蔣沁炆 ,俞鳳 ,陳艷慧 ,許秀華 ,方雪瑤 ,肖艷萍 ,曹星衛(wèi) ,鐘橋石 ,胡龍華
(1、南昌市第三醫(yī)院檢驗(yàn)科,江西 南昌 330009;2、南昌大學(xué)第二附屬醫(yī)院檢驗(yàn)科,江西 南昌 330006)
肺炎克雷伯菌是臨床常見(jiàn)病原菌,可引起下呼吸道、泌尿生殖道、血流、傷口及顱內(nèi)等人類(lèi)多部位感染,是醫(yī)院感染監(jiān)控的重要菌株。由于碳青霉烯類(lèi)抗菌藥物的使用,在抗菌藥物的選擇壓力下,耐碳青霉烯類(lèi)肺炎克雷伯菌(CRKP)甚至全耐藥的肺炎克雷伯菌不斷被發(fā)現(xiàn),肺炎克雷伯菌的高分離率及高耐藥性已成為臨床抗感染關(guān)注的重點(diǎn)。據(jù)報(bào)道[1],在耐碳青霉烯類(lèi)類(lèi)腸桿菌菌中,CRKP列居第一。喹諾酮類(lèi)藥物是第一種完全由人工合成的的一類(lèi)廣譜、強(qiáng)效的抗菌藥物,其中氟喹諾酮類(lèi)藥物具有高效、服用方便、血藥濃度高、良好的生物利用度、組織分布廣和潛在毒副作用低等特點(diǎn),已廣泛用于臨床抗感染治療[2]。臨床資料表明,隨著氟喹諾酮類(lèi)抗菌藥物的使用,革蘭陰性桿菌極易對(duì)氟喹諾酮類(lèi)藥物獲得耐藥性,傳統(tǒng)的藥物作用靶位改變和主動(dòng)外排耐藥機(jī)制[3]難于解釋耐藥率的快速上升速度。近年來(lái)發(fā)現(xiàn)的質(zhì)粒介導(dǎo)的耐藥基因qnr編碼的蛋白能夠保護(hù)喹諾酮類(lèi)藥物作用靶位而引起耐藥。革蘭陰性桿菌攜帶qnr基因可能是引起其對(duì)喹諾酮類(lèi)耐藥率快速上升的主要原因。本研究旨在對(duì)本地區(qū)臨床分離的CRKP進(jìn)行qnrA、qnrB、qnrS基因檢測(cè),以了解其存在分布及耐藥情況。
1.1 菌株來(lái)源 收集2016年1月-2017年3月南昌大學(xué)第二附屬醫(yī)院臨床分離的129株碳青霉烯類(lèi)抗生素耐藥(亞胺培南/美洛培南)和喹諾酮類(lèi)耐藥(環(huán)丙沙星/左氧氟沙星)的肺炎克雷伯菌,剔除同一患者相同部位重復(fù)分離株。
1.2 主要儀器和設(shè)備 全自動(dòng)微生物分析儀VITEK 2-Compact及配套鑒定卡(法國(guó)生物梅里埃公司產(chǎn)品);PCR儀 (杭州朗基科學(xué)儀器有限公司產(chǎn)品);二氧化碳培養(yǎng)箱;美國(guó)Thermo Scientific公司超低溫冰箱。PCR試劑、瓊脂糖、DNA Marker均為北京天根生化科技有限公司產(chǎn)品;PCR引物由杭州擎科生物工程有限公司合成。
1.3 菌株鑒定和藥敏試驗(yàn) 采用VITEK 2-Compact全自動(dòng)微生物分析儀對(duì)所有菌株進(jìn)行鑒定,采用GN16革蘭陰性桿菌藥敏試驗(yàn)卡進(jìn)行藥物敏感試驗(yàn),質(zhì)控菌株為肺炎克雷伯菌ATCC700603。藥敏結(jié)果參照當(dāng)年度CLSI文件標(biāo)準(zhǔn)進(jìn)行判讀及結(jié)果解釋。替加環(huán)素藥敏結(jié)果判讀參照美國(guó)食品藥品監(jiān)督局(FDA)標(biāo)準(zhǔn)。藥敏結(jié)果統(tǒng)計(jì)時(shí)中介歸耐藥。
