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        1 株產(chǎn)單寧酶嗜熱真菌的鑒定、酶學性質分析及碳水化合物活性酶表達

        2018-10-08 02:50:10谷新晰盧海強劉亞娟陳賽娟谷子林孟祥晨陳寶江
        食品科學 2018年18期
        關鍵詞:產(chǎn)酶單寧活力

        谷新晰,盧海強,劉亞娟,陳賽娟,谷子林,孟祥晨,陳寶江,*

        (1.河北農業(yè)大學食品科技學院,河北 保定 071000;2.東北農業(yè)大學 乳品科學教育部重點實驗室,黑龍江 哈爾濱 150030;3.河北農業(yè)大學山區(qū)研究所,河北 保定 071000;4.河北農業(yè)大學動物科技學院,河北 保定 071000)

        單寧酶(EC 3.1.1.20)是一類降解單寧中酯鍵和縮酚酸鍵的水解酶,廣泛分布在植物和微生物中[1-2]。其底物單寧作為一種天然大分子物質存在于植物的莖、根和果實當中。因作為食品加工原料的果實含有單寧,往往具有苦澀味,這使得柿子、刺梨等高含量單寧水果生產(chǎn)加工時需要進行脫澀處理[3-4]。采用乙醇脫澀、乙烯脫澀及加熱脫澀等傳統(tǒng)方法進行脫澀處理,達到了一定的效果,但是產(chǎn)品在加工處理過程中會出現(xiàn)返澀現(xiàn)象[5-6]。利用單寧酶脫澀法不僅可以避免上述現(xiàn)象的發(fā)生,同時還可以提高產(chǎn)品的穩(wěn)定性[7-9]。單寧酶較高的價格限制了其在食品領域應用的范圍,豐富單寧酶資源具有較強的現(xiàn)實意義。

        嗜熱真菌是一類能夠在45 ℃以上正常生長,而在19 ℃以下無法生長的真核微生物[10]。嗜熱真菌所分泌酶類大部分為嗜熱酶[11],因其具有較高的催化反應溫度及良好的穩(wěn)定性能,在食品、醫(yī)藥及化工等領域方面應用前景廣闊[12-13]。目前,嗜熱真菌來源的單寧酶研究鮮有報道。碳水化合物活性酶(carbohydrate-active enzymes,CAZymes)是一類降碳解水化合物酶類的總稱[14],大多數(shù)食品原料含有淀粉、纖維素、果膠類等物質,這使得降解這些物質酶在食品工業(yè)中發(fā)揮著越來越重要的作用。因此,CAZymes酶譜分析是對菌株應用潛力的重要指標,傳統(tǒng)的酶譜分析策略無法全面對菌株酶譜分析。隨著現(xiàn)代轉錄組學技術的不斷發(fā)展,利用轉錄組學測序技術開展菌株產(chǎn)酶譜的研究成為新的策略。

        本課題組前期從大曲中分離、篩選獲得1 株產(chǎn)單寧酶的嗜熱真菌HBHF5,本研究旨在對菌株HBHF5進行鑒定及酶學特性的相關研究;利用轉錄組測序技術對該菌株糖苷水解酶譜進行分析,掌握菌株的產(chǎn)酶性能,為尋找新型單寧酶及其他食品酶的開發(fā)提供理論指導。

        1 材料與方法

        1.1 材料與試劑

        菌株HBHF5篩選自河北保定劉伶醉釀酒股份有限公司大曲粉,并保存于本實驗室。

        牛肉膏、蛋白胨等均為國產(chǎn)分析純;Trizol、氯仿-異戊醇(24∶1,V/V) 北京索萊寶科技有限公司;單寧酸 美國Sigma公司;真菌DNA提取試劑盒、聚合酶鏈式反應(polymerase chain reaction,PCR)相關試劑北京全式金生物技術有限公司。

        基礎鹽溶液:NH4NO311 g,MgSO4·7H2O 1 g,NaCl 0.1 g,溶于100 mL水,用于固態(tài)發(fā)酵培養(yǎng)基和液態(tài)發(fā)酵培養(yǎng)基的制備。固態(tài)發(fā)酵培養(yǎng)基:麩皮5 g,單寧酸10 mg,基礎鹽溶液5 mL,放置于250 mL錐形瓶中,混勻,自然pH值,121 ℃滅菌20 min。液態(tài)發(fā)酵培養(yǎng)基:麩皮1.5 g,單寧酸150 mg,基礎鹽溶液150 mL,放置于250 mL錐形瓶中,混勻,自然pH值,121 ℃滅菌20 min。

