陳文杰 蘇獻(xiàn)豪 王躍遷 王會鵬 葉桃 陳駿 趙加應(yīng) 蔡元坤
結(jié)直腸癌(colorectal cancer,CRC)是常見的腸道惡性腫瘤,目前發(fā)病率居全球第三位,據(jù)統(tǒng)計每年超過120萬新發(fā)病例,大約60萬患者死于結(jié)直腸癌,居癌癥相關(guān)死亡第四位[1]。結(jié)直腸癌的發(fā)生涉及到多因素、多階段、多途徑,近年來有研究發(fā)現(xiàn)腸道菌群失調(diào)可能在結(jié)直腸癌的發(fā)生中扮演重要角色,并且已發(fā)現(xiàn)多種細(xì)菌(產(chǎn)毒脆弱擬桿菌屬、糞腸球菌、梭桿菌屬、解沒食子酸鏈球菌等)可能是大腸致癌菌[2-5]。姜黃素是從姜黃中提取的一種天然多酚類物質(zhì),因其具有抗炎、抗感染、抗腫瘤、抗氧化、免疫調(diào)節(jié)等多種藥理作用和生物學(xué)功能[6],近年來成為研究的熱點,本實驗擬通過監(jiān)測姜黃素干預(yù)小鼠成瘤過程中小鼠腸道菌群的變化,探究姜黃素的抗癌作用機制,及腸道菌群是否是其可能的作用靶點。
實驗動物:C57BL/6小鼠,6周齡,25只,體重17~20 g,SPF級飼養(yǎng)環(huán)境,由華東師范大學(xué)實驗動物中心提供,生產(chǎn)許可證號:SCXK(滬)2011-0031。
主要試劑:氧化偶氮甲烷、右旋葡聚糖硫酸鈉、姜黃素,均由Sigma-Aldrieh公司(美國)提供。
實驗分組及安排:25只小鼠隨機分為基礎(chǔ)飲食組(BD)5只、AOM/DSS造模組(MO)10只、姜黃素干預(yù)造模組(CU)10只,所有小鼠在同等環(huán)境下飼養(yǎng)1周后開始試驗,基礎(chǔ)飲食組全程自由飲食;造模組于1、4、7周首日腹腔注射AOM(10 mg/kg),然后自由飲用2.5%DSS藥水3天后改為自由飲水[7];干預(yù)組在造模開始后進行姜黃素隔日灌胃(200 mg/kg)至處死。分別于實驗前和處死前收集小鼠糞便,-80℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
DNA提取及高通量測序:采用德國QIANEN公司生產(chǎn)的QIAamp DNA Stool Mini Kit試劑盒提取糞便樣品微生物的總DNA,具體步驟按照說明書操作,所提取的DNA于-80℃保存。高通量測序擴增細(xì)菌16SrRNA的421~460 bp區(qū) 域, 上 下 游 引 物 分 別 為 421F5?-ACTCCTACGGGAGGCAGCA-3?,460R5?-GGACTACHVGGGTWTCTAAT-3?。將得到的PCR產(chǎn)物構(gòu)建測序文庫,采用Illumina Miseq平臺測序,對高質(zhì)量測序數(shù)據(jù)進行生物信息學(xué)分析,該部分由上海美吉生物醫(yī)藥科技有限公司完成。
統(tǒng)計學(xué)處理采用SPSS 21.0軟件,計量數(shù)據(jù)以(x±s)表示,多組間差異采用方差分析,對于不滿足正態(tài)分布或方差齊性的數(shù)據(jù)采用Welch檢驗和Brown-Forsythe檢驗,P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。基于樣品測序產(chǎn)生的OTU結(jié)果,采用Qiime軟件計算beta多樣性距離矩陣,并用R語言vegan軟件包作非線性多維標(biāo)度(nonmetric multidimensional scaling,NMDS)。
造模組與姜黃素組小鼠在后期的體重增量中,造模組小鼠體重增量平均要少于姜黃素干預(yù)組(見圖1)。在第7周處死小鼠時發(fā)現(xiàn),姜黃素組小鼠結(jié)直腸腫瘤的成瘤數(shù)量、瘤體體積(見圖2、3),明顯小于造模組,提示在腫瘤的發(fā)生過程中,姜黃素起到了抑制腫瘤生成的作用。
在44例樣本中,總共獲得2 373 451條原始序列,經(jīng)過質(zhì)量過濾且Index完全匹配的有效序列和去除嵌合體之后的優(yōu)質(zhì)序列數(shù)為1 596 185,樣本序列長度主要集中在421~460 bp區(qū)域。為了便于進一步研究,對所有有效序列進行了OUT聚類,并按照最小樣本序列數(shù)進行了抽平,最終獲得339OUT單元。(見圖4)。
