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        食品動(dòng)物源碳青霉烯耐藥基因blaIMP-4的發(fā)現(xiàn)

        2019-01-10 22:08:15ZhuYao,ZhangWan-jiang,SchwarzStefan
        關(guān)鍵詞:耐藥數(shù)據(jù)庫(kù)

        碳青霉烯類抗生素(Carbapenems)是一類抗菌譜最廣、抗菌活性最強(qiáng)的非典型β-內(nèi)酰胺類抗生素,是目前人醫(yī)臨床治療多重耐藥(Muti-drug resistant,MDR)革蘭氏陰性菌感染最主要的抗菌藥物之一。世界各國(guó)均嚴(yán)禁將其應(yīng)用于畜牧養(yǎng)殖業(yè)。然而,隨著碳青霉烯類抗生素在臨床的廣泛應(yīng)用,碳青霉烯耐藥菌株開始出現(xiàn),特別是碳青霉烯耐藥腸桿菌科細(xì)菌的不斷出現(xiàn),給人醫(yī)臨床和公共衛(wèi)生帶來(lái)了嚴(yán)峻挑戰(zhàn)。由于動(dòng)物源耐藥菌是耐藥基因重要的儲(chǔ)存庫(kù)之一,并且可以通過(guò)直接接觸、環(huán)境以及食物鏈等方式轉(zhuǎn)移擴(kuò)散給人類,進(jìn)而威脅人類健康。因此,動(dòng)物源碳青霉烯耐藥菌和其耐藥基因的流行特點(diǎn)和傳播機(jī)制的研究對(duì)揭示碳青霉烯耐藥菌和其耐藥基因的擴(kuò)散傳播機(jī)制具有十分重要的意義。

        近期發(fā)表于《Journal of Antimicrobial Chemotherapy》的一項(xiàng)研究報(bào)道,首次發(fā)現(xiàn)了產(chǎn)金屬β-內(nèi)酰胺酶IMP-4的豬源陰溝腸桿菌。作者在對(duì)我國(guó)東北地區(qū)動(dòng)物源碳青霉烯耐藥腸桿菌科細(xì)菌進(jìn)行流行病學(xué)調(diào)查過(guò)程中,發(fā)現(xiàn)一株豬直腸拭子來(lái)源的碳青霉烯耐藥陰溝腸桿菌,藥敏試驗(yàn)結(jié)果顯示該分離菌呈現(xiàn)多重耐藥表型,同時(shí)對(duì)美羅培南、亞胺培南、爾他培南、氨曲南、頭孢他啶、青霉素、慶大霉素、環(huán)丙沙星、氟苯尼考、磷霉素、四環(huán)素耐藥。利用雙紙片協(xié)同法和E-test法檢測(cè)表明該分離菌產(chǎn)金屬β-內(nèi)酰胺酶,耐藥基因檢測(cè)顯示該菌株攜帶重要的金屬β-內(nèi)酰胺酶基因-blaIMP-4。通過(guò)接合轉(zhuǎn)移試驗(yàn)表明blaIMP-4耐藥基因位于能夠自我轉(zhuǎn)移的接合型質(zhì)粒中,將其命名為pIMP-4-EC62。為了進(jìn)一步鑒定和分析質(zhì)粒pIMP-4-EC62,對(duì)其進(jìn)行了全基因組測(cè)序,獲得了該質(zhì)粒的全序列。比對(duì)分析顯示質(zhì)粒pIMP-4-EC62具有典型的IncHI2質(zhì)粒骨架,與數(shù)據(jù)庫(kù)中IncHI2質(zhì)粒骨架具有高度的同源性。同時(shí),序列分析顯示質(zhì)粒pIMP-4-EC62包含4個(gè)多重耐藥區(qū),多種不同類型的耐藥基因、重金屬離子抗性基因、消毒劑抗性基因以及大量的可移動(dòng)遺傳元件,分別分布于4個(gè)多重耐藥區(qū)。此外,基因環(huán)境分析顯示blaIMP-4基因位于一個(gè)具有不同基因盒陣列新的I類整合子(blaIMP-4-Kl.pn.I3-qacG2-aacA4-arr-3)中,質(zhì)?;蛐蛄猩蟼髦罣enBank數(shù)據(jù)庫(kù)后該整合子被收錄至整合子數(shù)據(jù)庫(kù)并將其命名為In1589。根據(jù)質(zhì)粒穩(wěn)定性試驗(yàn)結(jié)果,在沒有抗生素的選擇壓力下該質(zhì)粒在野生菌和受體菌中均具有高度的穩(wěn)定性。為了進(jìn)一步闡明IncHI2質(zhì)粒的進(jìn)化以及質(zhì)粒中耐藥基因的分布特征,作者將質(zhì)粒pIMP-4-EC62與GenBank數(shù)據(jù)庫(kù)中不同國(guó)家、不同菌種來(lái)源的51個(gè)IncHI2質(zhì)?;蛐蛄羞M(jìn)行了核心基因組進(jìn)化分析,顯示這些質(zhì)粒分為兩個(gè)不同的進(jìn)化支。不論是在質(zhì)粒核心結(jié)構(gòu)方面還是在耐藥基因分布方面,ST1/IncHI2質(zhì)粒與其它序列型的IncHI2質(zhì)粒明顯不同。同時(shí),耐藥基因分布結(jié)果表明ST1/IncHI2質(zhì)粒是介導(dǎo)碳青霉烯類耐藥基因傳播的重要載體。

        本研究首次在食品動(dòng)物中發(fā)現(xiàn)了碳青霉烯類耐藥基因blaIMP-4,其成為動(dòng)物健康和人類公共衛(wèi)生安全的重大隱患。因此,為了進(jìn)一步防控碳青霉烯類耐藥菌和耐藥基因的擴(kuò)散和傳播,迫切需要對(duì)動(dòng)物源碳青霉烯類耐藥菌的流行情況進(jìn)行及時(shí)和重點(diǎn)監(jiān)測(cè)。

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