1.4 引物序列 引物由杭州擎科生物工程有限公司合成,qnrA、qnrB、qnrS引物參照文獻(xiàn),具體見(jiàn)表1。
1.5 PCR擴(kuò)增與基因檢測(cè)采用煮沸法提取肺炎克雷伯菌總DNA,對(duì)qnrA、qnrB、qnrS耐藥基因進(jìn)行擴(kuò)增。擴(kuò)增體系一致,即:DNA模板、正向引物(F)、反向引物(R)各 1μl,2×mix12.5μl,用無(wú)菌三蒸水定容至25μl。實(shí)驗(yàn)用引物見(jiàn)表1。反應(yīng)條件:94℃預(yù)變性 5min,94℃ 1min、66℃ 5min(退火溫度各反應(yīng)略 有 不 同 )、72℃ 1min,32 個(gè) 循 環(huán) 后 72℃延 伸4min。5μl PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳后,用凝膠成像系統(tǒng)觀察結(jié)果并記錄,并將目的產(chǎn)物送杭州擎科生物工程有限公司進(jìn)行雙向測(cè)序,測(cè)序結(jié)果經(jīng)BLAST與已知序列比對(duì)以確定其基因型。
表1 PCR引物序列
1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理 采用WHONET5.6進(jìn)行藥敏數(shù)據(jù)分析。
2.1 藥敏試驗(yàn)結(jié)果 129株CRKP臨床分離株中,對(duì)對(duì)喹諾酮類(lèi)藥物中環(huán)丙沙星耐藥率最高,達(dá)94.6%(123/129),其次為左氧氟沙星,耐藥率為93.1%(121/129)。氨基糖苷類(lèi)慶大霉素、阿米卡星、妥布霉素的耐藥率較一致,對(duì)阿米卡星、慶大霉素、妥布霉素的耐藥率分別為60.8%(79/129)、66.2%(86/129)和61.5%(80/129)。對(duì)頭孢菌素類(lèi)抗菌藥物耐藥率均大于95%。氨曲南的耐藥率為97.7%(126/129),耐藥率最低為替加環(huán)素32.8%(41/125)。耐喹諾酮類(lèi)抗菌藥物CRKP對(duì)臨床常用15種抗菌藥物的耐藥情況見(jiàn)圖1。
圖1 耐喹諾酮類(lèi)抗菌藥物CRKP對(duì)臨床常用15種抗菌藥物的耐藥情況
2.2 qnr基因檢測(cè)結(jié)果 129株CRKP檢測(cè)出qnr基因陽(yáng)性 98株,絕大多數(shù)為 qnrS(75.2%,97/129),僅1株為qnrB,未檢出qnrA,見(jiàn)圖2。qnrS基因陽(yáng)性株的標(biāo)本類(lèi)型以痰液為主,占52.6%(51/96),其次為血液和中段尿,為別為19.6%(19/97)和11.3%(11/97),其余來(lái)自膿液、傷口分泌物、膽汁、CVP 導(dǎo)管等。主要分布科室為綜合ICU18.6%(18/97)、急診 ICU15.5%(15/97)、 神經(jīng)外科 14.4%(14/97),其他分布于呼吸內(nèi)科、肝膽外科等病房。
圖2 qnrS基因陽(yáng)性株電泳圖譜,4、5號(hào)為qnrS基因陽(yáng)性株,1、2、3、6、7為qnrS 基因陰性株