圖1 小鼠體重增長圖
圖2 造模組及姜黃素組成瘤圖片
圖3 成瘤數(shù)目及載瘤負(fù)荷圖
在OUTs聚類完成的基礎(chǔ)上,我們進行稀釋曲線和豐度曲線的繪制,稀釋曲線圖中可以看出開始時曲線快速上升,說明隨測序深度增加,新發(fā)現(xiàn)的細(xì)菌種類也增加;隨著測序深度增加(序列數(shù)目增多),曲線趨于平緩,當(dāng)序列數(shù)達(dá)一定數(shù)目時,基本處于平臺期,提示測序深度可以覆蓋所有細(xì)菌物種。從物種豐度曲線可以看出,相對豐度過高的菌種在各樣本中較少,隨樣本中物種組成豐富度的增加,曲線越平坦,物種組成的均勻度也就越高,不同樣本在不同的豐度達(dá)到平臺期,多數(shù)樣品所測得OTUs豐度在10至200區(qū)間。見圖5。
通過組間差異檢驗可以看出,T1點(干預(yù)前)時各組小鼠的多樣性指數(shù)差異無統(tǒng)計學(xué)意義,T2點(干預(yù)后)時MO組的多樣性指數(shù)更高,高于其他2組,與BD組比較差異有統(tǒng)計學(xué)意義(t=2.73,P=0.02),與CU組比較差異無統(tǒng)計學(xué)意義(見表1、2)。另外可以看出T2點時各組的多樣性指數(shù)均較T1點時明顯升高,其中CU組與BD在T2點時多樣性指數(shù)更接近,均小于造模組,提示化學(xué)誘導(dǎo)成瘤過程中,小鼠腸道菌群結(jié)構(gòu)出現(xiàn)變動,而姜黃素能維持腸道菌群相對穩(wěn)定。
對優(yōu)質(zhì)序列按照不同相似程度進行聚類獲得OUTs,每一OUT中選一條代表性序列同已知數(shù)據(jù)庫比對、注釋分析,獲得該序列代表的細(xì)菌信息。分別按門(Phylum)、綱(Class)、目(Order)、科(Family)、屬(Genus)水平統(tǒng)計結(jié)果。圖6為各小鼠腸道菌群在菌門(Phylum)水平構(gòu)成的柱狀圖??梢钥闯龈鹘M小鼠腸道菌群在門水平有其特異性,但是擬桿菌門(Bacteroidetes)、厚壁菌門(Firmicutes)、疣微菌門(Verrucomicrobia)以及變形菌門(Proteobacteria)為主要優(yōu)勢菌門。其他如放線菌門(Actinobacteria)、柔膜菌門(Tenericutes)也存在于大部分樣品中,但豐度均小于1%。另外可以看出優(yōu)勢菌門的物種在干預(yù)前后發(fā)生了變化,為了更直觀準(zhǔn)確的對比菌群的變化,我們對基礎(chǔ)組、造模組和姜黃素組小鼠腸道菌群在門水平上進行了對比分析統(tǒng)計(見圖7),從統(tǒng)計圖中我們可以直觀的看出,基礎(chǔ)飲食組的腸道菌群在測序前后無明顯變化,排除了飼養(yǎng)環(huán)境引起的菌群變化因素;造模組和基礎(chǔ)飲食組干預(yù)前后腸道菌群在門水平?jīng)]有明顯變化,而姜黃素組改變較大,表現(xiàn)為干預(yù)后擬桿菌門(Bacteroidetes)增加,厚壁菌門(Firmicutes)減少,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),另外疣微菌門(Verrucomicrobia)、變形菌門(Proteobacteria)以及放線菌門(Actinobacteria)干預(yù)后也有少量增加,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05);干預(yù)后造模組與姜黃素組對比,姜黃素組擬桿菌門(Bacteroidetes)較少,疣微菌門(Verrucomicrobia),差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。
圖4 序列長度分布圖
圖5 稀釋曲線及豐度分布曲線圖
表1 T1點(干預(yù)前)Alpha多樣性指數(shù)表
表2 T2點(干預(yù)后)Alpha多樣性指數(shù)表
圖6 門水平小鼠腸道菌群柱狀圖
