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        狐源大腸桿菌毒力基因的檢測

        2018-11-23 03:04:42王紹紅李政志張艷芳劉偉石
        野生動物學(xué)報 2018年4期
        關(guān)鍵詞:毒力致病性陽性率

        王紹紅 柴 榮 李政志 張艷芳 劉偉石 薛 原 孫 穎

        (東北林業(yè)大學(xué)野生動物資源學(xué)院,哈爾濱,150040)

        大腸桿菌(Escherichiacoli)作為一種機(jī)會致病菌,含有多種毒力因子,這些毒力因子對分析大腸桿菌的致病性,研究其是否存在潛在的致病能力等方面起著至關(guān)重要的作用,因此檢測相關(guān)毒力基因具有重要意義。毒力基因廣泛存在于染色體,毒力島和質(zhì)粒上[1],是否存在水平轉(zhuǎn)移現(xiàn)象現(xiàn)在還未可知,另毒力基因存在變異現(xiàn)象,因此研究毒力基因的發(fā)展,分析其致病性,進(jìn)行毒力基因檢測,研究其內(nèi)在聯(lián)系,對于疾病的預(yù)防以及臨床指導(dǎo)用藥具有十分重要的意義。

        耶爾森菌強(qiáng)毒力島(high island,HPI)常出現(xiàn)在大腸桿菌強(qiáng)毒力菌株中,是主要由irp1、irp2、irp3、irp4、irp5、fyuA、ybtA等基因組成的毒力基因簇。HPI含有編碼攝取合成Ybt相關(guān)基因,與鐵攝取與調(diào)節(jié)有關(guān),而鐵元素是保證細(xì)菌在宿主體內(nèi)存活的關(guān)鍵因素,因此攜帶有HPI毒力島的菌株可攝取鐵元素,易在宿主體內(nèi)存活,致病,具有較強(qiáng)的毒力,而且已有研究表明HPI毒力島可在兩種細(xì)菌間水平轉(zhuǎn)移,因此,HPI毒力島的研究對大腸桿菌致病性的研究具有重要意義。另,大腸桿菌的致病性也與黏附素、毒素、侵襲性酶以及多種因子有關(guān)[2]。

        本研究采用PCR法對135株東北地區(qū)狐源大腸桿菌進(jìn)行irp2,fyuA,ybtA,iucD,iss,fimH種毒力基因的檢測并進(jìn)行克隆測序,研究種毒力基因出現(xiàn)的頻率,為后續(xù)毒力因子流行情況的研究提供試驗(yàn)數(shù)據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 菌株

        本實(shí)驗(yàn)檢測東北地區(qū)狐源大腸桿菌共135株,分離的菌株及經(jīng)過生理生化鑒定為大腸桿菌。

        1.2 主要試劑

        膠回收試劑盒,質(zhì)粒抽提試劑盒均購于愛思進(jìn)公司;瓊脂糖,LB,50×TAE緩沖液,DL2000 DNA maker,TaqDNA聚合酶,DH5α和pMD-18T等均購自寶生物生物技術(shù)有限公司。

        1.3 引物合成

        根據(jù)相關(guān)文獻(xiàn)記載的大腸桿菌HPI毒力島主要結(jié)構(gòu)基因及其相關(guān)基因合成對引物,分別用于irp2,fyuA及fimH,iucD,iss,ybtA種毒力基因的擴(kuò)增,引物由博仕生物有限公司合成。引物序列見表1。

        1.4 PCR法擴(kuò)增

        irp2,fyuA及fimH,iucD,iss,ybtA基因。

        表1 大腸桿菌毒力基因的引物

        Tab.1 Primers for E.coli virulence genes

        1.5 PCR產(chǎn)物電泳鑒定

        取PCR產(chǎn)物5 μL,進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳,以DNA Maker DL2000為參照,EB染色后置于紫外燈下觀察。

        2 結(jié)果

        2.1 單個毒力基因的檢測結(jié)果

        對135株大腸桿菌進(jìn)行PCR檢測:共57株檢出irp2,陽性率為42.22%;11株檢出ybtA,陽性率為 8.15%;13株檢出fyuA,陽性率為9.63%;56株檢出fimH,陽性率為41.48%;17株檢出iucD,陽性率為12.59%;1株檢出iss,陽性率為0.07%(圖1~6)。

