李飛鴻,侯應軍,李雪涵,余心怡,渠慎春
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蘋果赤霉素氧化酶基因的克隆及功能分析
李飛鴻,侯應軍,李雪涵,余心怡,渠慎春
(南京農(nóng)業(yè)大學園藝學院,南京 210095)
【目的】從‘蘇帥’蘋果()中分離克隆赤霉素氧化酶基因的開放閱讀框(ORF),分析其序列特征及在蘋果中的組織表達特異性,通過在煙草中過表達研究其對煙草生長發(fā)育的影響,為該基因功能分析及應用提供理論參考?!痉椒ā坎捎肦T-PCR方法從蘋果中克隆出的ORF區(qū)。利用NCBI、DNAMAN和Pfam在線軟件進行氨基酸序列比對和保守結構域分析;利用Expasy在線軟件對氨基酸組成、分子量、等電點進行分析;利用SignalP和TMHMM Server V.2.0分別在線分析蛋白質的信號肽和預測蛋白質的跨膜結構域;利用MEGA 7.0軟件構建系統(tǒng)進化樹。采用實時熒光定量PCR(RT-qPCR)方法檢測在蘋果不同組織中的表達量。構建過表達載體,采用農(nóng)桿菌介導的遺傳轉化技術將導入煙草中,獲得具有潮霉素抗性的轉基因煙草植株,通過GUS染色、基因組PCR和RT-PCR鑒定轉基因陽性植株;將野生型和轉基因煙草移栽后,在第一朵花開放時測定轉基因煙草的株高、節(jié)間長度和葉片長寬比以及煙草葉片葉綠素含量,激素GA1和GA4含量,并通過RT-qPCR方法分析煙草中相關基因的表達水平。【結果】成功克隆并獲得了長為1 122 bp的ORF區(qū),編碼373個氨基酸殘基,蛋白相對分子質量為42.8 kD,理論等電點為5.44,不穩(wěn)定系數(shù)為49.73,具有GA2ox的保守結構域DIOX_N和20G-Fell_Oxy,但無明顯疏水區(qū),無跨膜區(qū),無信號肽,為非分泌蛋白。序列系統(tǒng)進化分析結果顯示MdGA2ox8與白梨GA2ox8親緣關系最近。RT-qPCR結果表明,在蘋果各組織中差異表達,在花中的表達量最高,其次為老葉>幼葉>韌皮部,在木質部和幼果中幾乎不表達。將轉入模式植物煙草中,獲得了5個轉基因陽性株系。與野生型相比,過表達煙草植株GA4含量降低,GA1含量有所升高,其中野生型和轉基因煙草GA1平均含量分別為1.26和1.75 ng·g-1,GA4平均含量分別為5.43和1.07 ng·g-1。與野生型相比,轉基因煙草植株GA1和GA4總含量降低,使植株節(jié)間縮短、矮化以及花期推遲,其中野生型和轉基因煙草植株平均高度分別為38.50和7.36 cm,節(jié)間長度分別為9.5和3.3 cm;轉基因煙草葉片顏色深綠,葉片長寬比降低。煙草內源赤霉素合成途徑相關基因和的表達水平受的正反饋調節(jié)?!窘Y論】獲得蘋果赤霉素氧化酶基因的開放閱讀框,具有組織表達差異性。過表達煙草植株中GA1和GA4總含量降低,導致植株節(jié)間長度縮短、植株矮化。
蘋果;赤霉素氧化酶;矮化;;過表達;煙草
【研究意義】蘋果()是世界范圍內廣泛栽培的果樹之一。矮化栽培現(xiàn)已成為世界蘋果栽培最主要的高效栽培模式,此栽培模式近幾年在我國發(fā)展迅速,主要通過矮化砧木實現(xiàn)?!K帥’是由南京農(nóng)業(yè)大學通過雜交培育的短枝型蘋果品種[1],以此品種為材料,克隆赤霉素代謝關鍵酶基因,通過研究其表達模式及功能,探討其節(jié)間縮短的主要機理,對果樹矮化和短枝形成機制的研究具有重要意義。【前人研究進展】在植物體內,具有生物活性的GA有GA1、GA3、GA4和GA7[2]。GA20-氧化酶(GA20ox)、GA3-氧化酶(GA3ox)和GA2-氧化酶(GA2ox)是參與植物赤霉素合成與代謝的關鍵酶,其中GA20ox和GA3ox參與GA合成,而GA2ox則參與GA的分解代謝[2]。GA2ox是由多基因家族編碼的雙加氧酶,是赤霉素代謝過程中關鍵酶之一,作用于有生物活性的GA1和GA4,分別將它們轉變成無活性的分解代謝物GA8和GA34,使植物體內GA的活性降低,維持植物體內生物活性GA和無活性GA的平衡[3]。研究表明,沉默可以促進植物生長和纖維的產(chǎn)生[4],而過表達則可以導致植株赤霉素含量的減少和矮化[5]。目前,已經(jīng)從擬南芥[6]、水稻[7]、梨[8-9]、葡萄[10]、馬鈴薯[11]、西洋參[12]、太子參[13]、柳枝稷[14]、山茶[15]、油菜[16]中克隆得到?!颈狙芯壳腥朦c】迄今,有關蘋果赤霉素合成相關基因克隆的研究僅見少量報道[17-20],而對蘋果的分離及功能研究尚未見報道?!緮M解決的關鍵問題】應用RT-PCR技術克隆的開放閱讀框(ORF),分析其組織特異性,利用生物信息學方法對其序列進行分析,構建過表達載體,通過農(nóng)桿菌介導的方法轉化煙草,分析過表達對煙草生長的影響,為果樹矮化機理研究提供理論依據(jù)。