從菌屬水平可以看出,造模組與姜黃素組干預(yù)前后菌屬發(fā)生了很大改變,造模組干預(yù)前后變化有統(tǒng)計學(xué)意義的菌屬有:Blautia(P<0.05)、Unclassif i ed_f__Enterobacteriaceae(P < 0.01)、Parabacteroides(P < 0.001)、unCUltured_f__Ruminococcaceae(P < 0.01)、Lactobacillus(P<0.05),姜黃素組干預(yù)前后變化有統(tǒng)計學(xué)意義的菌屬有:norank_f__Bacteroidales_S24-7_group(P<0.001)、Akkermansia(P<0.05)、Blautia(P<0.01)。為了進一步觀察造模組和姜黃素組干預(yù)后菌屬有無區(qū)別,我們對二者進行了比較,結(jié)果發(fā)現(xiàn)Akkermansia在姜黃素組富集,而Parabacteroides在造模組富集,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01)。見圖8。
近年來,從中藥中分離提取有效成分進行抗癌研究逐漸成為研究熱點,姜黃素便是其中之一。既往的研究表明,姜黃素具有抗炎、抗腫瘤等作用。眾所周知,腸炎是引起腸癌的重要原因之一。姜黃素作為一種較安全的中藥成分,人們在之前就已經(jīng)開始了姜黃素作用于腸炎的研究[8],作為對現(xiàn)有治療的補充。但是,姜黃素生物利用度非常低,限制了它作為藥物的應(yīng)用。
近年來,隨著腸道菌群的改變對腸癌發(fā)生發(fā)展的研究越來越多,人們意識到腸癌的發(fā)生和腸道菌群也有著密不可分的關(guān)系[9-10],口服姜黃素生物利用率低,但是在腸道內(nèi),姜黃素與腸道菌群直接作用,我們猜想姜黃素會與腸道菌群互相作用從而調(diào)節(jié)腸道菌群的構(gòu)成,以此來進行對腸炎腸癌的預(yù)防。通過使用經(jīng)典的造模方法,同時在造模的基礎(chǔ)上進行姜黃素的干預(yù),我們設(shè)計了此實驗,并且通過高通量測序的方法,證明了姜黃素在預(yù)防腸癌的發(fā)生發(fā)展上,確實調(diào)整了腸道菌群的構(gòu)成,并在一定程度上維持了腸道菌群的穩(wěn)定。相比于造模組小鼠,姜黃素組小鼠的腸道菌群雖然在主要菌群中有比較大的變化,但是在種屬的分析上,我們可以看出,造模組的小鼠腸道菌群變化更大,而在姜黃素干預(yù)組小鼠變化中,我們可以看到屬于疣微菌門(Verrucomicrobia)的艾克曼菌(Akkermansia)有明顯的增加,在最近的研究中[11]已經(jīng)確認(rèn)艾克曼菌(Akkermansia)對于減少腸道炎癥有很重要的作用,通過我們的數(shù)據(jù),我們可以認(rèn)識到,姜黃素通過增加艾克曼菌抑制腸道炎癥從而減少腸癌的發(fā)生。但同時我們也可以看到,在我們的測序數(shù)據(jù)里面,最主要的擬桿菌屬發(fā)生了非常大的變化,而造模組的擬桿菌屬的變化卻沒有姜黃素組這么劇烈。結(jié)合我們既往的研究[12],推斷在造模成瘤的過程中,產(chǎn)毒脆弱擬桿菌屬在造模組中占據(jù)了主要地位,造成腸癌的發(fā)生,而姜黃素組抑制了此類菌種在腸道菌群中的組成,從而進一步抑制腸癌的發(fā)生。由于測序深度有限,我們無法在此文中給出確切的數(shù)據(jù)來證明我們的猜想。但是結(jié)合既往的研究結(jié)果,我們不難推斷出我們的實驗從一個基本面上證明了我們的猜想。綜合上述結(jié)果,我們可以認(rèn)為,姜黃素一方面通過盡量維持腸道菌群的穩(wěn)定性來減少腸癌的發(fā)生,另一方面,姜黃素也通過增加腸道內(nèi)的益生菌,抑制有害菌屬的增加來抑制腸炎的發(fā)生發(fā)展,從而進一步的抑制腸癌的發(fā)生發(fā)展。
圖7 各組門水平小鼠腸道菌群差異圖。7A:BD組干預(yù)前后門水平菌群差異;7B:CU組干預(yù)前后門水平菌群差異;7C:MO組干預(yù)前后門水平菌群差異;7D:CU組與MO組干預(yù)后門水平菌群差異
圖8 各組屬水平小鼠腸道菌群差異圖。8A:MO組干預(yù)前后屬水平菌群差異;8B:CU組干預(yù)前后屬水平菌群差異;8C:CU組與MO組干預(yù)后屬水平菌群差異
綜上,本研究通過小鼠結(jié)直腸癌模型,初步探究了姜黃素可能的抑癌機制,為結(jié)直腸癌與腸道菌群相關(guān)性的研究提供了新思路。