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        基于二代小波算法的數(shù)字全息顯微成像自動對焦方法

        2019-03-05 10:23:16,,,
        計算機(jī)測量與控制 2019年2期
        關(guān)鍵詞:全息圖全息對焦

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        (浙江工業(yè)大學(xué) 信息工程學(xué)院,杭州 310023)

        0 引言

        全息術(shù)由Gabor在1948年首次提出,1967年Goodman和Lawrence提出采用計算機(jī)重建全息圖的思想。經(jīng)過多年的發(fā)展,數(shù)字全息術(shù)的特殊優(yōu)點使其在最近幾年成為國際研究的重要領(lǐng)域之一[1]。目前,數(shù)字全息術(shù)已廣泛應(yīng)用于各個方面,如微小距離計量[3-4]、微生物研究[5]、粒子分析[6]、存儲、加密等,其中,數(shù)字全息顯微成像技術(shù)也成為數(shù)字全息術(shù)[7]的重要應(yīng)用之一。

        最佳重建距離是獲取最優(yōu)全息重建圖像的重要參數(shù)之一,傳統(tǒng)手動輸入重建距離的方式不僅效率低,而且因為難以獲得準(zhǔn)確的重建距離而導(dǎo)致不能獲取最佳重建圖像。近些年來,數(shù)字全息顯微自動對焦技術(shù)已獲得廣泛關(guān)注,基于圖像清晰度評價函數(shù)的數(shù)字全息顯微對焦技術(shù)是目前應(yīng)用的主要對焦技術(shù)之一。圖像清晰度評價函數(shù)大致可分為以下幾類:基于空間特征的評價函數(shù),如灰度方差法、拉普拉斯算子等;基于頻域特征的評價函數(shù),如傅里葉變換、離散余弦變換等;基于信息熵的評價函數(shù)等[8]。然而這些傳統(tǒng)算法對于數(shù)字全息圖的評價存在很多問題,如全息圖的噪點影響等可能讓算法失效,無法準(zhǔn)確找到最佳重建點。因此,本文提出一種基于二代小波[9]的數(shù)字全息顯微成像自動對焦方法,利用此方法可以自動尋找最佳對焦點,獲取全息圖的最優(yōu)重建效果。

        近年來,嵌入式產(chǎn)品由于體積小和使用方便等原因被廣泛使用,且部分嵌入式產(chǎn)品已被應(yīng)用于國防、工業(yè)、通信等多個領(lǐng)域[10]。因此,數(shù)字全息顯微成像技術(shù)的便攜化也是目前數(shù)字全息顯微技術(shù)發(fā)展的重要目標(biāo)之一。如何將基于PC平臺的傳統(tǒng)算法移植到嵌入式平臺,同時具有較好的重建速度也是目前研究的主要方向之一。因此,本文提出一種基于OPENCV和FFTW庫的角譜算法,結(jié)合同軸全息光路和嵌入式處理平臺實現(xiàn)嵌入式平臺上的數(shù)字全息顯微重建。

        1 系統(tǒng)結(jié)構(gòu)及原理

        數(shù)字全息顯微系統(tǒng)由硬件和軟件兩大部分組成,其中硬件部分主要完成全息圖的采集、計算、結(jié)果顯示、用戶交互等工作;軟件部分則利用基于OPENCV和FFTW庫的角譜算法結(jié)合二代小波圖像評價算法對全息圖進(jìn)行全息重建和圖像評價處理,實現(xiàn)全息圖的自動對焦重建。

        1.1 系統(tǒng)結(jié)構(gòu)

        全息圖是由參考光與物光干涉而產(chǎn)生,因此全息圖中包含了物體的全部信息。全息圖由圖像傳感器記錄,從而獲取全息圖的數(shù)據(jù)。如圖1所示,該系統(tǒng)主要包括三個部分:光路采集、計算處理和顯示交互。

        數(shù)字全息光路包括同軸與離軸兩種,相比于離軸全息,同軸全息因為具有光路更加簡單,能夠較好的微型化等優(yōu)點,所以更加適用于數(shù)字全息顯微技術(shù)的便攜化應(yīng)用。因此,本系統(tǒng)選擇采用同軸全息光路,如圖2所示,同軸全息光路主要是利用光源的相干性,當(dāng)相干光透過物體時,一部分直接透過物體為參考光,另一部分在物體上發(fā)生衍射形成物光,兩種光發(fā)生干涉形成全息圖,從而被圖像傳感器CMOS記錄,本系統(tǒng)采用650nm部分相干紅色LED作為光源,利用200um微孔增加其相干性,為了獲取更加清晰的圖像,采用1.4um像元尺寸的CMOS傳感器作為圖像傳感器。

