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        長(zhǎng)鏈非編碼RNA在腫瘤中的研究進(jìn)展

        2018-11-15 00:44:36王馨悅李劍
        癌癥進(jìn)展 2018年11期
        關(guān)鍵詞:肝癌胃癌肺癌

        王馨悅,李劍

        河北醫(yī)科大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,石家莊0500000

        在過(guò)去,人們認(rèn)為非編碼RNA(non-coding RNA,ncRNA)沒(méi)有任何生物學(xué)功能,是暗物質(zhì)。但是隨著多個(gè)物種基因組測(cè)序的完成,人們發(fā)現(xiàn)在真核生物的基因組中,能夠編碼蛋白質(zhì)的序列還不足2%,而在線蟲中此類基因卻可達(dá)60%。這說(shuō)明能夠編碼蛋白質(zhì)的序列所占比例與物種進(jìn)化水平呈負(fù)相關(guān)趨勢(shì),即生物進(jìn)化的等級(jí)越高,其基因組中長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)的比例就越高,反之亦然[1]。除去非編碼區(qū),可推算出約有91%的基因組序列能轉(zhuǎn)錄生成ncRNA。其中有廣為人知的轉(zhuǎn)運(yùn)RNA(transfer RNA,tRNA)、核糖體RNA(ribosomal RNA,rRNA)等,也有近年來(lái)的研究熱點(diǎn)微小RNA(microRNA,miRNA)、lncRNA等。與miRNA相比,人們對(duì)lncRNA所知甚少,而今因?yàn)榘l(fā)現(xiàn)其調(diào)節(jié)功能與惡性腫瘤的密切關(guān)系而成為研究熱點(diǎn)。本文結(jié)合國(guó)內(nèi)外最新研究,對(duì)lncRNA在惡性腫瘤中的研究進(jìn)展作一綜述。

        1 lncRNA的簡(jiǎn)介

        1.1 lncRNA的來(lái)源與分類

        lncRNA是指轉(zhuǎn)錄本長(zhǎng)度超過(guò)200 nt,位于細(xì)胞核或細(xì)胞質(zhì)內(nèi),通常由RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄生成的分子。由于缺乏有意義的開放閱讀框(open reading frame,ORF),lncRNA一般不能編碼蛋白質(zhì),只能以RNA的形式在多種層次上調(diào)控基因的表達(dá)。研究人員根據(jù)lncRNA與信使RNA(messenger RNA,mRNA)的相似性,推測(cè)其來(lái)源[2]:①編碼蛋白質(zhì)的基因結(jié)構(gòu)被破壞;②染色體重排;③在反轉(zhuǎn)錄轉(zhuǎn)座的作用下,變成具有功能的非編碼返座基因和不具有功能的非編碼返座假基因;④lncRNA中鄰近的重復(fù)序列發(fā)生兩次串聯(lián)重復(fù)事件;⑤可轉(zhuǎn)座元件的插入。又根據(jù)其來(lái)源和分布特點(diǎn)分為5類:正義鏈lncRNA、反義鏈lncRNA、雙向lncRNA、內(nèi)含子lncRNA、基因間lncRNA。

        1.2 lncRNA的特點(diǎn)與功能

        與mRNA和小分子RNA不同,lncRNA在不同物種之間的保守性較差,這是快速適應(yīng)進(jìn)化的結(jié)果。但許多l(xiāng)ncRNA仍含有高保守元件,且研究結(jié)果表明,這些高保守元件的核苷酸序列或空間結(jié)構(gòu)對(duì)lncRNA維持其二級(jí)結(jié)構(gòu)的穩(wěn)定性或功能的發(fā)揮至關(guān)重要[3]。即lncRNA的一級(jí)結(jié)構(gòu)具有低保守性,而二級(jí)結(jié)構(gòu)具有高保守性。

        lncRNA功能繁多,與腫瘤相關(guān):①維持細(xì)胞的生長(zhǎng)與增殖;②躲避生長(zhǎng)抑制因子;③保證復(fù)制的連續(xù)進(jìn)行;④促進(jìn)轉(zhuǎn)移和侵襲;⑤誘導(dǎo)血管生成;⑥抑制細(xì)胞凋亡[4]。與此同時(shí),lncRNA在腫瘤中的作用亦表現(xiàn)在其對(duì)腫瘤代謝的影響。研究顯示,腫瘤的浸潤(rùn)、轉(zhuǎn)移及血管生成的過(guò)程中都伴有l(wèi)ncRNA表達(dá)的改變,而腫瘤的這些行為改變均涉及腫瘤的代謝變化[5]。即lncRNA可以通過(guò)影響糖代謝、脂肪代謝等來(lái)影響腫瘤的發(fā)生發(fā)展。

        2 lncRNA與腫瘤

        越來(lái)越多的研究結(jié)果顯示,腫瘤的發(fā)生發(fā)展與lncRNA的異常表達(dá)密切相關(guān),lncRNA在許多惡性腫瘤中的表達(dá)都與在正常組織中有很大差異。本文將近年來(lái)研究較透徹的lncRNA進(jìn)行了歸納總結(jié)(表1)。