1.1.1 植物材料‘蘇帥’由南京農(nóng)業(yè)大學以‘印度’蘋果為母本、‘金帥’為父本雜交育成,2011年通過江蘇省作物品種審定委員會鑒定(蘇鑒果201108)。該品種植株生長健壯,樹冠緊湊,枝條粗壯,具有典型的短枝型蘋果品種特征[1]。本研究所用‘蘇帥’苗為八棱海棠作為砧木的3年生盆栽苗,所用基質為泥炭土,株高160 cm,由南京農(nóng)業(yè)大學果樹生物技術實驗室保存。于2016年6月取‘蘇帥’中枝頂端展葉2周的幼葉,液氮速凍后于-70℃保存?zhèn)溆?;煙草K326種子由玉溪中煙種子有限責任公司提供。
1.1.2 菌株與試劑 大腸桿菌菌株DH5、農(nóng)桿菌菌株EHA105均購自上海唯地生物技術有限公司。T4 DNA連接酶購自New England Biolabs公司。各種限制性內切酶、PrimeSTAR GXL DNA聚合酶、反轉錄試劑盒、DNA凝膠回收試劑盒和質粒提取試劑盒均購自TaKaRa公司。pEASY-Blunt克隆載體購自TransGen Biotech、植物RNA提取試劑盒購自成都福際生物技術有限公司。GA1標準樣品和GA4標準樣品均購自Sigma公司,色譜級甲醇購自Tedia公司,其他試劑均為國產(chǎn)分析純。
1.2.1根據(jù)先前研究結果[21],‘蘇帥’蘋果中基因MDP0000309451可能與其節(jié)間較短的表型相關,參照NCBI GenBank中蘋果基因序列,采用Primer-BLAST設計引物序列(表1),由上海捷瑞生物工程有限公司合成。
表1 蘋果MdGA2ox8克隆、表達及功能分析所用引物
以‘蘇帥’中枝頂端展葉2周的幼嫩葉片為材料提取總RNA及反轉錄得到的cDNA為模板,引物-F1和-R1用于ORF克隆。PCR反應體系:模板(cDNA)1.0 μL,10×PCR Buffer 2.5 μL,dNTP 2.0 μL,上下游引物各0.75 μL,1.0 μL PrimeSTAR GXL酶,用超純水補足至25 μL。反應程序:98℃ 3 min;98℃ 10 s,55℃ 15 s,68℃ 10 s,35個循環(huán);68℃延伸5 min,4℃保存。產(chǎn)物回收:PCR產(chǎn)物用1.0%的瓊脂糖凝膠電泳檢測并拍照,按照膠回收試劑盒說明書的步驟進行PCR產(chǎn)物的回收。產(chǎn)物的連接轉化:將回收產(chǎn)物與pEASY-Blunt克隆載體相連接,步驟如下:(1)連接:PCR產(chǎn)物3 μL,pEASY-Blunt克隆載體1 μL,總體積4 μL,25℃反應15 min;(2)轉化:取-70℃保存的大腸桿菌DH5,冰上融化,至半融化狀態(tài)時加入4 μL的連接產(chǎn)物,輕彈混勻,冰浴20—30 min,42℃熱激30 s,立即放于冰上2 min,在超凈工作臺中加入250 μL的無抗性的LB液體培養(yǎng)基,200 r/min,37℃搖菌培養(yǎng)1 h;(3)涂板:離心后去上清液,留取100 μL菌液均勻涂于50 mg·L-1Km抗性的平板上,37℃培養(yǎng)8—12 h;(4)陽性克隆檢測:挑取白色單菌落,接種在含有50 mg·L-1Km的LB液體培養(yǎng)基中,250 r/min,37℃搖菌培養(yǎng)4 h,PCR檢測陽性克隆,測序驗證。