        圖1 系統(tǒng)結(jié)構(gòu)圖

        圖2 同軸光路圖

        在計算處理部分采用TI公司的AM335X處理器作為處理核心,該處理器最高主頻為1G赫茲,同時配合Linux嵌入式操作系統(tǒng)完成整個處理過程。顯示交互部分采用7寸液晶屏和觸摸屏配合,通過LCD總線和I2C總線實現(xiàn)數(shù)據(jù)與AM335X的通信,完成整個采集、處理和顯示過程。整體裝置框架如圖3所示。

        圖3 自制數(shù)字全息顯微系統(tǒng)框架圖

        圖像傳感器獲取到全息圖后利用USB串行數(shù)據(jù)總線將數(shù)據(jù)傳輸給嵌入式處理器AM335X,AM335X獲取到全息圖數(shù)據(jù)后利用OPENCV和FFTW配合優(yōu)化后的角譜算法對全息圖進(jìn)行重建,然后利用圖像質(zhì)量評價函數(shù)對重建后的圖像進(jìn)行評價,找到最佳重建點,最后將最佳重建圖像通過LCD總線輸出到LCD顯示屏進(jìn)行顯示。

        1.2 全息原理

        全息技術(shù)是利用相干光的特性,結(jié)合圖4所示,一部分相干光照射待記錄的物體形成物光波,另一束直接照射在干板上形成參考波,參考波與物光波在圖像傳感器上進(jìn)行干涉,從而形成包含物體振幅和相位信息的全息圖。此時,由圖像傳感器記錄,并保存物體的原本全部信息。

        圖4 全息原理示意圖

        數(shù)字全息重建就是利用計算機(jī)模擬光路,還原物體原始信息的方法[11-12],由傅里葉逆變換可知光場與其角譜[13-14]之間的關(guān)系為:

        (1)

        即F(fx,fy)為光場f(x,y)的角譜,由此可得:

        (2)

        將F(fx,fy)用方向余弦表示:

        (3)

        根據(jù)標(biāo)量波動方程,任一平面光場可看做無數(shù)組傳播方向不同,幅值不同的平面波疊加而成。因此得到角譜之間的關(guān)系:

        (4)

        由上面的式子可知,角譜與其光場的關(guān)系為傅里葉變換的關(guān)系,則角譜重建算法得到的再現(xiàn)像光場的復(fù)振幅分布為:

        U(x,y)=F-1{F[U0(x,y)]GAS(fx,fy)}

        (5)

        其中:U0(x,y)為實際記錄時的全息圖,GAS(fx,fy)為計算機(jī)需要模擬的傳遞函數(shù),公式為:

        (6)

        從式(5)、(6)可知,數(shù)字全息顯微重建需要的輸入?yún)?shù)包括:圖像傳感器記錄的全息圖U0(x,y),參考波的波長,圖像傳感器像素尺寸和,重建距離。

        重建距離代表物體實際距離圖像傳感器的距離,因此只有當(dāng)重建距離等于實際重建距離時,才會得到最清晰的重建像,但由于這個距離一般小于1 mm,難以測量,實際重建過程中難以獲得。因此,本文提出利用圖像質(zhì)量評價函數(shù)完成數(shù)字全息顯微自動對焦,從而獲取最佳重建距離以及重建物像的方法。

        2 數(shù)字全息顯微自動對焦方法

        鑒于重建距離Z值難以獲得的情況,本文提出基于二代小波算法的數(shù)字全息顯微成像自動對焦方法。該方法是利用圖像質(zhì)量評價函數(shù)對重建后的全息圖進(jìn)行評價,根據(jù)評價結(jié)果進(jìn)行最佳重建距離Z值的確定,從而獲得最佳重建效果。經(jīng)過對比幾個傳統(tǒng)圖像質(zhì)量評價方法,實驗證明二代小波圖像質(zhì)量評價方法更加適用于數(shù)字全息顯微重建后的圖像質(zhì)量評價,能夠準(zhǔn)確獲取最佳重建點。

        2.1 常用圖像質(zhì)量評價函數(shù)

