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        小麥錳超氧化物歧化酶基因的克隆與原核表達

        2019-01-09 06:51:10于永昂趙俊杰馬振鋒胡海燕
        江蘇農業(yè)科學 2018年23期
        關鍵詞:原核克隆測序

        于永昂, 張 蕾, 趙俊杰, 賀 杰, 馬振鋒, 胡海燕

        (河南科技學院生命科技學院/現代生物育種河南省協同創(chuàng)新中心,河南新鄉(xiāng) 453003)

        植物在自然界中經常會受到病菌、干旱、冷害和高鹽等生物和非生物脅迫,引發(fā)細胞內部產生大量的活性氧(reactive oxygen species,ROS),大量積累的ROS能夠對植物體內的核酸、脂質、蛋白質等生物大分子產生傷害[1]。為了保持細胞內部氧化還原的平衡,植物在長期進化過程中發(fā)展出幾種酶和非酶系統(tǒng)來緩解由活性氧引起的氧化損傷,其中超氧化物歧化酶(superoxide dismutase,SOD)是植物用來清除活性氧的一種關鍵酶。SOD能夠催化植物體內分子氧活化的中間產物超氧陰離子自由基(O2-·)的歧化反應從而生成氧分子和過氧化氫,在逆境脅迫下增強SOD基因表達能夠提高植物清除活性氧的能力,增強植物的抗逆性[2]。超氧化物歧化酶按照金屬輔基主要分為鐵(Fe)SOD、(錳)SOD和(銅/鋅)SOD 3種。許多研究表明,MnSOD與作物的抗逆性有著密切的關系。Tanaka等利用酵母MnSOD在水稻中過量表達提高了轉基因植株對鹽脅迫的耐受性,轉基因植株的SOD和抗壞血酸過氧化物酶(ascorbate peroxidase,APX)活性在鹽脅迫處理條件下能夠提高1.5~2.0倍[3];韓利芳等將煙草MnSOD基因轉入苜蓿中提高了轉基因植株的MnSOD活性[4];王丙鋒等將檉柳MnSOD基因轉化到酵母基因組中,提高了酵母的抗旱和耐高溫的能力[5];陳莉等在仙客來中過表達MnSOD基因,提高了轉基因植物對高溫脅迫的抗性[6]。

        小麥是我國重要的糧食作物之一,但干旱、低溫和鹽堿等非生物脅迫嚴重影響其產量[7]。為此,本研究從小麥葉片中克隆MnSOD基因全長序列,并對該基因蛋白在生物信息學分析的基礎上構建了pET32-TaMnSOD原核表達載體,在大腸桿菌中用異丙基硫代半乳糖苷(IPTG)成功誘導表達出目的蛋白,為小麥MnSOD蛋白的進一步分離純化和基因的表達、提高小麥對逆境脅迫的適應能力奠定基礎。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 試驗材料 本試驗小麥品種為矮抗58,由河南科技學院小麥中心提供。2016年5月選取顆粒飽滿、大小一致的種子用0.1% HgCl2消毒10 min后,用流水沖洗5次后置于鋪有濾紙的培養(yǎng)皿中發(fā)芽,3 d后選取發(fā)芽的小麥種子播種至含有混合營養(yǎng)基質的營養(yǎng)缽內,在16 h光照(28 ℃)—8 h黑暗(25 ℃)培養(yǎng)箱中培養(yǎng),3葉期時,取新鮮嫩葉用液氮速凍后,-80 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.1.2 菌株與試劑 原核表達載體pET-32a、大腸桿菌(Escherichiacoli)DH5α及表達菌株BL21(DE3)均由河南科技學院生命科技學院分子生物學實驗室保存。pGM-T載體、DNA凝膠回收試劑盒、TaqDNA聚合酶及質粒小量抽提試劑盒均購自TIANGEN公司;T4 DNA連接酶、限制性內切酶購自TaKaRa公司;其余試劑均為國產分析純。

        1.2 方法

        1.2.1 小麥葉片總RNA的提取和cDNA的合成 參照Trizol試劑盒說明書提取小麥葉片的總RNA。調整提取的RNA濃度為200 ng/μL,用PrimeScriptTMRT reagent Kit(Perfect Real Time)(TaKaRa,大連)按操作說明合成cDNA第1鏈。

        1.2.2 小麥MnSOD基因的克隆 根據GenBank公布的小麥MnSOD基因序列(GenBank登錄號:AF092524)設計特異性引物MnSOD-F1(5′-CCATGGCGCTCCGCACGTT-3′)和MnSOD-R1(5′-GTGTCACCTCTATGCAATGT-3′)。以cDNA為模板進行PCR擴增,PCR反應程序:94 ℃預變性 5 min;94 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸30 s,33個循環(huán);72 ℃延伸5 min。PCR產物經1.5%瓊脂糖凝膠電泳檢測,回收純化PCR產物。將回收的目的片段與pGM-T載體連接后轉化DH5α感受態(tài)細胞,挑取陽性克隆進行PCR鑒定后送北京三博遠志生物技術有限公司進行測序。

