張 琳, 陳 彥 宏, 王 雪 妍, 解 曉 彤, 李 亞 靜, 金 朝 霞
( 大連工業(yè)大學(xué) 生物工程學(xué)院, 遼寧 大連 116034 )
三七(PanaxnotoginsengF.H.Chen),又名田七,主產(chǎn)于云南文山州,其干燥根和根莖可以入藥,具有很高的藥用價(jià)值[1]。植物內(nèi)生菌對(duì)植物生長(zhǎng)發(fā)育和系統(tǒng)演化發(fā)揮重要作用,如產(chǎn)皂苷、產(chǎn)生激素促進(jìn)植物生長(zhǎng)、抗氧化能力等。何秀麗等[2]發(fā)現(xiàn)重樓的內(nèi)生菌有多種生理活性,如抑制其他微生物活性、抗腫瘤細(xì)胞活性等,部分內(nèi)生菌發(fā)酵液可產(chǎn)生宿主重樓植物中主要活性物質(zhì)甾體皂苷。徐幼平等[3]發(fā)現(xiàn)噴施含IAA的細(xì)菌發(fā)酵液能使玉米和番茄植株內(nèi)源IAA水平上升,促進(jìn)植物生長(zhǎng)。目前有關(guān)植物促生菌報(bào)道較多的是植物根際促生菌(Plant growth promoting rhizobacteria,PGPR),主要具有產(chǎn)鐵元素、解磷、水解酶活性、產(chǎn)IAA、產(chǎn)ACC等能力,而對(duì)于植物內(nèi)生菌方面的研究較少。
前期實(shí)驗(yàn)篩選研究了3種三七內(nèi)生細(xì)菌PN8、PN12、PN15產(chǎn)皂苷的類(lèi)型及含量。本實(shí)驗(yàn)對(duì)這3種內(nèi)生細(xì)菌的促生作用及機(jī)理、內(nèi)生定殖能力等方面進(jìn)行了測(cè)定,并利用16S rDNA序列進(jìn)行分析鑒定。
1.1.1 供試菌株
菌種為實(shí)驗(yàn)室從三七中分離純化的3株內(nèi)生細(xì)菌,在牛肉膏蛋白胨斜面上保存?zhèn)溆谩?/p>
1.1.2 主要試劑
ACC,上海邁瑞爾化學(xué)技術(shù)有限公司;α-丁酮酸,上海麥克林生化技術(shù)有限公司;PCR試劑和DNA marker,大連寶生物工程公司;鉻天青S,上海源葉生物科技有限公司;Salkowski試劑:1 mL 0.5 mol/L FeCl3溶液與50 mL體積分?jǐn)?shù)35%的高氯酸溶液混合;其他試劑均為分析純。
1.1.3 培養(yǎng)基
牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基(NA):蛋白胨10 g/L,牛肉膏5 g/L,NaCl 5 g/L,pH 7.0~7.4。
DF培養(yǎng)基:Na2HPO46.0 g/L,KH2PO44.0 g/L,MgSO4·7H2O 0.2 g/L,葡萄糖2.0 g/L,葡萄糖酸2.0 g/L,檸檬酸2.0 g/L,F(xiàn)eSO4·7H2O 1 mg/L,H3BO310 μg/L,MnSO4·H2O 11.19 μg/L,ZnSO4·7H2O 124.6 μg/L,CuSO4·5H2O 78.22 μg/L,MnO310 μg/L,pH 7.2。
ADF液體培養(yǎng)基:將配制的0.5 mol/L ACC溶液經(jīng)0.2 μm的濾膜抽濾除菌后,加入不含(NH4)2SO4的DF培養(yǎng)基中,終濃度為3.0 mmol/L。
KB液體培養(yǎng)基:甘油 10 mL/L,胰蛋白胨20 g/L,K2HPO41.5 g/L,MgSO4·7H2O 1.5 g/L,pH 7.0。
1.2.1 菌株的ACC脫氨酶活性測(cè)定
ACC脫氨酶活性的測(cè)定按照Magnucka等[4]的方法稍加改進(jìn)。液體培養(yǎng)3種內(nèi)生菌來(lái)制備粗酶液。分別向得到的3種粗酶液中各加入0.5 mol/L ACC進(jìn)行酶解反應(yīng),同時(shí)添加不加ACC的對(duì)照組,在540 nm處測(cè)吸光度。α-丁酮酸標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)的繪制參照李鄭義[5]的方法。ACC脫氨酶酶活性的定義為每毫升粗酶液每小時(shí)產(chǎn)生1 μmol α-丁酮酸為一個(gè)酶活力單位(U/mL)。
1.2.2 菌株產(chǎn)IAA的能力
1.2.2.1 比色法測(cè)定IAA的產(chǎn)量
參照比色法加以改進(jìn),將菌株分別在不含色氨酸與含有200 μg/mL色氨酸的液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)5 d。菌液離心后,取等量上清液與Salkowski試劑混勻,暗反應(yīng)20 min。在530 nm 處測(cè)定吸光度。IAA標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)的繪制參照文獻(xiàn)[6]的方法。
