張 禹，李麗娟，鐘佳琳，雷初朝，陳 宏，黃永震*

（1.西北農(nóng)林科技大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院，陜西楊凌 712100；2.貴州工程應(yīng)用技術(shù)學(xué)院畢節(jié)試驗(yàn)區(qū)研究院，貴州畢節(jié) 551700）

Altman和Cech發(fā)現(xiàn)了RNA的“酶”作用，為人類探索生命的奧密打開了一扇新的大門。Cech[1]用原始RNA世界、當(dāng)代RNA世界、RNA技術(shù)和生物醫(yī)學(xué)應(yīng)用的世界概括了RNA領(lǐng)域的發(fā)展及未來。在這3個(gè)RNA世界當(dāng)中，非編碼RNA（Non-coding RNA，ncRNA），即那些目前大家認(rèn)為不作為蛋白翻譯模板（mRNA）的各種RNA，在基因的表達(dá)調(diào)控中起著至關(guān)重要的作用，對(duì)于動(dòng)物的育種工作具有指導(dǎo)意義。

1 ncRNA在基因表達(dá)中的調(diào)控作用

調(diào)控基因表達(dá)是ncRNA的一個(gè)核心功能。例如，在X染色體失活過程中，Xist（An Essential lnc RNA for X Chromosome Inactivation）與 XCI（X-chromosome Inactivation）位點(diǎn)相互作用，引起該染色體構(gòu)象變化，更加容易與各種蛋白因子相結(jié)合，最終導(dǎo)致X染色體失活[2-3]。近年來研究人員對(duì)ncRNA做了大量研究，其中，以非編碼長(zhǎng)鏈RNA（lncRNA）、miRNA和環(huán)狀RNA（circRNA）的研究為主。同時(shí)，研究還發(fā)現(xiàn)相當(dāng)數(shù)目的ncRNA調(diào)控轉(zhuǎn)錄都是通過別位作用（Trans Effect）完成的，即調(diào)控離此ncRNA轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生處距離較遠(yuǎn)位點(diǎn)的基因表達(dá)或染色質(zhì)表觀遺傳狀態(tài)。

1.1 miRNA對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控 之前大多數(shù)研究認(rèn)為，miRNA在細(xì)胞漿中通過結(jié)合靶基因3′UTR抑制或降解mRNA，從而導(dǎo)致翻譯的終止或抑制，最終造成相應(yīng)功能的障礙，以此機(jī)制來發(fā)揮負(fù)調(diào)控作用[4]。但也發(fā)現(xiàn)部分miRNA所在基因組的位置與一些增強(qiáng)子區(qū)域重疊，于是便引出了miRNA與增強(qiáng)子有何關(guān)系的疑問，并成功通過后來的一些研究證明了miRNA是一種雙功能分子[5]。當(dāng)miRNA位于細(xì)胞核中時(shí)，通過結(jié)合增強(qiáng)子改變其染色質(zhì)狀態(tài)激活表達(dá)；而在胞漿中時(shí)，則可通過作用于mRNA 3′UTR區(qū)域阻斷翻譯（圖1）[5]。研究人員把定位于核內(nèi)并具有激活作用的RNA稱為NamiRNA（Nuclear Activating miRNA）?；诖?，提出了NamiRNA-增強(qiáng)子靶基因網(wǎng)絡(luò)激活模型[5]，用于揭示miRNA在細(xì)胞核內(nèi)的功能，并可借此模型解釋一些表達(dá)上調(diào)現(xiàn)象，如腫瘤細(xì)胞中的“上調(diào)基因”。

圖1 miRNA在胞漿與胞核中的雙向性功能[5]