        1.2.3 小麥MnSOD基因的生物信息學分析 用ProtParam(http://web.expasy.org/protparam/)分析小麥MnSOD編碼氨基酸序列的物理性質;用Predict protein預測MnSOD基因編碼蛋白的二級結構;用SMATER分析MnSOD基因編碼蛋白的氨基酸序列的保守結構域;利用BlastP(http://www.ncbi.nlm.nih.gov/BLAST)進行同源性搜索,選取與小麥MnSOD同源性較高的植物的MnSOD氨基酸序列,利用DNAMAN 8.0進行多序列比對,用Mega 5.0軟件構建系統(tǒng)發(fā)育樹。

        1.2.4 原核表達載體的構建 根據獲得的小麥MnSOD編碼區(qū)序列設計原核表達引物MnSOD-F2(5′-CGGGATCCATGGCGCTCCGCACGTTG-3′,下劃線部分為BamHⅠ酶切位點)和MnSOD-R2(5′-CCCAAGCTTCGCAAGCACTTTTTC ATA-3′,下劃線部分為Hind Ⅲ酶切位點),以小麥葉片cDNA為模板進行PCR擴增。用T4連接酶將回收純化的PCR產物與pGM-T載體于16 ℃連接過夜,轉化大腸桿菌感受態(tài)細胞DH5α,挑取單克隆進行測序分析。將測序正確的pGM-TaMnSOD質粒與原核表達載體pET-32a分別用BamHⅠ和Hind Ⅲ進行雙酶切操作,回收目的片段,經T4連接酶連接后,轉化DH5α感受態(tài)細胞,抽提質粒經PCR和雙酶切鑒定,獲得原核表達載體pET32a-TaMnSOD。

        1.2.5 重組質粒融合蛋白的表達 將測序正確的pET32a-TaMnSOD重組質粒熱激轉化至大腸桿菌BL21(DE3)感受態(tài)細胞中,涂布于含有卡那霉素的LB平板上。挑取陽性克隆于含有卡那霉素的5 mL LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃、200 r/min培養(yǎng)12 h。按1%的接種量接種到10 mL LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃、200 r/min振蕩培養(yǎng)至D600 nm為0.5左右,加入終濃度為0.5 mmol/L的IPTG誘導3 h。5 000 r/min離心5 min收集菌體,加入SDS-PAGE(十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳)上樣緩沖液煮沸10 min,取10 μL進行SDS-PAGE(5%濃縮膠,12%分離膠),分析蛋白表達結果。

        2 結果與分析

        2.1 小麥MnSOD基因的克隆

        以小麥葉片cDNA為模板進行逆轉錄PCR(RT-PCR),擴增產物經瓊脂糖凝膠電泳檢測,在分子量相當于750 bp左右擴增出1條清晰的條帶(圖1),與預測大小相符,推斷其為小麥MnSOD基因序列。測序結果表明,該基因全長813 bp。采用NCBI(美國國立生物技術信息中心)的ORF Finder分析發(fā)現,該序列包含1個675 bp的開放閱讀框,編碼224個氨基酸,起始密碼子為ATG,終止密碼子為TGA(圖2)。

        2.2 小麥MnSOD基因的生物信息學分析

        用ProtParam預測TaMnSOD基因編碼蛋白的相對分子量為24.56 ku,分子式為C1 119H1 724N300O318S3,等電點(pI)為6.83。理論推導其半衰期約為30 h,不穩(wěn)定參數為29.56,蛋白質性質穩(wěn)定(不穩(wěn)定參數在40以下為穩(wěn)定蛋白)??偟膸ж撾姾傻臍埢?Asp+Glu,即天冬氨酸+谷氨酸)為24個,總的帶正電荷的殘基(Arg+Lys,即精氨酸+賴氨酸)為23個。親水性平均數為-0.269,預測該蛋白為親水性蛋白,其脂肪指數為91.52。用TMHMM-2.0(http://www. cbs. dtu. dk / services / TMHMM-2.0)對TaMnSOD的氨基酸序列進行分析,沒有跨膜結構域,沒有信號肽,是一個可溶性蛋白質。MnSOD蛋白二級結構預測結果顯示,在整個蛋白中,α-螺旋占35.71%,β-折疊占15.18%,無規(guī)則卷曲占27.23%,延伸鏈占 21.88%。將推測的TaMnSOD氨基酸序列在GenBank上進行Blast比對后,采用DNAMAN 6.0軟件進行多重序列比對。將克隆的TaMnSOD基因編碼的氨基酸序列與GenBank中其他植物的MnSOD氨基酸序列進行比對,發(fā)現該基因編碼蛋白與大麥(BAK03227)、二穗短柄草(XP_010231530)、水稻(XP_015640127)的MnSOD具有較高的同源性,氨基酸相似性分別達到95.13%、88.70%、82.68%(圖3)。進一步經Clustal W聚類分析后,利用Mega 5.0軟件采用相鄰連接法繪制進化樹,結果表明,本研究克隆的小麥TaMnSOD基因編碼的蛋白和大麥的親緣關系最近(圖4)。

