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        長鏈非編碼RNA調(diào)節(jié)痛風(fēng)炎癥信號通路的研究進展

        2019-01-03 08:40:16楊顏瑜熊琴譚敏權(quán)亞萍張全波
        中華老年多器官疾病雜志 2019年6期
        關(guān)鍵詞:信號

        楊顏瑜,熊琴,譚敏,權(quán)亞萍,張全波

        (川北醫(yī)學(xué)院附屬醫(yī)院老年醫(yī)學(xué)科,南充637000)

        痛風(fēng)是單鈉尿酸鹽晶體沉積于滑液或其他組織,導(dǎo)致關(guān)節(jié)紅腫熱痛反復(fù)發(fā)生及組織損傷的一種癥狀。Framingham研究表明,在美國痛風(fēng)的患病率為3.9%,影響著大約830萬成年人,是成年人中最常見的炎癥性關(guān)節(jié)炎,其中男性和女性的痛風(fēng)患病率分別為4‰與1.4‰,且隨著生活習(xí)慣和飲食結(jié)構(gòu)改變,其患病率正呈逐年上升趨勢[1]。痛風(fēng)的發(fā)病機制與免疫功能紊亂、多條炎癥信號通路激活相關(guān)。有研究表明,在痛風(fēng)性關(guān)節(jié)炎患者和健康體檢者外周血單核細胞(peripheral blood mononuclear cells,PBMCs)中,長鏈非編碼RNA(long non-coding RNAs,LncRNAs)的表達譜存在明顯差異[2],提示LncRNAs可能參與了痛風(fēng)性關(guān)節(jié)炎的發(fā)病。因此研究LncRNAs與痛風(fēng)炎癥通路的關(guān)系可能會進一步揭示痛風(fēng)的發(fā)病機制,并對痛風(fēng)的早期預(yù)防、診斷、治療提供新的思路。

        1 LncRNAs

        LncRNAs是基因轉(zhuǎn)錄組的重要組成部分,其長度大于200個核苷酸,且不具有蛋白質(zhì)編碼功能,該概念由日本科學(xué)家于2002年時首次提出[3]。新一代的測序技術(shù)發(fā)現(xiàn)大多數(shù)基因組DNA通常轉(zhuǎn)錄成LncRNAs,其量遠遠超過編碼RNA,且在染色質(zhì)修飾、轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后及蛋白質(zhì)編碼水平都發(fā)揮著重要作用[4,5]。LncRNAs廣泛表達于樹突狀細胞、巨噬細胞、中性粒細胞、自然殺傷(natural killer,NK)細胞、T細胞和B細胞,參與免疫細胞分化與活化,通過激活或抑制轉(zhuǎn)錄因子,調(diào)節(jié)信使核糖核酸(messenger RNA,mRNA)和microRNA的穩(wěn)定性,從而參與多種疾病發(fā)生,包括炎癥性腸病、糖尿病、多發(fā)性硬化、類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎、肺癌及乳腺癌等[6]。隨著LncRNAs被發(fā)現(xiàn)的生物學(xué)功能越來越多,其特異性表達的特點已用于疾病的靶向治療[7]。

        2 LncRNAs與痛風(fēng)

        2.1 表達譜差異

        單鈉尿酸鹽(monosodium urate,MSU)誘發(fā)的炎癥反應(yīng)是慢性痛風(fēng)患者骨質(zhì)破壞的關(guān)鍵調(diào)節(jié)劑,通過微陣列分析認為,MSU刺激的小鼠巨噬細胞中LncRNA-Jak3是與MSU相關(guān)的功能性促破骨細胞基因,能夠誘導(dǎo)破骨細胞分化,且通過對比痛風(fēng)患者與健康體檢者外周血標本發(fā)現(xiàn),前者LncRNA-Jak3表達明顯上調(diào)[8]。Chu等[9]采用基因芯片分析發(fā)現(xiàn),在類風(fēng)濕關(guān)節(jié)炎以及痛風(fēng)性關(guān)節(jié)炎中存在766個差異表達的LncRNAs,其中在痛風(fēng)性關(guān)節(jié)炎患者中155個上調(diào),611個下調(diào)。而姚承佼[10]利用LncRNAs表達譜芯片發(fā)現(xiàn),在原發(fā)性痛風(fēng)患者與健康體檢者之間,存在2倍以上差異表達的LncRNAs共1 815個,其中在原發(fā)性痛風(fēng)患者中上調(diào)表達875個,下調(diào)表達940個,如AJ227913、AK001903、ENSG00000239182表達上調(diào),lnc-CCDC64B-1:8表達下調(diào),采用實時定量聚合酶鏈反應(yīng)(quantitative real-time PCR,RT-PCR)擴大樣本量后對篩選出感興趣的LncRNAs進行驗證,其結(jié)果與基因芯片結(jié)果基本吻合。