        1.2 儀器與設備

        CX31光學顯微鏡 日本Colmpus公司;GL-2M離心機上海市離心機械研究所;ABI 9700 PCR儀 美國Applied Biosystems公司;凝膠成像儀分析系統(tǒng) 美國Bio-Rad公司;立式高速低溫離心機 日本Hitachi公司。

        1.3 方法

        1.3.1 菌株的鑒定

        1.3.1.1 菌落形態(tài)特征觀察

        將菌株HBHF5點植在PDA平板中,45 ℃倒置培養(yǎng),觀察并記錄菌落形狀、大小、生長速率、是否產(chǎn)色素等,對照真菌鑒定手冊[15],初步確定菌株的種屬地位。

        1.3.1.2 ITS序列分子鑒定

        菌株HBHF5基因組DNA提取采用CTAB法;ITS序列PCR擴增參數(shù)及體系參照文獻[16]進行,純化后的PCR擴增產(chǎn)物由華大基因科技服務有限公司進行測序;將獲得的測序結果提交NCBI數(shù)據(jù)庫(http://www.ncbi.nlm.gov/blast/)進行BLAST同源性分析,采用MEGA 5.0軟件構建系統(tǒng)進化樹并分析。

        1.3.2 生長曲線的測定

        采用菌體干重法測定菌株生長曲線。菌株孢子懸浮液接種于50 mL PDB培養(yǎng)基中,45 ℃搖床培養(yǎng),分別在12、24、36、48、60 h和72 h取樣,過濾獲得菌絲體,在105 ℃條件下烘干至質量恒定,測定菌體質量,繪制菌株的生長曲線。

        1.3.3 單寧酶活力的測定

        粗酶液的制備:菌株HBHF5種子接種于液體發(fā)酵培養(yǎng)基,在45 ℃條件下?lián)u床培養(yǎng)72 h后,發(fā)酵液離心處理(12 000 r/min,10 min),收集上清液,即為粗酶液,4 ℃?zhèn)溆谩?/p>

        單寧酶活力測定參考Sharma等[17]方法。取100 μL適當稀釋酶液與400 μL沒食子酸丙酯溶液(1.25 mmol/L,pH 5.0)混勻,60 ℃反應10 min后,加入300 μL羅丹寧終止反應,并加入200 μL KOH(0.5 mmol/L)溶液進行顯色,在520 nm波長處測定其吸光度,并計算酶活力。以每分鐘水解沒食子酸丙酯底物產(chǎn)成1 μmol沒食子酸所需酶量定義為1 個酶活力單位(U)。

        1.3.4 固態(tài)培養(yǎng)和液態(tài)培養(yǎng)對菌株HBHF5產(chǎn)酶的影響

        將菌株HBHF5種子接種于液體或固態(tài)產(chǎn)酶培養(yǎng)基中,45 ℃誘導培養(yǎng)4 d后收集液體發(fā)酵培養(yǎng)液,離心處理收獲上清液為樣品1(SSF1),菌體進行超聲波破碎為樣品2(SSF2);固態(tài)發(fā)酵浸出液為樣品3(SmF1),固態(tài)發(fā)酵菌體超聲波破碎液為樣品4(SmF2),分別對4 種樣品進行單寧酶活力的測定,探究該菌單寧酶的在固液兩種培養(yǎng)方式對產(chǎn)酶的影響。

        1.3.5 酶學性質分析

        1.3.5.1 最適反應pH值的測定

        將酶液在不同pH值(2、3、4、5、6、7、8、9)條件下與底物反應,按照1.3.3節(jié)方法測定酶活力,以最高酶活力為100%,測定酶最適反應pH值。

        1.3.5.2 最適反應溫度的測定

        在最適pH值條件下,將酶液在不同溫度(20、30、40、50、60、70、80 ℃)與底物進行反應,按照標準方法測定酶活力,以最高酶活力為100%,測定酶最適反應溫度。

        1.3.5.3 熱穩(wěn)定性的測定

        在最適pH值條件下,將酶液分別在50、60 ℃和70 ℃處理不同時間(0、2、5、10、20、30 min和60 min),以最高酶活力為100%,測定剩余酶活力,研究單寧酶的熱穩(wěn)定性。

        1.3.5.4 金屬離子對酶活力的影響

        通過在酶反應體系中加入終濃度為1、5 mmol/L的金屬離子(Cu2+、Fe3+、Mn2+、Ca2+、Mg2+、Li+、K+、Na+和Zn2+)研究其對酶活力的影響。以未經(jīng)過添加任何金屬離子的反應為對照組,按照標準酶活力測定方法測定其剩余酶活力。

