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        “GOTl”新型脫靶檢測(cè)技術(shù)有望成為新的行業(yè)檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)

        2019-02-17 13:07:26
        傳感器世界 2019年3期
        關(guān)鍵詞:堿基位點(diǎn)工具

        2019年3月1日,Science雜志發(fā)表了中科院神經(jīng)科學(xué)研究所楊輝等研究人員的一項(xiàng)研究成果——胞嘧啶單堿基編輯會(huì)導(dǎo)致大量單核苷酸突變的脫靶,該研究建立了一種被命名為GOTI(Genome-wide Offtarget analysis by Two-cell embryo Injection)的新型脫靶檢測(cè)技術(shù),并以此技術(shù)確認(rèn)了經(jīng)典CRISPR/Cas9系統(tǒng)并沒(méi)有明顯的脫靶效應(yīng),而近年來(lái)興起的單堿基編輯技術(shù)卻有可能導(dǎo)致大量無(wú)法預(yù)測(cè)的脫靶,存在嚴(yán)重的安全風(fēng)險(xiǎn)。

        據(jù)悉,此研究顯著提高了基因編輯技術(shù)脫靶檢測(cè)的敏感性,并且可以在不借助于任何脫靶位點(diǎn)預(yù)測(cè)技術(shù)的情況下發(fā)現(xiàn)之前的脫靶檢測(cè)手段無(wú)法發(fā)現(xiàn)的完全隨機(jī)的脫靶位點(diǎn),為基因編輯工具的安全性評(píng)估帶來(lái)了新工具,有望成為新的行業(yè)檢測(cè)標(biāo)準(zhǔn)。

        團(tuán)隊(duì)成員先是檢測(cè)了經(jīng)典的CRISPR/Cas9系統(tǒng),結(jié)果發(fā)現(xiàn),設(shè)計(jì)良好的CRISPR/Cas9并沒(méi)有明顯的脫靶效應(yīng),結(jié)束了之前對(duì)于CRISPR/Cas9脫靶率的爭(zhēng)議。而對(duì)另一個(gè)同樣被寄予厚望的CRISPR/Cas9衍生技術(shù)BE3的檢測(cè)下發(fā)現(xiàn),BE3存在非常嚴(yán)重的脫靶,而且多出現(xiàn)在傳統(tǒng)脫靶預(yù)測(cè)認(rèn)為不太可能出現(xiàn)脫靶的位點(diǎn),因此之前方法一直沒(méi)有發(fā)現(xiàn)其脫靶問(wèn)題。

        團(tuán)隊(duì)分析后認(rèn)為,這些脫靶位點(diǎn)有部分出現(xiàn)在抑癌基因上,因此經(jīng)典版本的BE3有著很大的隱患,目前不適合作為臨床技術(shù)。研究團(tuán)隊(duì)的這些重要發(fā)現(xiàn),證實(shí)了以BE3為代表的部分基因編輯技術(shù)存在無(wú)法預(yù)測(cè)的脫靶風(fēng)險(xiǎn),讓世人重新審視了這些新興技術(shù)的風(fēng)險(xiǎn)。更重要的是,此工作建立了一種在精度、廣度和準(zhǔn)確性上遠(yuǎn)超越之前的基因編輯脫靶檢測(cè)技術(shù),有望由此開(kāi)發(fā)精度更高、安全性更大的新一代基因編輯工具,建立行業(yè)的新標(biāo)準(zhǔn)。

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