        2.2 高尿酸血癥

        高尿酸血癥是痛風(fēng)發(fā)生發(fā)展的重要生物化學(xué)基礎(chǔ),然而只有一部分高尿酸血癥患者會進展到痛風(fēng)階段,這與個體的遺傳異質(zhì)性有關(guān)。全基因組關(guān)聯(lián)研究(genome-wide association studies,GWAS)證實了尿酸排泄在痛風(fēng)發(fā)展中的重要性,并確定了35個與血清尿酸鹽濃度有關(guān)的基因位點,而LncRNAs通過調(diào)節(jié)染色質(zhì)及基因表達,可參與生物體的遺傳過程[11]。

        2.3 固有免疫

        高尿酸作為損傷相關(guān)分子模式(damage-associated molecular patterns,DAMPS)之一,當沉積析出尿酸鹽晶體時,可觸發(fā)機體固有免疫系統(tǒng),誘導(dǎo)炎癥因子如白細胞介素-1(interleukin-1,IL-1)的產(chǎn)生,而IL-1又可加重痛風(fēng)炎癥。由此可見,痛風(fēng)的發(fā)生與機體固有免疫密切相關(guān)。另外,LncRNAs在免疫細胞的分化和活化中起著重要作用[12]。Wang等[13]發(fā)現(xiàn)了一種在樹突狀細胞(dendritic cells,DC)中特異性表達的 LncRNA,即Lnc-DC,指出Lnc-DC通過抑制信號傳導(dǎo)及轉(zhuǎn)錄激活因子3(signal transducers and activators of transcription 3,STAT3)去磷酸化促進DC的成熟并激活T細胞應(yīng)答在單核細胞向DC分化時,表達廣泛上調(diào),進而影響機體的固有免疫。Mitchell等[14]于2009年首次提出LncRNA-COX2具有調(diào)控固有免疫的作用,其位于環(huán)氧合酶2(cyclooxygenase-2,COX2)蛋白編碼基因的上游,與COX2基因間距52 kb,在細胞核與細胞質(zhì)中與巨噬細胞特異性結(jié)合,是一個重要的免疫基因[15]。隨著基因芯片與測序技術(shù)的發(fā)展,越來越多的LncRNAs被證明與固有免疫有關(guān),例如:LncRNA-Lethe、LncRNA-PACER、LncRNA-THRIL、LncRNA-NEAT1等[16]。

        3 相關(guān)炎癥信號通路

        痛風(fēng)的發(fā)病機制涉及機體的多條炎癥信號通路[17]。其中細胞膜Toll樣受體(Toll-like receptors,TLRs)通路和細胞質(zhì)核苷酸結(jié)合寡聚化結(jié)構(gòu)域樣受體蛋白(nucleotide-binding oligomerization domain receptor protein,NLRP)通路目前研究最廣泛[18]。下面主要從LncRNAs與這兩條信號通路的關(guān)系進行論述。

        3.1 TLRs

        痛風(fēng)的發(fā)生離不開炎癥反應(yīng)細胞的參與,而TLRs信號轉(zhuǎn)導(dǎo)在炎癥細胞的募集和激活中起關(guān)鍵作用,因此,了解這些細胞對細胞因子和趨化因子的調(diào)節(jié)作用將對痛風(fēng)的發(fā)作和緩解提供更多線索。TLRs屬于模式識別受體家族,可識別病原相關(guān)分子模式,目前研究表明,與痛風(fēng)性關(guān)節(jié)炎相關(guān)的TLRs包括TLR2、TLR4、TLR接頭蛋白分子髓樣分化因子88(myeloid differentiation factor 88,Myd88)以及核因子-κB(nuclear factor-κB,NF-κB)。

