羅藝,張洪德,陳思祖,徐文莉,李康,廖長征
(深圳市龍崗中心醫(yī)院中心實驗室,廣東 深圳 518116)
痛風(fēng)是尿酸鹽結(jié)晶沉積于關(guān)節(jié)及其周圍結(jié)締組織而引起的最常見的炎性關(guān)節(jié)炎[1-4],其根本原因是由于嘌呤代謝紊亂造成血尿酸水平過高或(和)尿酸排泄減少,病變主要發(fā)生在關(guān)節(jié)軟骨、滑膜、骨骺、肌腱、以及血管較稀少的膠原纖維組織和腎臟等部位。流行病學(xué)調(diào)查顯示:痛風(fēng)發(fā)病率急劇升高并呈低齡化趨勢[5]。研究表明,遺傳是原發(fā)性痛風(fēng)發(fā)病的重要因素之一,10%~35%的痛風(fēng)患者具有家族史,且患痛風(fēng)者家族成員中無癥狀高尿酸血癥發(fā)生率約為25%~70%[6]。ABCG2是一種ATP結(jié)合轉(zhuǎn)運蛋白,廣泛分布于具有分泌、排泄功能的組織中,其功能異常可導(dǎo)致尿酸排泄能力下降[7]。亞洲、白種、非洲人群中,ABCG2與高尿酸血癥和痛風(fēng)的最強關(guān)聯(lián)位點均為rs2231142位點,該位點可引起ABCG2蛋白141位谷氨酰胺轉(zhuǎn)變?yōu)橘嚢彼?(Q141K)。高分辨率熔解曲線技術(shù)(high resolution melting,HRM)是一種利用熔解溫度判斷產(chǎn)物序列的技術(shù),借助嵌入式飽和染料對DNA有較強結(jié)合能力和很低抑制作用的特點,可實現(xiàn)對擴增片段序列低至1個堿基改變的高靈敏檢測能力[8]。PCR產(chǎn)物的GC含量、長度、序列以及雜合情況決定了擴增片段熔解溫度及熔解曲線的形狀,現(xiàn)已廣泛用于檢測基因突變與分型的分子診斷、人類多種疾病相關(guān)遺傳多態(tài)性分析等方面。目前,已有文獻報道不同地域人群rs2231142位點單核苷酸多態(tài)性與痛風(fēng)的相關(guān)性,而華南地區(qū)人群尚無文獻報道,因此本文采用HRM技術(shù)分析rs2231142基因位點,研究其與原發(fā)性痛風(fēng)相關(guān)性,為痛風(fēng)的防控與治療提供參考。
1.1 一般資料 痛風(fēng)組426例樣本均選自2016年5月至2016年10月期間就診于自深圳市龍崗中心醫(yī)院門診的男性患者(21~65歲),所有患者均符合美國風(fēng)濕病協(xié)會制定的痛風(fēng)診斷標(biāo)準(zhǔn);對照組200例樣本均選自本院體檢科就診健康男性,排除惡性腫瘤、高尿酸、高脂血、高血壓、痛風(fēng)、糖尿病等疾病。本研究已通過本院倫理學(xué)委員會批準(zhǔn),所有參與本研究患者均知悉本試驗?zāi)康?。測量所有受試者血壓、體重和身高并計算出體重指數(shù)。采集空腹靜脈血,檢測血清尿酸、尿素氮、肌酐、總膽固醇、甘油三酯、血糖等生化指標(biāo)。
1.2 試劑與儀器
1.2.1 核酸提取與純度檢測 全血DNA抽提試劑盒(杭州博日);DNA濃度與純度檢測使用DN-1000(美國 Thermo Scientific)。
1.2.2 生化指標(biāo)檢測 C702全自動生化分析儀(瑞士Roche)
1.2.3 引物合成與PCR擴增 引物由蘇州金唯智生物科技有限公司合成;MeltDoctor HRM Master Mix試劑盒(美國Life Technologies);PCR擴增儀為ViiA7實時熒光定量PCR儀(美國ABI)。
1.3 方法
1.3.1 樣本處理 采集 5ml EDTA抗凝外周靜脈血,取200μl抽提全血基因組DNA(操作步驟嚴(yán)格參照說明書),并測定DNA濃度與純度,保證核酸純度相同的條件下使用TE緩沖液稀釋至相同DNA 濃度(50ng/μl),置 4℃保存?zhèn)溆谩?/p>
