韓慧敏,舒明明,揣云海,陳夢楠,郝鎂娟,商 微,封志純
胚胎植入前遺傳學(xué)篩查(preimplantation genetic screening, PGS)也稱胚胎植入前非整倍性篩查即對行體外受精(invitrofertilization, IVF)發(fā)育到第 3天或第 5天的胚胎進行染色體非整倍性篩查,選擇整倍性染色體胚胎移植,以提高臨床妊娠率(clinical pregnancy rate,CPR),降低早期流產(chǎn)率。育齡婦女初次妊娠的自然流產(chǎn)率約為5%~13%,而2次自然流產(chǎn)后再次流產(chǎn)的發(fā)生率約為24%~29%[1]。美國生殖醫(yī)學(xué)學(xué)會(ASRM)[2]和美國婦產(chǎn)科醫(yī)師學(xué)會(ACOG)[3]將復(fù)發(fā)性流產(chǎn)(recurrent spontaneous abortion,RSA)定義為2次或者2次以上的妊娠丟失。RSA的病因復(fù)雜,包括遺傳學(xué)因素、解剖學(xué)因素、內(nèi)分泌因素、感染因素、免疫功能異常、抗磷脂綜合征及獲得性血栓前狀態(tài)等,其中大部分RSA的發(fā)生都與胚胎的非整倍體狀態(tài)相關(guān),有研究[4]顯示RSA中胚胎非整倍體率超過50%。該文通過分析行PGS的高齡和RSA患者染色體的異常發(fā)生率及其臨床結(jié)局,一是提高上述兩種情況的活產(chǎn)率;二是為PGS技術(shù)的進一步推廣提供臨床數(shù)據(jù)支持。
1.1試劑和儀器G1、G2培養(yǎng)基購自瑞典Vitrolife公司;Covaris S2系統(tǒng)超聲購自美國Covaris公司;Qiagen純化試劑盒購自德國Qiagen公司;DNA建庫試劑盒購自美國New England Biolabs公司;HiSeq2500系統(tǒng)購自美國Illumina公司。
圖1 單細胞染色體高通量測序檢測流程
1.2研究對象和方法
1.2.1病例資料 回顧性分析2014年12月~2017年3月在中國人民解放軍海軍總醫(yī)院生殖醫(yī)學(xué)中心行PGS 91例患者125個周期的臨床資料,患者年齡25~45(34.06±5.20)歲,體質(zhì)指數(shù)(21.34±3.0)kg/m2,基礎(chǔ)促卵泡生成素(7.95±4.1)mIU/ml。其中RSA患者54例,均有2次或2次以上的自然流產(chǎn)史;高齡患者47例(>35歲),最大年齡為45歲;其中高齡的RSA患者10例。所有患者行PGS前簽署知情同意書。
1.2.2胚胎培養(yǎng)、活檢 MII(Metaphase II)期卵母細胞采用單精子胞漿內(nèi)注射(intracytoplasmic sperm injection ,ICSI)方式進行體外受精,G1培養(yǎng)基中進行培養(yǎng), 48 h后卵裂胚轉(zhuǎn)移至G2培養(yǎng)基中繼續(xù)培養(yǎng)48~72 h。對卵裂期或囊胚期的胚胎進行活檢。一般活檢單個卵裂球細胞或4~8個囊胚滋養(yǎng)層細胞,活檢后的胚胎行玻璃化冷凍,液氮中長期保存。
1.2.3全基因組擴增及測序 所有活檢標本的單細胞全基因組擴增均采用多次退火環(huán)狀循環(huán)擴增技術(shù)(multiple annealing and looping-basedamplification cycle, MALBAC)。首先,擴增是通過將DNA退火到一個隨機引物庫中,與由27個通用核苷酸序列和8個簡并堿基組成的隨機引物結(jié)合,然后進行線性預(yù)擴增和指數(shù)擴增,最終產(chǎn)生2 μg的全基因組DNA用于高通量測序。用Covaris S2系統(tǒng)超聲將400 ng純化好的DNA擴增產(chǎn)物打斷成150~250 bp片段,再用Qiagen純化試劑盒進行純化,DNA建庫試劑盒進行建庫(圖1),HiSeq2500系統(tǒng)進行上機測序。
