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        高遷移率族蛋白2在肝癌組織中的表達(dá)及對(duì)肝癌細(xì)胞生物學(xué)活性的影響

        2019-01-31 02:41:08陳建安陳思玉劉麗文朱威威陳曉龍何玉婷孫冉冉任志剛崔光瑩余祖江
        關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)庫水平實(shí)驗(yàn)

        陳建安,陳思玉,劉麗文,朱威威,陳曉龍,余 炎,何玉婷,孫冉冉,任志剛,李 娟,崔光瑩,余祖江

        鄭州大學(xué)第一附屬醫(yī)院感染科 鄭州450052

        原發(fā)性肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma, HCC)是我國(guó)最常見和致死率較高的惡性腫瘤之一[1]。其惡性程度高,進(jìn)展快,除了早期外科手術(shù)切除外,放、化療多不能取得滿意的療效,且預(yù)后極差[2]。因此,探索HCC發(fā)生、發(fā)展的分子機(jī)制,尋找新的預(yù)后判斷標(biāo)志物和治療靶點(diǎn),對(duì)提高HCC治愈率具有重要的臨床意義。

        高遷移率族蛋白(high mobility group box,HMGB)是真核細(xì)胞核內(nèi)一類含量豐富的核蛋白,功能多樣。在細(xì)胞中,作為核DNA結(jié)合蛋白,HMGB1和HMGB2高度保守[3-4]。作為細(xì)胞外成分,HMGB家族與敗血癥、關(guān)節(jié)炎、癌癥等疾病關(guān)系密切[5]。HMGB1在各種人類癌癥中過表達(dá),包括前列腺癌、人腦膠質(zhì)瘤[6]、前列腺癌[7]、結(jié)直腸癌[8]和乳腺癌[9]等。更重要的是,HMGB優(yōu)先結(jié)合順鉑(Ⅱ)二酰氯(順鉑)修飾的DNA或錯(cuò)誤摻入的核苷類似物,并因此抑制核苷酸切除修復(fù),這可能對(duì)于癌癥治療很有價(jià)值[10]。目前對(duì)HMGB2的研究相對(duì)較少,主要集中在胃癌[11]、乳腺癌[12]等。本研究利用癌癥基因組圖譜(TCGA)和GEO公共數(shù)據(jù)庫驗(yàn)證HMGB2在HCC組織中的表達(dá)及其對(duì)預(yù)后的影響,同時(shí)分析了HMGB2對(duì)HCC細(xì)胞增殖、侵襲及凋亡、周期的影響,探討其對(duì)HCC發(fā)展預(yù)測(cè)和靶向治療的價(jià)值。

        1 材料與方法

        1.1TCGA和GEO公共數(shù)據(jù)庫有關(guān)HCCHMGB2表達(dá)譜數(shù)據(jù)的分析

        1.1.1 數(shù)據(jù)下載及過濾 下載TCGA數(shù)據(jù)庫中的HCC相關(guān)數(shù)據(jù)。根據(jù)表達(dá)譜數(shù)據(jù),對(duì)HMGB2 mRNA表達(dá)由低到高排序,低于中位數(shù)節(jié)點(diǎn)的樣本為低表達(dá)組,高于中位數(shù)節(jié)點(diǎn)的樣本為高表達(dá)組。下載GEO數(shù)據(jù)庫中7個(gè)數(shù)據(jù)集(GSE76297,GSE10143,GSE14520,GSE25097,GSE36376,GSE102083,GSE57957)中有關(guān)HCC HMGB2 mRNA表達(dá)譜文件。數(shù)據(jù)過濾方法參見文獻(xiàn)[13]。

        1.1.2富集分析(genesetenrichmentanalysis,GSEA) 采用 GSEA 2.2.1分別對(duì)TCGA數(shù)據(jù)庫中HMGB2 mRNA低表達(dá)組和高表達(dá)組進(jìn)行分析。利用 GSEA網(wǎng)站 MsigDB數(shù)據(jù)庫獲得 c2.cp.kegg.v5.1.symbols.gmt數(shù)據(jù)集,然后按缺省加權(quán)富集統(tǒng)計(jì)的方法進(jìn)行富集分析,隨機(jī)組合次數(shù)為 1 000。