        1.3.6 CAZymes基因表達分析

        菌株HBHF5接入液態(tài)誘導培養(yǎng)基中,45 ℃誘導培養(yǎng)72 h后離心收集菌體。采用Trizol方法提取總RNA,并使用Agilent 2100 Bioanalyzer和Agilent RNA 6000 Nano Kit對RNA濃度與完整性進行測定分析,純度采用凱奧K5500微量分光光度計來測定。取3 μg總RNA樣品,利用Ribo-Zero-magnetic-kit對樣品mRNA進行富集,通過Fragmentation buffer試劑對mRNA進行片段化處理,并以此為模板構建表達文庫。

        采用HiseqTM2500測序平臺進行雙端測序,獲得100 bp左右測序reads。對獲得的原始測序序列進行分析,去除只含有接頭或過短的序列數(shù)據(jù)。利用軟件TOPHAT(v2.0.6)將預處理后的數(shù)據(jù)與參考Ensembl真菌數(shù)據(jù)庫Aspergillus fumigatus.CADRE.33基因組序列進行比對獲得基因的注釋信息。依據(jù)CAZymes數(shù)據(jù)庫(http://www.cazy.org/)分類標準,對測序數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析。

        1.4 數(shù)據(jù)處理

        每組實驗均設3 次重復,取平均值,運用Microsoft Excel 2010和SPSS 19.0數(shù)據(jù)處理軟件對試驗數(shù)據(jù)結果進行處理和方差分析。

        2 結果與分析

        2.1 菌株鑒定

        圖1 HBHF5菌株菌落特征(A)及系統(tǒng)發(fā)育樹(B)Fig. 1 Cultural characteristics (A) and phylogenetic tree (B) of strain HBHF5

        如圖1A所示,菌株HBHF5在45 ℃條件下生長旺盛,培養(yǎng)3 d菌落即可鋪滿整個平皿,在 PDA平板中的菌落緊密,表面粗糙,菌落中心突起,邊緣為輻射狀褶痕;菌株生長初期時,菌落顏色為白色,隨后菌落逐漸成為藍綠色,在生長后期,菌落顏色為淺灰色,呈粉末狀。分生孢子頭頂囊呈燒瓶狀,分生孢子梗單層,成木柵狀排列狀布滿頂囊,孢子成球形,綠色。

        如圖1B所示,菌株HBHF5 ITS序列經(jīng)BLAST比對分析,菌株HBHF5與煙曲霉(Aspergillus fumigatus AF293)一致性為99%,且在進化樹中位于同一個分支中,即具有較近的親緣關系。

        綜上所述,菌株HBHF5經(jīng)形態(tài)觀察和分子鑒定結果,該菌屬于曲霉屬,煙曲霉種,最終命名為煙曲霉HBHF5(A. fumigatus HBHF5)。

        2.2 菌株生長曲線的測定

        圖2 HBHF5菌株生長曲線Fig. 2 Growth curve of strain HBHF5

        A. fumigatus HBHF5生長變化情況如圖2所示,該菌以體積分數(shù)1%接菌培養(yǎng)時延滯期時間為12 h,菌株培養(yǎng)24 h后進入對數(shù)生長期,大約持續(xù)生長36 h,即在培養(yǎng)60 h后達到生長穩(wěn)定期。同時通過對單寧酶活力測定分析,發(fā)現(xiàn)該菌在對數(shù)培養(yǎng)時期即開始進行產(chǎn)酶,隨著菌株自身的生長,產(chǎn)酶量也隨之增加,直至對數(shù)生長周期,單寧酶產(chǎn)酶量達到最大值,其酶活力為136 U/mL。以上結果表明A. fumigatus HBHF5菌株在45 ℃條件下生長迅速,能夠短周期發(fā)酵生產(chǎn)即可獲得單寧酶產(chǎn)物。

        2.3 菌株產(chǎn)酶特性及酶學性質分析

        通過對比分析研究固態(tài)和液態(tài)發(fā)酵方式下A. fumigatus HBHF5產(chǎn)單寧酶差異,發(fā)現(xiàn)培養(yǎng)方式對該菌的產(chǎn)酶影響較大。A. fumigatus HBHF5在固態(tài)培養(yǎng)條件下幾乎不合成單寧酶,而在液態(tài)發(fā)酵培養(yǎng)時可產(chǎn)生大量的單寧酶,且以胞外分泌形式為主(94%)(圖3)。這與已報道大多數(shù)生產(chǎn)單寧酶菌株的產(chǎn)酶方式不同,該特性使得A. fumigatus HBHF5可以采用液態(tài)深層發(fā)酵方式生產(chǎn)單寧酶。

