李 勛,周楠迪,田亞平
(江南大學(xué) 工業(yè)生物技術(shù)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,江蘇 無錫 214122)
抗生素是全球最廣泛使用的抗菌藥物,但其在醫(yī)藥與畜牧方面的過度使用造成嚴(yán)重后果,耐抗生素細(xì)菌的出現(xiàn),使得抗生素的使用面臨嚴(yán)重挑戰(zhàn)[1-2],因此,尋找可代替?zhèn)鹘y(tǒng)抗生素藥物且對(duì)人體與環(huán)境無毒害、無殘留的天然抑菌物質(zhì)成為研究熱點(diǎn),細(xì)菌素獨(dú)特的優(yōu)點(diǎn),使其成為抗生素類藥物替代品的首要選擇,在生物飼料添加劑、微生態(tài)制劑[3]、生物藥品等領(lǐng)域具有較好的應(yīng)用前景[4]。細(xì)菌素是由某些細(xì)菌代謝過程中通過核糖體合成的一類具有抑菌活性的多肽或蛋白復(fù)合物[5]。芽孢桿菌(Bacillus)在自然界中分布廣泛,生理特性豐富,能夠產(chǎn)生酶類、胞外桿菌肽、大環(huán)內(nèi)酯、類噬菌體顆粒等多種拮抗物質(zhì)[5-6]。
地衣芽孢桿菌能夠代謝產(chǎn)生多種物質(zhì),在工業(yè)和醫(yī)藥業(yè)中應(yīng)用較多,是一種具有極高應(yīng)用價(jià)值的微生物[7]。地衣芽孢桿菌產(chǎn)抑菌活性物質(zhì)種類較多,其中,抗菌肽因其可作為抗生素的替代品,受到重視。Mendo 等[8]報(bào)道地衣芽孢桿菌189 可產(chǎn)生抑菌多肽,可以抑制革蘭氏陽性菌株的生長(zhǎng)。樊陳[1]等從地衣芽孢桿菌發(fā)酵液中分離出一種具有廣譜抑菌效果的抗菌肽,該抑菌肽對(duì)革蘭氏陽性菌株抑制效果優(yōu)于革蘭氏陰性菌株。紀(jì)兆林等[9]對(duì)地衣芽孢桿菌培養(yǎng)條件進(jìn)行優(yōu)化,抑菌率提升了34.6%,并從發(fā)酵液中分離出一種穩(wěn)定性高的抑菌肽。
本研究從實(shí)驗(yàn)室保藏菌株中篩選出一株高抑菌活性物質(zhì)產(chǎn)生菌,對(duì)其菌落形態(tài)、生理生化特征與16S rRNA 基因水平鑒定。通過單因素試驗(yàn)與正交試驗(yàn),確定其最適發(fā)酵培養(yǎng)基與培養(yǎng)條件。使用硫酸銨分級(jí)鹽析與離子交換層析對(duì)發(fā)酵液中抑菌物質(zhì)進(jìn)行分離,并對(duì)分離純化所得抑菌物質(zhì)的特性進(jìn)行研究。
1.1.1 實(shí)驗(yàn)菌株 實(shí)驗(yàn)室保藏菌株JN-814B、JN-814C、JN-814D、JN-814E、JN-814、JN-814G、JN-814LX、凝結(jié)芽孢桿菌ACCC10229、凝結(jié)芽孢桿菌CICC21736、凝結(jié)芽孢桿菌0076(T)。
1.1.2 指示菌株 金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)、枯草芽孢桿菌(Bacillus subtillis)、銅綠假單胞菌(Pseudomonas aeruginose)、大腸桿菌(E.coli)、酵母菌(Yeast)、黑曲霉(Aspergillus niger)。
1.1.3 培養(yǎng)基 LB 培養(yǎng)基;YPD 培養(yǎng)基;PDA 培養(yǎng)基。固體培養(yǎng)基向其中添加1.5%~2%瓊脂粉。
初始培養(yǎng)基:葡萄糖10 g/L,胰蛋白胨10 g/L,酵母粉5 g/L,氯化鈉10 g/L。
1.2.1 抑菌活性物質(zhì)的檢測(cè) 采用管碟法[10]檢測(cè)抑菌活性物質(zhì)。