        2.1 肺癌

        肺癌是發(fā)病率和病死率增長(zhǎng)最快,對(duì)人類健康和生命威脅最大的惡性腫瘤之一。雖然肺癌的病因至今尚不完全明確,但主要因素為吸煙、空氣污染、電離輻射等[6]。經(jīng)研究發(fā)現(xiàn),許多l(xiāng)ncRNA在肺癌患者中都表達(dá)異常。肺腺癌相關(guān)轉(zhuǎn)錄本1(metastasis associated lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT1)是第一個(gè)在肺癌中被研究的lncRNA,在肺癌中表達(dá)有較高的特異性,被認(rèn)為是非小細(xì)胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)尤其是肺腺癌轉(zhuǎn)移早期階段的特異性標(biāo)志物[4]。研究顯示,MALAT1在肺癌患者體內(nèi)表達(dá)上調(diào),能夠促進(jìn)肺癌細(xì)胞增長(zhǎng)和遷移[4,7-8]。在肺癌患者的肺組織內(nèi)還有很多l(xiāng)ncRNA與其功能相似,如HOTAⅠR、CCAT2等。而母系表達(dá)基因3(maternally express 3,MEG3)是第一個(gè)被發(fā)現(xiàn)具有腫瘤抑制功能的lncRNA[9]。它可能通過(guò)下調(diào)BCL-XL(B-cell lymphoma-XL)的表達(dá)來(lái)抑制腫瘤細(xì)胞的增殖,同時(shí)促進(jìn)細(xì)胞凋亡[10]。其在正常組織中通常呈高表達(dá)狀態(tài),尤其是腦組織;而在肺癌患者肺組織內(nèi)低表達(dá),甚至不表達(dá)。與MEG3一樣,GAS6-AS1、TUG1等有抑制腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)移的作用,在肺癌患者體內(nèi)表達(dá)下調(diào)。由此可見,肺癌患者肺組織中的許多l(xiāng)ncRNA表達(dá)均異常,一些有抑制腫瘤細(xì)胞增殖、轉(zhuǎn)移作用的lncRNA表達(dá)下調(diào);而具有促進(jìn)腫瘤細(xì)胞增殖、轉(zhuǎn)移的lncRNA表達(dá)上調(diào)。值得關(guān)注的是,除了MALAT1,近年來(lái)研究人員又陸續(xù)發(fā)現(xiàn)了一些肺腺癌特異性 lncRNA(表 2)[9,11-14],如 CCAT2、CAS6-AS1、CAS5、HOTAⅠR等,它們可能是肺癌預(yù)后預(yù)測(cè)分子標(biāo)志物,或許能夠?yàn)榉伟┑脑\斷和治療提供參考。

        表1 lncRNA的功能及涉及腫瘤類型

        表2 相關(guān)lncRNA在肺癌中的作用

        2.2 肝癌

        肝癌可分為原發(fā)性肝癌和繼發(fā)性肝癌兩大類。原發(fā)性肝癌是中國(guó)高發(fā)的、危害極大的惡性腫瘤。同肺癌一樣,原發(fā)性肝癌的病因及確切分子機(jī)制尚不完全清楚,但lncRNA在肝癌的發(fā)生發(fā)展中一樣起著重要的調(diào)控作用。H19是最早被鑒定的印跡基因之一,它在肝癌中起著重要的調(diào)控作用。H19上調(diào)促進(jìn)肝癌細(xì)胞的增殖,下調(diào)會(huì)抑制增殖[15]。且在試管內(nèi)水平研究發(fā)現(xiàn),H19是通過(guò)逆轉(zhuǎn)上皮-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化來(lái)抑制肝癌細(xì)胞轉(zhuǎn)移的。H19通過(guò)蛋白復(fù)合體HNRNPU/PCAF/RNAPolⅡ促進(jìn)蛋白乙酰化,激活miRNA-200家族,逆轉(zhuǎn)上皮細(xì)胞-間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial-mesenchymal transition,EMT),從而抑制肝癌細(xì)胞向遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移。lncRNA UCA1在肝癌組織中高表達(dá),能夠提示病情的進(jìn)展,還預(yù)測(cè)肝癌移植術(shù)后患者復(fù)發(fā)的風(fēng)險(xiǎn)[16]。除此之外,還有很多l(xiāng)ncRNA也在肝癌組織中異常表達(dá)(表3)[17-21],如MALAT1、HOTAⅠR、MVⅠH、HEⅠH、HULC等,它們與肝癌的發(fā)生發(fā)展、轉(zhuǎn)歸及預(yù)后都密不可分。