        圖1 irp2基因片斷的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物Fig.1 PCR amplification product of the irp2 gene fragmentM:DNA Makers DL2000Lane1-5:The positive strains for target genes

        圖2 fyuA基因片斷的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物Fig.2 PCR amplification product of the fyuA gene fragmentM:DNA Makers DL2000Lane1-5:The positive strains for target genes

        圖3 fimH基因片斷的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物Fig.3 PCR amplification product of the fimH gene fragmentM:DNA Makers DL2000Lane1-5:The positive strains for target genes

        圖4 iss基因片斷的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物Fig.4 PCR amplification product of the iss gene fragmentM:DNA Makers DL2000Lane1:The positive strains for target genes

        圖5 iucD基因片斷的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物Fig.5 PCR amplification product of the iucD gene fragmentM:DNA Makers DL2000Lane1-5:The positive strains for target genes

        圖6 ybtA基因片斷的PCR擴(kuò)增產(chǎn)物Fig.6 PCR amplification product of the ybtA gene fragmentM:DNA Makers DL2000Lane1-5:The positive strains for target genes

        2.2 2-3個毒力基因的檢出結(jié)果

        由表2可知,Irp2,fyuA以及fimH,ybtA和Irp2,fyuA,fimH分別同為陽性的菌株均有3株,分別占2.22%;Irp2,fimH同為陽性的菌株有8株,占5.93%;fimH,fyuA同為陽性的菌株有2株,占1.48%;Irp2,iucD同為陽性的菌株有9株,占6.66%;fimH,iucD同為陽性的菌株有4株,占2.96%;Irp2,ybtA同為陽性的菌株有6株,占4.44%;fyuA,iucD以及Irp2,iucD,fimH分別同為陽性的菌株均有1株,分別占0.74%,未發(fā)現(xiàn)有同時攜帶3個以上毒力基因的菌株。

        表2 毒力基因檢測結(jié)果統(tǒng)計(jì)

        Tab.8 Virulence gene test results statistic

        3 討論

        大腸桿菌致病性主要與其菌毛、毒素、抗血清活性因子、侵襲性酶及鐵獲取系統(tǒng)和生物膜形成的相關(guān)蛋白有關(guān),它們提供了定植的能力,以及形成生物膜,捕獲鐵等基本營養(yǎng)物質(zhì),造成上皮損傷,逃避宿主的防御機(jī)制,從而增強(qiáng)了大腸桿菌引起全身感染的能力。其中大腸桿菌產(chǎn)生的特定的毒力因子是決定其致病性的關(guān)鍵因素。

        實(shí)驗(yàn)檢測了6種毒力基因,編碼不同的毒力因子,分別在大腸桿菌侵入,定植,保護(hù)細(xì)菌免受宿主細(xì)胞自噬機(jī)制的識別和捕獲,以及營養(yǎng)、分泌毒素的過程中起著重要的作用。

        其中,fimH(黏附素)能夠暴露于細(xì)菌表面而不是菌毛的組成部分,是菌毛的次要成分,對D-甘露糖受體結(jié)合起著獨(dú)特的作用[7]??少x予1型菌毛結(jié)合D-甘露糖,并因此結(jié)合許多類型的真核細(xì)胞(包括腸、肺、膀胱、腎上皮和各種炎癥細(xì)胞)的能力對保護(hù)大腸桿菌免受吞噬有直接或間接的作用[8]。

        實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示作為HPI毒力島主要結(jié)構(gòu)基因的irp2和黏附相關(guān)基因fimH的檢出率最高,同樣,在趙李祥的研究中fimH檢出率也非常高,達(dá)到90%以上[9]。在鐘杏好等的研究中,fimH檢出率也高達(dá)87.1%~91.3%[10],與本實(shí)驗(yàn)結(jié)果一致,而fimH檢出率普遍很高,這是否說明這個基因比較穩(wěn)定,以及其在大腸桿菌的生存與定植過程中是否發(fā)揮著不可或缺的作用,是否所有有定植能力的大腸桿菌都有這種毒力基因,種種問題還有待進(jìn)一步驗(yàn)證。