1.2.2 目的菌株的選育 將實(shí)驗(yàn)室保藏菌株分別活化后,接種入LB 培養(yǎng)基,適宜條件下培養(yǎng)12 h,發(fā)酵液10 000 r/min,4 ℃離心20 min,以金黃色葡萄球菌為指示菌,以管碟法測(cè)定上清液對(duì)其的抑制作用,選擇抑菌效果最佳的菌株作為目標(biāo)菌株。
1.2.3 發(fā)酵培養(yǎng)基的優(yōu)化 采用單因素實(shí)驗(yàn),將初始培養(yǎng)基中碳源葡萄糖分別替換為蔗糖、乳糖、麥芽糖、環(huán)糊精、玉米淀粉,將其中氮源物質(zhì)胰蛋白胨替換為魚粉蛋白胨,豆餅、豆粕、硫酸銨、尿素,將其中無機(jī)鹽分別替換為氯化鉀,磷酸氫二鉀,磷酸氫二鈉,硫酸鎂。分別對(duì)單因素優(yōu)化出的3 個(gè)營養(yǎng)元素與酵母粉進(jìn)行添加量?jī)?yōu)化。根據(jù)優(yōu)化結(jié)果,設(shè)置3個(gè)水平對(duì)其進(jìn)行L9(34)正交試驗(yàn)。
1.2.4 發(fā)酵條件的優(yōu)化 使用優(yōu)化后的培養(yǎng)基進(jìn)行發(fā)酵,在其他條件不變的情況下,分別對(duì)發(fā)酵初始pH,裝液量,發(fā)酵溫度,接種量,發(fā)酵時(shí)間進(jìn)行優(yōu)化。
1.2.5 優(yōu)化結(jié)果的驗(yàn)證 為驗(yàn)證培養(yǎng)基與培養(yǎng)條件優(yōu)化結(jié)果的可靠性,對(duì)優(yōu)化后的培養(yǎng)基組成與培養(yǎng)條件進(jìn)行驗(yàn)證,分別以優(yōu)化前與優(yōu)化后進(jìn)行發(fā)酵培養(yǎng),檢測(cè)發(fā)酵液上清液的抑菌效果。
1.2.6 抑菌效價(jià)的計(jì)算 抑菌效價(jià)計(jì)算采用管碟法:二劑量法[11]。
1.3.1 硫酸銨分級(jí)鹽析[12]將發(fā)酵液離心,取上清液,分別向其中添加硫酸銨至飽和度為20%、30%、40%、50%、60%、70%、80%,離心,取沉淀,將沉淀溶于50 mmol/L,pH 6.8 的Tris-HCl 緩沖液中,將溶解液置于緩沖液中透析除鹽[13],檢測(cè)透析液的抑菌活性[14]。
1.3.2 DEAE-Sephrose-FF 陰離子交換層析 硫酸銨沉淀后的溶解液,DEAE-Sephrose-FF 陰離子交換層析柱經(jīng)0.05 mmol/L,pH 6.8 的Tris-HCl 緩沖液平衡后,上樣量1 mL,使用0%、27%、46%、100%1 mol/L NaCl Tris-HCl 緩沖液進(jìn)行梯度洗脫,檢測(cè)波長(zhǎng)280 nm,收集各峰組分并濃縮,檢測(cè)其抑菌活性[15]。
1.4.1 抑菌肽蛋白酶敏感性 取陰離子交換分離后的抑菌活性物質(zhì)樣品,分別置于6 支試管中,調(diào)節(jié)pH 至所用蛋白酶最適pH,分別加入酸性蛋白酶、中性蛋白酶、堿性蛋白酶,木瓜蛋白酶、胰蛋白酶、亮氨酸氨肽酶,脯氨酸氨肽酶,使酶的最終濃度為10 mg/mL,對(duì)照組添加無菌水,在各酶最適溫度水浴30 min 后調(diào)pH 至中性。檢測(cè)各組樣品抑菌活性。
1.4.2 抑菌肽氨基酸組成分析 對(duì)離子交換后所得抑菌肽進(jìn)行濃鹽酸水解,高效液相色譜檢測(cè)水解后樣品中的氨基酸組成,與未經(jīng)水解的樣品進(jìn)行對(duì)比,獲得目標(biāo)抑菌肽的氨基酸組成。
1.4.3 抑菌肽溫度穩(wěn)定性 取陰離子交換分離后的抑菌活性肽樣品,配置成0.02 g/mL 溶液,放入離心管中,分別置于50,60,70,80,90,100 ℃條件下水浴20 min,冷卻至室溫后測(cè)定抑菌活性。
1.4.4 抑菌肽pH 穩(wěn)定性 取7 管陰離子交換分離后的抑菌活性肽樣品,使用0.05 mol/L 的NaOH 溶液與0.05 mol/L HCl 分別調(diào)整pH 4~10,37 ℃處理12 h,調(diào)整pH 至7.0 后測(cè)定其抑菌活性