        圖3 培養(yǎng)方式對A. fumigatus HBHF5產(chǎn)單寧酶的影響Fig. 3 Effect of culture systems on tannase production of strain HBHF5

        經(jīng)測定,該單寧酶在pH值為6.0時,酶活力最高。在pH 5.0~9.0范圍內,能夠維持60%以上的酶活力(圖4A),具有一定的pH值適應性,能夠滿足多種原料加工生產(chǎn)中的需求。該單寧酶最適反應溫度為60 ℃,在70 ℃時依然具有50%以上的酶活力,在20 ℃反應時,該單寧酶能維持大約57%的酶活力(圖4B),該酶屬于嗜熱酶。

        在酶熱穩(wěn)定性的研究中發(fā)現(xiàn),該單寧酶在50 ℃熱處理1 h,其剩余酶活力基本未發(fā)生改變;60 ℃處理60 min,相對酶活力在80%以上;當該酶在70 ℃處理30 min,能夠保持80%的酶活力,且在處理60 min后,依然能夠維持大約50%的酶活力,以上結果充分表明HBHF5菌株所產(chǎn)單寧酶具有極好的熱穩(wěn)定性(圖4C),該性能能夠保證該單寧酶在生產(chǎn)及貯存過程中保持較強活力,有利于酶制劑產(chǎn)品品質的穩(wěn)定。

        在低離子濃度(1 mmol/L)存在的條件下,除 K+、Li+和Na+未對酶活力造成抑制之外,金屬離子Cu2+對酶活力抑制最為明顯,其次是Zn2+對酶活性的抑制明顯(94%),其他活性抑制率結果為:Fe3+(69%),Mn2+(61%)和Mg2+(22%)。以上的金屬離子在高離子濃度(5 mmol/L)下,對酶的抑制率不同程度增高,其中以Fe3+和Na+變化最為顯著,其抑制率分別為88%和31%(圖4D)。

        圖4 A. fumigatus HBHF5的單寧酶酶學性質分析Fig. 4 Characterization of tannase from strain HBHF5

        2.4 菌株CAZymes基因表達分析

        圖5 A. fumigatus HBHF5碳水化合物活性酶基因表達分析Fig. 5 Distribution of CAZymes gene expression in A. fumigatus HBHF5

        通過對菌株HBHF5的轉錄組測序分析,共獲得該菌的23 927 186 條reads,數(shù)據(jù)量為3 589 077 900 bp,GC含量為53.41%,Q20值為98.12%,Q30值為95.10%,Percentage值為92.73%。通過對比對到參照基因組(Aspergillus fumigatus.CADRE.33)上的reads分布統(tǒng)計發(fā)現(xiàn),reads分布在Exon區(qū)域值最高為87.98%,其次是定位在Integenic區(qū)域(11.8%),只有0.22%的reads定位在Intron區(qū)域,以上數(shù)據(jù)說明測序結果符合要求,可以進行后續(xù)分析。

        菌株所產(chǎn)酶的種類決定著其在酶制劑開發(fā)中的潛力的大小,經(jīng)對A. fumigatus HBHF5的轉錄組分析,當該菌以麩皮作為唯一碳源時,共有2 151 個酶基因表達,其中氧化還原酶579 個、轉移酶644 個、水解酶522 個、裂合酶167 個、異構酶71 個和合成酶168 個,水解酶類數(shù)量大約占總酶的24%左右。

        CAZymes是一類具有降解、修飾及生成糖苷鍵的功能酶類的總稱,由糖酯酶類(carbohydrate esterase,CEs)、糖苷水解酶類(glycoside hydrolase,GHs)、糖基轉移酶類(glycosyl transferase,GTs)和多糖裂解酶類(polysaccharide lyase,PLs)組成[18]。以麩皮為碳源時,菌株HBHF5中CAZymes基因表達結果如圖5所示。經(jīng)分析,CEs有12 個基因表達,GHs共有56 個基因表達,PLs共有2個基因表達,其中GHs表達最為豐富,約占CAZymes酶類表達總數(shù)的70%(167 個基因),約占總GHs家族的14.5%(21種),其主要種類如下:聚半乳糖醛酸酶、幾丁質酶、半乳糖苷酶、甘露糖苷酶、葡萄糖淀粉酶、纖維素酶、淀粉酶、木聚糖酶、甘露聚糖酶、海藻糖酶等。

