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        核酸試紙條法檢測食品中小腸結(jié)腸炎耶爾森菌

        2018-12-10 11:02:44張宏偉莎日娜鄭文杰王碩
        食品研究與開發(fā) 2018年24期
        關(guān)鍵詞:耶爾森氏菌結(jié)腸炎

        張宏偉,莎日娜,鄭文杰,王碩

        (1.天津科技大學(xué)食品工程與生物技術(shù)學(xué)院,天津300457;2.天津出入境檢驗(yàn)檢疫局,天津300461;3.天津醫(yī)學(xué)高等專科學(xué)校,天津300222)

        小腸結(jié)腸炎耶爾森菌(Yersinia enterocolitica),是腸桿菌科、耶爾森菌屬的一個(gè)種,廣泛分布于自然界的土壤、水體中,野生動(dòng)物,家畜,昆蟲中均有檢出,生存溫度從0℃~40℃,在0℃~40℃環(huán)境中保持生命力可達(dá)18個(gè)月之久,-25℃能存活24 h以上,這種嗜冷性質(zhì)決定了保存在4℃~5℃冰箱中的食品更具有傳染的危險(xiǎn)性。

        小腸結(jié)腸炎葉爾森氏菌是一種急性胃腸炎型食物中毒病原菌,可致人畜患病。耶爾森氏菌病典型癥狀為胃腸炎、發(fā)熱,亦可引起闌尾炎和反應(yīng)性關(guān)節(jié)炎,另一個(gè)并發(fā)癥是敗血癥,死亡率較高。經(jīng)典檢測方法耗時(shí)長,步驟繁多,操作復(fù)雜,成本高昂,不能滿足快速鑒定食品中是否污染該菌的要求,本研究旨在應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)技術(shù)建立檢測方法,結(jié)合免疫金試紙條檢測方法,避免PCR方法結(jié)果檢測需要電泳使用溴化乙錠(ethidium bromide,EB)、PCR產(chǎn)物污染等問題,探索建立一種快速準(zhǔn)確避免污染的檢測方法,便于在實(shí)驗(yàn)室推廣應(yīng)用。

        1 材料與方法

        1.1 材料與試劑

        基因組提取試劑盒:Promega公司;HS Ex Taq DNA聚合酶(5 U/μL):大連寶生物公司;引物合成由上海生物工程公司完成;核酸快速檢測試紙條:優(yōu)思達(dá)公司。

        菌株采用4株美國模式培養(yǎng)物集存庫(American type culture collection,ATCC)菌株和22株中國醫(yī)學(xué)細(xì)菌保藏管理中心(national center for medical culture collections,CMCC)小腸結(jié)腸炎耶爾森氏菌標(biāo)準(zhǔn)菌株,9株其它耶爾森氏菌屬標(biāo)準(zhǔn)菌和其它菌屬17株ATCC標(biāo)準(zhǔn)菌株,具體見表1。

        表1 試驗(yàn)菌株Table 1 Bacterial strains for detection

        1.2 儀器與設(shè)備

        PrC-200熱循環(huán)儀:MJ公司;1510核酸蛋白分析儀:賽默飛世爾科技有限公司。

        1.3 方法

        1.3.1 引物設(shè)計(jì)

        利用細(xì)菌16s-23srDNA間區(qū)序列設(shè)計(jì)特異性引物見表2,引物組合見表3。在引物合成時(shí),一條引物的5’端標(biāo)記異硫氰酸熒光素(fluorescein isothiocyanate,F(xiàn)ITC),另一條引物的 5’端標(biāo)記地高辛(Digoxin)。

        表2 引物序列Table 2 Primers sequence

        表3 16s-23s rDNA間區(qū)引物組合Table 3 Detection primer combination

        1.3.2 反應(yīng)體系

        體系的構(gòu)成如下:10×buffer,5 μL;引物(10 μmol/L)各 2 μL;dNTP(10 mmol/L),1 μL;模板 DNA,2 μL;Taq酶(5 U/μL),1 μL;ddH2O,37 μL。

        反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性10 min;擴(kuò)增循環(huán):94℃30 s,56℃溫度退火 15 s,72℃延伸 60 s,進(jìn)行 30個(gè)循環(huán),72℃延伸5 min,4℃保存。

        1.3.3 特異性試驗(yàn)

        利用表1中的標(biāo)準(zhǔn)菌株對引物分別進(jìn)行特異性試驗(yàn),以篩選出通用性好,特異性強(qiáng)的引物。

        1.3.4 靈敏度試驗(yàn)

        取1 mL標(biāo)準(zhǔn)菌株增菌液用于提取基因組DNA,利用紫外分光光度計(jì)檢測DNA質(zhì)量及純度。將PCR模板進(jìn)行10倍梯度稀釋,按建立方法擴(kuò)增,同時(shí)用凝膠電泳和膠體金試紙條方法觀察檢測結(jié)果。

        1.3.5 樣品加菌試驗(yàn)

        3份經(jīng)證實(shí)未污染結(jié)腸炎耶爾森氏菌的碎肉樣品,1份作為對照樣品,2份各25 g分別接種1 mL不同濃度小腸結(jié)腸炎耶爾森氏菌液和1 mL 10倍濃度的大腸埃希菌和金葡菌菌液,混勻后進(jìn)行檢測。