1.4.5 抑菌肽抑菌譜 將硫酸銨初步分離得到的抑菌肽分別對(duì)金黃色葡萄球菌、枯草芽孢桿菌、大腸桿菌、銅綠假單胞菌、酵母等菌株做抑菌活性檢測(cè)。
2.1.1 目的菌株的選擇 將實(shí)驗(yàn)室保藏的10 株菌發(fā)酵液上清液抑菌效果如圖1 所示。其中,菌株JN-814C 抑菌圈直徑最大,對(duì)金黃色葡萄球菌抑制效果最明顯,故選擇菌株JN-814C 為抑菌活性物質(zhì)產(chǎn)生菌進(jìn)行研究。
2.1.2 菌株JN-814C 的鑒定 菌株JN-814C 在LB培養(yǎng)基上生長(zhǎng)良好,菌落為淺黃色圓形菌落,不透明,表面光滑,菌落邊緣呈不規(guī)則狀。其生理生化特征見表1。
對(duì)菌株JN-814C 進(jìn)行16S rRNA 測(cè)序,將所測(cè)得的序列與Genbank 中的16S rRNA 相似性進(jìn)行比較。菌株JN-814C 與Bacillus chenifoormis 的16S rRNA 序列同源性達(dá)到99%以上。
綜合生理生化鑒定和16S rRNA 測(cè)序結(jié)果,可以認(rèn)為菌株JN-814C 為地衣芽孢桿菌(Bacillus cheniformis)的一個(gè)亞種。
圖1 實(shí)驗(yàn)室保藏菌株發(fā)酵液上清液抑菌效果Fig.1 Antibacterial results of differernt bacterial strains preserved in the laboratory
2.2.1 菌株JN-814C 細(xì)胞生長(zhǎng)與發(fā)酵曲線 由圖2 可知,菌株JN-814C 接種入發(fā)酵培養(yǎng)基后即開始產(chǎn)生抑菌活性物質(zhì),在22 h 時(shí)分泌產(chǎn)物抑菌圈直徑達(dá)到最大值,抑菌凈直徑約為23 mm,發(fā)酵30 h 以后,由于培養(yǎng)基中營養(yǎng)物質(zhì)被消耗,不利于代謝產(chǎn)物積累,發(fā)酵液中活菌數(shù)量也逐漸減少,同時(shí),產(chǎn)物抑菌圈直徑開始逐漸下降,發(fā)酵液中抑菌活性物質(zhì)的量開始減少。因此推斷抑菌活性物質(zhì)主要產(chǎn)生于菌體生長(zhǎng)的對(duì)數(shù)期,在發(fā)酵后期抑菌活性物質(zhì)的減少可能與菌體分泌蛋白酶有關(guān)。故選擇22 h 作為發(fā)酵培養(yǎng)周期。
圖2 菌株JN-814C 產(chǎn)抗菌物質(zhì)的發(fā)酵曲線Fig.2 Fermentation curve of strain JN-814C for an antibacterial substance productionan antibacterial substance production
2.2.2 發(fā)酵培養(yǎng)基的確定 由圖3 可知,培養(yǎng)基最佳碳源、氮源、無機(jī)鹽分別為糊精、胰蛋白胨、硫酸鎂。其最適添加量分別為糊精0.5%,胰蛋白胨0.5%,硫酸鎂0.1%。培養(yǎng)基成分正交優(yōu)化結(jié)果見表2。
經(jīng)單因素試驗(yàn)與正交試驗(yàn),確定培養(yǎng)基中各因素影響大小依次為A>C>B>D,最優(yōu)培養(yǎng)及配方為糊精5 g/L、胰蛋白胨10 g/L、酵母粉5 g/L,硫酸鎂3 g/L。
2.2.3 培養(yǎng)條件的確定 培養(yǎng)條件產(chǎn)抑菌物質(zhì)的抑菌活性的影響見圖4。
1)種子培養(yǎng)時(shí)間的確定。由圖4(a)可以看出,種子培養(yǎng)時(shí)間最佳為22 h,此時(shí)菌體生長(zhǎng)處于對(duì)數(shù)末期,菌體生長(zhǎng)速率與菌體數(shù)量均處在較高水平,故選擇種齡為22 h。