1.3.2 引物設(shè)計與 PCR擴增 使用Primer3軟件,根據(jù)rs2231142位點設(shè)計引物(見表1)并合成。使用MeltDoctor HRM Master Mix試劑盒,反應(yīng)體系為:2X MeltDoctor HRM Master Mix 12.5μl,上游引物 0.5μl、下游引物 0.5μl、非標(biāo)記探針 0.5μl、DNA樣本1μl,去離子水補足體系總體積25μl,使用熒光定量PCR儀按照以下反應(yīng)條件擴增:Taq酶熱啟動(95℃,10min);變性(94℃,30s);退火(58℃,30s);延伸(72℃,30s);循環(huán) 35 次,72℃終末延伸5min。在60℃~95℃進行高分辨率熔解曲線分析,溫度每上升1℃采集25次熒光信號。當(dāng)擴增模板上存在堿基突變時,熔解溫度和熔解曲線形狀與野生型的樣本即會產(chǎn)生差別,分別設(shè)置已知型別的DNA模板作為標(biāo)準(zhǔn)對照品,通過將未知樣本HRM圖譜和標(biāo)準(zhǔn)品比對,即可得出樣本基因型,由此可實現(xiàn)對已知位點的單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)和突變進行基因分型。表1所示ABCG2基因rs2231142位點的擴增引物
表1 PCR反應(yīng)引物及非標(biāo)記探針序列
1.4 統(tǒng)計學(xué)處理 數(shù)據(jù)分析使用SPSS 19.0軟件;正態(tài)分布資料用(±s)表示;兩組間數(shù)據(jù)比較采用t檢驗;兩組間基因型和等位基因構(gòu)成比采用χ2檢驗;擬合優(yōu)度χ2檢驗對痛風(fēng)組、對照組SNP位點進行 Hardy-Weinberg 平衡檢驗;P<0.05 表示差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
2.1 rs2231142基因分型檢測結(jié)果 將樣本DNA擴增產(chǎn)物的HRM圖譜與已知基因型的標(biāo)準(zhǔn)品圖譜進行比對,即可知道該樣品的基因型:若某個樣本僅有C等位基因的Tm值,即為CC型;僅含有A等位基因的Tm值,即AA型;若某樣本既含有C等位基因又有A等位基因的Tm值,即為雜合型A/C。
圖1 高分辨率熔解曲線rs2231142基因分型
2.2 rs2231142基因型與痛風(fēng)發(fā)病相關(guān)性分析表2所示為對照組與痛風(fēng)組rs2231142基因型與等位基因分布的對比情況,采用擬合優(yōu)度χ2檢驗顯示病例對照組中SNP位點基因型分布符合Hardy-Weinberg 遺傳平衡定律(P>0.05);對照組與痛風(fēng)組CC、A/C、CC 基 因 型 攜 帶 頻 率 分 別 為 :59.98%、31.02%、9.00%和 30.05%、52.82%、17.14%,對照組與痛風(fēng)組各基因型攜帶頻率差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01);痛風(fēng)組 rs2231142 A 等位基因攜帶頻率為 43.54%,對照組為 24.05%,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01);AA基因攜帶者與A等位基因攜帶者痛風(fēng)對比CC基因攜帶者與C等位基因攜帶者發(fā)病風(fēng)險性分別提高了3.802倍和2.377倍,提示該基因位點與華南地區(qū)人群原發(fā)性痛風(fēng)具有相關(guān)性。
2.3 rs2231142位點與痛風(fēng)相關(guān)生理及生化指標(biāo)關(guān)聯(lián)性 rs2231142基因型與痛風(fēng)相關(guān)生化指標(biāo)進行了單因素方差分析,結(jié)果如表3所示,rs2231142多態(tài)性與收縮壓、尿素氮、肌酐、尿酸等生化指標(biāo)具有相關(guān)性。
