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        醫(yī)學(xué)CT圖像預(yù)處理上下文算法研究

        2018-09-14 12:02:30史延新
        電子科技 2018年9期
        關(guān)鍵詞:分形紋理均值

        史延新

        (西安工業(yè)大學(xué) 理學(xué)院,陜西省 西安市 710032)

        近年來(lái),醫(yī)學(xué)圖像以其直觀準(zhǔn)確的特點(diǎn)已成為醫(yī)學(xué)診斷和治療中的關(guān)鍵環(huán)節(jié)之一,并在計(jì)算機(jī)輔助臨床外科手術(shù)及評(píng)價(jià)、康復(fù)器械研制、遠(yuǎn)程醫(yī)療、醫(yī)學(xué)培訓(xùn)、教學(xué)研究等方面發(fā)揮著巨大作用[1]。醫(yī)學(xué)CT圖像技術(shù)不斷發(fā)展,如多排螺旋CT、平板CT、超高速CT掃描、多相期增強(qiáng) CT 掃描[2]、PET/CT[3-4]以及低劑量CT[5-7]等,目前已經(jīng)可以應(yīng)用于人體的各個(gè)部位。通過(guò)對(duì)醫(yī)學(xué)CT圖像進(jìn)行預(yù)處理提高圖像質(zhì)量,特別是保持紋理特征非常重要,在推動(dòng)惡性腫瘤的早期診斷領(lǐng)域更是意義重大[8]。目前醫(yī)學(xué)CT圖像預(yù)處理的方法主要有高斯濾波、各向異性過(guò)濾算法、總變分最小化算法和NL-means算法等。這些方法能夠較好地提高醫(yī)學(xué)CT圖像的質(zhì)量,但在保持紋理特征方面略顯不足。

        本文為了充分保持醫(yī)學(xué)CT圖像的紋理特征,將信息論上下文模型引入圖像預(yù)處理,取得了較好的效果,為進(jìn)一步進(jìn)行分割、配準(zhǔn)、分析等處理提供了支撐。

        1 上下文模型

        根據(jù)信息論,符號(hào)流(Xn,Xn-1,…,X1)可以看成是一個(gè)離散的隨機(jī)向量,(Xi-1,Xi-2,…,X1)即為當(dāng)前符號(hào)Xi的上下文[9]。

        用Q表示上下文(Xi-1,Xi-2,…,X1)所有可能的取值集合,稱(chēng)為上下文空間,其定義為:

        Q={(xi-1,…,x1)|xj∈Λ,j=1,…,i-1}

        (1)

        上式中,∧表示有限的字母表;上下文空間Q是一個(gè)有限集,它包含的元素個(gè)數(shù):|Q|=|Λ|i-1。理論上,符號(hào)流(Xi-1,Xi-2,…,X1)通常是一個(gè)有限階的馬爾科夫過(guò)程。

        對(duì)于二維的圖像,可以將每一行或每一列的灰度特征看成是圖像的一維向量,表示為

        (2)

        式中,Xi(i=1,2,…,M)表示圖像的行向量;Yj(j=1,2,…,N)表示圖像的列向量。

        根據(jù)馬爾科夫隨機(jī)場(chǎng)理論,對(duì)于己知圖像,對(duì)某個(gè)像素點(diǎn)的灰度值的估計(jì)與己知被估計(jì)像素點(diǎn)鄰域的信息進(jìn)行估計(jì)的結(jié)果是相同的。一個(gè)馬爾科夫隨機(jī)場(chǎng){f(m,n),(m,n)∈∧}可以用下面的公式來(lái)描述

        p(f(m,n)|f(k,l)(k,l)≠(m,n)(k,l)∈∧)=
        p(f(m,n)|f(k,l)(k,l)∈N(m,n))

        (3)

        式中,f(m,n)表示(m,n)點(diǎn)的灰度值;∧表示全圖域;N(m,n)表示像素點(diǎn)(m,n)的鄰域但不包括(m,n)。

        為了描述上下文量化的誤差,可以使用相對(duì)熵或條件熵最小的原則[10-11],也可以使用互信息最大的原則[12]。上下文量化的過(guò)程就是一個(gè)目標(biāo)函數(shù)的最優(yōu)化過(guò)程。因此,目標(biāo)函數(shù)最優(yōu)化的算法都可以應(yīng)用于上下文量化。