        2.3 原核表達載體的構建與鑒定

        使用BamH Ⅰ和Hind Ⅲ雙酶切質粒pET32-TaMnSOD,切出來的片段與預期結果大小一致,表明TaMnSOD基因已經插入載體pET-32a中(圖5)。酶切鑒定正確的陽性克隆,經測序后顯示插入的外源基因序列與預期片段序列一致,未出現堿基突變及移碼現象。由此表明,pET32-TaMnSOD原核表達載體構建成功。

        2.4 MnSOD基因重組蛋白的SDS-PAGE分析

        將構建成功的重組表達質粒pET32-TaMnSOD轉化大腸桿菌BL21(DE3)感受態(tài)細胞,在37℃、IPTG濃度為0.5 mmol/L 條件下,分別誘導1、2、3、4 h后進行SDS-PAGE分析。圖6結果表明,與對照相比,pET32-TaMnSOD轉化菌經IPTG誘導后,在相對分子質量為45 ku左右處有1條蛋白條帶,除去載體PET32自身表達的20 ku蛋白后,結果與預期的目的蛋白(24.56 ku)大小一致。

        3 討論

        植物在不利環(huán)境脅迫(鹽漬、干旱、高溫、低溫等)下其細胞代謝過程不協調會引起ROS大量積累,構成氧化脅迫威脅植物的細胞結構[8-9]。因此,采用分子生物學手段,對植物的氧化代謝進行修飾,提高植物抗氧化脅迫的能力,是植物抗性研究的方向之一[10-11]。SOD是植物細胞防御系統(tǒng)中重要的保護酶類,在防御活性氧傷害中起著關鍵性的作用,其活性高低與植物的抗逆能力密切相關[12]。目前,植物中許多MnSOD基因已經被克隆并用來轉化不同植物,獲得了SOD活性增強的轉基因植株。鄧婷婷等將極端耐鹽的鹽生杜氏藻的DsMnSOD基因轉化SOD缺陷型大腸桿菌并誘導其表達,結果表明,轉染后的大腸桿菌在耐鹽和抗寒等方面的耐受性明顯提高[13]。付暢等將西伯利亞蓼PsMnSOD基因轉入酵母中,提高了酵母在鹽堿脅迫下的SOD活性,并提高了酵母對鹽堿脅迫的抗性,表明PsMnSOD基因在抵御鹽堿脅迫中起到非常重要的作用[14]。另外,MnSOD在轉基因煙草、苜蓿和棉花等植物中的過量表達提高了它們對氧化脅迫的耐受性[10]。由此表明,MnSOD基因對于增強植物的抗逆能力具有重要作用。

        目前,用于表達重組蛋白的外源系統(tǒng)主要有大腸桿菌系統(tǒng)、酵母表達系統(tǒng)和動物細胞表達系統(tǒng)[15-17]。大腸桿菌表達系統(tǒng)因其具有遺傳背景清楚、結構簡單、外源蛋白表達量高以及基因表達調控機制明確等優(yōu)點,已經成為目前最常用的表達宿主[18]。真核生物基因的原核表達受表達載體、宿主菌、IPTG濃度、溫度、誘導表達時間等因素的影響[19-20]。本試驗采用目前應用最廣泛的pET大腸桿菌表達系統(tǒng)進行原核表達,該系統(tǒng)能與Tag(標簽)連接進行融合蛋白表達,目的蛋白易于純化,并且具有操作方便、表達量大等優(yōu)點[21]。一般 37 ℃、0.5 mmol/L 終濃度的IPTG適合絕大多數的蛋白表達,本研究采用該條件進行原核表達,所表達出的融合蛋白與目的蛋白相對分子量一致。

        本研究從小麥葉片中克隆到Mn超氧化物歧化酶基因TaMnSOD,其編碼蛋白與其他植物中的MnSOD具有較高的相似性。將TaMnSOD基因與原核表達載體PET-32a構建融合表達載體,在大腸桿菌BL21(DE3)中成功表達,從而為小麥MnSOD基因編碼蛋白功能研究提供理論基礎。

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