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        蚓激酶基因在畢赤酵母中的表達及其發(fā)酵條件優(yōu)化

        2018-11-14 02:59:58江鵬湯斌
        食品與發(fā)酵工業(yè) 2018年10期
        關鍵詞:優(yōu)化

        江鵬,湯斌

        1(安徽工程大學 生物與化學工程學院,安徽 蕪湖,241000) 2(微生物發(fā)酵安徽省工程研究中心,安徽 蕪湖,241000)

        蚓激酶(Lumbrokinase,LK)是從蚯蚓體內發(fā)現(xiàn)的一組同時具有纖溶活性和激酶活性的絲氨酸蛋白酶[1]。該酶能夠刺激纖溶酶原轉變成纖溶酶,從而催化纖維蛋白,起到溶血栓作用[2]。臨床試驗表明,蚓激酶還可用于預防和治療冠心病、腦梗塞、肺心病和下肢深靜脈血栓等疾病[3-4]。該酶穩(wěn)定性良好,酶制劑既能口服,亦可注射,已得到廣泛應用[5-6]。目前,市售蚓激酶主要來源于蚯蚓粉末的提取純化,此法所得產品純度較低且產量少。因此,通過異源表達生產高純度的蚓激酶已成為未來蚓激酶工業(yè)化生產的趨勢[7]。

        近年來,研究者已從不同種類蚯蚓中克隆得到蚓激酶編碼基因,并在大腸桿菌中進行表達,但目的蛋白多以包涵體形式存在,因而沒有纖溶活性[8-11]。相較于原核表達系統(tǒng),畢赤酵母表達系統(tǒng)具有胞外分泌且易于純化目的蛋白的優(yōu)勢[12-14]。趙明明[15]等首次在畢赤酵母中成功表達了蚓激酶F238基因,酶活最高為100 U/mL。隨后,宋馨宇[16]等人通過G418抗性梯度篩選獲得1株耐高抗性的GS115-pPIC9K-F238菌株,搖瓶培養(yǎng)84 h后達蚓激酶酶活峰值257.6 U/mL。然而,目前蚓激酶在畢赤酵母中表達研究的報道較少,且表達量較低,遠不能應用于工業(yè)化生產[15-16]。

        為了提高蚓激酶在畢赤酵母表達系統(tǒng)中的產量,本文從重組菌誘導表達條件出發(fā),優(yōu)化初始菌體量、pH和溫度,并研究氨基酸對蚓激酶在酵母中表達的影響,最終通過高密度發(fā)酵手段實現(xiàn)蚓激酶基因在畢赤酵母中的大量表達,為今后蚓激酶的工業(yè)化生產提供理論參考。

        1 材料與方法

        1.1 材料與試劑

        蚯蚓樣本:獲自校園土壤中,經本實驗室分子生物學鑒定為赤子愛勝蚓。本文所用E.coliJM109、畢赤酵母GS115、pPIC9K質粒均為安徽工程大學微生物發(fā)酵研究中心保藏菌種,pMD18-T載體購自上海Sangon公司。Trizol試劑、尿激酶、購自上海Sangon公司,牛血纖維蛋白原、凝血酶購自Sigma公司,其他試劑購自國藥。

        1.2 蚓激酶基因的克隆及表達

        利用Trizol法提取赤子愛勝蚓總RNA,試劑盒法反轉錄合成cDNA。通過GenBank數(shù)據(jù)庫搜索蚓激酶編碼序列,經比對分析設計引物對Primer 1-F+Primer 1-R。以cDNA為模板克隆目的基因,并將其連接pMD18-T載體,送上海生工測序。根據(jù)測序結果設計引物對Primer 2-F+Primer 2-R。PCR產物和質粒同時用EcoRⅠ和NotⅠ雙酶切,連接后轉化E.coliJM109,篩選得到重組質粒pPIC9K-lks2送上海生工測序。引物見表1。利用SacI酶對該重組質粒進行線性化,電轉化畢赤酵母GS115感受態(tài)細胞,利用MD平板進行篩選,并提取轉化子基因組DNA,進行PCR驗證。挑取MD平板上的酵母單菌落接種于YPD培養(yǎng)基中,30 ℃,220 r/min培養(yǎng)18 h。按1%量接種于30 mL BMGY培養(yǎng)基中,30 ℃,220 r/min培養(yǎng)至OD600值為2~6,離心去上清收集菌體,將菌體重懸于 30 mL BMMY 培養(yǎng)基中,30 ℃,220 r/min振蕩培養(yǎng),每隔24 h加體積分數(shù)0.5%甲醇進行誘導表達。

        表1 本研究所用引物Table 1 Primers used in this study

        注:下劃線為酶切位點。

        1.3 蚓激酶活力測定方法

        本文采用國標法[17](纖維蛋白平板法)測定蚓激酶活力:制備纖維蛋白平板,將梯度濃度的尿激酶標準品點樣于纖維蛋白平板上,放置10 min后移入37 ℃培養(yǎng)箱,保溫18 h取出測量溶圈垂直的2個直徑,并計算2個直徑的乘積,重復測定3次,求平均值。以測定不同濃度的溶圈垂直直徑乘積(A)的對數(shù)為縱坐標,標準品尿激酶濃度(C)的對數(shù)為橫坐標繪制標準曲線。線性回歸方程為:lnA=0.864lnC+2.047 7,R2=0.969 8。