1.2 lncRNA對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控 lncRNAs雖然很久以前就被發(fā)現(xiàn)，但直到近年才逐漸被關(guān)注。lncRNAs對(duì)于基因的表達(dá)調(diào)控滲透在基因表達(dá)的每一個(gè)階段：表觀遺傳水平調(diào)控、轉(zhuǎn)錄水平調(diào)控、轉(zhuǎn)錄后水平調(diào)控、翻譯水平調(diào)控[6]。在表觀遺傳水平，主要通過介導(dǎo)組蛋白修飾與甲基化來改變?nèi)旧|(zhì)表觀狀態(tài)，從而影響基因的正常表達(dá)。如HOTAIR可以通過對(duì)蛋白PRC2、LSD1、CoR-RESTREST的招募，完成對(duì)于人類HoxD基因表達(dá)的調(diào)控[7]。在基因的轉(zhuǎn)錄過程中，一些lncRNA可通過干擾轉(zhuǎn)錄因子與啟動(dòng)子的結(jié)合干擾轉(zhuǎn)錄。如DHFR上游的1個(gè)lncRNA能與DHFR啟動(dòng)子形成RNA-DNA螺旋結(jié)構(gòu)，抑制轉(zhuǎn)錄因子TFIID的結(jié)合，從而抑制DHFR基因表達(dá)[8]。在轉(zhuǎn)錄完成后，lncRNA可與miRNA相互作用參與轉(zhuǎn)錄后的調(diào)控、可作為小RNA的前體、調(diào)控mRNA的選擇性剪接、影響mRNA穩(wěn)定性。如NLC1-C也稱為基因間RNA162（LINC00162），在細(xì)胞核中可抑制miR-320a和miR-383的轉(zhuǎn)錄，進(jìn)而成功地對(duì)人類精子發(fā)生進(jìn)行調(diào)節(jié)[9]。在mRNA翻譯階段，lncRNA可在翻譯起始及延伸階段進(jìn)行調(diào)控改變蛋白活性，或與特定蛋白結(jié)合，改變其在胞質(zhì)中的定位[10]。

1.3 circRNA對(duì)基因表達(dá)的調(diào)控 circRNA作為ncRNA，廣泛存在于生物細(xì)胞內(nèi)，且占據(jù)了約所有轉(zhuǎn)錄本的10%[11]。然而，由于技術(shù)限制，早在1976年植物中就發(fā)現(xiàn)了的circRNA，在被驗(yàn)證之前，一直被認(rèn)為是mRNA合成過程中錯(cuò)誤剪接的產(chǎn)物。直到2012年被證實(shí)，circRNA穩(wěn)定且廣泛地存在于包括人類在內(nèi)的真核生物界[12]。至此，circRNA的存在再次引起了研究者的廣泛重視。已發(fā)現(xiàn)的circRNA的主要作用是調(diào)節(jié)基因表達(dá)，具體機(jī)制主要包括以下3種[13]。

1.3.1 miRNA分子海綿作用 一些circRNA上具有miRNA結(jié)合位點(diǎn)，能夠競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miRNA，從而抑制其對(duì)相應(yīng)mRNA的降解作用，主要見于外顯子構(gòu)成的circRNA（如CDR1as、circRNA-SRY以及circRNA-ZNF19等）。哈佛醫(yī)學(xué)院Salmena等[14]的ceRNA調(diào)控假說在2011年7月做出了合理推斷。ceRNA具有數(shù)量和種類不等的MRE（miRNA應(yīng)答元件，miRNA Response Element），可競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miRNA，降低miRNA對(duì)靶基因的負(fù)性調(diào)控。在李強(qiáng)等[15]對(duì)circRNA的miRNA海綿功能的檢測(cè)實(shí)驗(yàn)中，以人胚胎細(xì)胞HEK293T、人工合成的has_circ_0000254的全長(zhǎng)序列和突變序列、miR-125b、inhibitor及Mir-NC和Trans1 T1 感受態(tài)細(xì)胞為材料，采用雙熒光素酶報(bào)告基因法進(jìn)行實(shí)驗(yàn)，結(jié)果顯示miR-125b能通過結(jié)合hsa-circ-000254影響熒光素酶報(bào)告載 體 psiCHECK2-has_circ_0000254（C254） 熒 光 活性改變，miR-125b inhibitor能封閉miR-125b與hsacirc-000254結(jié)合影響其熒光活性改變。