        圖像質(zhì)量評價函數(shù)是通過對圖像的像素之間的關(guān)系進(jìn)行相關(guān)計算,從而判斷該圖片質(zhì)量的好壞。當(dāng)圖像清晰時,圖像細(xì)節(jié)更加豐富,在時域的表現(xiàn)為像素之間的特征值變化較大,在頻域的表現(xiàn)為高頻分量更多,經(jīng)過大量的研究,國內(nèi)外學(xué)者提出了許多清晰度評價方法,其中比較經(jīng)典的有灰度方差法、Laplacian函數(shù)、Tenengrad能量梯度法等。

        2.1.1 灰度方差法

        圖像越清晰,邊緣越明顯,對應(yīng)的灰度方差值也就越大,因此,圖像的清晰度可用灰度方差法來表示,灰度方差公式如下:

        (7)

        2.1.2 Laplacian函數(shù)

        Laplacian函數(shù)采用二階微分的Laplacian算子與圖像進(jìn)行卷積,然后取結(jié)果的梯度平方和用來評價圖像清晰度,其表達(dá)式為:

        (8)

        其中:G(x,y)=f(x,y)?L,L為卷積核。

        2.1.3 Tenengrad函數(shù)

        Tenengrad函數(shù)是一種基于梯度的圖像評價函數(shù),圖像越清晰,具有更加尖銳的邊緣,因而具有更大的梯度函數(shù)值。Tenengrad函數(shù)是使用Sobel算子提水平和垂直方向的梯度值進(jìn)行評價,其表達(dá)式為:

        (9)

        其中:Gx、Gy為Sobel算子的卷積核。

        2.2 二代小波

        二代小波是由Sweldens[15]等人在1994年提出,當(dāng)時其提出一種在時域中構(gòu)建第二代小波變換的方法。二代小波的顯著優(yōu)點是提高了小波變換的速度,其不需要傅里葉變換,放棄了二進(jìn)平移和伸縮的條件,速度約為傳統(tǒng)小波變換的2倍,同時還具有第一代小波的全部優(yōu)點。此外,其整個運(yùn)算不需要額外的輔助存儲內(nèi)存,非常適用嵌入式平臺內(nèi)存資源缺乏的情況。

        2.2.1 二代小波原理

        二代小波通過三個步驟來實現(xiàn)高頻與低頻的分離,分別為分裂、預(yù)測和更新[16]。

        步驟1:分裂(split)

        分裂過程是將原始圖像Sj分解成奇數(shù)集和偶數(shù)集兩個部分,奇數(shù)集Sj,2l+1為原始圖像奇數(shù)位置的值的集合,偶數(shù)集Sj,2l為原始圖像偶數(shù)位置的值的集合,如下式所示:

        Sj=(偶數(shù)集,奇數(shù)集)=(Sj,2l,Sj,2l+1)

        (10)

        步驟2:預(yù)測(predict)

        預(yù)測部分是利用數(shù)據(jù)間的相關(guān)性用偶數(shù)部分的值去預(yù)測奇數(shù)部分的值,主要過程為利用預(yù)測算子p結(jié)合偶數(shù)集中的值去預(yù)測奇數(shù)集中的值,然后對比奇數(shù)集中的值與預(yù)測值之間的差值,得到差值dj-1,該差值就是原始信號經(jīng)過小波變換后的高頻部分,如下式所示:

        dj-1=sj,2l+1-p(sj,2l)

        (11)

        其中:dj-1為預(yù)測差值,對應(yīng)高頻部分,p為預(yù)測算子。

        步驟3:更新(update)

        采用更新計算是因為經(jīng)過分裂產(chǎn)生的Sj,2l的一部分整體性質(zhì)與原始圖像有差異,需要對其進(jìn)行更新運(yùn)算,更新過程為將更新算子U作用于預(yù)測部分得到的殘差值dj-1上,從而生成一個與原始圖像相同的子集cj-1,如下式所示:

        cj-1=Sj,2l-U(dj-1)

        (12)

        其中:cj-1對應(yīng)低頻部分,U為更新算子。

        若想實現(xiàn)多級二代小波變換,則只需對cj-1重復(fù)上面的分裂、預(yù)測和更新三個步驟即可。對原始圖像進(jìn)行二級小波分解如圖5所示。

        圖5 二代小波變換示意圖

        由此可知,二代小波可對原始圖像分解為4部分:1個低頻部分LLn和3個高頻部分LHn,HLn,HHn,其中LLn是其經(jīng)過n級變換后的低頻分量,LHn、HLn、HHn分別為其經(jīng)過n級變換后的垂直、水平和對角線方向上的高頻分量。