1.2.4數(shù)據(jù)分析 HiSeq 2500平臺全基因組擴增后的每個樣本產(chǎn)生約2 Mb reads的數(shù)據(jù)量,高質(zhì)量的reads與hg19參考基因組進行比對。染色體拷貝數(shù)分析按以下方法進行:整個參考基因組分為若干個1 Mb大小不重疊的窗口,計算每個窗口的Reads數(shù)目,通過R語言對每個窗口GC含量矯正后的Reads 數(shù)目進行作圖,使拷貝數(shù)變異可視化。
1.2.5胚胎移植 活檢后的胚胎行玻璃化凍存,PGS檢測結(jié)果正常的胚胎將在復(fù)蘇周期中移植入宮腔,并進行個體化黃體支持。
1.3分析指標及判定標準本研究的主要觀測指標為胚胎染色體異常率、CPR,持續(xù)妊娠率(ongoing pregnancy rate,OPR),流產(chǎn)率(miscarriage rate,MR)。異常胚胎率(%)=檢測回報異常的胚胎數(shù)目/送檢胚胎數(shù)×100%,CPR(%)=B超下可見孕囊的周期數(shù)/移植周期數(shù)×100%,OPR(%)=持續(xù)妊娠周期數(shù)/移植周期數(shù)×100%,MR(%)=流產(chǎn)周期數(shù)/妊娠周期數(shù)×100%。
圖2 染色體整倍性胚胎(46,XN)
圖3 多條染色體異常的胚胎[46,XN,-4(×1,mos*),13(×1,mos*),-21(×1,mos*),-22(×1,mos*)]
圖4 2號染色體單體,9號染色體三體的胚胎[46,XN,-2(×1),+9(×3)]
2.1胚胎異常率本研究共對91例患者125個取卵周期的526枚胚胎進行PGS,其中卵裂胚74枚,囊胚452枚,526枚胚胎檢測結(jié)果顯示有355枚胚胎為染色體異常,胚胎染色體異常率為67.49%(355/526)。RSA患者83個PGS周期共檢測胚胎329枚,217枚胚胎為染色體異常,染色體異常率為65.96%(217/329);高齡患者79個PGS周期數(shù)共檢測胚胎243枚,177枚胚胎為染色體異常,染色體異常率為72.84%(177/243),合并RSA和高齡的患者10例,共37個取卵周期。見表1。本研究主要篩查出的染色體異常包括微小缺失、與重復(fù)(10 Mb以上的片段缺失和重復(fù))和非整倍體 (mosaic, mos)表示嵌合疑似,圖2~4分別為其中3類染色體拷貝數(shù)檢測結(jié)果圖,其中圖2為整倍體胚胎,可用于移植,圖3為多條染色體異常的胚胎,圖4為2號染色體單體、9號染色體三體的異常胚胎,這兩類胚胎均不可用于移植。
表1 患者的染色體異常率與臨床妊娠結(jié)局[%(n/n)]
2.2PGS的妊娠結(jié)局本研究91例行PGS助孕患者共實施74個單胚胎凍融移植周期,臨床妊娠42例,CPR為56.76%(42/74);自然流產(chǎn)發(fā)生1例,MR為2.38%(1/42);持續(xù)妊娠41例,OPR為 55.41%(41/74)。其中符合RSA患者共進行了50個解凍移植周期,臨床妊娠28例,其CPR為56.00%(28/50);持續(xù)妊娠27例,OPR為 54.00%(27/50);自然流產(chǎn)發(fā)生1例,MR為3.57%(1/28)。高齡患者共進行了28個解凍移植周期,高齡患者的臨床妊娠16例,CPR為57.14%(16/28);持續(xù)妊娠15例,OPR為 53.57%(15/28);自然流產(chǎn)1例,MR為6.25%(1/16)。其中有10例患者合并有高齡和RSA,共行4次解凍移植周期,其中2例患者在持續(xù)妊娠中,1例流產(chǎn),1例未孕。兩組分組中均納入了這10例患者。見表1。將高齡患者進一步分為35~40歲組和>40歲組觀察其臨床結(jié)局。35~40歲組患者送檢胚胎145枚,其中胚胎染色體異常95枚,胚胎異常率為65.51%(95/145)。35~40歲組患者共進行了22個解凍移植周期,臨床妊娠14例,CPR為63.63%(14/22);自然流產(chǎn)1例,MR為7.14%(1/14)。