        3.1.1 LncRNAs與TLR2 研究發(fā)現(xiàn),LncRNA-THRIL和LncRNA-COX2在TLR2介導(dǎo)的免疫反應(yīng)中扮演著重要角色[6]。LncRNA-THRIL是在巨噬細胞中最新鑒定的LncRNA,可通過與異質(zhì)核核糖蛋白L(heterogeneous nuclear ribonucleoprotein L,hnRNP-L)結(jié)合形成功能性復(fù)合物,在TNF-α基因啟動子區(qū)域調(diào)節(jié)腫瘤壞死因子-α(tumor necrosis factor-α,TNF-α)表達。在TLR2配體(Pam3CSK4)刺激后TNF-α表達上升,而LncRNA-THRIL表達下調(diào),由此可見,LncRNA-THRIL可作為保護性反饋因子,抑制炎癥反應(yīng)發(fā)生[19]。Carpenters等[15]鑒定出一種位于前列腺內(nèi)環(huán)氧化物合成酶2(prostaglandin endoperoxide synthase 2,PTGS-2)附近的LncRNA,即LncRNA-COX2,其作為一種廣泛的調(diào)控元件,可介導(dǎo)不同類型免疫基因的激活與抑制。當Pam3CSK4刺激巨噬細胞時,COX2表達升高,并通過與hnRNP-A/B和hnRNP-A2/B1形成復(fù)合物,抑制炎癥靶基因轉(zhuǎn)錄,當使用短發(fā)夾RNA(short hairpin RNA,shRNA)敲除小鼠巨噬細胞中LncRNA-COX2時可導(dǎo)致促炎基因表達減少。

        3.1.2 LncRNAs與TLR4 TLR4是脂多糖(lipopolysaccharides,LPS)刺激下革蘭氏陰性菌的主要模式識別受體[6],LncRNA-PACER是人單核細胞及乳腺上皮細胞中最早控制TLR4信號轉(zhuǎn)導(dǎo)的LncRNAs之一。Krawczyk等[20]采用RNA結(jié)合蛋白免疫沉淀技術(shù)(RNA-binding protein immunoprecipitation,RIP)證明LncRNA-PACER可與NF-κB的小亞基p50特異性結(jié)合,促進COX2基因表達,通過參與前列腺素的生物合成,參與炎癥反應(yīng)。LncRNA-NKILA是另一個調(diào)節(jié)TLR4的LncRNA,在人類炎癥刺激的乳腺癌細胞中可與NF-κB/抑制因子κB(inhibitator factor κB,IKB)復(fù)合物結(jié)合遮蓋磷酸化位點,阻止IκB激酶(IκB kinase,IKK)誘導(dǎo)的磷酸化和 NF-κB激活,被敲除后可致細胞凋亡減少和細胞侵襲性增強。LncRNA-NKILA作為NF-κB信號傳遞的“守門人”,能夠抑制NF-κB活性,抑制癌癥細胞轉(zhuǎn)移[21]。除此之外,LncRNA-EPS是一種促進紅細胞成熟的LncRNA,其在靜息的巨噬細胞中高度表達,但TLR配體的激活可抑制其表達。LncRNA-EPS通過TLR4誘導(dǎo)其3′末端CANACA基序與hnRNPL相互作用,抑制核小體轉(zhuǎn)位與基因轉(zhuǎn)錄,防止免疫基因、慢性炎癥和免疫病理的自發(fā)激活,但在LncRNA-EPS缺失的細胞中可促進細胞凋亡,加重炎癥反應(yīng)[22, 23]。

        3.1.3 LncRNAs與TLR2/TLR4 在TLR2/TLR4刺激下,LncRNA-IL-17R表達上調(diào),過表達的LncRNA-IL-17R可抑制LPS誘發(fā)的炎癥反應(yīng)[6]。此外LncRNA-Ehd1和LncRNA-Lyn同樣也受TLR2和TLR4的刺激[15]。

        3.1.4 LncRNAs與Myd88 Myd88是TLRs信號通路中的重要轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白,由296個氨基酸組成,包括C端的Toll/IL-1受體(Toll/interleukin-1 receptor,TIR)結(jié)構(gòu)域與N端的死亡結(jié)構(gòu)域(death domain,DD),其中DD通過與IL-1受體相關(guān)激酶(IL-1 receptor associated kinase,IRAK)家族蛋白分子IRAK1及IRAK2結(jié)合成信號傳導(dǎo)復(fù)合物,活化不同的信號途徑,參與炎癥反應(yīng)的發(fā)生。實驗表明,在肝癌組織中,LncRNA-Myd88作為一種新型LncRNA,位于Myd88基因的上游,與Myd88間距20 kb。LncRNA-Myd88的表達與Myd88呈正相關(guān),但轉(zhuǎn)錄方向與Myd88相反,可促進肝癌細胞的生長和轉(zhuǎn)移,促進NF-κB信號通路的激活,與疾病預(yù)后不良相關(guān)[24]。