1.3.2 調(diào)控經(jīng)典的RNA剪接 以MBL的表達(dá)為例[16]。circMbl是muscleblind基因的第2個(gè)外顯子形成的circRNA。muscleblind基因編碼剪接因子MBL（甘露糖結(jié)合凝集素），與mRNA的穩(wěn)定性密切相關(guān)。circMbl的側(cè)翼內(nèi)含子上具有很多MBL蛋白結(jié)合位點(diǎn)，可以特異性結(jié)合MBL蛋白，二者的結(jié)合促進(jìn)circMbl的產(chǎn)生，而circMbl的產(chǎn)生則進(jìn)一步結(jié)合MBL蛋白促進(jìn)circMbl的產(chǎn)生。circRNA是通過轉(zhuǎn)錄產(chǎn)生的，經(jīng)典的mRNA剪接與外顯子的環(huán)化作用是相互競(jìng)爭(zhēng)的，因此經(jīng)典的mRNA剪接就會(huì)被競(jìng)爭(zhēng)性的抑制，即muscleblind基因相關(guān)mRNA的剪接會(huì)因此而受到抑制。

1.3.3 與轉(zhuǎn)錄調(diào)控原件結(jié)合調(diào)控母基因的轉(zhuǎn)錄 有研究顯示，有些circRNA分子可以通過吸附蛋白質(zhì)因子，影響蛋白功能從而參與到基因的表達(dá)調(diào)控中[17]。如ciankrd52可與RNA聚合酶復(fù)合體相互作用，從而影響該酶的活性，最終達(dá)到調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄的作用。Li等[18]研究發(fā)現(xiàn)，ElciRNA（如circPAIP2）能夠與U1互補(bǔ)配對(duì)，進(jìn)而與U1小核核糖核蛋白（U1small Nuclear Ribonucleoproteins，snRNP）相互作用，從而順式調(diào)控作用促進(jìn)自身編碼基因轉(zhuǎn)錄。

2 ncRNA對(duì)于動(dòng)物育種的重要意義

2.1 ncRNA對(duì)于動(dòng)物育種的重要作用

2.1.1 ncRNA對(duì)繁殖的影響 許多研究表明，miRNA在卵泡的生長(zhǎng)發(fā)育過程中發(fā)揮著重要作用[19]。Tesfaye等[20]通過研究體外成熟與未成熟牛卵母細(xì)胞發(fā)現(xiàn)了59種miRNA的差異表達(dá)，其中，31個(gè)miRNA優(yōu)先在未成熟牛卵母細(xì)胞中表達(dá)，28個(gè)優(yōu)先在成熟牛卵母細(xì)胞表達(dá)。有研究發(fā)現(xiàn)，通過人為干擾降低miRNA會(huì)導(dǎo)致卵母細(xì)胞發(fā)育受阻，降低排卵率，對(duì)雌性生殖造成影響[21]。

lncRNA在哺乳動(dòng)物精子的生長(zhǎng)發(fā)育過程中有著重要的作用[22]。HongrES2是一個(gè)長(zhǎng)1 588 bp的lncRNA，特異性地在附睪尾部區(qū)域表達(dá)，該轉(zhuǎn)錄物優(yōu)選位于細(xì)胞核中，在細(xì)胞核中它被加工成23bp miRNA類小RNA，稱為mil-HongrES2，其抑制附睪特異性蛋白CES7的表達(dá)，從而抑制其膽固醇酯酶活性，調(diào)節(jié)精子的成熟[23]。

