吳偉林,楊 帆,孟章進(jìn),姜桂英,方 芝
(江蘇油田石油工程技術(shù)研究院,江蘇揚(yáng)州 225009)
油田經(jīng)長期注水開發(fā),地層水中已形成了較為穩(wěn)定的微生物群落,在低于100℃的較淺的地層中,微生物群落較為復(fù)雜,種類多且數(shù)量大,以細(xì)菌為主,主要包括石油烴降解菌、脫氮菌、產(chǎn)甲烷菌、硫酸鹽還原菌、鐵細(xì)菌、硫細(xì)菌和腐生菌等。這些細(xì)菌在地層環(huán)境長期生存的過程中,產(chǎn)生了較強(qiáng)的適應(yīng)性[1]。這些微生物的存在對水質(zhì)有很大影響,在油田水系統(tǒng)中尤以硫酸鹽還原菌(SRB)、鐵細(xì)菌(FB)和腐生菌(TGB)對水質(zhì)的影響最大。
傳統(tǒng)的富集培育、分離鑒定的生物學(xué)方法,只能獲得生物的可培養(yǎng)部分,而這可培養(yǎng)部分僅占環(huán)境生物的百分之幾,不同的生物還需要準(zhǔn)備不同的培養(yǎng)基進(jìn)行選擇性培養(yǎng)[2]。用分子生態(tài)學(xué)研究方法可以更全面認(rèn)識(shí)環(huán)境中的生物,從環(huán)境中提取總的生物分子DNA,利用PCR(聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng))技術(shù),在特定引物作用下,將環(huán)境中存在的生物信息分子16S rDNA進(jìn)行2n倍擴(kuò)增(n=30~40),這些分子經(jīng)過連接到質(zhì)粒上轉(zhuǎn)化進(jìn)入感受態(tài)細(xì)胞中,培養(yǎng)、選取連接轉(zhuǎn)換成功的細(xì)胞,并提取其中的生物信息分子16S rDNA,對其進(jìn)行測序,再與基因庫中的生物信息分子16S rDNA進(jìn)行對比,確定科屬或種屬,即構(gòu)建成環(huán)境樣品的基因文庫[3-7]。這種方法較費(fèi)時(shí),但對研究環(huán)境中存在的物種非常有用。另一種簡便快速的生物技術(shù)方法是DGGE(變性梯度凝膠電泳),雖然得不到非常詳盡的物種信息,但可以快速檢測到生物的變化,對物種的部分信息也能有所了解。
本文用基因文庫法對兩個(gè)污水處理大站系統(tǒng)中的菌群進(jìn)行普查,建立江蘇油田回注污水的菌群基因組文庫,并應(yīng)用DGGE技術(shù)分析系統(tǒng)流程中細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)變化,為后續(xù)污水治理提供理論基礎(chǔ)。
高二聯(lián)和楊家壩污水處理站系統(tǒng)水樣;離心機(jī);PCR擴(kuò)增儀;變性梯度凝膠電泳儀。
總DNA提?。簩⒂吞锊杉臉悠窊u勻,取1200mL~2 000 mL樣品于離心杯中,5 000 r/min離心20 min,小心移除上清液。依次加入溶菌酶、氯仿處理,離心獲得樣品的總DNA。
PCR擴(kuò)增:所得細(xì)菌總DNA,PCR擴(kuò)增16S rDNA,瓊脂糖電泳檢測確認(rèn),加入特征引物PCR擴(kuò)增16S rDNA V3區(qū)。
功能菌的選擇性培養(yǎng):根據(jù)油田腐蝕重要菌的特性,利用選擇性培養(yǎng)基培養(yǎng)腐生菌、鐵細(xì)菌及硫酸鹽還原菌,提取其總DNA擴(kuò)增16S rDNA中的V3區(qū),同樣進(jìn)行DGGE分析,對照其他樣品,確定相關(guān)細(xì)菌,軟件測定各條帶亮度,分析總生物量和重要細(xì)菌的相對量。
圖1 高二聯(lián)和楊家壩污水處理站系統(tǒng)中細(xì)菌群落及分類菌DGGE
對采集的高二聯(lián)和楊家壩區(qū)塊12個(gè)樣品,通過總DNA的提取,細(xì)菌群落的16S rDNA V3區(qū)選擇性擴(kuò)增,并進(jìn)行DGGE檢測,其結(jié)果(見圖1,左圖),并與選擇性培養(yǎng)后的結(jié)果對比(見圖1,右圖)。從圖1中可以看出各樣品呈現(xiàn)不同的細(xì)菌分布特征,主體微生物較接近。其中樣品3、4號(hào)細(xì)菌種類最豐富。3及4號(hào)合并建庫。
根據(jù)水樣的細(xì)菌豐富情況,選擇3號(hào)和4號(hào)水樣合并構(gòu)建細(xì)菌文庫。由樣品的總DNA通過連接和轉(zhuǎn)化,構(gòu)建了相應(yīng)的文庫,結(jié)果(見表1)。
由表1可知,樣本中存在大量未培養(yǎng)的細(xì)菌,也存在 Geobacter lovleyi SZ,Desulfobulbus sp,Bacterium B1C2-1,Arcobacter sp.R-28214, 油田細(xì)菌,Pseudomonas stutzeri A1501,Bacteroides sp,Acholeplasma sp,Syntrophobacter sulfatireducens,Desulfobulbus propionicus,Desulforegula conservatrix,Wolinella succinogenes,F(xiàn)irmicutes bacterium 及 Trichlorobacter thiogenes等。主要的硫酸鹽還原菌為Desulfobulbus和Desulforegula。
