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        肝細(xì)胞癌患者血清中SOX 1和VIM啟動(dòng)子的甲基化檢測(cè)及其臨床意義

        2018-11-15 00:44:50張良周進(jìn)學(xué)肖騰向宏市
        癌癥進(jìn)展 2018年11期
        關(guān)鍵詞:甲基化標(biāo)志物陽性率

        張良,周進(jìn)學(xué),肖騰#,向宏市

        1鄭州頤和醫(yī)院普外科,鄭州450000

        2河南省腫瘤醫(yī)院普外科,鄭州4500000

        肝細(xì)胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)占原 發(fā)性肝癌的90%以上,是中國較常見的惡性腫瘤之一[1]。早期診斷是HCC治療的先決條件[2]。臨床上,HCC的檢測(cè)主要基于血清甲胎蛋白(α-fetoprotein,AFP)、病變活檢及各種成像技術(shù)。然而,這些HCC監(jiān)測(cè)和診斷技術(shù)仍存在一些限制[3]。因此,新生物標(biāo)志物的探究對(duì)于改善早期HCC的診斷具有十分重要的臨床意義。腫瘤患者血液中循環(huán)腫瘤細(xì)胞游離DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)作為生物標(biāo)志物,已廣泛用于預(yù)測(cè)風(fēng)險(xiǎn)、診斷疾病和預(yù)測(cè)預(yù)后。表觀遺傳學(xué)的改變?cè)谌祟惸[瘤的發(fā)生、進(jìn)展中起著重要作用。腫瘤中最常見的表觀遺傳變化為基因啟動(dòng)子區(qū)域中的異常DNA甲基化,可導(dǎo)致腫瘤抑制基因的沉默。相關(guān)研究證實(shí),DNA甲基化改變可作為腫瘤的生物標(biāo)志物用于早期檢測(cè)包括HCC在內(nèi)的多種腫瘤。血清性別決定區(qū)域Y框蛋白1(sex-determining region Y-box protein 1,SOX1)和波形蛋白(vimentin,VⅠM)基因啟動(dòng)子甲基化可能是卵巢癌和結(jié)直腸癌的潛在預(yù)測(cè)生物標(biāo)志物,且已在HCC組織中檢測(cè)到SOX1基因和VIM基因的異常甲基化。然而,HCC患者血清中SOX1基因和VIM基因啟動(dòng)子甲基化作用尚不清楚。因此,本研究對(duì)HCC患者血清SOX1基因和VIM基因啟動(dòng)子甲基化狀態(tài)進(jìn)行評(píng)估,以探究其作為生物標(biāo)志物用于診斷HCC的潛在價(jià)值,現(xiàn)報(bào)道如下。

        1 對(duì)象與方法

        1.1 研究對(duì)象

        選取2015年1月至2016年6月于鄭州頤和醫(yī)院和河南省腫瘤醫(yī)院確診的HCC患者60例作為研究組(HCC組)。所有HCC患者術(shù)前均未進(jìn)行抗腫瘤等其他治療,且均經(jīng)術(shù)后病理學(xué)檢查確診為HCC,血清乙型肝炎表面抗原(hepatitis B surface antigen,HbsAg)均呈陽性。其中男性36例,女性24例;年齡30~70歲,平均(49.29±13.71)歲;臨床分期根據(jù)《原發(fā)性肝癌的臨床診斷與分期標(biāo)準(zhǔn)》[4]:Ⅰ~Ⅱ期24例,Ⅲ~Ⅳ期36例;分化程度:高分化18例,中分化17例,低分化25例;無包膜侵犯32例,有包膜侵犯28例;伴轉(zhuǎn)移(包括肝門淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、肝外轉(zhuǎn)移)25例,不伴轉(zhuǎn)移35例;伴肝硬化41例,不伴肝硬化19例;術(shù)前檢測(cè)AFP≥20 μg/L記為陽性:陽性42例,陰性18例。選取同期于鄭州頤和醫(yī)院和河南省腫瘤醫(yī)院治療的乙型肝炎后肝硬化(liver cirrhosis,LC)患者50例(LC組)、慢性乙型病毒性肝炎(chronic viral hepatitis type B,CHB)患者50例(CHB組)作為疾病對(duì)照組,診斷均符合2015年版《慢性乙型肝炎防治指南》[5],排除乙型肝炎病毒/丙型肝炎病毒重疊感染和人類免疫缺陷病毒混合感染者。另外,選取同期于鄭州頤和醫(yī)院和河南省腫瘤醫(yī)院體檢的健康體檢者50例作為健康對(duì)照組(Control組),排除患其他肝臟疾病及其他重要軀體疾病的患者。4組研究對(duì)象的年齡、性別等基線資料比較,差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),具有可比性(表1)。本研究經(jīng)醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)通過,所有對(duì)象均對(duì)本研究知情同意并簽署知情同意書。