1.2.2序列分析 將測序驗證正確的核苷酸序列和推導氨基酸序列分別在NCBI數(shù)據(jù)庫上用BLASTn和BLASTp進行序列相似性分析;通過ExPASy Proteomics Server的在線軟件Protparam(https://web.expasy.org/protparam/)對蛋白進行理化性質的分析和預測,應用ProtScale(https://web.expasy. org/cgi-bin/protscale/protscale.pl)軟件預測蛋白質的疏水性;利用SignalP(http://www.cbs.dtu.dk/services/ SignalP/)在線分析蛋白質的信號肽;應用TMHMM Server V.2.0(http://www.cbs.dtu.dk/services/TMHMM/)在線程序預測蛋白質的跨膜結構域;下載可可()、擬南芥()、大豆()、玉米()、葡萄()、白梨()、草莓(subsp.)、煙草()、甜菜(subsp.)9個物種的氨基酸序列,使用Pfam(http://pfam.xfam.org/search# searchSequenceBlock)和DNAMAN對氨基酸序列進行分析和比對,系統(tǒng)發(fā)育樹使用MEGA 7.0軟件構建[22]。
1.2.3 表達載體的構建及農(nóng)桿菌的轉化 含酶切位點產(chǎn)物的擴增:設計引物-F2和-R2,以測序正確的pEASY-質粒為模板,-F2和-R2引物擴增含Ⅰ和HⅠ酶切位點的PCR產(chǎn)物,PCR反應體系:模板(pEASY-質粒)0.5 μL,10×PCR Buffer 2.5 μL,dNTP 2 μL,上下游引物各0.75 μL(100 ng·μL-1),PrimeSTAR GXL酶1 μL,用超純水補足至25 μL。PCR程序:98℃ 3 min;98℃ 10 s,60℃ 15 s,68℃ 10 s,35個循環(huán);68℃延伸5 min,4℃保存。
PCR產(chǎn)物回收:PCR擴增產(chǎn)物用1.0%的瓊脂糖凝膠電泳檢測并拍照,按照膠回收試劑盒說明書的步驟進行PCR擴增產(chǎn)物的回收。PCR產(chǎn)物連接轉化:將回收產(chǎn)物連接pEASY-Blunt克隆載體,步驟同1.2.1,轉化大腸桿菌DH5,PCR檢測陽性克隆,測序驗證。
雙酶切:將測序正確的陽性菌液提取質粒,構建pCAMBIA1301-35SN-載體,步驟如下:(1)雙酶切體系:HⅠ 2 μL,Ⅰ 2 μL,10×K Buffer 2 μL,質粒(分別為pCAMBIA1301-35SN-或pCAMBIA1301-35SN空載)7 μL,ddH2O補足至40 μL,37℃反應3 h;(2)連接:將酶切產(chǎn)物進行瓊脂糖凝膠電泳檢測,切膠回收酶切后的目的基因和空載片段,連接體系:T4DNA連接酶0.5 μL,Ligase 10×Buffer 1 μL,pCAMBIA1301-35SN載體回收片段3.5 μL,目的基因5 μL,總體系10 μL,于16℃反應1 h;(3)轉化和涂板:同1.2.1節(jié);(4)陽性克隆檢測:挑取白色單菌落,接種在含有50 mg·L-1Km的LB液體培養(yǎng)基中,250 r/min,37℃搖菌培養(yǎng)4 h,用-F2和-R2引物進行PCR檢測陽性克隆,送去測序驗證;(5)將成功構建的載體pCAMBIA1301-35SN-轉化農(nóng)桿菌EHA105菌株,具體步驟參照說明書。將PCR檢測陽性的菌液提取質粒,并送公司測序。
1.2.4遺傳轉化煙草及其鑒定 采用葉盤轉化法轉化煙草K326[23-24],其中篩選抗性標記潮霉素(Hyg)的濃度為10 mg·L-1,每兩周更換一次培養(yǎng)基,以保持轉基因煙草的抗性篩選壓。轉基因煙草的鑒定如下:首先剪取抗性煙草的葉片進行GUS染色,對于GUS檢測呈藍色的植株,進一步提取其DNA,利用基因特異引物-F1和-R1進行PCR檢測。然后,提取PCR檢測陽性株系的葉片RNA(按照試劑盒說明書),反轉錄為cDNA,內參檢測模板質量,再以-F1和- R1為引物,進行PCR檢測,反應體系:模板(cDNA)1 μL,10×PCR Buffer 2.5 μL,dNTP 2 μL,上下游引物各0.5 μL,rTaq酶0.15 μL,用超純水補足至25 μL。PCR程序:94℃ 5 min;94℃ 40 s,55℃ 40 s,72℃ 90 s,35個循環(huán);72℃延伸10 min,PCR產(chǎn)物4℃保存,用1%的瓊脂糖凝膠電泳檢測。
1.2.5組織特異性表達 2018年4—5月取‘蘇帥’的花、幼葉、老葉、韌皮部、木質部和幼果分別進行檢測,上游引物-RT-F,下游引物-RT-R,作為內參基因(表1)。每處理重復3次,根據(jù)2?ΔCt公式計算結果,通過SPSS軟件計算標準誤差和差異顯著性。