        2.2.2 基于二代小波的圖像質(zhì)量評價函數(shù)

        用二代小波變換結(jié)合圖像的能量函數(shù)來評價圖像的清晰度,當(dāng)圖像清晰時,二代小波變換后的高頻部分能量最大,隨著圖像的模糊,能量逐漸向低頻部分分布,此時高頻部分能量減少。因此,根據(jù)二代小波變換后的高頻部分與低頻部分的能量可以評價圖像清晰度,且在全息圖具有部分噪點的特性基礎(chǔ)上提出了綜合低頻與高頻部分的清晰度評價函數(shù),如下式所示:

        (13)

        其中:HLn,LHn,HHn為n級二代小波變換后的高頻部分,LLn為n級二代小波變換后的低頻部分。

        3 數(shù)字全息顯微軟件系統(tǒng)設(shè)計

        該系統(tǒng)硬件部分主要由三部分組成,軟件處理部分大致可分為6部分,如圖6所示,當(dāng)圖像傳感器獲取到全息圖后,利用USB串行數(shù)據(jù)總線傳輸給嵌入式平臺AM335X進(jìn)行圖像預(yù)處理、全息重建、二代小波分解和圖像質(zhì)量評價,重復(fù)以上過程,不斷掃描不同重建距離Z值,得到不同重建距離Z對應(yīng)的重建結(jié)果圖像評價值,然后找到最佳的評價值,即找到最佳重建距離,最后輸出最佳重建結(jié)果。主要流程如圖6所示。

        圖6 軟件流程圖

        3.1 圖像預(yù)處理

        由于以圖像傳感器最大分辨率獲取全息圖,因此圖片信息較大,而嵌入式平臺處理能力相對較弱,因此采用中心部分320x240大小RIO提取的方法裁剪圖片,找到感興趣區(qū)域,同時減少計算量,預(yù)處理過程如圖7所示。

        圖7 圖像預(yù)處理

        3.2 全息重建

        利用全息重建算法對預(yù)處理后的全息圖進(jìn)行全息重建,得到重建后的物體圖像。對照全息原理,首先利用傅里葉變換將全息圖轉(zhuǎn)換到頻域,得到全息圖對應(yīng)的角譜,然后經(jīng)過相移,將零頻點移動到頻譜中間,再利用角譜之間的關(guān)系乘以傳遞函數(shù)GAS,得到對應(yīng)重建距離的頻譜,最后再次相移后,利用傅里葉反變換得到重建后的圖像。整體重建過程如圖8所示。

        圖8 全息重建過程

        3.3 基于圖像評價的自動對焦

        當(dāng)?shù)玫街亟ǖ膱D像后,再利用二代小波對圖像進(jìn)行二級變換處理,提取全息圖的高頻與低頻部分,結(jié)合二代小波圖像質(zhì)量評價函數(shù)對重建圖像進(jìn)行評價,二代小波分解過程如圖9所示。

        如圖9所示,經(jīng)過二級變換得到對應(yīng)的高頻與低頻部分,分別求得高頻與低頻部分的能量值,并帶入二代小波質(zhì)量評價函數(shù)式(13)求得對應(yīng)的評價結(jié)果。重復(fù)掃描重建區(qū)間內(nèi)的不同重建距離,得到對應(yīng)的圖像評價結(jié)果,找到最佳圖像質(zhì)量評價值,即找到最佳對焦點,從而獲取最佳重建結(jié)果,完成自動對焦。

        4 實驗結(jié)果與分析

        4.1 重建速度

        基于數(shù)字全息顯微技術(shù)便攜化的要求,本文將基于傳統(tǒng)PC的數(shù)字全息顯微重建算法應(yīng)用于嵌入式平臺,且為了能夠?qū)崿F(xiàn)實時重建,需要對傳統(tǒng)算法進(jìn)行改進(jìn),因此,本文采用OPENCV和FFTW庫結(jié)合的形式去提高算法速度。前面提到,整個重建過程主要包括兩部分:1)傳遞函數(shù);2)角譜重建。因此,分別對這兩部分進(jìn)行測試,并得到該算法在AM335X平臺平均實際運(yùn)行速度如表1所示。

        由測試結(jié)果可知,當(dāng)嵌入式主板主頻在1 GHz時,該算法計算時間大約為0.6 s,本文采用OPENCV配合FFTW庫的方式實現(xiàn)的角譜算法滿足在嵌入式平臺實時重建的要求。