1.2.2.2 高效液相色譜法檢測(cè)IAA產(chǎn)量
將菌株在液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)5 d。未接菌的培養(yǎng)液作為空白對(duì)照。按照文獻(xiàn)[7]方法對(duì)菌株IAA提取、純化后產(chǎn)量進(jìn)行測(cè)定。
測(cè)定條件:流動(dòng)相為體積比1∶1的1%乙酸和甲醇,體積流量0.5 mL/min,檢測(cè)波長(zhǎng)280 nm。
1.2.3 嗜鐵能力測(cè)定
采用CAS檢測(cè)法[8]測(cè)定細(xì)菌的產(chǎn)嗜鐵素能力。將菌株接種于KB培養(yǎng)基中培養(yǎng)7 d,取出后離心,取上清液加入等量的CAS檢測(cè)液,觀察顏色變化,若顏色變?yōu)辄S綠色,表明菌株具產(chǎn)嗜鐵素能力。以培養(yǎng)基作空白對(duì)照。
1.2.4 溶磷能力測(cè)定
采用磷酸鈣平板檢測(cè)法測(cè)定溶磷能力。將菌株接種至NA培養(yǎng)液中培養(yǎng)5 d,觀察培養(yǎng)基情況,若變透明顯示細(xì)菌具有解磷能力,根據(jù)透明圈大小判斷細(xì)菌解磷能力強(qiáng)弱。
1.2.5 水解酶活性測(cè)定
參照文獻(xiàn)[9]的方法,將菌株接種至選擇性培養(yǎng)基,培養(yǎng)5 d后觀察有無(wú)透明圈,記錄大小。
1.2.6 16S rDNA基因序列分析菌種鑒定
參照文獻(xiàn)[10]的方法對(duì)16S rDNA序列擴(kuò)增和分析,提取菌株P(guān)N8、PN12、PN15的總DNA。27F5′-GAGCGGATAACAATTTCACACAGG-3′和1492R 5′-CGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGAC-3′為引物,對(duì)3株菌株的16S rDNA進(jìn)行擴(kuò)增?;厥盏腜CR產(chǎn)物送至生物公司進(jìn)行測(cè)序。將所得的序列與GeneBank數(shù)據(jù)庫(kù)中的核酸序列進(jìn)行BLAST分析比對(duì)。
分別對(duì)3株菌株進(jìn)行ACC脫氨酶活性測(cè)定,結(jié)果如圖1所示,PN8、PN12、PN15的ACC脫氨酶活性分別為4.72、6.79、4.93 U/mL。其中菌株P(guān)N12的ACC脫氨酶活性最高。ACC脫氨酶活力是考評(píng)植物根際和內(nèi)生促生菌促進(jìn)宿主植物生長(zhǎng)能力的重要指標(biāo)之一,對(duì)促進(jìn)植物的生長(zhǎng)發(fā)育及提高植物拮抗各種脅迫起到重要作用。從藥用植物三七中篩選出來(lái)的三株細(xì)菌PN8、PN12、PN15均具有ACC脫氨酶活性,但酶活性有待進(jìn)一步提高。
圖1 3株內(nèi)生菌的ACC脫氨酶活性Fig.1 ACC deaminase activities of three endophytic bacteria
2.2.1 比色法測(cè)定IAA的產(chǎn)量
如圖2所示,菌株P(guān)N8、PN12、PN15在不含色氨酸的培養(yǎng)基中,IAA產(chǎn)量分別為0.99、1.54、2.76 μg/mL,在含200 μg/mL色氨酸的培養(yǎng)基中,IAA產(chǎn)量分別為2.97、6.36、14.50 μg/mL。3種內(nèi)生菌均在色氨酸培養(yǎng)基中IAA的合成量較高,說(shuō)明色氨酸的存在能較明顯地增加菌株對(duì)IAA產(chǎn)量,表明色氨酸是細(xì)菌IAA生物合成途徑的前體物質(zhì)[10]。
2.2.2 高效液相色譜檢測(cè)IAA產(chǎn)量
利用高效液相色譜法進(jìn)一步測(cè)定內(nèi)生細(xì)菌IAA產(chǎn)量,結(jié)果如圖3所示。標(biāo)準(zhǔn)品IAA出峰時(shí)間為15.473 min,菌株P(guān)N8、PN12和PN15的出峰時(shí)間分別為15.520、15.545、15.544 min;峰面積分別為11 819、15 272、30 429 mV·min。表明菌株P(guān)N8、PN12、PN15均可分泌IAA。標(biāo)準(zhǔn)曲線(xiàn)的線(xiàn)性回歸方程為Y=10 998X+425.62,線(xiàn)性相關(guān)系數(shù)為0.999 31。根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)方程進(jìn)行計(jì)算得到菌株P(guān)N8、PN12、PN15分泌IAA的量分別為0.989、1.529、2.750 μg/mL。從實(shí)驗(yàn)結(jié)果可以看出,3株內(nèi)生菌的產(chǎn)量較文獻(xiàn)[7]中報(bào)道的少,可以從IAA的提取處理方法及菌體發(fā)酵實(shí)驗(yàn)條件等方面加以改進(jìn)。