1.2.6 轉基因煙草形態(tài)指標的測定 轉基因煙草和野生型各5株,經(jīng)煉苗后移栽,在第一朵花開放時進行各項指標的測定和取樣。測量煙草株高和節(jié)間長度(從頂而下第3—13片葉的總節(jié)間長度),測量從頂而下第4、5、6、7片葉的葉長和葉寬,計算葉片的長寬比。
1.2.7 轉基因煙草葉綠素含量的測定 選取轉基因株系與野生型煙草的由頂而下第4、5片葉,參照李合生的丙酮乙醇(1﹕1)提取方法提取煙草葉片葉綠素[25]。
1.2.8 轉基因煙草GA1、GA4含量的測定 選取轉基因株系、野生型煙草的由頂而下第4、5片葉,準確稱量0.5 g。送南京鐘鼎生物技術有限公司,采用ESI-HPLC-MS/MS方法檢測植物激素GA1、GA4的含量。
1.2.9 轉基因煙草中基因的表達分析 以作為內參基因進行RT-qPCR分析。通過NCBI設計特異引物:上游引物-RT-F和下游引物-RT-R,同時設計相關基因和的引物,分別為-RT-F,-RT-R和-RT-F,-RT-R。每處理重復3次,根據(jù)2?ΔΔCt公式計算結果。
利用SPSS 17.0軟件進行顯著性分析。利用Excel 2010和GraphPad Prism 7.0軟件進行數(shù)據(jù)分析并作圖。
以‘蘇帥’葉片cDNA為模板,通過PCR擴增,瓊脂糖凝膠電泳檢測出一條1 000—2 000 bp的特異條帶(圖1-B)。經(jīng)產(chǎn)物回收、克隆、測序,該序列全長為1 122 bp,編碼373個氨基酸。該基因已經(jīng)在GenBank登錄,登錄號為XM_008372903。運用ExPASy Proteomics Server的在線軟件Protparam對MdGA2ox8蛋白質進行理化性質的分析和預測。結果顯示,其分子式為C1906H2959N507O573S19,相對分子質量為42.8 kD,理論等電點5.44。其中負電荷氨基酸殘基(Asp+Glu)總數(shù)為48,正電荷氨基酸殘基(Arg+Lys)總數(shù)為39,脂肪系數(shù)為79.68,蛋白質不穩(wěn)定系數(shù)為49.73,平均親水系數(shù)為-0.39,預測該蛋白為親水蛋白。預測MdGA2ox8蛋白無跨膜區(qū),無信號肽序列,為非分泌蛋白。NCBI上分析氨基酸序列的保守結構域,發(fā)現(xiàn)屬于PcbC superfamily超家族,有兩個比較保守的結構域,分別是DIOX_N和2OG-FeII_Oxy保守結構域。
將編碼的氨基酸序列在NCBI進行搜索,下載白梨、葡萄、草莓、可可等9個物種的氨基酸序列與其進行同源性比對,發(fā)現(xiàn)編碼的氨基酸序列與白梨、草莓和大豆具有較高的相似性,序列一致性分別為89.72%、70.34%和63.03%。多重序列比對結果表明這些所編碼的氨基酸序列均含有兩個保守結構域,分別為DIOX_N和2OG-FeII_Oxy(圖2)。為探討蘋果與其他植物之間的關系,選取相似性較高的10種植物的GA2ox蛋白氨基酸序列與MdGA2ox8蛋白氨基酸序列進行比較分析,采用鄰位相連法繪制進化樹。如圖3所示,蘋果編碼的氨基酸序列與白梨的氨基酸序列屬于同一個進化支,親緣關系最近,然后與草莓聚為一支,再與他雙子葉、單子葉植物聚類。
紅色方框代表DIOX_N結構域;黑色方框代表2OG-FeII_Oxy結構域
圖3 不同物種GA2ox8的系統(tǒng)進化樹
通過RT-qPCR方法檢測在蘋果不同組織中的表達(圖4),發(fā)現(xiàn)在花中的表達量最高,與其他組織的表達量差異顯著;其次為老葉、幼葉和韌皮部,但相互之間差異不顯著,而在幼果和木質部的表達量最低,幾乎不表達,表明的表達具有組織特異性。
不同小寫字母表示差異顯著(P<0.05)。下同
