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        貴州地區(qū)非阻塞性無精癥與SIRPA-SIRPG基因rs6080550多態(tài)性的相關性**

        2019-03-12 02:34:00王嬋娟王治海禹文峰官志忠
        貴州醫(yī)科大學學報 2019年2期
        關鍵詞:精癥多態(tài)性基因型

        王嬋娟,何 燕,張 婷,王治海,禹文峰,官志忠,安 宇

        (1.貴州醫(yī)科大學 地方病與少數(shù)民族疾病教育部重點實驗室,貴州 貴陽 550004;2.貴州省醫(yī)學分子生物學重點實驗室,貴州 貴陽550004;3.貴州省人民醫(yī)院中心實驗室,貴州貴陽 550002)

        我國孕齡期夫妻不孕不育的發(fā)生率大約為15%~20%,因男方因素導致的不孕不育約為50%,其中無精癥是造成男子不育的重要原因之一,約占不育男性的15%[1]。無精癥可分為阻塞性無精癥(obstructive azoospermic,OA)和非阻塞性無精癥(non-obstructive azoospermic,NOA),其中非阻塞性無精癥是指男性睪丸生精細胞發(fā)生萎縮退化不能產(chǎn)生精子[2]。已有研究顯示男性非阻塞性無精癥中精子的生成障礙與Y染色體微缺失、X染色體與常染色體的基因突變以及減數(shù)分裂遺傳重組缺陷有關[3-4],隨著芯片技術的發(fā)展,全基因組關聯(lián)研究(Genome-wide association study,GWAS)成為一種有效的研究復雜疾病發(fā)病基因及其位點的手段,它主要通過對大樣本人群DNA樣本進行全基因組高密度單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)位點分型,從而揭示與疾病發(fā)生相關的遺傳位點[5]。目前已有少數(shù)研究通過GWAS找到了一些可能與非阻塞性無精癥相關的基因區(qū)域,并在后續(xù)相關的SNP與非阻塞性無精癥的相關研究中探討這些SNP與無精癥的關聯(lián)[6],信號調(diào)節(jié)蛋白α(SIRPA)和信號調(diào)節(jié)蛋白γ(SIRPG)蛋白編碼區(qū)則是其中之一,已有的研究表明 SIRPA和SIRPG蛋白編碼區(qū)的突變和無精癥風險性相關,rs6080550(C/T)則是其中一個多態(tài)位點;SIRP是信號調(diào)節(jié)蛋白家族,是受體膜上的糖蛋白,參與了負向調(diào)節(jié)受體酪氨酸激酶的級聯(lián)過程,但其基因在精子生成中的作用目前尚未見報道。本研究選取rs6080550作為研究靶點,以貴州地區(qū)非阻塞性無精癥患者和正常男性健康對照人群為研究對象,探討該位點的多態(tài)性與貴州非阻塞性無精癥的相關性,以期為貴州人群非阻塞性無精癥的診斷及預防提供理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 對象

        在知情同意的原則下隨機選取臨床確診的非阻塞性無精癥患者145例[(46.5±20.2)歲]及正常男性健康體檢人群174例[(48.3±12.9)歲],分為疾病組及對照組。疾病組平均不育年限4.5年,臨床檢查已排除精索靜脈曲張、生殖道梗阻、隱睪、附睪損傷等其他泌尿生殖系統(tǒng)疾患,且無特殊病史及家族史,經(jīng)精液檢查,均確診為非阻塞性無精癥。

        1.2 試劑與儀器

        人基因組rs6080550(C/T)SNP位點TaqMan探針分型試劑盒(TaqMan SNP Genotyping Assays,美國應用生物系統(tǒng)公司),TaqMan Genotyping Master Mix(美國應用生物系統(tǒng)公司),NanoDropTMLite分光光度計(美國Thermo Fisher公司,ABI stepone Plus Real-time PCR儀(美國應用生物系統(tǒng)公司)。

        1.3 基因組DNA提取及定量

        對研究人群全血采用酚/氯仿抽提法抽提基因組DNA,NanoDropTMLite分光光度計測量DNA的濃度及純度,將每個DNA樣本統(tǒng)一稀釋成濃度為20μg/L的應用液。

        1.4 SIRPA-SIRPG基因rs6080550(C/T)SNP位點基因分型

        對研究人群采用人基因組rs6080550(C/T)SNP位點TaqMan探針分型試劑盒進行基因分型,ABI Stepone Plus Real-time PCR儀進行PCR擴增。PCR擴增總體積10μL,包含2×TaqMan Genotyping Master Mix 5 μL、40×TaqMan SNP Genotyping Assay Mix 0.25 μL、DNA 模板 1.5 μL、ddH2O 3.25 μL。PCR反應條件為:95℃熱變性10 min,92℃變性15 s,60℃退火1 min,共30個循環(huán)。使用StepOne Software v2.1軟件,讀取熒光信號,通過X、Y軸散點圖分析及測序結(jié)果確定樣本的基因型。

        1.5 統(tǒng)計學分析

        采用SPSS17.0統(tǒng)計軟件處理數(shù)據(jù),直接計數(shù)法統(tǒng)計位點的基因型頻率和等位基因頻率,組間基因型頻率和等位基因頻率比較采用χ2檢驗,設定P<0.05時差異有統(tǒng)計學意義。