        3.1.5 LncRNAs與NF-κB 研究表明,NF-κB信號傳導(dǎo)失調(diào)與炎癥、自身免疫病、癌癥、傳染病以及免疫系統(tǒng)發(fā)育不良相關(guān)[25]。到目前為止,有多個LncRNAs被證明參與NF-κB的信號轉(zhuǎn)導(dǎo)。其中與炎癥性關(guān)節(jié)炎最直接相關(guān)的是LncRNA-P21,其可通過多種機制影響細胞功能:(1)通過與hnRNP-K關(guān)聯(lián)介導(dǎo)p53依賴的靶基因轉(zhuǎn)錄;(2)通過與靶mRNA結(jié)合,以防止靶蛋白翻譯;(3)通過干擾轉(zhuǎn)錄因子之間的相互作用調(diào)節(jié)對缺氧的反應(yīng)[26]。另一個與調(diào)節(jié)NF-κB活性有關(guān)的LncRNA是表達于成纖維細胞的LncRNA-Lethe,其通過與NF-κB亞基RelA結(jié)合抑制NF-κB的DNA結(jié)合活性,在NF-κB負反饋信號傳導(dǎo)中起重要作用[27]。

        Covarrubias等[28]研究表明,在巨噬細胞中,LncRNA-AK170409在LPS和Pam3CSK4的刺激下可高度表達,但當表達降低時可導(dǎo)致NF-κB信號傳導(dǎo)顯著減弱,從而使炎癥因子IL-6表達減少。另一種LncRNA即LncRNA-MALAT1可與NF-κB亞基p65和p50相互作用抑制NF-κB 的DNA結(jié)合活性以及促炎因子TNF-α和IL-6的產(chǎn)生,但對IL-1β沒有影響,由此可見LncRNA-MALAT1可微調(diào)炎癥反應(yīng)和先天免疫,這種有效的自我控制機制有助于促炎反應(yīng)及抗炎反應(yīng)之間保持平衡[29]。也有研究表明,LncRNA-Arid2-IR可抑制IL-1β相關(guān)的NF-κB依賴性炎癥反應(yīng),其過表達后可促進IL-1β誘導(dǎo)的NF-κB信號傳導(dǎo)和炎癥細胞因子表達[30,31]。除此之外,LncRNA-HOTAIR、LncRNA-MIR31HG、LncRNA-C2dat1都可通過IKK調(diào)節(jié)NF-κB的活性[32]。

        3.2 NLRP

        3.2.1 LncRNAs與NLRP 在細胞質(zhì)中,NLRP通過其效應(yīng)結(jié)構(gòu)域募集炎性小體,并與適應(yīng)器蛋白裝配形成復(fù)合物,活化含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶-1(cysteinyl aspartate specific proteinase,caspase-1),進而介導(dǎo)炎癥因子IL-1β和IL-18轉(zhuǎn)變?yōu)榛罨问?,發(fā)揮促炎作用[33]。Zhang等[34]證實在內(nèi)皮細胞中存在的大量LncRNA-MEG3能夠促進主動脈內(nèi)皮細胞凋亡,同時通過序列互補作用抑制miR-223功能、增加NLRP3的表達并增強內(nèi)皮細胞焦磷酸化,當其過度表達時能夠使褪黑素誘導(dǎo)的NLRP3、凋亡相關(guān)斑點樣蛋白(apoptosis-associated specklike protein containing a CARD,ASC)、caspase1減少,最終致炎癥因子IL-1β和IL-18減少。

        3.2.2LncRNA-Gm4419與NLRP Yi等[35]采用轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)(RNA-Seq)與RT-PCR技術(shù)發(fā)現(xiàn),在糖尿病腎病的小鼠中有14種異常表達的LncRNAs,其中LncRNA-Gm4419的表達高度上調(diào),同時發(fā)現(xiàn)LncRNA-Gm4419可通過與NF-κB亞基P50結(jié)合,調(diào)控NLRP3的炎癥體活化,促進其表達。

        4 結(jié)語

        隨著基因測序技術(shù)的快速發(fā)展,越來越多的LncRNAs進入人們的視野,這類特殊的RNA分子廣泛參與細胞分化、免疫應(yīng)答、新陳代謝,以及多種疾病的發(fā)生發(fā)展過程。雖然其與痛風(fēng)關(guān)系的研究尚處于初級階段,但新近研究表明某些LncRNAs在痛風(fēng)患者與正常人之間存在著明顯的差異表達。在未來,我們應(yīng)重點研究LncRNAs在痛風(fēng)中的具體發(fā)病機制,相信會有更多參與調(diào)節(jié)痛風(fēng)的LncRNAs被發(fā)現(xiàn),使其成為潛在的生物標志物和治療靶點,為痛風(fēng)患者帶來福音。

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