        1.4 蚓激酶畢赤酵母重組菌的發(fā)酵條件優(yōu)化

        基礎誘導培養(yǎng)基為BMMY,誘導溫度30℃,裝液量30%,搖床轉速220 r/min,甲醇添加量體積分數(shù)為0.5%。誘導初始菌體量優(yōu)化:初始OD600分別為0.5、1、1.5、2和2.5,取發(fā)酵液上清以纖維平板法測纖溶活力。誘導pH值的優(yōu)化:在上述優(yōu)化基礎上,調整初始pH值分別為4.5、5、5.5、6、6.5和7,以纖溶活力確定最佳pH值。誘導溫度的優(yōu)化:上述優(yōu)化基礎上,設置初始溫度分別為26、28、30、32、34 ℃,同樣根據(jù)纖溶活力確定最佳誘導溫度。

        氨基酸對重組菌產酶的影響:在BMMY培養(yǎng)基中分別添加體積分數(shù)為0.1%的不同種類氨基酸,對照組不加氨基酸,誘導84 h后取樣檢測酶活力。

        1.5 重組畢赤酵母發(fā)酵罐放大培養(yǎng)

        1.5.1 種子培養(yǎng)

        一級種子液:挑取MD平板上的重組菌,接于10 mL YPD中,30 ℃,220 r/min培養(yǎng)18 h,OD600值為12左右。

        二級種子液:按1%的接種量取一級種子液接于350 mL BMGY中,30 ℃,220 r/min培養(yǎng)至OD600值為6~7。

        1.5.2 發(fā)酵過程控制

        10 L發(fā)酵罐裝液量6.5 L,培養(yǎng)基為BSM培養(yǎng)基,添加體積分數(shù)為0.1%的絲氨酸,PTM1添加量為4 mL/L培養(yǎng)基,通過氨水調節(jié)pH 5.0。將二級種子液接入發(fā)酵罐中,根據(jù)畢赤酵母表達手冊進行菌體的前期培養(yǎng),控制DO為40%,發(fā)酵pH值為5.0,培養(yǎng)溫度30 ℃,通氣量為0.5 vvm,罐壓0.08 MPa。待菌體濕重達到200 g/L左右后,停止流加甘油。溶氧上升后,饑餓培養(yǎng)0.5 h,開始甲醇誘導。誘導過程嚴格控制甲醇流加速率使DO在40%小幅波動,氨水調節(jié)pH值控制在5.5,誘導溫度28 ℃,通氣量為0.6 vvm,罐壓控制在0.08 MPa。

        1.5.3 菌體初始濃度優(yōu)化

        將450 mL二級種子液離心,去上清,用100 mL BMMY培養(yǎng)基洗勻菌體,全部接入發(fā)酵罐中,取發(fā)酵液離心測得菌體濕重為3±0.5 g/L,以此為基準,通過控制加入的二級種子液的量來使得接種后發(fā)酵罐中菌體初始質量濃度分別為3±0.5、6±0.5、9±0.5和12±0.5 g/L,培養(yǎng)條件均一致。發(fā)酵過程每隔12 h取樣,測菌體濕重和蚓激酶活力。

        2 結果與分析

        2.1 蚓激酶基因的克隆及分析

        目前在GenBank數(shù)據(jù)庫中已公布的蚓激酶編碼序列共有19條,其中F238基因[17-19](GeneBank No. DQ202401)的相關研究最多。本文從赤子愛勝蚓中擴增得到蚓激酶基因lks2,全長738 bp,編碼246個氨基酸(圖1-A)。比對結果顯示,lks2與F238基因同源性為99.59%,其中第136、175和398位堿基不同,導致編碼的46和59位氨基酸發(fā)生差異(圖2)。

        圖1 蚓激酶基因克隆(A)、表達載體雙酶切(B)和重組菌基因組PCR(C)Fig.1 Lumbrukinase gene cloning (A), expression vectordouble enzyme cutting (B) and recombinant bacterialgenome PCR (C)

        圖2 lks2基因與F238基因的差異Fig.2 The difference between lks2 gene and F238 gene

        2.2 蚓激酶基因在畢赤酵母中的表達

        將lks2與pPIC9k質粒相連接,雙酶切驗證結果顯示表達載體pPIC9K-lks2構建成功(圖1-B)。將該表達載體電轉化畢赤酵母,獲得重組菌GS115-pPIC9K-lks2,經轉化子基因組DNA的PCR驗證結果顯示構建成功(圖1-C)。將該重組菌進行搖瓶發(fā)酵試驗,取不同誘導時間的發(fā)酵上清適當稀釋,點樣于纖維蛋白平板。結果顯示,重組畢赤酵母的蚓激酶酶活在84 h達到峰值254.4 U/mL(圖3)。

