《廣州中醫(yī)藥大學學報》在2018年版《中國期刊引證報告》中基金論文比為0.64；核心影響因子為0.734；核心綜合評價總分為55.80，在“中醫(yī)藥類高校學報”中列第3位。在2018年版《中國學術期刊影響因子年報（自然科學與工程技術）》中基金論文比為0.78；復合影響因子1.381，在“中醫(yī)學和中藥學類”123種刊源中列第15位。