由此可見，ncRNA在動(dòng)物生殖細(xì)胞生長(zhǎng)發(fā)育過程中具有一定的調(diào)控作用。目前，關(guān)于各類家畜有關(guān)繁殖性能的基因已經(jīng)有相當(dāng)多的研究，并且，自2002年lncRNA正式被提出到2010年報(bào)道lncRNA可調(diào)控細(xì)胞重編程，再到Weikard等[24]利用RNA深度測(cè)序，發(fā)現(xiàn)牛皮膚組織中存在4 848個(gè)潛在的長(zhǎng)鏈非編碼RNA，再到Y(jié)ue等[25]發(fā)現(xiàn)lncYYW在成肌細(xì)胞分化過程中上調(diào)表達(dá)，過表達(dá)lnc YYW能增加細(xì)胞周期中S期的細(xì)胞數(shù)目，不難發(fā)現(xiàn)目前關(guān)于ncRNA對(duì)基因表達(dá)調(diào)控的研究也在快速發(fā)展。若能將ncRNA作為調(diào)控相關(guān)基因的重要工具，在原有的分子標(biāo)記輔助選擇（MAS）基礎(chǔ)上加入ncRNA對(duì)于基因表達(dá)調(diào)控的內(nèi)容，將會(huì)對(duì)品種改良與新品種的培育有很大幫助。

2.1.2 ncRNA對(duì)胚胎發(fā)育的影響 近些年的研究表明，ncRNA在胚胎發(fā)育的各個(gè)時(shí)期都發(fā)揮著重要作用。Dicer酶突變的斑馬魚的卵母細(xì)胞和受精卵在胚胎發(fā)育過程中出現(xiàn)了嚴(yán)重缺陷但可通過體外注射成熟miRNA恢復(fù)正常的實(shí)驗(yàn)表明，miRNA對(duì)于胚胎發(fā)育具有重要作用[26-28]。在ncRNA對(duì)早期胚胎發(fā)育影響的研究中，Elmira等[29]在非洲爪蟾胚胎上通過使用HTSeq根據(jù)Tophat將轉(zhuǎn)錄表達(dá)轉(zhuǎn)換為了RPKM值，并通過高斯過程模擬了表達(dá)。在眾多l(xiāng)ncRNA中發(fā)現(xiàn)了8個(gè)lncRNA可能對(duì)早期胚胎的發(fā)育具有調(diào)控作用。同時(shí)，有研究表明，HOTAIR通過反式作用調(diào)控在動(dòng)物胚胎早期發(fā)育中對(duì)細(xì)胞的分化至關(guān)重要的Hox基因的表達(dá)[30]。在關(guān)于胚胎后期發(fā)育的相關(guān)研究中，Boris等[31]對(duì)胎盤中基因端粒較長(zhǎng)做出了解釋，胎盤中的低甲基化有利于lncRNA TERRA的表達(dá)，而在癌細(xì)胞的研究中發(fā)現(xiàn)TERRA可以通過與端粒酶的結(jié)合抑制端粒酶的作用，因此胎盤中的端粒酶因受高表達(dá)的TERRA的抑制而降低了對(duì)胎盤中基因端粒的損傷，造成胎盤中端粒較長(zhǎng)的現(xiàn)象。Zhang等[32]使用短干擾RNA對(duì)As-api5表達(dá)的下調(diào)導(dǎo)致A.sinica的死亡率和胚胎畸形增加。其實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，API5在胚胎滯育終止和早期胚胎發(fā)育中起關(guān)鍵作用。miRNA在胚胎干細(xì)胞增殖與自我更新方面也具有重要的作用，小鼠miR-290-295（人miR-371-373家族）在其中高度表達(dá)，而在其他組織表達(dá)下調(diào)，且有研究闡明了一個(gè)新的ESC的維持和增殖中β-catenin/LEF1-miR-372和miR-DKK1正反饋調(diào)節(jié)循環(huán)[33]?？梢?，ncRNA的調(diào)控作用存在于動(dòng)物從胚胎發(fā)育到胎兒誕生的各個(gè)時(shí)期，并且一些ncRNA對(duì)于某些在胚胎發(fā)育過程中發(fā)揮著重要作用的基因具有調(diào)控作用。