        圖3 重組菌纖溶活力測定Fig.3 Fibrinolytic activity of GS115-pPIC9K-lks2

        2.3 重組菌GS115-pPIC9K-lks2的發(fā)酵條件優(yōu)化

        2.3.1 誘導初始培養(yǎng)條件優(yōu)化

        畢赤酵母甲醇誘導過程中需要消耗大量的氧,當菌體濃度較低時培養(yǎng)基成分和供氧量充足,但隨著菌體量的增加使得培養(yǎng)基中溶氧降低,從而影響菌體代謝,因此接種量對重組菌產酶影響較大。通過調整初始OD600值來研究初始菌體量對重組菌GS115-pPIC9K-lks2的影響,不同接種量的產酶變化趨勢基本一致,達到最高酶活時間點均是誘導84 h。當OD600=1.5時,蚓激酶酶活最高,峰值為288 U/mL(圖4-A)。在此基礎上優(yōu)化誘導pH值和溫度,結果如圖4-B,C所示,最佳誘導初始pH值為5.5,最適誘導溫度為28 ℃,此條件下蚓激酶酶活峰值達364.4 U/mL。

        2.3.2 氨基酸添加對重組菌產酶的影響

        氨基酸是構成蛋白質的基本組成,通過添加氨基酸可在一定程度上加快目的蛋白的合成。本文在BMMY培養(yǎng)基中添加各類氨基酸,研究不同氨基酸對重組菌的產酶影響。結果如圖5所示,絲氨酸、甘氨酸和異亮氨酸的添加對重組菌產酶有促進作用,其中以絲氨酸效果最佳。添加0.1%絲氨酸后,蚓激酶酶活達到397.6 U/mL。這可能是絲氨酸在菌體代謝過程中影響了重組菌合成蛋白的能力,對外源基因表達過程起到一定的調控作用。

        圖4 重組畢赤酵母GS115-pPIC9K-lks2的發(fā)酵條件優(yōu)化Fig.4 Optimization of fermentation conditions for the GS115-pPIC9K-lks2

        2.4 重組菌發(fā)酵罐放大培養(yǎng)

        在搖瓶優(yōu)化基礎上,利用10 L發(fā)酵罐對重組菌GS115-pPIC9K-lks2進行放大培養(yǎng)及高密度發(fā)酵條件研究。種子液濃度為OD600=6時進行上罐發(fā)酵,此時菌體處于對數(shù)生長期,代謝能力強,有利于擴大培養(yǎng)。由于初始菌體量對畢赤酵母蚓激酶的高效表達具有重要影響,本文對發(fā)酵罐初始菌體接種量進行了比較研究。結果如圖6-A所示,初始菌體量的增加有利于提高菌體生長速率,達到在相同時間內迅速增加菌體密度的目標。隨著菌體密度增加,蚓激酶活力迅速上升,最佳接種菌濃度為9±0.5 g/L(圖6-B)。此外,初始接種量的增加可顯著縮短發(fā)酵周期。當菌體初始濃度為9±0.5 g/L時,誘導前期培養(yǎng)時間較優(yōu)化前(3±0.5 g/L)縮短了11.5 h,蚓激酶酶活提高了1.08倍(3±0.5 g/L,蚓激酶酶活為527.8 U/mL),達到1 098.2 U/mL。

        圖5 不同氨基酸對產酶影響Fig.5 Different amino acid effect on enzyme production

        圖6 發(fā)酵罐放大培養(yǎng)Fig.6 Fermentation tank amplification culture

        3 討論

        蚓激酶屬于絲氨酸蛋白酶,其編碼基因已經成功在細菌、真菌和動植物中實現(xiàn)表達。本文研究了蚓激酶在畢赤酵母中的異源表達,并通過誘導條件優(yōu)化及高密度發(fā)酵研究,有效提高了蚓激酶的產量并縮短了發(fā)酵周期,突破了目前畢赤酵母蚓激酶表達量低的瓶頸,具有重要的工業(yè)應用價值。

        本研究通過對重組菌GS115-pPIC9K-lks2的誘導條件優(yōu)化,發(fā)現(xiàn)誘導初始菌體密度對產酶效果影響較大。菌體密度過低,會導致菌體生長環(huán)境中相對甲醇量偏高,從而產生毒性影響菌體正常代謝。甲醇誘導畢赤酵母產酶過程需要消耗大量的氧氣,因此菌體密度過高會導致溶氧不足,造成菌體無法有效利用碳源維持自身生存,同樣影響產酶能力。因而,確定最佳誘導初始菌體密度對蚓激酶在畢赤酵母中的表達十分關鍵。本文在搖瓶培養(yǎng)和發(fā)酵罐擴大培養(yǎng)過程中完成了最佳初始菌體量的優(yōu)化,從而顯著提升了蚓激酶的產量,為其大規(guī)模生產提供了方向。

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