        表1 4組對(duì)象的基線資料

        1.2 方法

        1.2.1 標(biāo)本采集和DNA提取 采集所有患者治療前及健康體檢者的清晨空腹外周靜脈血8 ml,置于EDTA抗凝管中,3000 r/min離心10 min后,分離血清。采用血清游離DNA提取試劑盒,根據(jù)試劑盒說明書進(jìn)行相關(guān)操作提取DNA,將血清DNA洗脫并于-20℃保存。

        1.2.2 DNA亞硫酸鹽修飾 采用EpiTect Bisulfite Kit試劑盒,根據(jù)試劑盒說明書對(duì)DNA進(jìn)行相關(guān)操作。取血清 DNA 2 μg 加入 4 mol/L NaOH,調(diào)整DNA終濃度為0.2 mol/L,于37℃變性10 min。加入30 mol/L NaHSO3,于50℃水浴16 h,經(jīng)DNA純化試劑盒修飾后,于室溫下加入4 mol/L NaOH,調(diào)整DNA終濃度為0.3 mol/L,靜置20 min脫硫。加入1/10體積乙酸鈉和冰乙醇使DNA沉淀,干燥后加入TE(pH=8.0)溶解。將修飾的DNA作為甲基化特異性聚合酶鏈反應(yīng)(methylmion specific polymerase chain reaction,MSP)模板,于-20℃儲(chǔ)存。

        1.2.3 MSPMSP引物序列由上海生工生物工程有限公司合成(表2)。采用25 μl聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)反應(yīng)體系:Premix Taq 12.5 μl,ddH2O 10.5 μl,正向引物和反向引物各0.5 μl、亞硫酸鹽修飾的DNA 1 μl。在ABⅠ7500型PCR儀上進(jìn)行擴(kuò)增,第一輪PCR反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性5 min;95℃變性30 s,58℃退火40 s,72℃引物延伸40 s,共進(jìn)行40個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min。將第一輪PCR產(chǎn)物稀釋50倍后,取1 μl進(jìn)行第二輪PCR反應(yīng),PCR反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性5 min;95℃變性30 s,65℃退火40 s,72℃引物延伸40 s,共進(jìn)行40個(gè)循環(huán);72℃延伸10 min,產(chǎn)物4℃保存。以人HCC細(xì)胞系(HepG2細(xì)胞,中科院上海細(xì)胞庫)DNA作為陽性對(duì)照(PC),以健康者外周血淋巴細(xì)胞DNA作為陰性對(duì)照(NC),以H2O代替DNA作為空白對(duì)照(Blank)。取7 μl PCR擴(kuò)增產(chǎn)物于2%瓊脂糖凝膠上進(jìn)行電泳,采用JS-3000凝膠成像系統(tǒng)分析儀采集圖像。

        表2 甲基化特異性聚合酶鏈反應(yīng)引物序列

        1.3 判定標(biāo)準(zhǔn)