2.1.3 ncRNA對(duì)表觀遺傳的影響 ncRNA存在并在體細(xì)胞和生殖細(xì)胞中起作用。體細(xì)胞中的ncRNA變化導(dǎo)致mRNA轉(zhuǎn)錄組改變，而種系ncRNA可能介導(dǎo)表觀遺傳記憶的傳播。在受精過程中，精子與卵子在結(jié)合時(shí)都攜帶了部分RNA（mRNA與ncRNA）。Carrell等[34]通過表觀遺傳記憶的研究發(fā)現(xiàn)，環(huán)境導(dǎo)致的表觀特征會(huì)通過雄性精子遺傳給后代，ncRNA可能是DNA序列與其最終表觀遺傳狀態(tài)之間的連接。Bony等[35]在分析由類視黃醇誘導(dǎo)的鼠類ES細(xì)胞中Hox簇的轉(zhuǎn)錄和表觀遺傳學(xué)特征的動(dòng)態(tài)變化中發(fā)現(xiàn)，來自Hox簇的2條ncRNA可代表ES細(xì)胞中快速誘導(dǎo)產(chǎn)生的轉(zhuǎn)錄物，并且它們與動(dòng)態(tài)表觀遺傳學(xué)變化相關(guān)。該團(tuán)隊(duì)解釋了Hox B簇中的ncRNA（Hobbit1）和Hox編碼基因的共調(diào)節(jié)是由共享的RARE依賴性增強(qiáng)子介導(dǎo)的。ncRNA可以通過影響基因組的表觀遺傳修飾來直接作用于表觀遺傳學(xué)水平，或者通過控制表觀遺傳調(diào)節(jié)劑的表達(dá)，從而間接誘導(dǎo)表觀遺傳改變。

自克隆羊“多利”誕生以來，克隆技術(shù)在各國(guó)快速發(fā)展起來，雖然在人類方面涉及倫理問題還有待商榷，但在動(dòng)物方面可謂前景廣闊。然而，在目前的克隆技術(shù)中，存在的最大問題是成功率極低。Ibtishama等[36]指出，由于各種原因?qū)е驴寺∈?，包括早期和晚期墮胎、免疫系統(tǒng)受損、循環(huán)和呼吸問題以及高死亡率，且失敗多發(fā)生于克隆體出生前，其主要原因似乎是非典型表觀遺傳重編程，即在受精卵最初幾次卵裂中，去甲基化酶清除了DNA分子上幾乎所有從親代遺傳來的甲基化標(biāo)志；在胚胎植入子宮時(shí)，一種新的甲基化遍布整個(gè)基因組，甲基化酶使DNA重新建立一個(gè)新的甲基化模式[37]。而在這一過程中，許多克隆胚胎卻顯示總體DNA甲基化模式異常。然而，在顧永娟等[38]關(guān)于胃癌中ncRNA與DNA甲基化的關(guān)系綜述中列舉了大量有關(guān)ncRNA以及DNA甲基化相互調(diào)控的研究，指出啟動(dòng)子區(qū)域的異常甲基化可能導(dǎo)致miRNA的異常表達(dá)，而miRNA并不只受表觀遺傳機(jī)制調(diào)控，也能通過直接作用于DNMT、HDAC和組蛋白甲基轉(zhuǎn)移酶（HMT）調(diào)控表觀遺傳修飾從而調(diào)控DNA甲基化和組蛋白修飾過程。且ncRNA可通過影響與重編程相關(guān)的基因的表達(dá)調(diào)控細(xì)胞的重編程過程[39]。ncRNA的作用與克隆的成功與否有可能具有一定的聯(lián)系，在這一過程中對(duì)于ncRNA作用的研究或許有助于提高克隆技術(shù)的成功率與準(zhǔn)確性。而克隆技術(shù)的成熟對(duì)于動(dòng)物遺傳育種的研究及應(yīng)用將會(huì)有極大的推進(jìn)作用。