用Ⅰ和HⅠ酶將從克隆載體上切下,與相同酶切的pCAMBIA1301-35SN載體連接,轉化大腸桿菌DH5,經(jīng)PCR鑒定及測序驗證,成功構建了植物表達載體pCAMBIA1301-35SN-(圖1-A)。提取質粒并成功轉化農(nóng)桿菌。用陽性單菌落農(nóng)桿菌菌液(OD=0.5)侵染煙草葉片,共培養(yǎng)3 d,用無菌水洗滌3次,無菌濾紙吸干水分,接種在10 mg·L-1的Hyg抗性培養(yǎng)基中,篩選培養(yǎng)30 d,獲得22個抗潮霉素的煙草抗性芽,GUS檢測結果表明,其中7株為GUS陽性植株(圖5-A),近一步提取這7株煙草DNA,用-F1和-R1引物進行PCR擴增,以野生型煙草葉片為對照,結果顯示,在獲得的7株GUS陽性植株中,6株成功檢測到(圖5-B),推斷已成功導入煙草基因組中。為了進一步驗證在轉基因陽性植株中是否在轉錄水平表達,提取經(jīng)PCR檢測的陽性轉基因煙草植株葉片總RNA并反轉錄成cDNA,檢測的表達。結果表明,有5個抗性植株中擴增得到片段大小一致的特異條帶(圖5-C);膠回收、克隆測序表明,所擴增條帶為目的基因序列,進一步證明成功導入煙草基因組中并在轉錄水平上進行表達,得到5個陽性轉基因植株。
M:Marker;1—7(B)、2—7(C):轉基因煙草植株transgenic tobacco plants;8:pCAMBIA1301-35SN-MdGA2ox8質粒pCAMBIA1301-35SN-MdGA2ox8 vector;WT(A)、9(B)、1(C):野生型煙草Wild-type tobacco
經(jīng)過生根、煉苗、移栽,3個月后,過表達影響了轉基因煙草的株高、節(jié)間長度和開花時間。如圖6-A、6-B所示,轉基因株系L-1、L-6、L-7、L-11和L-31出現(xiàn)明顯的花期延遲和矮化表型,分別比野生型低66%、81%、94%、75%和88%,其中野生型株高達到38.5 cm,而轉基因株系L-7和L-31株高分別只有2.3和4.5 cm。同時與野生型相比,轉基因煙草的節(jié)間長度均有所縮短,以L-7和L-31株系節(jié)間縮短最為嚴重(圖6-C)。此外,轉基因煙草葉片長寬比均比野生型顯著降低(圖6-D)。野生型煙草開花時間為85—90 d,而轉基因株系均未開花。
轉基因株系的葉綠素含量均高于野生型,其中L-1、L-7、L-11、L-31株系的葉綠素含量與野生型相比達顯著水平,分別比野生型提高61%、44%、31%和27%,而L-6株系的葉綠素含量僅比野生型高13%(圖7)。
為研究過表達對赤霉素合成的影響及主要作用通路,選取野生型煙草和轉表達量高的煙草植株葉片,測定GA1和GA4的含量。從圖8-A可以看出,轉的煙草植株葉片中GA1含量均高于野生型,其中,野生型的GA1含量為1.26 ng·g-1,L-6、L-7和L-31株系GA1的含量分別為野生型的1.32、1.29和1.56倍。然而,轉基因植株的GA4含量均低于野生型(圖8-B)。如圖8-C所示,過表達的煙草中GA1+GA4總含量均低于野生型,其中野生型的GA1+GA4總含量為6.69 ng·g-1,株系L-6、L-7和L-31的GA1+GA4總含量分別為3.08、1.90和3.47 ng·g-1。
WT:野生型煙草wild-type tobacco;L:轉基因株系transgenic line;L-1、L-6、L-7、L-11、L-31:MdGA2ox8過表達煙草的5個株系MdGA2ox8overexpression tobacco
圖7 MdGA2ox8過表達對煙草葉綠素含量的影響
為確認轉基因煙草株高的降低(圖6-A、6-B)是由的過表達所致,以煙草葉片的cDNA為模板,利用RT-qPCR技術分析了轉基因煙草中的表達量。結果表明,野生型煙草中無的表達,而轉基因煙草株系中的表達量極高,且各轉基因株系間其表達量不同(圖9-A)。此外,轉基因煙草L-6、L-7、L-11、L-31株系中和的表達量均高于野生型,而L-1株系中其表達量低于野生型(圖9-B、9-C)。
圖8 MdGA2ox8過表達對煙草葉片赤霉素含量的影響
圖9 RT-qPCR檢測MdGA2ox8過表達株系
赤霉素是一個較大的萜類化合物家族,在植物整個生命循環(huán)過程中起著重要的調控作用。植物中是一個小基因家族,由多個基因編碼,目前已從擬南芥中分離得到8個[26-27],但在蘋果上相關基因的克隆與分析卻沒有很好地開展[17-18]。本研究成功獲得了蘋果ORF,其具有基因家族共同的結構特點,含有DIOX-N和20G-Fell_Oxy保守結構域,通過同源分析結果顯示與其他物種的基因同源性最高達90%,因此推測該基因屬于基因家族的成員,命名為。本研究將MdGA2ox8與其他10種植物的15條GA2ox序列進行系統(tǒng)進化分析,結果與前人研究結果一致[13],與AtGA2ox8和AtGA2ox7聚為一類,可能主要催化C20-Gas(GA12和GA53)2-羥基化[15]。