        1.2細(xì)胞實(shí)驗(yàn)主要試劑及儀器人正常肝細(xì)胞LO2、HCC細(xì)胞株SMMC7721和Hep3B購自中國(guó)科學(xué)院細(xì)胞庫。DMEM培養(yǎng)基購自美國(guó)Gibco公司,標(biāo)準(zhǔn)胎牛血清購自美國(guó)HyClone公司,HMGB2抗體和β-actin抗體購于武漢三鷹公司,HMGB2 siRNA(序列為5’-CUGAACAUCGCCCAAAGAU-3’)及陰性對(duì)照(NC)siRNA(序列為5’-UUCUCCGAACGU GUCACGUTT-3’)由上海吉瑪制藥公司設(shè)計(jì)合成,脂質(zhì)體轉(zhuǎn)染試劑Lipofectamine2000購自美國(guó)Invitrogen公司,CCK-8試劑購于日本同仁公司,Matrigel膠和Transwell小室購于BD公司,細(xì)胞周期和細(xì)胞凋亡檢測(cè)試劑盒購自南京凱基公司。

        1.3HMGB2siRNA轉(zhuǎn)染后HCC細(xì)胞生物學(xué)活性的檢測(cè)

        1.3.1 細(xì)胞培養(yǎng)及轉(zhuǎn)染 細(xì)胞復(fù)蘇后,用含體積分?jǐn)?shù)10% 胎牛血清和100 U/mL青霉素/鏈霉素的DMEM培養(yǎng)基,在37 ℃、體積分?jǐn)?shù)5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。待細(xì)胞融合度達(dá)80%~90%時(shí),取狀態(tài)好的細(xì)胞用于后續(xù)實(shí)驗(yàn)。分別收獲對(duì)數(shù)生長(zhǎng)期的SMMC7721和Hep3B細(xì)胞接種于6孔板,用Lipofectamine2000分別轉(zhuǎn)染HMGB2 siRNA、NC siRNA并設(shè)置空白對(duì)照,48 h后進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)。

        1.3.2 HMGB2蛋白的檢測(cè) 用RIPA裂解蛋白提取試劑(中國(guó)碧云天公司)和蛋白酶抑制劑(美國(guó)羅氏公司)收集細(xì)胞和細(xì)胞裂解物,取等量蛋白行100 g/L SDS-PAGE電泳后轉(zhuǎn)移至PVDF膜(Millipore,USA)上,用含50 g/L脫脂乳和TBS緩沖液封閉1 h,加HMGB2抗體(按1∶1 000稀釋)、內(nèi)參β-actin抗體(按1∶5 000稀釋),4 ℃搖床過夜,TBST洗滌3次,經(jīng)二抗孵育1 h和洗滌后,將膜暴露,用Labwork對(duì)蛋白條帶進(jìn)行灰度分析。以目的蛋白與內(nèi)參條帶灰度值的比值表示目的蛋白表達(dá)水平。

        1.3.3 CCK-8法檢測(cè)細(xì)胞增殖 將轉(zhuǎn)染24 h后的細(xì)胞以每孔5×104個(gè)/mL的密度接種于96孔板,培養(yǎng)24、72和120 h后分別進(jìn)行CCK-8實(shí)驗(yàn)。檢測(cè)波長(zhǎng)450 nm。每組3個(gè)復(fù)孔。

        1.3.4 Transwell 體外遷移實(shí)驗(yàn) 選用孔徑為8 μm 的24孔 Borden 小室,上室加入1×105個(gè)細(xì)胞,總體積200 μL,下室加入300 μL含血清培養(yǎng)基,每組設(shè)置3個(gè)復(fù)孔。48 h后取出小室,甲醇固定并用結(jié)晶紫染色孵育10 min以去除上層小室側(cè)的未遷移細(xì)胞。顯微鏡下隨機(jī)選取5個(gè)視野進(jìn)行拍攝,計(jì)算每個(gè)視野的平均細(xì)胞數(shù)。

        1.3.5 細(xì)胞凋亡和細(xì)胞周期的檢測(cè) 轉(zhuǎn)染48 h后收集細(xì)胞,用預(yù)冷的PBS洗滌細(xì)胞2次,加入1×binding buffer 重懸細(xì)胞并調(diào)整細(xì)胞濃度為1×106個(gè)/mL,離心棄上清,用適量1×binding buffer重懸,加入5 μL Annexin V-FITC和5 μL PI染料混勻后避光孵育15 min,上流式儀檢測(cè)細(xì)胞凋亡率。實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。轉(zhuǎn)染48 h后收集細(xì)胞,PBS洗2遍,2.5 g/L胰蛋白酶消化,離心棄上清,加入冰預(yù)冷的體積分?jǐn)?shù)70%的乙醇4 ℃孵育1 h。1 000 r/min離心10 min,棄上清,用PBS 2 mL重懸細(xì)胞。再加入300 μL PI,4 ℃下避光孵育30 min,上流式儀檢測(cè)細(xì)胞周期。實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次。