2.2 ncRNA在動(dòng)物育種上的探索 對(duì)于ncRNA的研究表明，ncRNA在表達(dá)上具有組織特異性，即在不同的組織中或組織的不同時(shí)期有著不同表達(dá)量的ncRNA參與細(xì)胞基因表達(dá)等生命活動(dòng)。因此目前關(guān)于ncRNA對(duì)于動(dòng)物生產(chǎn)性能的影響也大多是依據(jù)這個(gè)思路。

近期在產(chǎn)奶性能方面有一些新的發(fā)現(xiàn)。金晶等[40]以泌乳期高乳品質(zhì)和低乳品質(zhì)中國(guó)荷斯坦奶牛乳腺組織作為實(shí)驗(yàn)對(duì)象，通過高通量測(cè)序技術(shù)檢測(cè)miRNA，發(fā)現(xiàn)了56個(gè)差異表達(dá)miRNA，并成功預(yù)測(cè)了相關(guān)功能靶基因CSN3、SCD、LALBA和DGAT2。紀(jì)志賓[41]研究表明，miR-143與IGFBP5在不同泌乳時(shí)期乳腺組織表達(dá)趨勢(shì)相同，均在泌乳高峰期低表達(dá)，且發(fā)現(xiàn)miR-143靶向IGFBP5 3'-UTR，并正向調(diào)控其表達(dá)；miR-143延緩了乳腺上皮細(xì)胞周期進(jìn)程，可抑制乳腺上皮細(xì)胞的增殖，并促進(jìn)其凋亡。林先滋等[42]研究表明，F(xiàn)ASN（脂肪酸合酶基因）與BTN1A1（嗜乳脂蛋白基因）的3'UTR上的結(jié)合位點(diǎn)分別有3個(gè)和2個(gè)，其中miR-103位于BTN1A1的靶位點(diǎn)與已知物種間同源性較高。Wang等[43]的研究表明，miR-221、miR-33b、miR-31在奶牛泌乳期高表達(dá)，而miR-223在泌乳高峰期則下降。胎衣不下奶牛母體胎盤中bta-miR-31與正常排出組奶牛相比表達(dá)量明顯偏高[44]。這些研究表明，ncRNA的差異表達(dá)與奶牛的產(chǎn)奶相關(guān)性狀的差異相關(guān)聯(lián)。可以作為今后利用miRNA調(diào)控奶牛產(chǎn)奶性能的重要依據(jù)。miRNA在奶牛乳腺發(fā)育和泌乳機(jī)理方面的研究才剛剛起步[45]。

在肌肉調(diào)控方面，尤其是對(duì)于豬肉與牛肉的研究較多。miR-206作為在2012年以前發(fā)現(xiàn)唯一在骨骼肌中特異表達(dá)的miRNA，其表達(dá)異常與一些肌肉相關(guān)疾病如肌肉營(yíng)養(yǎng)不良、肌萎縮性側(cè)索硬化癥等有關(guān)[46]。HMGCS1基因?qū)τ谪i的骨骼肌發(fā)育具有一定影響，而miRNA-18a/b則可通過調(diào)控HMGCS1的表達(dá)間接影響骨骼肌的發(fā)育[47]。王亞輝等[48]通過在牛骨骼肌中做EDU增殖發(fā)現(xiàn)，mir-133b對(duì)牛骨骼肌衛(wèi)星細(xì)胞增殖具有促進(jìn)作用。在牛肌內(nèi)脂肪的研究中發(fā)現(xiàn)，牛肌內(nèi)脂肪和皮下脂肪組織確實(shí)存在一些差異表達(dá)的miRNAs[49]，根據(jù)其在相關(guān)信號(hào)通路中的富集程度可推測(cè)其作用機(jī)制，如miR-27b的預(yù)測(cè)靶基因在MAPK信號(hào)通路中富集度最高，可推測(cè)其作用機(jī)制并進(jìn)行下一步研究。大量研究表明，miRNA對(duì)于骨骼肌性狀或其他性能有具有調(diào)控作用。Sun等[50]研究表明，lncRNA同樣可以調(diào)控這些性狀，一種在成肌細(xì)胞分化過程中逐漸上調(diào)的新型肌肉特異性RNA lnc MD，其表達(dá)上調(diào)和沉默可以引起肌原性標(biāo)志物——肌球蛋白重鏈（MHC）和肌細(xì)胞生成素（Myo G）的上調(diào)和下降。Jin等[51]發(fā)現(xiàn)，通過過表達(dá)或抑制lnc133b可促進(jìn)衛(wèi)星細(xì)胞分化的增殖或抑制；Li等[52]發(fā)現(xiàn)了一種脂肪細(xì)胞分化中差異表達(dá)的lncRNA并命名為脂肪細(xì)胞分化相關(guān)長(zhǎng)鏈ncRNA（ADNCR），可通過作為miR-204的競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA（ce RNA）抑制脂肪細(xì)胞分化。以上研究表明，不僅miRNA對(duì)于動(dòng)物生產(chǎn)性能具有調(diào)控作用，lncRNA也有，很有可能circRNA等其他ncRNA都有這方面的作用。最初認(rèn)為在分子層面是表達(dá)的基因片段對(duì)性狀的調(diào)控起作用，然而現(xiàn)在發(fā)現(xiàn)miRNA、lncRNA也可以。由于性狀是多方面協(xié)調(diào)作用最終的結(jié)果，如未對(duì)這一體系有確切了解，在動(dòng)物育種工作中將無(wú)法保證準(zhǔn)確度與效率。