本研究通過農(nóng)桿菌介導的葉盤轉化法獲得了5株轉基因株系,結果表明過表達煙草引起植株的矮化、節(jié)間縮短,葉片長寬比降低和花期延遲。Schomburg等[28]研究發(fā)現(xiàn),過表達導致煙草矮化和花期推遲。此外,Kotoda等[5]也發(fā)現(xiàn)過表達擬南芥出現(xiàn)矮化和晚花表型;過表達和煙草節(jié)間嚴重縮短,植株矮化[28],這與本研究結果相一致。另外,轉基因煙草株系的總葉綠素含量均高于對照,說明過表達不僅誘導植株矮化,還提高了總葉綠素含量,這與王慶杰等[29-31]研究結果一致。
赤霉素合成代謝早期途徑在高等植物中基本相同,而在GA12以后的代謝途徑中,在不同物種和不同組織中的表達量有較大差異。在荔波連蕊茶中在嫩枝和兩年生莖段中的表達量最高[15];在蜜柑成年樹的新葉和花芽以及幼苗莖中表達,但在其他組織中表達量較低[5]。本研究的結果與上述結果不同,主要在花中優(yōu)勢表達,在幼果和木質部中幾乎不表達,這可能是物種或時間不同所致。因此推測主要在花中起作用,以控制活性GA的水平,可能參與果實的形成,但不參與果實和木質部的發(fā)育。
RT-qPCR技術是現(xiàn)代生物學研究中常用的檢測基因表達水平的技術手段[10],通過對轉基因煙草株系基因表達水平進行分析研究,結果表明5個轉基因株系中表達量顯著高于野生型,說明這5株轉基因煙草均為過表達株系,但各株系間表達量具有差異,這與李軍等[32]的研究結果相一致,推測其表達量的差異可能是插入位點和拷貝數(shù)的不同造成的[33]。此外,赤霉素合成相關基因和在株系L-6、L-7、L-11和L-31中的表達量均高于野生型,筆者推測可能是由于過表達,導致具有生物活性的GA含量降低,從而提高了和的表達量。而轉基因株系L-1的和表達量較低,推測可能是表達量未達到反饋調節(jié)水平。
在植物體內,具有生物活性的GA有GA1、GA3、GA4和GA7[2]。GA2ox作用于有生物活性的GA1和GA4,分別將它們轉變成無活性的分解代謝物GA8和GA34,使植物體內GA的活性降低[3]。為檢測過表達對赤霉素合成與代謝的影響,進而研究的作用通路,選取轉表達量高的煙草植株(L6、L7、L31)和野生型煙草植株的葉片,測定赤霉素GA1和GA4的含量。結果表明,轉基因煙草植株葉片中GA1與GA4含量的總和比野生型低,這可能是引起煙草植株節(jié)間縮短、矮化的主要原因,這與擬南芥中過表達導致赤霉素含量的減少進而植株矮化的研究結果一致[5],也有研究表明,在煙草中過表達降低了煙草活性GA的水平并引起矮化[28]。劉露露等[31]研究發(fā)現(xiàn),過表達煙草GA4含量增加而GA1含量并無顯著變化;Xiao等[34]分析內源GA顯示轉()植物中GA4和GA1水平降低,與野生植物相比GA34含量增加。本研究與其結果一致,在轉基因煙草葉片中GA4含量顯著低于野生型,但與其研究結果不同的是GA1含量較高于野生型。結合煙草赤霉素合成相關基因分析,推測GA1含量相比野生型增加,可能是由于赤霉素合成相關基因(如)表達量上升的原因。然而,本研究結果表明GA4含量的降低是活性GA含量降低的主要因素,因此推測主要作用于分解代謝活性GA4轉變?yōu)闊o活性的GA34,從而影響植株高度。
從‘蘇帥’蘋果中克隆得到長為1 122 bp的開放閱讀框(ORF),編碼373個氨基酸,屬于PcbC superfamily超家族,有DIOX_N和2OG-FeII_Oxy保守結構域,同源序列比對和進化樹分析均表明其與白梨同源性最高,進化關系最近。過表達降低了煙草葉片中GA4含量,導致煙草節(jié)間縮短、植株矮化、葉色深綠、葉片長寬比降低以及延遲開花時期;正反饋調節(jié)赤霉素合成相關基因和的表達量。
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(責任編輯 岳梅)
Cloning and Function Analysis of Apple Gibberellin Oxidase Gene
LI FeiHong, Hou YingJun, LI XueHan, YU XinYi, QU ShenChun
(College of Horticulture, Nanjing Agricultural University, Nanjing 210095)