圖2 3株內(nèi)生菌在不同培養(yǎng)基中的IAA產(chǎn)量Fig.2 IAA yields of three endophytic bacteria in different culture
嗜鐵能力、溶磷能力、水解酶活性測(cè)定結(jié)果如圖4所示。根據(jù)CAS檢測(cè)法測(cè)定嗜鐵能力(圖4(A)),菌株P(guān)N8、PN15反應(yīng)后均變?yōu)辄S綠色,說(shuō)明產(chǎn)嗜鐵素;菌株P(guān)N12則沒(méi)有變?yōu)辄S綠色,說(shuō)明不產(chǎn)嗜鐵素。溶解磷酸鈣平板培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)(圖4(B))可以看出,3株內(nèi)生菌都具有溶磷特性,溶磷能力由高到低依次為PN15、PN8、PN12。將菌株分別在蛋白酶、淀粉酶、果膠酶、纖維素酶選擇培養(yǎng)基上培養(yǎng)10 d,觀察透明圈大小,測(cè)定水解能力培養(yǎng)。結(jié)果表明,3株菌都具有淀粉酶水解活性(圖4(C));PN12和PN15具有淀粉酶水解活性,PN15的較高(圖4(D));PN12具有一定的果膠酶水解活性(圖4(E))。統(tǒng)計(jì)結(jié)果如表1所示。
綜上,實(shí)驗(yàn)中篩選獲得的3株三七內(nèi)生細(xì)菌所具有的嗜鐵和溶磷能力,以及多種水解酶特性,對(duì)于內(nèi)生細(xì)菌在植物體中的穿梭定殖和對(duì)宿主植物發(fā)揮促生作用具有一定的意義。
將測(cè)得的菌株P(guān)N8、PN12、PN15的16S rDNA 基因組序列分析在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中進(jìn)行BLAST比對(duì),選取序列相近的模式菌株,用Mega 5.1軟件進(jìn)行多序列比對(duì)并構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),結(jié)果如圖5所示。從圖5可以看出,3株菌株分別與產(chǎn)氣腸桿菌(Enterobacteraerogenes)、普城沙雷菌(Serratiaplymuthica)、嗜麥芽窄食單胞菌(Stenotrophomonasmaltophilia)的同源性最高,遺傳進(jìn)化距離分別與產(chǎn)氣腸桿菌(E.aerogenes)、普城沙雷菌(S.plymuthica)、嗜麥芽窄食單胞菌(S.maltophilia)最近,并在同一分支中,初步鑒定PN8為產(chǎn)氣腸桿菌(E.aerogenes),PN12為普城沙雷菌(S.plymuthica),PN15為嗜麥芽窄食單胞菌(S.maltophilia)。
(a) 標(biāo)準(zhǔn)品
(b) PN8
(c) PN12
(d) PN15
A,嗜鐵能力;B,溶磷能力;C,蛋白酶活性;D,淀粉酶活性;E,果膠酶活性;F,纖維酶活性
表1 3株內(nèi)生菌的嗜鐵能力、溶磷能力、水解酶活力的統(tǒng)計(jì)結(jié)果Tab.1 The statistical result of siderophore production, dissolving phosphate and the activities of hydrolytic enzymes of three endophytic bacteria
本實(shí)驗(yàn)研究的3種三七內(nèi)生細(xì)菌均具有多種促生能力,并且擁有嗜鐵能力、解磷、水解酶活性、產(chǎn)IAA、產(chǎn)ACC等能力,其中菌株P(guān)N12產(chǎn)ACC脫氨酶的能力最強(qiáng),達(dá)6.79 U/mL;同時(shí)也具有產(chǎn)IAA和溶磷能力,具有蛋白酶、淀粉酶、果膠酶和纖維素酶活性。菌株P(guān)N15產(chǎn)IAA的能力最強(qiáng),達(dá)2.75 μg/mL,同時(shí)具有產(chǎn)ACC、嗜鐵和溶磷能力,具有蛋白酶和淀粉酶活性。菌株P(guān)N8產(chǎn)ACC脫氨酶和產(chǎn)IAA的能力較弱,具有溶磷能力和蛋白酶活性。對(duì)3種內(nèi)生細(xì)菌進(jìn)行16S rDNA 序列分析,表明菌株P(guān)N8、PN12分別屬于產(chǎn)氣腸桿菌(E.aerogenes)、普城沙雷菌(S.plymuthica)、嗜麥芽窄食單胞菌(S.maltophilia)。
(a) PN8
(b) PN12
(c) PN15