        iss(保護(hù)素)是pTJ100相關(guān)基因,是在大多數(shù)APEC菌株中發(fā)生的一組質(zhì)粒相關(guān)基因[11],賦予細(xì)菌攝取鐵和抗血清的作用,編碼與組織侵襲相關(guān)的毒力因子,與鐵的攝取與調(diào)節(jié)有直接或間接的關(guān)系[12],在禽類菌株中更常見,而iucD在人類菌株中更為普遍[12],在本次實(shí)驗(yàn)中iss的檢出率僅為0.07%,iucD檢出率卻為12.59%,另外,兩種基因檢出率都不高與Ewers等的82.7%、78.0%有較大出入[13],iss檢出率也不高于Ragione等研究中的88.7%[8],而相較于呂殿紅等人研究的28.7%也有一定的差距[14],Bonnet等認(rèn)為iss為禽致病性大腸桿菌的標(biāo)志基因之一[2],而在本實(shí)驗(yàn)中iss毒力基因的檢出率要明顯低于其他基因且唯一檢出的1株恰好沒有其他5種毒力基因。

        另外,在此次研究中,有7個分離株同時攜帶3種毒力基因,占全部菌株的5.19%,47個菌株同時攜帶2種毒力基因,占全部菌株的34.81%,并未發(fā)現(xiàn)有攜帶更多毒力基因的菌株,根據(jù)Wang等的研究,大腸桿菌菌株的致病性與毒力相關(guān)基因的數(shù)量和組合模式密切相關(guān)[15],因此,這里還可以做進(jìn)一步的研究。

        此外,在耶爾森氏菌的鐵代謝的高致病性島(HPI)中,小鼠模型顯示HPI增加了腸外感染中的大腸桿菌毒力[16]。fyuA,irp2,ybtA屬于HPI毒力島的核心和功能基因,是它的的3個啟動區(qū)。其中ybtA屬Arac轉(zhuǎn)運(yùn)調(diào)節(jié)家族,促進(jìn)fyuA、irp2、irp6等啟動子的表達(dá)抑制自身啟動子[4],對Ybt的合成攝取起調(diào)節(jié)作用[16]。irp2與攝鐵能力有關(guān),參與鐵載體的合成和表達(dá),可作為HPI的標(biāo)志基因;fyuA可編碼鐵抑制外膜蛋白,是Ybt細(xì)菌素及巴氏桿菌素的外膜受體,與大腸桿菌毒力密切相關(guān)。

        實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明,同為HPI毒力島主要結(jié)構(gòu)基因,同時攜帶irp2與fyuA基因的菌株卻少于同時攜帶有irp2與fimH的菌株且fyuA的檢出率低于irp2。事實(shí)上,HPI毒力島不完整的現(xiàn)象在胡靜等人的研究中曾有記載,fyuA在HPI核心區(qū)的邊緣,在進(jìn)化和轉(zhuǎn)移過程中容易破壞和丟失,所以fyuA的檢出率往往低于irp2[17],且在HPI核心區(qū)中除邊緣丟失的情況外,還存在其他形式的缺失。且在胡靜的實(shí)驗(yàn)中,EAggEC菌株所攜帶的與耶爾森菌同源的HPI毒力島,即便HPI存在,正常情況下并不表現(xiàn)強(qiáng)毒力和生長抑制,也并不意味著細(xì)菌獲得了致病性,猜想與菌種的遺傳差異有關(guān),那么是否HPI在水平轉(zhuǎn)移過程中也存在這種情況,那么HPI僅存在于強(qiáng)毒力菌株是否還成立呢?另外,irp2與fimH,irp2與iucD同時存在的菌株數(shù)頗多是否是偶然,是否說明irp2與fimH,iucD之間存在某種關(guān)聯(lián)還有待深入研究。

        研究表明,大量的菌株可形成一個重要的毒力基因庫,在某些情況下,并與其他因素結(jié)合,可能會產(chǎn)生新的致病菌株。新的致病形式的大腸桿菌往往通過不同毒力基因的組合而出現(xiàn),而大腸桿菌也能夠?qū)⒍玖蜉敵龅狡渌锾m氏陰性生物。因此,檢測環(huán)境中的大腸桿菌毒力基因是至關(guān)重要的。

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