白雪晶,馮 磊,徐文波,趙 陽(yáng),羅 風(fēng),羅 旋
(昆明醫(yī)科大學(xué)第六附屬醫(yī)院/云南省玉溪市人民醫(yī)院檢驗(yàn)科 653100)
遺傳性耳聾指由于基因和染色體異常所致的耳聾,分為綜合征性耳聾和非綜合征性耳聾,發(fā)病率較高,每1 000個(gè)新生兒當(dāng)中就有1~3個(gè)被確診,終生帶病,嚴(yán)重影響了患者的生活質(zhì)量[1]。大量的流行病學(xué)調(diào)查結(jié)果顯示,有4個(gè)基因是在中國(guó)耳聾人群中最為常見(jiàn)的突變基因,且所選擇的9個(gè)突變位點(diǎn)占這4個(gè)基因突變的80%~90%[2-3]。其中,GJB2基因與先天性耳聾密切相關(guān),中國(guó)先天性耳聾患者中20%攜帶有GJB2基因的突變;線粒體基因突變與慶大霉素、鏈霉素等氨基糖苷類藥物引起的藥物性耳聾有密切關(guān)系;SLC26A4基因突變可以導(dǎo)致大前庭水管腫大綜合征;GJB3基金突變被認(rèn)為與高頻聽(tīng)力下降有關(guān)[4]。其中,GJB2和SLC26A4基因突變是由常染色體隱性遺傳引起的,線粒體基因突變是母系遺傳,GJB3基因突變表現(xiàn)為常染色體顯性遺傳。本研究應(yīng)用遺傳性耳聾基因芯片試劑盒檢測(cè)玉溪市某特殊教育學(xué)校學(xué)生常見(jiàn)耳聾基因的突變情況,探討基因芯片技術(shù)在非綜合征性耳聾診斷中的應(yīng)用,現(xiàn)將結(jié)果報(bào)道如下。
1.1一般資料 選擇玉溪市某特殊教育學(xué)校的青少年非綜合征性耳聾患者131例為研究對(duì)象,均為玉溪市常住人口?;颊咧?,男64例,女67例;年齡8~23歲,中位年齡14歲;漢族70例,彝族29例,回族2例,傣族5例,哈尼族20例,蒙古族2例,拉祜族2例,基諾族1例。納入標(biāo)準(zhǔn):(1)所有研究對(duì)象均2代以上為玉溪市常住人口;(2)聽(tīng)力檢測(cè)證實(shí)為重度、極重度感音神經(jīng)性非綜合征性耳聾。排除標(biāo)準(zhǔn):(1)曾確診為急、慢性化膿性中耳炎病,有中耳手術(shù)史者;(2)其他疾病史,可引起聽(tīng)力下降者(包括顱面部外傷、腦膜炎、迷路感染等);(3)伴有外耳、中耳畸形,引起傳導(dǎo)性聽(tīng)力下降者;(4)有明確的爆震傷、噪聲接觸史者;(5)曾使用過(guò)大劑量的非氨基糖苷類藥物史者;(6)伴有腦癱、智力發(fā)育障礙、因全身其他疾病影響聽(tīng)力檢測(cè)效果者;(7)綜合征性耳聾患者。本研究經(jīng)患者及其家屬知情同意,并獲得醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理學(xué)委員會(huì)批準(zhǔn)。
1.2方法
1.2.1病史的調(diào)查 通過(guò)家屬填寫(xiě)聾啞患者登記表和電話家訪的方式掌握患者病史,包括耳聾發(fā)病年齡、家族史、個(gè)人史(感冒發(fā)燒史、耳毒性藥物使用史、頭部外傷史)等情況。
1.2.2外周血采集 由專職護(hù)士按照采血標(biāo)準(zhǔn)流程用乙二胺四乙酸二鉀(EDTA-K2)抗凝管采集受試者對(duì)象前臂外周血2 mL,特殊醫(yī)用冰盒保存血樣。
1.2.3基因組DNA提取 按照血液基因組DNA提取試劑盒(北京天根DP319)說(shuō)明書(shū)提取血液基因組DNA。取一定量提取的DNA用紫外分光光度計(jì)進(jìn)行定量和純度檢測(cè),其余置-80 ℃冰箱備用。
1.2.4基因檢測(cè) 采用晶芯?九項(xiàng)遺傳性耳聾基因檢測(cè)試劑盒(微陣列芯片法)[博奧生物集團(tuán)有限公司,國(guó)食藥監(jiān)械(準(zhǔn))字2013第3401518號(hào)]及其配套儀器進(jìn)行標(biāo)本的多重聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴(kuò)增、芯片雜交、洗滌及掃描,檢測(cè)樣本4個(gè)基因的9個(gè)常見(jiàn)突變位點(diǎn)[GJB2基因c.35 del G、c.176_191 del 6、c.235 del C、c.299 del AT;GJB3基因c.538C>T;SLC26A4基因c.2168A>G、c.IVS7-2A>G;線粒體基因(mtDNA)12SrRNA的m.1494C>T、m.1555A>G位點(diǎn)],根據(jù)熒光雜交信號(hào)和耳聾基因微陣列芯片探針排布位置進(jìn)行信號(hào)的讀取及結(jié)果判讀。
1.3統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用SPSS17.0統(tǒng)計(jì)學(xué)軟件進(jìn)行分析。計(jì)數(shù)資料以百分?jǐn)?shù)表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn);當(dāng)樣本量小于40或理論頻數(shù)小于1時(shí)使用Fisher確切概率法。以P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。