【Objective】The objective of this study is to clone the open reading frame (ORF) of a gibberellin 2-oxidase gene (gibberellin2-oxidase 8,) from apple cultivar ‘Sushuai’, to analyze its sequence characteristics and tissue expression specificity. The effects of overexpression ofon tobacco growth and development were studied in order to provide a theoretical reference for the functional analysis and application of the gene.【Method】The ORF region ofwas cloned from apple by RT-PCR method. The amino acid sequence alignment and conserved domain analysis were performed by NCBI, DNAMAN and Pfamonline software. The composition, theoretical molecular weight and isoelectric point (pI) of the amino acid were deduced by Expasy software online. The protein signal peptide and transmembrane domain were analyzed by SignalP and TMHMM Server V.2.0. The phylogenetictree was constructed by a neighbor-joining (NJ) method using MEGA 7.0 program. The expression level in different tissues of apple was detected by RT-qPCR. To characterize the function of,ORF driven by thepromoter was delivered into tobacco by-mediated transformation approach. Transgenic plants with hygromycin resistance were obtained and identified by using GUS staining, genomic PCR, and RT-PCR. After transplanting, the plant height, internode length, blade aspect ratio, content of chlorophyll, and content of GA1, GA4in tobacco were measured at the first flowering stage. The expression level of related genes in tobacco was analyzed by RT-qPCR.【Result】The ORF sequence ofobtained from ‘Sushuai’ is 1 122 bp in length, encoding a putative protein about 373 amino acids. The predicted molecular weight of MdGA2ox8 is 42.8 kD, the theoretical pI is 5.44 and the instability coefficient is 49.73. MdGA2ox8 contains conserved domains DIOX_N and 20G-Fell_Oxy, without obvious