        2 醫(yī)學(xué)CT圖像的紋理特征

        由于CT成像設(shè)備的限制,以及人體生理結(jié)構(gòu)的復(fù)雜性、人體組織器官結(jié)構(gòu)的特異性,使醫(yī)學(xué)圖像普遍存在質(zhì)量不高的問(wèn)題。以肝臟CT圖像為例,如圖1所示。

        圖1 正常肝臟的CT圖像

        肝臟CT圖像中包括肝、腎、胰、脾等多種臟器,肝臟與它們毗鄰,邊緣模糊,各CT值相近,灰度值相近,但是卻具有不同的紋理特征,并且當(dāng)有肝臟病變發(fā)生時(shí),肝臟微結(jié)構(gòu)發(fā)生了明顯變化,從而使正常肝臟與異常肝臟CT圖像之間的紋理特征出現(xiàn)了較大的差別,正常肝臟組織表現(xiàn)為肝臟邊緣光滑,肝臟組織圖像紋理細(xì)膩,紋理清晰,肝臟組織信號(hào)均勻,未見(jiàn)明確高信號(hào)或低信號(hào)結(jié)節(jié)狀改變;病變肝臟組織表現(xiàn)為肝臟邊緣不夠光滑,呈高低不平的結(jié)節(jié)狀改變,圖像紋理粗糙且紋理雜亂無(wú)章,肝臟信號(hào)不均勻,在灰色的肝臟背景中見(jiàn)多發(fā)的、大小不等的較高信號(hào)的結(jié)節(jié)灶,肝裂增寬。如圖2所示。因此紋理特征成為分離不同器官、組織,分析肝臟病變的重要依據(jù)[13]。

        圖2 病變肝臟的CT圖像

        圖像的紋理特征是一種主觀性視覺(jué)特征,常用的描繪紋理特征的統(tǒng)計(jì)量主要有均值、方差、逆差矩、對(duì)比度、熵、非相似度、角二階矩(能量)、相關(guān)性等[14]。此外,分形維提供了對(duì)圖像粗糙度和不同尺度下的自相似性分析的有力工具。方向分形維構(gòu)造方法如下:

        log(sum(f,θ))=-k(θ)log(f)+b(θ)

        (4)

        上式中,sum(f,θ)是當(dāng)前頻率為f在θ方向上功率譜密度的累加和;θ為8個(gè)基本的方向,即0°,45°,90°,135°,180°,225°,270°,315°。如圖3所示,分形維數(shù)反映圖像不規(guī)則程度,分形截距反映圖像灰度曲面變化的快慢,并且還從另一個(gè)側(cè)面反映了圖像灰度表面的粗糙程度[15]。

        圖3 8個(gè)方向的方向分形維特征和方向分形截距圖

        3 算法實(shí)現(xiàn)

        首先,為避免維數(shù)災(zāi)難,對(duì)紋理特征進(jìn)行篩選。不同組織病變的特征向量選擇存在差異,以肝癌CT圖像為例。根據(jù)正常肝臟CT圖像和病變肝臟CT圖像,按照類(lèi)間距離進(jìn)行篩選。常用的描繪紋理特征和方向分形維作為候選。如圖4所示,橫坐標(biāo)為各候選特征分量:1-灰度均值、2-標(biāo)準(zhǔn)差、3-三階矩、4-信息熵、5-分型斜率均值、6-分形截距均值、7-分形斜率方差、8-分形截距方差??v坐標(biāo)為各特征分量的歸一化值。從圖4可以看出灰度均值、標(biāo)準(zhǔn)差、三階矩、信息熵和方向分形維的類(lèi)間差異較大,考慮計(jì)算復(fù)雜度等因素,最終選擇灰度均值、熵和分形維、分形截距構(gòu)成特征向量組描述紋理特征。其次,因?yàn)橐陨霞y理特征沒(méi)有體現(xiàn)像素之間的相對(duì)位置關(guān)系,所以引入上下文模型,使用式(3)獲得上下文信息,并使用LBG算法進(jìn)行上下文量化。

        圖4 特征分量分析

        為了實(shí)現(xiàn)算法采用一個(gè)滑動(dòng)窗口。關(guān)于窗口大小的設(shè)置,窗口越小,程序的運(yùn)行速度越快,但是提取的特征誤差也相應(yīng)增大;窗口越大,提取的特征也就越準(zhǔn)確,但是程序的運(yùn)行時(shí)間也就越長(zhǎng),通過(guò)實(shí)驗(yàn)權(quán)衡利弊,選取7×7的滑動(dòng)窗口。