        1.4統(tǒng)計(jì)學(xué)處理使用 SPSS 17.0和GraphPad Prism 5進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。采用Kaplan-Meier法繪制生存曲線并行l(wèi)og-rank檢驗(yàn);HCC組織和癌旁正常組織中,以及不同臨床病理特征的HCC組織中HMGB2 mRNA表達(dá)水平的比較采用兩獨(dú)立樣本t檢驗(yàn);3組細(xì)胞中HMGB2蛋白表達(dá)水平的比較采用單因素方差分析,兩兩比較采用LSD-t檢驗(yàn);檢驗(yàn)水準(zhǔn)α=0.05。

        2 結(jié)果

        2.1TCGA及GEO數(shù)據(jù)庫數(shù)據(jù)分析結(jié)果

        2.1.1 HCC組織中HMGB2 mRNA的表達(dá)特點(diǎn) TCGA數(shù)據(jù)集及GEO數(shù)據(jù)集分析結(jié)果(表1)顯示,患者年齡中位數(shù)為59歲;HCC組織中HMGB2 mRNA表達(dá)水平較癌旁正常組織升高。TCGA數(shù)據(jù)集數(shù)據(jù)分析結(jié)果顯示,HCC組織中HMGB2 mRNA表達(dá)水平與種族、甲胎蛋白表達(dá)水平、TNM分期及分化程度有關(guān),與種族、性別、 年齡無關(guān)(表2);針對(duì)總體生存(overall survival,OS)、無進(jìn)展生存(progression-free survival,PFS)的生存分析結(jié)果顯示,HMGB2 mRNA高表達(dá)組預(yù)后差于低表達(dá)組(圖1,χ2分別為8.162、4.819,P分別為0.028、0.004)。OS時(shí)間指從隨機(jī)化開始至因任何原因引起死亡的時(shí)間,PFS時(shí)間指從隨機(jī)化開始到患者現(xiàn)腫瘤進(jìn)展或死亡的時(shí)間。

        表1 GEO和TCGA公共數(shù)據(jù)庫中HCC及癌旁正常組織中HMGB2 mRNA表達(dá)水平的比較

        表2 不同臨床病理特征的HCC組織中HMGB2 mRNA表達(dá)水平的比較

        *:數(shù)據(jù)有缺失

        圖1 HMGB2 mRNA高、低表達(dá)組OS(上)、PFS(下)生存曲線

        2.1.2 GSEA分析 GSEA 結(jié)果提示HMGB2 高表達(dá)樣本富集到細(xì)胞周期、DNA復(fù)制、RNA降解等基因集,見圖2。

        從上到下依次為細(xì)胞周期(FDR=0.06)、DNA復(fù)制(FDR=0.12)、RNA降解(FDR=0.14)、錯(cuò)配修復(fù)(FDR=0.20)

        圖2GSEA分析結(jié)果

        2.2HMGB2蛋白在HCC細(xì)胞中的表達(dá)見圖3和表3、4。Western bolt結(jié)果顯示,SMMC7721和Hep3B細(xì)胞中HMGB2蛋白表達(dá)水平高于正常肝細(xì)胞LO2;轉(zhuǎn)染HMGB2 siRNA的SMMC7721、Hep3B細(xì)胞中HMGB2蛋白表達(dá)水平低于空白對(duì)照組和NC組。

        圖3 HMGB2蛋白的檢測(cè)

        2.3 3組細(xì)胞增殖、侵襲能力的比較轉(zhuǎn)染HMGB2 siRNA 之后,SMMC7721和Hep3B的增殖、侵襲能力均低于NC組和空白對(duì)照組,見圖4、5和表3、4。

        圖4 細(xì)胞增殖曲線

        圖5 細(xì)胞侵襲實(shí)驗(yàn)結(jié)果(×100)

        2.4 3組細(xì)胞細(xì)胞周期、凋亡率的比較見表3、4。HMGB2 siRNA 轉(zhuǎn)染的SMMC7721和Hep3B細(xì)胞被阻滯在G0/G1期,細(xì)胞凋亡率高于NC組和空白對(duì)照組。