1998 年,Matinez-Martinez等[4]首次報(bào)道質(zhì)粒介導(dǎo)的喹諾酮類(lèi)耐藥基因qnr,其編碼的蛋白Qnr屬于五肽重復(fù)家族,可與Ⅱ型拓?fù)洚悩?gòu)酶特異性結(jié)合,導(dǎo)致細(xì)菌對(duì)喹諾酮類(lèi)藥物耐藥。有研究表明,Qnr蛋白可與DNA促旋酶結(jié)合,保護(hù)喹諾酮的作用靶位,不被喹諾酮類(lèi)藥物抑制,從而使細(xì)菌對(duì)喹諾酮發(fā)生低水平耐藥[5]。qnr基因的單獨(dú)存在可使菌株對(duì)喹諾酮藥物的敏感性降低,但可能并未達(dá)到具有臨床意義的喹諾酮耐藥水平或僅僅導(dǎo)致低水平的喹諾酮耐藥,但攜帶qnr基因的菌株在喹諾酮藥物的選擇壓力下容易發(fā)生染色體突變,或者含染色體突變的菌株在適宜的條件下可以捕獲qnr基因,在這兩種情況下菌株同時(shí)具有了質(zhì)粒和染色體介導(dǎo)的喹諾酮耐藥機(jī)制,從而引起高水平喹諾酮耐藥[6]。
我們的研究結(jié)果顯示,129株CRKP耐藥及多重耐藥性非常嚴(yán)重,臨床幾乎無(wú)經(jīng)驗(yàn)抗感染藥物可選,對(duì)臨床常用的15種抗菌藥物耐藥率大于90%有10種,耐藥率最低的為替加環(huán)素(32.6%),對(duì)氨基糖苷類(lèi)慶大霉素、阿米卡星、妥布霉素的耐藥率較一致(60%左右),對(duì)左氧氟沙星和環(huán)丙沙星的耐藥率也極其嚴(yán)重,耐藥率均大于90%,這與戴爾寬[7]、周道平[8]等報(bào)道的結(jié)果類(lèi)似,其對(duì)喹諾酮類(lèi)藥物的耐藥率均大于90%甚至高達(dá)100%。而與杭亞平[2]等在2011-2012年對(duì)江西地區(qū)CRKP臨床分離株中質(zhì)粒介導(dǎo)的喹諾酮類(lèi)耐藥基因檢測(cè)的研究中結(jié)果有所不同,這可能與近年喹諾酮類(lèi)藥物使用較廣泛或CRKP克隆株播散有關(guān)。此次研究中發(fā)現(xiàn),CRKP攜帶質(zhì)粒介導(dǎo)的qnr基因檢出率較高,129株CRKP中有98株攜帶qnr基因,與胡偉[11]等報(bào)道類(lèi)似,qnr基因的檢出率為>50%,而與鄭紅波[12]等結(jié)果不同,其qnr檢測(cè)陽(yáng)性率低。98株攜帶qnr基因菌株中有97株為qnrS,僅1株為qnrB,未發(fā)現(xiàn)qnrA。此結(jié)果與羅勇[9]等報(bào)道類(lèi)似,以qnrS檢出為主,而與黃支密[10]等報(bào)道的結(jié)果不同,其未檢出qnr基因。目前各地都未發(fā)現(xiàn)CRKP中攜帶qnrA基因的相關(guān)報(bào)道,但在碳青霉烯類(lèi)抗菌藥物敏感的肺炎克雷伯菌中發(fā)現(xiàn)有qnrA基因[13-15]。
綜上所述,攜帶質(zhì)粒介導(dǎo)qnr基因是CRKP臨床分離株對(duì)喹諾酮類(lèi)抗菌藥物耐藥的主要原因,質(zhì)粒介導(dǎo)耐藥基因水平傳播及菌株同源性播散可能是CRKP對(duì)喹諾酮類(lèi)抗菌藥物耐藥率快速上升的主要原因。必須強(qiáng)調(diào)的是,臨床抗感染應(yīng)以抗菌藥物敏試驗(yàn)結(jié)果為依據(jù),合理使用抗菌藥物,以降低臨床菌株的選擇壓力,同時(shí)臨床醫(yī)護(hù)工作者應(yīng)加強(qiáng)醫(yī)院感染意識(shí),注意無(wú)菌操作及手衛(wèi)生,加強(qiáng)消毒,防止耐藥菌株的播散。
實(shí)驗(yàn)與檢驗(yàn)醫(yī)學(xué)2018年4期