        1.3.6 市售樣品檢測

        利用建立的方法對市場購買的樣品進(jìn)行檢測,并與GB 4789.8-2016《食品安全國家標(biāo)食品微生物學(xué)檢驗(yàn)小腸結(jié)腸炎耶爾森氏菌檢驗(yàn)》進(jìn)行比較。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 特異性引物的確定

        應(yīng)用溫度梯度PCR,分別用9對引物進(jìn)行PCR檢測,發(fā)現(xiàn)S1/A2引物組合在56℃退火時(shí)特異性最好,實(shí)驗(yàn)用近緣菌株都無假陽性出現(xiàn),而小腸結(jié)腸炎耶爾森氏菌都出現(xiàn)特異性泳帶。因此,本研究選擇S1/A2作為小腸結(jié)腸炎耶爾森氏菌PCR檢驗(yàn)的特異性引物,退火溫度確定為56℃,其擴(kuò)增產(chǎn)物為282 bp。

        2.2 特異性試驗(yàn)

        小腸結(jié)腸炎耶爾森氏菌標(biāo)準(zhǔn)菌株檢測結(jié)果均為陽性結(jié)果,耶爾森氏菌其他屬標(biāo)準(zhǔn)菌株及對照標(biāo)準(zhǔn)菌株檢測結(jié)果均為陰性,部分檢測結(jié)果見圖1、圖2。

        圖1 特異性檢測結(jié)果Fig.1 Detece of specificity by electrophoresis

        圖2 對照菌株特異性檢測結(jié)果Fig.2 Detece of specificity by nucleic acid strips

        檢測結(jié)果顯示小腸結(jié)腸炎標(biāo)準(zhǔn)菌株檢測沒有出現(xiàn)假陰性結(jié)果,耶爾森氏菌屬其他種的標(biāo)準(zhǔn)菌株及對照標(biāo)準(zhǔn)菌株檢測均沒有出現(xiàn)假陽性結(jié)果,說明引物特異性良好,試紙條顯示的檢測結(jié)果與電泳結(jié)果相符合,表明其檢測特異性良好。

        2.3 靈敏度試驗(yàn)

        模板稀釋倍數(shù)分別為 100、10、1、10-1、10-2、10-3、10-4、10-5、10-6、10-7μg/mL,檢測結(jié)果見圖 3。

        圖3 靈敏度檢測結(jié)果Fig.3 Detece of sensitivity

        檢測結(jié)果表明,隨著稀釋度的增加,檢測條帶逐漸減弱,當(dāng)稀釋濃度達(dá)到10-3μg/mL時(shí),電泳檢測結(jié)果顯示為陰性,而試紙條則有淡紅色條帶出現(xiàn),說明試紙條檢測靈敏度較電泳方法高一個(gè)數(shù)量級(jí),可達(dá)到10-3μg/mL。

        2.4 樣品加菌試驗(yàn)

        添菌靈敏度檢測結(jié)果見圖4。

        圖4 添菌靈敏度檢測結(jié)果Fig.4 Detece of sensitivity in samples

        檢測結(jié)果表明,盡管有高濃度的干擾菌存在,電泳檢測靈敏度可達(dá)到101CFU/mL,而試紙條檢測靈敏度較電泳檢測高一個(gè)數(shù)量級(jí),達(dá)到了100CFU/mL。

        2.5 市售樣品檢測

        用PCR-試紙條法對市售722份水產(chǎn)及禽畜肉進(jìn)行檢測,并與國標(biāo)方法檢測結(jié)果進(jìn)行比較,結(jié)果見表4。

        表4 市售樣品檢測結(jié)果Table 4 Detection result of samples

        檢測結(jié)果表明,PCR-試紙條方法檢測陽性率高于國標(biāo)方法。以國標(biāo)方法為基準(zhǔn)方法,對新建立的方法進(jìn)行評估,見表5。

        表5 PCR-試紙條方法評估表Table 5 Assessment of PCR-immunoblotting strips method

        3 討論

        檢測假陽性的發(fā)生可能因素包括:(1)如果檢測中多對引物相互反應(yīng),出現(xiàn)引物二聚體則可能導(dǎo)致假陽性結(jié)果。(2)樣品中存在目標(biāo)菌死菌,作為較為靈敏的核酸檢測方法,檢測到死菌信號(hào)。(3)傳統(tǒng)的檢測方法對檢驗(yàn)人員的經(jīng)驗(yàn)要求較高,如果檢驗(yàn)人員經(jīng)驗(yàn)不足,則使用經(jīng)典檢測方法有可能造成漏檢。使用PCR-試紙條方法作為篩選方法,可以彌補(bǔ)檢驗(yàn)人員因經(jīng)驗(yàn)不足造成的漏檢情況。以本研究建立的快速方法檢測到陽性結(jié)果,需要用國標(biāo)方法加以確認(rèn),以國標(biāo)方法檢測作為判定依據(jù)。

        國家標(biāo)準(zhǔn)小腸結(jié)腸炎耶爾森氏菌耶爾森氏檢測方法至少需要7天完成檢測、容易發(fā)生檢測人員因經(jīng)驗(yàn)不足造成漏檢,采用本研究建立的檢測方法特異性強(qiáng),靈敏度高,可在24小時(shí)內(nèi)得到檢測結(jié)果。本研究采用試紙條代替凝膠電泳,既減少了PCR產(chǎn)物的二次污染,又避免了EB對人體的傷害和對環(huán)境的污染,是傳統(tǒng)方法的有益補(bǔ)充。

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