>40歲組患者送檢胚胎98枚,其中胚胎染色體異常82枚,>40歲組的胚胎異常率為83.67%(82/98)。>40歲組患者共進行了6個解凍移植周期,臨床妊娠2例,CPR為33.33%(2/6),其中>40歲組胚胎異常率明顯高于35~40歲組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),>40歲組的CPR和MR均低于35~40歲組,但差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P>0.05),見表2。
表2 兩組高齡患者臨床結(jié)局[%(n/n)]
人類胚胎的染色體異常率在40%~60%,40歲以上女性染色體異常率可達80%。有報道表明<35歲的女性胚胎著床率約為30%,而40歲以上女性胚胎著床率僅為6%[5],患者高齡及移植了非整倍體胚胎是導(dǎo)致IVF過程中胚胎著床率降低的主要原因。PGS 是早于產(chǎn)前篩查及產(chǎn)前診斷的遺傳學(xué)篩查方式,可通過篩查出染色體正常的胚胎改善IVF妊娠結(jié)局,在我國主要用于高齡、反復(fù)種植失敗、RSA及攜帶異常染色體的不孕患者[6]。
近年來隨著全基因組擴增技術(shù)的應(yīng)用和發(fā)展,比較基因組雜交(comparative genomic hybridization, CGH),第二代基因測序技術(shù)(next generation sequencing,NGS)因可進行全基因組的染色體篩查,漸取代了早前的熒光原位雜交技術(shù),本研究中對所采取的MALBAC-NGS-PGS技術(shù)是一種新的PGS技術(shù),具有均一性好、等位基因脫口率低、擴增成功率高等特點,已經(jīng)成功應(yīng)用于單細胞全基因組擴擴增,及單個卵母細胞和精子測序[7],與CGH相比在檢測異常染色體敏感性和準確性上并無差別,但只需要0.04 x的測序深度就可以進行全染色體篩查,且通量高,速度快, 成本低,利于PGS在臨床推廣使用[8]。
本研究采用MALBAC-NGS-PGS技術(shù)對高齡及RSA患者125個周期526枚胚胎進行PGS檢測,結(jié)果顯示,RSA和高齡患者(>35歲)胚胎染色體異常率分別達65.96%和 72.84%,其中40歲以上患者的胚胎異常率高達83.67%。 RSA及高齡患者行PGS后,選擇染色體正常的單胚胎移植CPR可達56.76%,MR僅為2.38%,進一步證實通過PGS可以有效篩查出高齡和RSA患者的非整倍體胚胎,降低因胚胎染色體數(shù)量異常導(dǎo)致的流產(chǎn)的風(fēng)險,有效改善這兩類患者的妊娠結(jié)局。另外,還進一步將高齡人群以年齡40歲為界分為兩組進行比較。結(jié)果表明40歲以上組的患者非整倍體胚胎率明顯高于35~40組(P<0.05),進一步驗證了Kuliev et al[9]和Pellestor et al[10]之前的研究,即認為女性年齡與胚胎染色體異常發(fā)生率成正相關(guān)的觀點。但是本研究中35~40歲組和>40組之間的CPR和MR差異均無統(tǒng)計學(xué)意義,這可能是由于本研究中>40歲組患者的移植周期數(shù)相對較少有關(guān),因此還需進一步擴充樣本量,完善研究。
但PGS的臨床應(yīng)用仍存在許多局限性,如 PGS檢測是一種侵入性檢查,可能會在一定程度上降低胚胎質(zhì)量和發(fā)育潛能[11];人類胚胎活檢的長期生物安全性尚未得到證實,有研究[12-13]表明胚胎活檢可對動物胚胎神經(jīng)和腎上腺發(fā)育產(chǎn)生負面影響;此外PGS需具備昂貴的儀器設(shè)備以及受過特殊訓(xùn)練和經(jīng)驗豐富的胚胎學(xué)家,增加患者的經(jīng)濟成本[14],但隨PGS技術(shù)的進一步完善和經(jīng)濟成本的下降,將在改善高齡、RSA患者及染色體異常攜帶者IVF結(jié)局方面發(fā)揮更大的作用。