        表3 相關(guān)lncRNA在肝癌中的作用

        2.3 胃癌

        胃癌亦是中國(guó)高發(fā)惡性腫瘤之一,了解能夠調(diào)節(jié)胃癌發(fā)生發(fā)展的lncRNA對(duì)胃癌的治療有很大幫助。研究顯示,大多表達(dá)異常的lncRNA都是上調(diào)的,如CCAT1、HULC、H19和lncRNABC002811等[22]。新的研究結(jié)果表明,lncRNA RP11-513G11.1在胃癌患者體內(nèi)高表達(dá),它不但與胃癌患者的TNM分期、轉(zhuǎn)移密切相關(guān),還是患者預(yù)后的獨(dú)立影響因素[23]。HOTAⅠR是HOX基因簇的表達(dá)產(chǎn)物,能與PRC2相結(jié)合,共同招募復(fù)合體,調(diào)節(jié)染色質(zhì)的結(jié)構(gòu)狀態(tài),進(jìn)而影響腫瘤組織的表觀遺傳狀態(tài)。它能在包括胃癌的多種腫瘤組織中過(guò)表達(dá),同時(shí)還與胃癌的TNM分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移等密切相關(guān),即HOTAⅠR能促進(jìn)胃癌細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)移[24]。而MEG3、AC096655.1-002等lncRNA在腫瘤中的表達(dá)量明顯下降,它們有抑制腫瘤細(xì)胞增殖轉(zhuǎn)移,促進(jìn)細(xì)胞凋亡的作用。與HOTAⅠR一樣,F(xiàn)ENDRR是另一個(gè)可以與PRC2相結(jié)合的lncRNA,它在胃癌組織中的表達(dá)下調(diào),能夠促使腫瘤細(xì)胞轉(zhuǎn)移,與胃癌患者的不良預(yù)后相關(guān)[25]。此外,研究發(fā)現(xiàn)PVT-1在順鉑耐藥胃癌患者體內(nèi)高表達(dá),與腫瘤耐藥相關(guān)[26]。現(xiàn)將相關(guān)lncRNA在胃癌中的作用總結(jié)如下(表4)[22,25-27]。

        2.4 乳腺癌

        乳腺癌發(fā)病率一直呈上升趨勢(shì),中國(guó)每年約有21萬(wàn)新發(fā)病例,居女性惡性腫瘤第一位[28]。同樣在乳腺癌中異常表達(dá)的lncRNA也有很多,如HOTAⅠR、LOC554202、LSⅠNCT5等。無(wú)論是原發(fā)性還是轉(zhuǎn)移性乳腺癌,HOTAⅠR的表達(dá)均上調(diào),它具有促進(jìn)細(xì)胞增殖,抑制細(xì)胞凋亡的作用,與乳腺癌的轉(zhuǎn)移和病死率呈正相關(guān)[29]。最新研究結(jié)果顯示,雌激素能夠通過(guò)G蛋白偶聯(lián)雌激素受體(G protein-coupled estrogen receptor,GPER)抑制miRNA-148a,提高HOTAⅠR的表達(dá)量,從而促進(jìn)乳腺癌的轉(zhuǎn)移[30]。為提高乳腺癌的治愈率,研究人員進(jìn)行了大量的研究。ⅠRAⅠN就是新發(fā)現(xiàn)的一種lncRNA,研究顯示其在人乳腺組織中呈單等位基因不均衡表達(dá)(即一些基因存在優(yōu)先表達(dá)出一個(gè)等位基因的現(xiàn)象),可作為抑癌基因,調(diào)控腫瘤細(xì)胞的成長(zhǎng)[31]。lncRNA-ROR是乳腺癌的分子標(biāo)志物,與癌旁組織相比,其表達(dá)量高,受雌激素、孕激素影響,與腫瘤的臨床癥狀及轉(zhuǎn)移相關(guān)[32]。另外,有研究顯示,在乳腺癌患者的尿液中H19的表達(dá)量增加,因此尿液H19或許可作為乳腺癌篩查的一個(gè)潛在的無(wú)創(chuàng)性生物標(biāo)志物[34]?,F(xiàn)將相關(guān)lncRNA在乳腺癌中的作用總結(jié)如下(表5)[26-27,29-34]。

        表4 相關(guān)lncRNA在胃癌中的作用

        表5 相關(guān)lncRNA在乳腺癌中的作用

        3 小結(jié)與展望

        lncRNA在腫瘤的發(fā)生發(fā)展中起著至關(guān)重要的作用。同一種lncRNA可以在多種不同的腫瘤組織中異常表達(dá),同一種腫瘤組織中也會(huì)有多種lncRNA的異常表達(dá)。雖然大多數(shù)lncRNA的表達(dá)上調(diào),但表達(dá)下調(diào)的lncRNA也不在少數(shù)。總之,要想攻克癌癥難題,研究lncRNA無(wú)疑是一個(gè)很好的切入點(diǎn)。然而,對(duì)lncRNA的研究目前仍處于起步階段,有很多的lncRNA未被發(fā)現(xiàn),已被確認(rèn)的lncRNA還有假陽(yáng)性的存在,大部分被鑒定出的lncRNA功能還未知,這已經(jīng)成為進(jìn)一步研究lncRNA的阻礙[1]。所以利用不斷發(fā)展的分子生物學(xué)技術(shù)發(fā)現(xiàn)和研究lncRNA無(wú)疑是一個(gè)熱點(diǎn)。本文對(duì)lncRNA在腫瘤中的研究進(jìn)展作一總結(jié),希望能對(duì)日后的研究有所幫助。

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