        4.2 重建精度

        重建精度是數(shù)字全息顯微系統(tǒng)的重要指標(biāo)之一,因此,采用USAF1951標(biāo)準(zhǔn)分辨率板對該系統(tǒng)的重建精度進(jìn)行測試,如圖10所示。

        圖10 分辨率板重建

        如圖10可知,該系統(tǒng)對分辨率板全息圖重建后,最大可分辨第7組的第2位,查分辨率表得,該系統(tǒng)的重建精度為3.48 μm,可觀察3.48 μm的微小物體。

        4.3 自動對焦準(zhǔn)確率

        由于數(shù)字全息顯微重建算法最佳重建距離難以獲得,本文提出了一種基于二代小波方法和角譜算法結(jié)合的數(shù)字全息顯微成像自動對焦方法。為了對比其他圖像評價算法,需要將各算法對全息圖重建后得到的結(jié)果進(jìn)行評價,將得到的評價值進(jìn)行歸一化處理,得到各評價算法對于各重建距離的圖像質(zhì)量評價曲線。如圖11所示,得到各圖像評價函數(shù)對一張分辨率板全息圖重建距離為0 mm到1 mm區(qū)間進(jìn)行自動對焦時的圖像質(zhì)量評價曲線,該分辨率板實際對焦距離(圖中△處)為0.59 mm。由圖中可知,拉普拉斯算子和灰度能量梯度函數(shù)得到的評價曲線相對雜亂,對焦點誤差較大,而二代小波函數(shù)和灰度方差法的到的評價函數(shù)明顯得到最佳對焦點。

        圖11 圖像質(zhì)量評價函數(shù)歸一化

        根據(jù)各評價曲線總結(jié)如表2所示。

        表中峰值性用來描述最佳對焦點相對其附近重建點的差值,由圖中可知,二代小波與灰度方差法相對峰值性較好,Laplacian(拉普拉斯)算子和Tenengrad(灰度梯度能

        表2 圖像質(zhì)量評價函數(shù)自動對焦結(jié)果對比 μm

        量)函數(shù)評價曲線則相對雜亂,峰值性較差,無法觀察到分辨率板刻度,分辨率大于500 μm,不適用于全息圖的自動對焦。二代小波準(zhǔn)確對焦,且峰值性最好,分辨率達(dá)到最佳為3.48 μm,灰度方差法則有些許誤差。因此,二代小波算法自動對焦效果最好。為了檢驗此數(shù)字全息顯微自動對焦的準(zhǔn)確率,我們隨機(jī)選取5副分辨率板全息圖進(jìn)行自動對焦測試,并將結(jié)果與實際重建點進(jìn)行對比,結(jié)果如表3所示:

        表3 自動對焦點與最佳對焦點比較 mm

        是進(jìn)一步驗證自動對焦準(zhǔn)確率,利用該系統(tǒng)采集20副分辨率板全息圖進(jìn)行驗證,對焦準(zhǔn)確為18張,對焦準(zhǔn)確率為90%。本裝置基于二代小波的數(shù)字全息顯微自動對焦系統(tǒng)對全息圖自動重建的效果如圖12所示。

        圖12 全息自動對焦重建圖

        實驗結(jié)果表明,本文提出的基于二代小波的數(shù)字全息顯微自動對焦方法具有較好的準(zhǔn)確率,自動對焦準(zhǔn)確率達(dá)90%以上,能夠解決傳統(tǒng)算法難以獲取最佳重建距離的問題。

        5 結(jié)束語

        針對目前數(shù)字全息顯微重建技術(shù)依賴傳統(tǒng)PC平臺的問題,本文采用OPENCV配合FFTW庫實現(xiàn)角譜重建算法,實現(xiàn)嵌入式平臺的快速重建,重建速度大約為0.6 s,系統(tǒng)的重建精度達(dá)到3.48 μm,對數(shù)字全息顯微成像技術(shù)的便攜化發(fā)展具有重要意義。針對傳統(tǒng)數(shù)字全息顯微重建算法需要

        手動輸入重建距離且重建距離獲取困難的問題,本文提出基于二代小波算法的數(shù)字全息顯微成像自動對焦方法,用全息圖自動尋找最佳重建點,自動對焦準(zhǔn)確率為90%以上,解決了傳統(tǒng)重建算法難以獲取重建距離的問題。

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