        表3 3組SMMC7721細(xì)胞HMGB2蛋白表達(dá)水平、穿膜細(xì)胞數(shù)、細(xì)胞周期和凋亡率的比較

        *:與空白對(duì)照組和NC組相比,P<0.05

        表4 3組Hep3B細(xì)胞HMGB2蛋白表達(dá)水平、穿膜細(xì)胞數(shù)、細(xì)胞周期和凋亡率的比較

        *:與空白對(duì)照組和NC組相比,P<0.05

        3 討論

        HCC是我國(guó)發(fā)病率最高的惡性腫瘤之一,由于其發(fā)病隱匿,早期無明顯不適,且極易發(fā)生遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移、血管侵襲和復(fù)發(fā),診斷和治療難度很大[14]。大多數(shù)患者在確診時(shí)已是晚期,失去了最佳治療時(shí)機(jī),因此,探索能夠提示早期HCC的分子指標(biāo)具有重要臨床意義。

        HMGB2是較為保守的HMGB家族成員,有報(bào)道[15]認(rèn)為高表達(dá)的HMGB2 在胚胎發(fā)育過程中具有重要作用,但在成人主要在淋巴器官和睪丸中表達(dá)。此外,在關(guān)節(jié)表面區(qū)域的軟骨細(xì)胞中HMGB2亦高表達(dá),敲除HMGB2基因后極易發(fā)展為骨關(guān)節(jié)炎[16]。近年來,多項(xiàng)研究證明HMGB2 在胃癌、膠質(zhì)母細(xì)胞瘤和胰腺癌等腫瘤中呈現(xiàn)高表達(dá),并且在腫瘤細(xì)胞增殖、侵襲轉(zhuǎn)移中發(fā)揮重要作用。Li等[11]發(fā)現(xiàn)沉默HMGB2后,胃癌細(xì)胞MKN45的增殖能力被抑制,PCNA和Ki-67表達(dá)減少。Wu等[17]的研究表明HMGB2促進(jìn)膠質(zhì)母細(xì)胞瘤的增殖、侵襲,并與預(yù)后生存相關(guān)。Cai等[18]證實(shí)沉默HMGB2后,胰腺癌細(xì)胞增殖能力下降,并且HMGB2參與維持胰腺癌細(xì)胞的糖酵解進(jìn)程。

        本研究利用GEO和TCGA數(shù)據(jù)集證實(shí)HMGB2 mRNA在HCC組織中高表達(dá),并且與甲胎蛋白表達(dá)水平、TNM分期、分化程度有關(guān),即惡性程度越高,HCC組織中HMGB2 mRNA的表達(dá)越高。更重要的是,本研究發(fā)現(xiàn)HCC組織中HMGB2 mRNA的表達(dá)與預(yù)后關(guān)系密切,高表達(dá)患者預(yù)后差,這與Kwon等[19]的研究結(jié)果一致。有報(bào)道[20]稱細(xì)胞周期的調(diào)控與腫瘤發(fā)生發(fā)展具有密不可分的關(guān)系,細(xì)胞周期調(diào)控機(jī)制受損導(dǎo)致細(xì)胞惡性增殖、凋亡異常、侵襲性增加。本研究利用GSEA方法發(fā)現(xiàn),HMGB2 mRNA的表達(dá)與細(xì)胞周期、DNA復(fù)制、 RNA降解等有關(guān),推測(cè)HMGB2可能是通過參與細(xì)胞周期調(diào)控和侵襲轉(zhuǎn)移影響HCC細(xì)胞的生存。我們進(jìn)一步利用細(xì)胞實(shí)驗(yàn)證實(shí),HMGB2蛋白在HCC細(xì)胞SMMC7721和Hep3B中高表達(dá);利用siRNA下調(diào)SMMC7721和Hep3B細(xì)胞中HMGB2的表達(dá)后,細(xì)胞增殖能力受到抑制,侵襲能力下降,細(xì)胞凋亡率升高;G0/G1期細(xì)胞增多,S期細(xì)減少,G2/M期細(xì)胞亦減少。這些結(jié)果再次提示HMGB2 有可能成為HCC臨床預(yù)后評(píng)價(jià)指標(biāo),并可能成為腫瘤治療的潛在靶點(diǎn)。

        綜上所述,HMGB2的異常表達(dá)可能與HCC細(xì)胞的增殖、侵襲、凋亡等密切相關(guān),可作為一個(gè)潛在的HCC發(fā)展的預(yù)測(cè)指標(biāo),為HCC靶向治療提供了一定參考價(jià)值。

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