高尿酸血癥(Hyperuricemia,HUA)是引起腎臟損害的重要因素之一,與糖、脂代謝紊亂關(guān)系密切,是心血管疾病的獨立危險因素。流行病學(xué)調(diào)查顯示HUA患病率呈逐年上升趨勢,目前我國HUA患者約1.2億,約占總?cè)丝诘?0%。HUA與痛風(fēng)的遺傳模式十分復(fù)雜,是由若干主效基因和多個微效基因共同控制并與環(huán)境相互作用而產(chǎn)生[4,9]。閻勝利[10]等調(diào)查顯示山東沿海地區(qū)40~49歲男性痛風(fēng)患病率最高,尤其南方及沿海經(jīng)濟發(fā)達地區(qū)HUA 患病率可高達 5.0%~23.5%,且呈現(xiàn)年輕化的趨勢,其原因可能與該地區(qū)居民攝入過多高嘌呤的海產(chǎn)品、動物內(nèi)臟、肉類食品以及大量飲用啤酒等因素有一定相關(guān)性。ABCG2大量表達于腎近曲小管刷狀緣膜上,起到排泄尿酸的作用,ABCG2基因Gln141賴氨酸位點基因突變已被證實為病因?qū)W突變。ABCG2基因賴氨酸等位基因編碼的分子能夠使尿酸轉(zhuǎn)運能力下調(diào)約50%[11],導(dǎo)致核苷酸結(jié)合結(jié)構(gòu)域不穩(wěn)定,從而引起蛋白質(zhì)的表達降低[12]。Matsuo等[13]對705名日本痛風(fēng)男性患者及1887名健康對照男性的發(fā)病年齡與基因分型進行分析,結(jié)果顯示ABCG2功能嚴(yán)重失活者的痛風(fēng)發(fā)病年齡較ABCG2功能正常者提前6.5年。多項研究[14-15]顯示rs2231142多態(tài)性位點是一個重要的痛風(fēng)發(fā)病遺傳標(biāo)志。Wang等[16]研究顯示,中國漢族男性ABCG2 rs2231142位點AA基因型攜帶者痛風(fēng)發(fā)病率對比CC基因型痛風(fēng)發(fā)病率顯著增高,表明該位點基因多態(tài)性與中國漢族男性原發(fā)性痛風(fēng)的發(fā)病關(guān)系密切。因此,本研究僅選取男性作為研究對象。
表2 痛風(fēng)組與健康對照組的rs2231142的等位基因和基因型分布例(%)
表3 rs2231142基因型與痛風(fēng)相關(guān)生化指標(biāo)的關(guān)聯(lián)性
本研究選取626例華南地區(qū)漢族人群作為研究對象,結(jié)果顯示ABCG2基因rs2231142位點,痛風(fēng)患者攜帶高風(fēng)險基因型 (AA+A/C)的比率為69.96%, 正常人群僅為 40.02%;rs2231142 基因位點各基因型在正常人和痛風(fēng)患者攜帶頻率差異均具有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.01)。針對發(fā)病風(fēng)險評估發(fā)現(xiàn)AA基因型攜帶者痛風(fēng)發(fā)病風(fēng)險較CC基因攜帶者提高3.802倍,A等位攜帶者發(fā)病風(fēng)險與C等位基因攜帶者相比提高了 2.377倍。ABCG2基因的rs2231142位點多態(tài)性還影響收縮壓、尿素氮、肌酐、尿酸等指標(biāo),此結(jié)果可解釋痛風(fēng)患者為何常合并代謝紊亂、高血壓等疾病,但相關(guān)作用機制還需作深入探討。本文所采用的HRM技術(shù),僅需在反應(yīng)體系中增加飽和熒光染料,不需使用探針即可進行基因分型,該方法實現(xiàn)閉管操作,有效降低污染;同時只需要一種試劑在同一平臺上進行基因分型和突變掃描,因此,該技術(shù)具有操作簡單、成本低廉、耗時少、誤差小、高通量等優(yōu)點,可將其作為痛風(fēng)SNP位點快速篩查方法并推薦廣泛應(yīng)用于臨床。