        甲基化引物擴(kuò)增出條帶,或者甲基化與非甲基化引物均擴(kuò)增出條帶,則血清SOX1基因或VIM基因啟動(dòng)子甲基化陽性;甲基化引物未擴(kuò)增出條帶而非甲基化引物擴(kuò)增出現(xiàn)條帶,則血清SOX1基因或VIM基因啟動(dòng)子甲基化陰性。

        1.4 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

        采用SPSS 20.0-軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。計(jì)量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(x±s)表示,組間比較采用F檢驗(yàn)或t檢驗(yàn);計(jì)數(shù)資料以率(%)表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn)。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 血清中SOX 1、VIM基因啟動(dòng)子甲基化檢測(cè)結(jié)果

        4組對(duì)象的SOX1、VIM基因啟動(dòng)子甲基化陽性率比較,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01);其中HCC組患者的血清SOX1、VIM基因啟動(dòng)子甲基化陽性率均高于LC組、CHB組和Control組,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);LC組和CHB組患者的血清SOX1、VIM基因啟動(dòng)子甲基化陽性率均高于Control組,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05);LC組患者的血清SOX1、VIM基因啟動(dòng)子甲基化陽性率均高于CHB組,但差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。(表3)

        表3 不同組別血清SOX 1、VIM基因啟動(dòng)子甲基化陽性率的比較[ n(%)]

        2.2 SOX 1、VIM基因啟動(dòng)子甲基化狀態(tài)與HCC患者臨床特征的關(guān)系

        不同包膜侵犯程度、分化程度、TNM分期、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移情況HCC患者的血清SOX1基因啟動(dòng)子甲基化狀態(tài)比較,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=7.641,P=0.006;χ2=8.871,P=0.012;χ2=7.797,P=0.005;χ2=7.636,P=0.006);但不同年齡、性別、腫瘤直徑、AFP水平、肝硬化、門靜脈癌栓HCC患者的血清SOX1基因啟動(dòng)子甲基化狀態(tài)比較,差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。不同分化程度、TNM分期、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移情況HCC患者的血清VIM基因啟動(dòng)子甲基化狀態(tài)比較,差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=12.967,P=0.002;χ2=5.926,P=0.015;χ2=10.080,P=0.001);但不同年齡、性別、腫瘤直徑、AFP水平、肝硬化、門靜脈癌栓、包膜侵犯程度HCC患者的血清VIM基因啟動(dòng)子甲基化狀態(tài)比較,差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。(表 4)

        表4 不同臨床特征HCC患者血清SOX 1、VIM基因啟動(dòng)子甲基化情況( n=60)

        3 討論

        腫瘤發(fā)生不同階段的CpG島異常高甲基化是導(dǎo)致腫瘤抑制基因(tumor suppressor gene,TSG)功能障礙的重要原因?;騿?dòng)子的超甲基化可以是早期或晚期事件中HCC的標(biāo)志物[6]。多種血清DNA的異常甲基化已被證實(shí)可作為評(píng)估HCC風(fēng)險(xiǎn)的生物標(biāo)志物,如血清Ras相關(guān)區(qū)域家族1A(Ras association domain family 1A,RASSF1A)、谷胱甘肽S轉(zhuǎn)移酶P1(glutathione S-transferase P1,GSTP1)、活化蛋白C(activator protein C,APC)等[7-8]。既往研究已在HCC組織中檢測(cè)到SOX1和VⅠM的異常甲基化[9-10]。本研究證實(shí),在HCC、LC、CHB患者血清中均可以檢測(cè)到SOX1基因和VIM基因啟動(dòng)子甲基化。既往研究表明,慢性肝炎-肝硬化-HCC是一個(gè)持續(xù)發(fā)展的過程[11]。本研究中發(fā)現(xiàn),HCC患者血清中SOX1基因和VIM基因啟動(dòng)子甲基化陽性率高于LC患者和CHB患者,且而LC、CHB患者的血清SOX1基因和VIM基因啟動(dòng)子甲基化陽性率高于Control組患者,這種趨勢(shì)可能對(duì)疾病的進(jìn)展具有一定預(yù)測(cè)價(jià)值。

