細(xì)胞Tunel試驗(yàn)陽性率比較
自噬是細(xì)胞清除其損傷的細(xì)胞器或錯(cuò)誤折疊蛋白的重要方式。自噬減弱時(shí),細(xì)胞內(nèi)錯(cuò)誤折疊的蛋白堆積,導(dǎo)致細(xì)胞衰老死亡。mTOR信號(hào)通路是細(xì)胞內(nèi)重要的信號(hào)通路,其可抑制自噬[4]。大量文獻(xiàn)報(bào)道,mTOR活化增加可致細(xì)胞衰老和退化[5-9]。胸腺是機(jī)體最重要的中樞免疫器官,TECs是胸腺中最為重要的基質(zhì)細(xì)胞之一,是胸腺微環(huán)境的重要組成部分。本實(shí)驗(yàn)室研究發(fā)現(xiàn),隨著小鼠年齡的增長,胸腺mTOR表達(dá)上調(diào)(未發(fā)表)。為進(jìn)一步研究mTOR在TECs退化中的作用,本研究通過建立mTORC1與下游作用的重要分子Raptor基因穩(wěn)定敲降的mTEC1細(xì)胞,成功構(gòu)建Raptor基因的pLKO.1-puro-shRNA慢病毒質(zhì)粒,并成功感染mTEC1。免疫印跡結(jié)果表明,轉(zhuǎn)染后的mTEC1-shRNA-Raptor細(xì)胞Raptor和p-mTOR以及p-p70S6k蛋白表達(dá)水平明顯降低,說明已成功構(gòu)建Raptor基因敲降的mTEC1細(xì)胞系。mTOR參與細(xì)胞的增殖和凋亡,本實(shí)驗(yàn)采用連續(xù)計(jì)數(shù)法以及Tunel法檢測(cè)細(xì)胞增殖與凋亡,結(jié)果顯示,Raptor基因的敲降并不影響mTEC1增殖和凋亡。Foxn1是轉(zhuǎn)錄叉頭因子家族成員,在胸腺發(fā)育中起重要作用。已有文獻(xiàn)報(bào)道,敲除mTORC1/Raptor并不會(huì)引起胸腺的明顯萎縮和胸腺細(xì)胞的凋亡,只有聯(lián)合敲除Foxn1后,胸腺才發(fā)生明顯的退化和萎縮[10]。本實(shí)驗(yàn)結(jié)果也證明這一點(diǎn)。盡管mTORC1信號(hào)通路參與細(xì)胞的生長增殖,但其對(duì)mTEC1的作用還未闡明,在胸腺退化過程中mTOR信號(hào)和Foxn1之間以何種方式發(fā)揮作用,尚有待深入研究。