表1 江蘇油田采集樣品3號(hào)和4號(hào)水樣的細(xì)菌文庫
表1 江蘇油田采集樣品3號(hào)和4號(hào)水樣的細(xì)菌文庫(續(xù)表)
其相對豐度(見表2)。
從表2可以看出,油田中以未培養(yǎng)的細(xì)菌為主,占總體的近40%,其次是羅氏地細(xì)菌和硫酸鹽還原菌分別約占16%,假單胞菌約占7%,端細(xì)菌及琥珀菌分別約占5%,其他如細(xì)菌,共生菌,三氯菌及鹽沼菌等各約占2%。根據(jù)油田功能菌(腐生菌、硫酸鹽還原菌及鐵細(xì)菌)分,腐生菌約占44%,硫酸鹽還原菌約占16%,鐵細(xì)菌<2%,未培養(yǎng)其生理生化特性不明的微生物占40%。
根據(jù)文庫的細(xì)菌檢測到的豐度及DGGE條帶亮度的聯(lián)系,利用凝膠分析系統(tǒng)進(jìn)行半定量,分析兩個(gè)污水處理系統(tǒng)中細(xì)菌量及群落變化或分布,結(jié)果(見表3,表 4)。
高集污水系統(tǒng)中油井微生物較多,處理后逐步降低,注水井中微生物又高了;假單胞菌油井中較多,處理后降低至消失;未培養(yǎng)菌及硫酸鹽還原菌為主體。油井中高6-58的硫酸鹽還原菌(細(xì)菌量指數(shù)1 203)較高6-65的硫酸鹽還原菌(細(xì)菌量指數(shù)700)高;地細(xì)菌油井中僅在高6-58存在,處理流程中逐步減少;端細(xì)菌在油井高6-65中較高,流程中僅在高二聯(lián)60 m3緩沖罐出口檢測到;沃氏琥珀菌僅在油井高6-58中檢測到;處理流程中高二聯(lián)三相分離器出口硫酸鹽還原菌(細(xì)菌量指數(shù)2 161)最高,依次減少緩沖罐出口硫酸鹽還原菌(細(xì)菌量指數(shù)1 337),高二聯(lián)注水泵進(jìn)口硫酸鹽還原菌(細(xì)菌量指數(shù)1 353)。
楊家壩污水處理系統(tǒng)中,處理流程中細(xì)菌量較高,隨處理過程而減少,種類較少,仍然以未培養(yǎng)菌及硫酸鹽還原菌為主體。該系統(tǒng)中,假單胞菌、地細(xì)菌、端細(xì)菌及沃氏琥珀菌幾乎沒有,僅在楊家壩注水泵進(jìn)口檢測到不足10%的地細(xì)菌。
油井中硫酸鹽不同,卞東中轉(zhuǎn)站硫酸鹽還原菌(細(xì)菌量指數(shù)3 598),郭塘中轉(zhuǎn)站硫酸鹽還原菌(細(xì)菌量指數(shù)1 544),閔18中轉(zhuǎn)站硫酸鹽還原菌(細(xì)菌量指數(shù)3 150),處理流程依次增加,楊三相分離器出口(硫酸鹽還原菌細(xì)菌量指數(shù)3 567),高100 m3沉降罐出口(硫酸鹽還原菌細(xì)菌量指數(shù)4 681),楊家壩注水泵進(jìn)口(硫酸鹽還原菌細(xì)菌量指數(shù)4 737)。
表2 檢測到的細(xì)菌相對豐度
表3 高集污水處理系統(tǒng)細(xì)菌群落分布
表4 楊家壩污水處理系統(tǒng)細(xì)菌群落分布
按油田功能分類細(xì)菌的結(jié)果(見表5)。
由表5可知,高集和楊家壩區(qū)塊污水中以腐生菌為主,其次是硫酸鹽還原菌,鐵細(xì)菌相對較少。值得注意的是,在卞東中轉(zhuǎn)站水樣中鐵細(xì)菌較多,硫酸鹽還原菌未檢測到;高6-65水樣中,鐵細(xì)菌較硫酸鹽還原菌多。
(1)用基因文庫法對高二聯(lián)和楊家壩污水處理站系統(tǒng)中菌群進(jìn)行普查,建立了回注污水的菌群基因組文庫,發(fā)現(xiàn)水樣中以未培養(yǎng)的細(xì)菌為主,占總體的近40%,其次是羅氏地細(xì)菌和硫酸鹽還原菌分別約占16%,假單胞菌約占7%,端細(xì)菌及琥珀菌分別約占5%,其他如細(xì)菌,共生菌,三氯菌及鹽沼菌等各占約2%。根據(jù)油田功能菌(腐生菌、硫酸鹽還原菌及鐵細(xì)菌)分,腐生菌占約44%,硫酸鹽還原菌占約16%,鐵細(xì)菌占<2%,未培養(yǎng)其生理生化特性不明的微生物占40%。
(2)通過DGGE分析發(fā)現(xiàn),高二聯(lián)集輸系統(tǒng)中鐵細(xì)菌增加,而SRB減少。楊家壩集輸系統(tǒng)中,鐵細(xì)菌和SRB均增加。鐵細(xì)菌在高二聯(lián)集輸系統(tǒng)中比楊家壩集輸系統(tǒng)中多,而SRB在楊家壩集輸系統(tǒng)中比高二聯(lián)集輸系統(tǒng)多。
表5 油田水系統(tǒng)中分類菌的分布情況
(3)通過基因文庫法和DGGE技術(shù)對污水處理站系統(tǒng)中菌群分析,有利于了解污水處理系統(tǒng)中細(xì)菌種類和分布情況,特別是油田常見危害菌(SRB、TGB、FB)的分布,為后續(xù)治理細(xì)菌起到指導(dǎo)作用。