        SOX1是SRY盒(SOX)蛋白家族成員之一,是編碼參與調(diào)控胚胎發(fā)育和細(xì)胞命運(yùn)的決定性轉(zhuǎn)錄因子。研究發(fā)現(xiàn),SOX1的組成型過表達(dá)可以抑制HCC細(xì)胞系的增殖、集落形成和侵襲能力,且SOX1敲減可以部分恢復(fù)這些功能,提示SOX1是HCC的重要腫瘤抑制因子[12]。另外,還有研究發(fā)現(xiàn),SOX1的異位表達(dá)可以通過干擾Wnt/β-連環(huán)蛋白信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)而抑制HCC生長(zhǎng)。已有研究證實(shí),SOX1的異常甲基化與子宮頸癌和非小細(xì)胞肺癌相關(guān)[13-14]。另外有研究報(bào)道,在HCC組織中,SOX1表達(dá)下調(diào)與啟動(dòng)子甲基化之間存在負(fù)相關(guān)[15]。VIM基因編碼波形蛋白,其在維持細(xì)胞形態(tài)、穩(wěn)定細(xì)胞骨架等多種過程中起重要作用。VⅠM也參與細(xì)胞遷移和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)。此外,既往研究表明,VⅠM參與上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化過程(EMT),而EMT是惡性腫瘤細(xì)胞侵襲和轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵途徑。另外,研究發(fā)現(xiàn),VIM基因啟動(dòng)子異常甲基化與宮頸癌和胰腺癌密切相關(guān)[16-17]。

        本研究評(píng)估血清SOX1基因和VIM基因啟動(dòng)子甲基化是否與HCC患者的臨床特征有關(guān)。結(jié)果發(fā)現(xiàn),SOX1基因和VIM基因啟動(dòng)子甲基化均與HCC患者的腫瘤分化程度、TNM分期、腫瘤遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移有關(guān),提示SOX1基因和VIM基因啟動(dòng)子甲基化功能與HCC進(jìn)展密切相關(guān),可能通過調(diào)控腫瘤細(xì)胞增殖、遷移和侵襲,從而參與HCC的臨床進(jìn)展過程。另外本研究還發(fā)現(xiàn),SOX1基因啟動(dòng)子甲基化與HCC患者的包膜侵犯情況有關(guān),推測(cè)SOX1基因啟動(dòng)子甲基化可能影響其他相關(guān)基因的表達(dá),從而導(dǎo)致HCC的臨床特征發(fā)生變化。以上結(jié)果表明,血清SOX1基因和VIM基因啟動(dòng)子甲基化狀態(tài)可能是HCC進(jìn)展的有效預(yù)測(cè)因子。

        然而,由于本研究樣本量較少,且沒有量化HCC患者血清和組織中SOX1、VIMmRNA和蛋白表達(dá)水平,因此在后續(xù)研究中將進(jìn)一步檢測(cè)HCC患者SOX1和VIM表達(dá)與啟動(dòng)子甲基化之間的關(guān)系,以期為血清SOX1基因和VIM基因啟動(dòng)子甲基化的臨床應(yīng)用提供更充分的參考依據(jù)。

        綜上所述,HCC患者血清中存在SOX1基因和VIM基因啟動(dòng)子甲基化,SOX1基因啟動(dòng)子甲基化與包膜侵犯程度、分化程度、TNM分期、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移有關(guān),VIM基因啟動(dòng)子甲基化與腫瘤分化程度、TNM分期、腫瘤遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移等有關(guān),可作為HCC分子診斷和病情進(jìn)展的生物標(biāo)志物。

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