對(duì)于不同畜禽及ncRNA的作用也開展了相關(guān)研究。截止2015年,已報(bào)道的豬miRNAs僅有326個(gè)，且miRNAs調(diào)控豬脂肪發(fā)育的研究十分欠缺[53]。顧真真等[54]研究發(fā)現(xiàn)，lnc LER在盧氏綠殼蛋母雞各組織中均有表達(dá)，尤其在產(chǎn)蛋高峰期肝臟中的表達(dá)量較高。作為lncRNA而廣為人知的H19轉(zhuǎn)錄物（印記的母本表達(dá)轉(zhuǎn)錄物），被認(rèn)為H19基因啟動(dòng)子區(qū)甲基化非常可能參與了遼寧絨山羊次級(jí)毛囊的轉(zhuǎn)錄抑制[55]。miR-191、miR-25-3p、SNORD44和SNORD48在懷孕和未懷孕的母牛體內(nèi)均出現(xiàn)了差異表達(dá)[56]，可利用這一特點(diǎn)作為檢測(cè)參考標(biāo)準(zhǔn)。譚婭等[57]通過對(duì)豬心肌與骨骼m(xù)iRNA轉(zhuǎn)錄組的比較分析揭示了二者生理學(xué)特征不同的原因。miRNA因這一特性而成為了獸藥研究領(lǐng)域中最有利的生物標(biāo)志物的候選者[58]。

3 展 望

ncRNA因其功能特性而具有與DNA 同樣重要的地位，但同時(shí)它作為基因表達(dá)過程的中間調(diào)控工具而非遺傳信息本質(zhì)。隨著分子生物技術(shù)的不斷發(fā)展，越來越多的ncRNA被發(fā)現(xiàn)，其功能和結(jié)構(gòu)研究也越來越深入。對(duì)這些ncRNA的研究仍將是不斷地發(fā)現(xiàn)新的ncRNA及新的ncRNA的調(diào)控機(jī)制及作用的過程。ncRNA很可能對(duì)于克隆技術(shù)的成功起著重要的作用，但仍有待研究和證明；ncRNA在畜禽遺傳育種方面表現(xiàn)出了巨大的潛力，但國(guó)內(nèi)外的研究目前都還很少，國(guó)內(nèi)尤為匱乏。因此，參照基因研究過程中的基因文庫(kù)，建立ncRNA 文庫(kù)，可為推進(jìn)ncRNA的研究及實(shí)際生產(chǎn)應(yīng)用提供幫助。