        2 結(jié)果

        2.1 SIRPA-SIRPG基因rs6080550位點基因型及等位基因頻率

        對照組人群基因型頻率分布符合Hardy-Weinberg平衡(P=1.0)。疾病組及對照組基因型與等位基因頻率分布的卡方檢驗結(jié)果如表1所示。rs6080550(C/T)基因型及等位基因頻率分布,在疾病組與對照組比較差異具有統(tǒng)計學意義(P<0.05)。疾病組TT基因型及T等位基因頻率均顯著高于對照組(P<0.05)。

        表1 SIRPA-SIRPG基因rs6080550基因型和等位基因頻率分布(n,%)Tab.1 Frequency distribution of rs6080550 genotypes and alleles in SIRPA-SIRPG gene

        2.2 SIRPA-SIRPG基因rs6080550位點基因型頻率與非阻塞性無精癥的患病風險

        SIRPA-SIRPG基因rs6080550位點基因型頻率與非阻塞性無精癥的相關性分析見表2。基因型頻率結(jié)果顯示rs6080550(T/T)增加人群中的非阻塞性無精癥患病風險,OR=13.52,P<0.05。

        表2 rs6080550基因型頻率與非阻塞性無精癥患病風險的關系Tab.2 Relationship between rs6080550 genotype frequency and risk of non-obstructive azoospermia

        3 討論

        男性非阻塞性無精癥的主要原因是精子生成障礙,精子發(fā)生是精原細胞相繼分化成初級精母細胞、次級精母細胞及精子細胞,并最終形成成熟精子的過程,任何一個環(huán)節(jié)出現(xiàn)異常都可能導致精子發(fā)生停滯,從而導致無精癥。目前已有的研究顯示男性非阻塞性無精癥中精子的生成障礙與Y染色體微缺失、Y染色體gr/gr缺失、X染色體與常染色體的基因突變以及減數(shù)分裂遺傳重組缺陷有關[3-4]。

        SNP是指在基因組水平上由單個核苷酸的變異所引起的DNA序列多態(tài)性,它是人類可遺傳的變異中最常見的一種。據(jù)研究揭示,與精子發(fā)生相關的基因大約有2 300多個[7],而基因異常通常被認為是非阻塞性無精癥的一個主要風險因素[8],一直以來關于精子發(fā)生相關的基因如FKBP6、蛋白質(zhì)精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶(PRMT6)、過氧化體生物合成因子10(PEX10)、轉(zhuǎn)錄因子SOX5(SOX5)、芳香化酶19(CYP19)等基因的SNP多態(tài)性與非阻塞性無精癥相關的研究報道層出不窮[9-13]。大量研究致力于通過現(xiàn)代測序技術和大規(guī)模的基因芯片技術尋找導致非阻塞性無精癥新的易感基因,但是,超過50%的無精癥的致病因素仍未可知[14]。

        近年來,GWAS為非阻塞性無精癥與易感基因SNP多態(tài)性的研究提供了更好的依據(jù),南京醫(yī)科大學胡志斌教授團隊在Nature Genetics上發(fā)表了一篇在中國人群中和非梗阻性無精癥相關的GWAS研究文章,研究中選取1 000例無精癥病人和1 703例對照對906 703 SNPs進行了分析,鎖定了一些與非阻塞性無精癥可能關聯(lián)的基因區(qū)域和位點[6],SIRPA-SIRPG基因 6080550(C/T)即是其中之一。本次研究選擇貴州地區(qū)人群,在貴州非阻塞性無精癥患者和正常男性健康體檢人群共319例樣本中對GWAS報道的SIRPA-SIRPG基因rs6080550(C/T)進行了進一步的驗證分析,探討該位點的多態(tài)性與非阻塞性無精癥的相關性,為貴州人群非阻塞性無精癥的診斷及預防干預提供一定的理論依據(jù)。

        本次結(jié)果顯示rs6080550基因型分布在非阻塞性無精癥疾病組和對照組中差異有統(tǒng)計學意義,疾病組rs6080550(TT)基因型頻率顯著高于對照組,該位點T等位基因頻率在疾病組中的分布也明顯高于對照組。同時,對該位點3種基因型患病風險OR值的評估中,rs6080550(TT)基因型OR值為13.52,遠大于1(P<0.05),結(jié)果顯示攜帶TT基因型可能增加非阻塞性無精癥的患病風險,可能是疾病的危險因素。對比目前國內(nèi)外對該位點的研究,日本曾對490例非阻塞性無精癥患者及對照進行了基因分型分析,所得結(jié)果顯示rs6080550位點基因的多態(tài)性與無阻塞性無精癥并沒有顯著相關性,rs6080550位點多態(tài)性并非無精癥的危險因素(OR=0.96)[15];國內(nèi)上海交通大學醫(yī)學院也對胡志斌教授團隊報道的位點進行了驗證實驗,也未得到SIRPA-SIRPG基因6080550(C/T)位點與非阻塞性無精癥相關的結(jié)果[16]。而本次對貴州人群的研究得到的結(jié)果與GWAS研究結(jié)果一致,rs6080550基因多態(tài)與非阻塞性無精癥相關。鑒于目前對該位點研究結(jié)果存在的爭議,可能需要更大的獨立集合的病例對照樣本進行進一步研究,對結(jié)果的確定可能還需要更大的人群樣本作為分析基礎。

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