hydrophobic region, transmembrane domain and signal peptide. The MdGA2ox8 protein is a non-secreted protein. Phylogenetic analysis showed that theMdGA2ox8 protein was closely related toGA2ox8 protein. The RT-qPCR results showed thatwas differentially expressed in apple tissues, with the highest expression in flowers, followed by old leaf>young leaf>phloem, but almost no expression in xylem and fruitlet. Five transgenic positive lines were obtained by transferringinto model plant tobacco. Compared with the wild-type, the GA4content decreased and GA1content increased in overexpressedtobacco plants. the average content of GA1in wild-type and transgenic tobacco was 1.26 and 1.75 ng·g-1, respectively. The average content of GA4in wild-type and transgenic tobacco was 5.43 and 1.07 ng·g-1, respectively. Compared with the wild-type, the total content of GA4and GA1in transgenic tobacco plants decreased, resulting in shorter internode length, dwarfing and delayed flowering. The average height of wild-type and transgenic tobacco plants was 38.50 and 7.36 cm, respectively. The average internode length of tobacco plants was 9.5 and 3.3 cm, respectively. The leaf of transgenic tobacco was dark green and the leaf aspect was reduced. Moreover, the expression level of endogenous gibberellin synthesis pathway-related genesandwas positively regulated by【Conclusion】The ORF of gibberellin 2-oxidase genewas obtained. The difference of tissue expression inwas found. The total content of GA1and GA4inoverexpressed tobacco decreased, which resulted in the shortening of internode length and dwarfing of plants.
apple (); gibberellin oxidase; dwarf;; overexpression; tobacco
2018-06-04;
2018-07-16
國家自然科學基金(3187110456)、江蘇省科學技術廳現(xiàn)代農(nóng)業(yè)-重點及面上項目(BE2017367)
李飛鴻,E-mail:798247396@qq.com。
渠慎春,Tel:025-84395724;E-mail:qscnj@njau.edu.cn
10.3864/j.issn.0578-1752.2018.22.012