        灰度均值、熵和8個(gè)方向的分形維數(shù)和分形截距的均值和方差分別使用式(5)~式(10)進(jìn)行計(jì)算[16]

        (5)

        (6)

        (7)

        (8)

        (9)

        (11)

        本文算法的具體實(shí)現(xiàn)步驟如圖5所示。

        圖5 本文算法流程圖

        4 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析

        本文使用的實(shí)驗(yàn)圖像來(lái)源于西安市北方醫(yī)院影像科提供的290幅身體不同部位的CT圖像。經(jīng)研究發(fā)現(xiàn)CT圖像的噪聲模型近似于高斯噪聲,本文在所有的實(shí)驗(yàn)中,通過(guò)在原始圖像中加入不同偏差的高斯白噪聲進(jìn)行模擬,高斯噪聲的均值為0,方差分別為10、20、30、40、50、60、70。并將本文算法與高斯濾波,各向異性過(guò)濾算法、總變分最小化算法和NL-means算法等方法進(jìn)行比較。在所有的實(shí)驗(yàn)中,圖像塊大小設(shè)置與滑動(dòng)窗口大小相同,為 7×7像素,濾波參數(shù)設(shè)置為 5,鄰域塊的搜索半徑設(shè)置為 21×21像素。所有參數(shù)設(shè)置根據(jù)實(shí)驗(yàn)均衡算法效率和實(shí)驗(yàn)結(jié)果得到。下面以肝囊腫CT圖像和肝癌CT圖像的實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行分析。

        圖5 肝囊腫CT圖像的實(shí)驗(yàn)結(jié)果

        圖6 肝癌CT圖像的實(shí)驗(yàn)結(jié)果

        主觀評(píng)價(jià)如圖所示,圖5為肝囊腫的CT圖像的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,圖6為肝癌的CT圖像的實(shí)驗(yàn)結(jié)果。從實(shí)驗(yàn)結(jié)果圖像可以看出,相比于其他方法,采用本文算法對(duì)肝臟CT圖像進(jìn)行預(yù)處理在去除噪聲的同時(shí),較好地保持了紋理特征和邊緣、細(xì)節(jié)等信息,人工偽影也被有效抑制。

        客觀評(píng)價(jià)以計(jì)算在無(wú)噪聲圖像和處理后圖像之間的峰值信噪比(PSNR)和加權(quán)的結(jié)構(gòu)相似性指數(shù)(sSSIM)作為評(píng)判依據(jù)。實(shí)驗(yàn)結(jié)果如表1~表4所示,其中,σ為高斯白噪聲的方差。對(duì)于不同方差的高斯噪聲實(shí)驗(yàn),峰值信噪比本文算法相比于其他方法均有所改善,加權(quán)的結(jié)構(gòu)相似性指數(shù)更是有大幅的提升。結(jié)構(gòu)相似性指數(shù)反映了人類(lèi)視覺(jué)系統(tǒng)高度適應(yīng)自然視覺(jué)系統(tǒng)的視覺(jué)特性[17],因此客觀評(píng)價(jià)反映本文算法更好地保持了原圖像中的紋理等結(jié)構(gòu)信息,更符合人類(lèi)的視覺(jué)特性。

        本文算法計(jì)算復(fù)雜、計(jì)算量較大,因此比其他方法需要更多的計(jì)算時(shí)間,算法的時(shí)間效率有待于進(jìn)一步改善。

        表1 肝囊腫CT圖像的PSNR值比較

        表2 肝囊腫CT圖像的sSSIM值比較

        表3 肝癌CT圖像的PSNR值比較

        表4 肝癌CT圖像的sSSIM值比較

        5 結(jié)束語(yǔ)

        本文提出的算法,選擇灰度均值、熵和分形維共同構(gòu)成向量,并將上下文模型引入,不僅提高了肝臟CT圖像質(zhì)量,更加有效地保持了紋理等高頻細(xì)節(jié)信息。提高醫(yī)生對(duì)圖像細(xì)節(jié)識(shí)別和分析的準(zhǔn)確度,為進(jìn)一步處理提供支撐。本文算法可以推廣到人體各部位CT圖像的預(yù)處理以及其他醫(yī)學(xué)圖像的預(yù)處理,但運(yùn)行效率有待于進(jìn)一步深入研究。

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