2.1基因突變檢測(cè)結(jié)果 131例青少年耳聾患者中,攜帶遺傳性耳聾相關(guān)突變基因的患者為27例[28.3%(27/131)]。
2.2患者耳聾基因突變位點(diǎn)、類型及突變率 在131例青少年耳聾患者中,GJB2突變者20例[15.5%(20/131)],包括c.235 del C純合突變11例(8.4%),其中4例為漢族,2例為彝族,5例為哈尼族;c.235 del C單雜合突變3例(2.3%),c.235 del C復(fù)合 c.299 del AT突變2例,c.235 del C復(fù)合c.176_191 del 6突變1例,均為漢族;c.176_191 del 6突變1例(0.8%),c.299 del AT突變2例(7.4%),均為漢族。SLC26A4突變者8例(6.1%),均為漢族,包括c.2168A>G純合突變1例,c.2168A>G 單雜合突變3例,c.IVS7-2A>G純合突變3例,c.IVS7-2A>G單雜合突變1例。mtDNA的m.1555A>G位點(diǎn)均質(zhì)型突變2例(1.5%),均為漢族,其他民族中未發(fā)現(xiàn)4個(gè)基因9個(gè)位點(diǎn)的突變對(duì)象。
2.3不同民族耳聾患者的基因突變檢出率 漢族基因突變檢出率為28.6%(20/70),彝族的檢出率為6.9%(2/29),哈尼族的檢出率為25.0%(5/20),回族、傣族、蒙古族、拉祜族、基諾族均未檢出基因突變。經(jīng)χ2檢驗(yàn),彝族、哈尼族與漢族耳聾基因突變檢出率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05);經(jīng)四格表確切概率法檢驗(yàn),彝族與哈尼族耳聾基因突變檢出率差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。見(jiàn)表1。
表1 4種耳聾基因的基因突變位點(diǎn)在玉溪各民族耳聾患者中檢出情況(n=27,n)
注:突變患者27例,其中3例為雙雜合突變,分別為c.235 del C/c.299 del AT 2例,c.235 del C/c.176_191 del 6 1例
耳聾包括常染色體顯性、常染色體隱性、X隱性或者線粒體遺傳[3-4]。非綜合性耳聾常染色體隱性遺傳最常見(jiàn)的原因是GJB2基因的突變[5-7],GJB2的p.V37I變種在東亞地區(qū)具有很高的等位基因頻率(最高可達(dá)10%)[8-10]。在許多國(guó)家已經(jīng)對(duì)常染色體隱性遺傳(DFNB1)位點(diǎn)的突變譜、基因型-表型相關(guān)性,以及DFNB1與耳聾的相關(guān)性進(jìn)行了分析。突變譜和突變頻率由于種族、地理、社會(huì)和醫(yī)學(xué)因素的不同而存在差異,遺傳在發(fā)病機(jī)制中起到了重要作用。在歐洲發(fā)達(dá)國(guó)家,2/3的耳聾病例由遺傳因素引起,約70%為非綜合征性耳聾,約30%為綜合征性耳聾[11]。剩下的1/3病例可以歸因于環(huán)境和未知的遺傳因素。在東亞的一些國(guó)家大約有1/2的病例是由遺傳引起的,非綜合征性耳聾占到60%~70%,其余的1/2病例歸因于其他環(huán)境和不能鑒別的遺傳因素[12]。
本研究通過(guò)對(duì)131例非綜合耳聾患者進(jìn)行GJB2(c.35 del G、c.176_191 del 6、c.235 del C、c.299 del AT)、SLC26A4(c.2168A>G、c.IVS7-2A>G)、GJB3(c.538C>T)和mtDNA 12SrRNA(m.1494C>T、m.1555A>G)4個(gè)耳聾相關(guān)基因的9個(gè)致聾突變位點(diǎn)的檢測(cè),其中檢出率最高的是GJB2基因,其次為SLC26A4基因,這符合國(guó)內(nèi)文獻(xiàn)[3-9]報(bào)道。耳聾基因的突變具有明顯的區(qū)域聚集性和民族差異性,云南是我國(guó)少數(shù)民族最多的省份,除漢族外,少數(shù)民族有25個(gè),各民族分布呈大雜居,小聚居的特點(diǎn),這為研究耳聾基因的民族差異性和區(qū)域聚集性提供了有利的條件。本研究發(fā)現(xiàn),在青少年非綜合征性耳聾患者中,GJB2、SLC26A4、mtDNA基因的突變率分別為15.5%、6.1%、1.5%。GJB2最常見(jiàn)的類型是c.235 del C突變,SLC26A4 基因的c.2168A>G,c.IVS7-2A>G突變率相同。不同耳聾致病突變位點(diǎn)的攜帶率存在地區(qū)差異,各地區(qū)應(yīng)根據(jù)當(dāng)?shù)厝巳旱臄y帶情況選擇篩查位點(diǎn)。
綜上所述,本研究采用基因芯片技術(shù)對(duì)131例青少年耳聾患者進(jìn)行檢測(cè),從分子水平上為耳聾患者提供明確的分子病因?qū)W診斷,同時(shí)得出非綜合性耳聾患者以GJB2基因和SLC26A4基因?yàn)樽钪饕闹虏』?。其中c.235 del C突變?yōu)樽畛R?jiàn)突變位點(diǎn),其次為c.IVS7-2A>G和c.2168A>G突變。