2)培養(yǎng)溫度對(duì)抑菌效果的影響。使用優(yōu)化后的培養(yǎng)基,分別在25、28、31、34、37、40、43 ℃溫度條件下進(jìn)行發(fā)酵培養(yǎng),檢測(cè)發(fā)酵液上清液抑菌效果。由圖4(b)可知,溫度對(duì)發(fā)酵上清液抑菌效果影響較大,低溫和高溫都不利于抑菌活性物質(zhì)的產(chǎn)生,在37 ℃時(shí),分泌產(chǎn)物抑菌圈直徑大到最大,所以選擇37 ℃作為發(fā)酵的培養(yǎng)溫度。
3)初始pH 對(duì)抑菌效果的影響。將發(fā)酵培養(yǎng)基的pH分別調(diào)整為5.5、6.0、6.5、7.0、7.5、8.0、8.5、9.0,培養(yǎng)22 h 后檢測(cè)發(fā)酵上清液的抑菌效果。由圖4(c)可知,在pH 范圍為6.0~9.0 內(nèi),培養(yǎng)基初始pH對(duì)發(fā)酵液抑菌效果基本無影響。
4)裝液量對(duì)抑菌效果的影響。分別向250 mL錐形瓶中添加20、30、40、50、60、70、80 mL 培養(yǎng)基,培養(yǎng)后測(cè)定發(fā)酵上清液的抑菌效果。由圖4(d)可知,裝液量在50 mL 以內(nèi)時(shí),隨著裝液量增加,上清液抑菌圈直徑逐漸增大,裝液量超過50 mL 以后,上清液抑菌圈直徑迅速下降,在裝液量50 mL 時(shí)分泌產(chǎn)物抑菌圈直徑最大,抑菌效果最佳,故選擇50 mL 作為發(fā)酵過程裝液體積。
圖3 培養(yǎng)基成分對(duì)產(chǎn)抑菌物質(zhì)的抑菌活性的影響Fig.3 Effects of carbon source on antibacterial activity
表2 培養(yǎng)基成分正交優(yōu)化結(jié)果Table 2 Orthogonal test results of medium composition
圖4 培養(yǎng)條件產(chǎn)抑菌物質(zhì)的抑菌活性的影響Fig.4 Effects of fermentation conditions on antibacterial activity
5)接種量對(duì)抑菌效果的影響。由圖4(e)可以看出,接種量在1%~10%范圍內(nèi)時(shí),接種量大小對(duì)發(fā)酵液抑菌效果影響較大,接種量在2%時(shí),抑菌圈最大,發(fā)酵液的抑菌效果最佳,隨著接種量增大,上清液抑菌圈直徑呈減小趨勢(shì)。
6)優(yōu)化結(jié)果的驗(yàn)證。為驗(yàn)證培養(yǎng)基與培養(yǎng)條件優(yōu)化結(jié)果的可靠性,對(duì)優(yōu)化后的培養(yǎng)基組成與培養(yǎng)條件進(jìn)行驗(yàn)證,分別對(duì)優(yōu)化前與優(yōu)化后進(jìn)行發(fā)酵培養(yǎng),檢測(cè)發(fā)酵液上清液的抑菌效果。結(jié)果如圖5 所示。
優(yōu)化后發(fā)酵液上清液抑菌效果得到提高,通過計(jì)算,優(yōu)化后發(fā)酵液抑菌效果較未優(yōu)化的發(fā)酵液抑菌效果提高41.4%。
圖5 不同發(fā)酵條件下的抑菌效果Fig.5 Bacteriostatic effects of different fermentation conditions
2.3.1 硫酸銨沉淀粗提取 硫酸銨鹽析如圖6 所示。由圖6 可知,菌株JN-814C 的發(fā)酵上清液經(jīng)硫酸銨分級(jí)鹽析濃縮后,抑菌活性物質(zhì)主要集中在硫酸銨飽和度為40%~70%的范圍之內(nèi),在70%~80%范圍內(nèi)抑菌活性物質(zhì)的量減少,說明該菌株所產(chǎn)抑菌性物質(zhì)可被硫酸銨沉淀,具有蛋白性質(zhì),為保證抑菌活性物質(zhì)的收率,選擇硫酸銨飽和度40%~80%作為上清液處理濃度。