        以上結果表明,菌株A. fumigatus HBHF5酶系較豐富,是1 株優(yōu)良的產(chǎn)酶菌株。

        3 討 論

        大曲中的微生物種類豐富,是一類亟待挖掘的我國特有微生物資源[19]。到目前為止,已從大曲中獲得了產(chǎn)嗜熱淀粉酶和半乳糖苷酶的芽孢桿菌[20],產(chǎn)糖化酶的棒曲霉和黑曲霉[21-22]及產(chǎn)酯酶的少根根霉等[23],而從大曲中獲得產(chǎn)單寧酶的嗜熱真菌鮮有報道。Penicillium sp.、Aspergillus sp.、Polyporus sp.和Trametes sp.等屬均篩選獲得了產(chǎn)單寧酶的真菌[24],而Aspergillus sp.來源的微生物是最具有商業(yè)開發(fā)價值的單寧酶生產(chǎn)菌種屬。本課題組前期從濃香大曲中篩選獲得了1 株產(chǎn)單寧酶的嗜熱真菌,經(jīng)鑒定該菌屬于煙曲霉種,命名為A. fumigatus HBHF5,該菌株在高溫培養(yǎng)時生長良好。

        大多數(shù)單寧酶最適反應溫度范圍在30~40 ℃之間,如A. niger N5-5單寧酶的最適溫度為45 ℃[25],而A. fumigatus HBHF5所產(chǎn)單寧酶最適反應溫度為60 ℃左右,在70 ℃時依然具有50%以上的酶活力,屬于嗜熱酶,且該酶在50 ℃條件下酶活性穩(wěn)定,這有利于該酶制劑的貯存加工。通過9 種金屬離子對單寧酶活力的影響研究結果,幾乎未發(fā)現(xiàn)有激活酶活性的金屬離子,有6 種金屬離子對該酶的活性有不同程度的抑制,這與Rajakumar等[26]的研究結果相似,卻與Sena等[27]的研究存在一定的差異,這可能是由于不同來源的單寧酶性質存在一定的差異所致。

        目前,生產(chǎn)所用菌株(黑曲霉)在液態(tài)發(fā)酵生產(chǎn)單寧酶時主要以胞內單寧酶形式存在,這使得在提取單寧酶時,往往需要破壁處理,該操作不僅增加了生產(chǎn)成本,同時還使得在破壁處理時大量細胞內蛋白溢出,加劇了單寧酶的分離純化難度[28],因此,獲得在液體培養(yǎng)生產(chǎn)胞外單寧酶的菌株,具有極其重要的現(xiàn)實意義。研究發(fā)現(xiàn),A. fumigatus HBHF5在液態(tài)發(fā)酵培養(yǎng)時,所產(chǎn)單寧酶主要以胞外酶的形式存在,這對于單寧酶的生產(chǎn)極具經(jīng)濟效應。固態(tài)發(fā)酵和液態(tài)發(fā)酵體系在含水量、含氧量、基質濃度及能量傳遞等方面存在較大差異。到目前為止,影響其胞外分泌機制仍不清楚,需進行進一步探究。

        食品酶類主要被用在碳水化合物原料的加工處理,因此分析菌株CAZymes的豐富程度,直接影響到菌株在食品酶制研發(fā)中的潛力。研究常通過對菌株不同酶活性的檢測來探究其產(chǎn)酶譜,雖然該策略具有一定的效果,但是酶種類數(shù)量往往較少,一般只有數(shù)種,因此不能客觀的對菌株的產(chǎn)酶潛力進行評價[29]。隨著組學時代的到來,轉錄組學技術的成熟和成本的降低為開展產(chǎn)酶譜的研究提供了有利的支撐[30]。A. fumigatus HBHF5在麩皮誘導時,經(jīng)轉錄組表達分析,共有2 151 個酶基因表達,有239 個CAZymes類基因表達,涉及到淀粉降解相關酶,纖維素降解相關酶和半纖維素降解相關酶,其酶總量遠高于傳統(tǒng)的酶譜檢測數(shù)量。因此,利用組學技術能夠客觀真實的評價菌株產(chǎn)酶譜。綜上所述,A. fumigatus HBHF5是1 株具有巨大開發(fā)潛力的酶制劑生產(chǎn)菌株。

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