圖6 硫酸銨鹽析Fig.6 Ammonium sulfate salting-out
2.3.2 DEAE-Sepharose-FF 陰離子交換層析分離選用DEAE-Sepharose-FF 對(duì)硫酸銨粗提液進(jìn)行分離,收集陰離子交換層析洗脫的個(gè)各峰組分,富集濃縮后測(cè)定其抑菌能力,結(jié)果抑菌性物質(zhì)分布于峰a 與峰b,其中,a 峰為穿透峰,峰b 為27%NaCl 洗脫峰,分別收集峰a 與峰b,冷凍干燥得到純化的抑菌肽。
圖7 DEAE-Sepharose-FF 離子交換圖譜Fig.7 DEAE-Sepharose-FF anion exchange chromatogram
圖8 層析出峰的各峰抑菌效果Fig.8 Bacteriostatic spectrum of the three fractions
發(fā)酵液中抑菌活性物質(zhì)經(jīng)硫酸銨沉淀與DEAE陰離子交換層析后得到分離,表現(xiàn)出一定的蛋白性,對(duì)其進(jìn)行蛋白酶處理。
2.4.1 蛋白酶敏感性 蛋白酶對(duì)抑菌活性的影響如圖9 所示。由圖9 可知,純化后的抑菌活性物質(zhì)經(jīng)7 種蛋白酶處理后,堿性蛋白酶對(duì)其抑菌活性影響較大,其次為亮氨酸氨肽酶,結(jié)果表明該抑菌物質(zhì)是多肽類物質(zhì),其肽鏈N 端存在亮氨酸殘基。
圖9 蛋白酶對(duì)抑菌活性的影響Fig.9 Effects of proteases on antimicrobial activity
表3 抑菌肽的抑菌譜Table 3 Antibacterial spectrum of antimicrobial peptide
2.4.2 抑菌肽氨基酸組成 抑菌肽氨基酸的組成如表4 所示。氨基酸分析表明,分離出的抑菌肽主要含有9 種氨基酸,其中谷氨酸的含量處于較高水平。
表4 抑菌肽氨基酸組成Table 4 Amino acid composition of antimicrobial peptide
2.4.3 熱穩(wěn)定性 溫度對(duì)抑菌活性的影響如圖10所示。由圖10 可知,純化后的抑菌肽經(jīng)不同溫度處理,在80 ℃以內(nèi)時(shí),抑菌效果保持在較高水平,且相對(duì)穩(wěn)定,超過80 ℃以后,抑菌效果明顯下降,說明該菌株所產(chǎn)抑菌肽具有一定的溫度耐受性,但對(duì)80 ℃以上高溫耐受性較差。
圖10 溫度對(duì)抑菌活性的影響Fig.10 Effects of temperature on antimicrobial activity
2.4.4 pH 穩(wěn)定性 將純化后抑菌肽樣品在不同pH條件下處理后,抑菌性實(shí)驗(yàn)結(jié)果如圖11 所示,從圖11 可以看出抑菌圈直徑變化較小,說明在pH 4~10范圍內(nèi),該細(xì)菌素活性較為穩(wěn)定。
圖11 p H 對(duì)抑菌活性的影響Fig.11 Effects of pH on antimicrobial activity
2.4.5 抑菌肽抑菌譜的測(cè)定 抑菌肽的抑菌譜如表3 所示。結(jié)果表明,分離所得抑菌肽對(duì)革蘭氏陽性菌表現(xiàn)出很好的拮抗性,對(duì)革蘭氏陰性菌及真菌無抑制作用。
本研究篩選出一株產(chǎn)抑菌活性物質(zhì)較高的菌株,地衣芽孢桿菌JN-814C,通過發(fā)酵優(yōu)化,將其抑菌效價(jià)提高41.4%,對(duì)發(fā)酵液中抑菌活性物質(zhì)進(jìn)行分離純化后,通過蛋白酶處理與氨基酸分析確定其為一種抑菌肽,研究表明,該抑菌肽穩(wěn)定性較好,其對(duì)革蘭氏陽性菌有較好的抑制作用,與文獻(xiàn)報(bào)道一致。
食品與生物技術(shù)學(xué)報(bào)2019年10期