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        如何利用REDCap實(shí)現(xiàn)重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)的錄入及管理

        2018-07-28 02:38:20李蒙田國(guó)祥賀海蓉耿輝曾憲濤呂軍
        關(guān)鍵詞:腎功肝功血常規(guī)

        李蒙,田國(guó)祥,賀海蓉,耿輝,曾憲濤,呂軍

        作者單位:1 710061 西安,西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院內(nèi)分泌科;2 100700 北京,陸軍總醫(yī)院干四科;3 710061 西安,西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院臨床研究中心;4 710061 西安,西安交通大學(xué)第一附屬醫(yī)院體檢部;5 430071 武漢,武漢大學(xué)中南醫(yī)院循證與轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中心·武漢大學(xué)循證與轉(zhuǎn)化醫(yī)學(xué)中心·武漢大學(xué)第二臨床學(xué)院循證醫(yī)學(xué)與臨床流行病學(xué)教研室

        重復(fù)測(cè)量設(shè)計(jì)在臨床研究中較為常見(jiàn),即在給予一種或多種處理后,在多個(gè)時(shí)間點(diǎn)上從同一個(gè)受試對(duì)象重復(fù)獲得指標(biāo)的觀察值[1];重復(fù)測(cè)量設(shè)計(jì)的目的是探討同一研究對(duì)象在不同時(shí)間點(diǎn)某指標(biāo)的變化情況[2]。對(duì)重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)進(jìn)行合理的管理,能夠使臨床研究數(shù)據(jù)采集過(guò)程順利實(shí)施。基于網(wǎng)絡(luò)的電子數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)REDCap是由美國(guó)國(guó)立衛(wèi)生院(National Institutes of Health,NIH)出資支持,由美國(guó)Vanderbilt大學(xué)研發(fā)的免費(fèi)電子數(shù)據(jù)采集軟件[3]。美國(guó)大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)研究普遍使用,目前全球已有117個(gè)國(guó)家共2659所大學(xué)使用該軟件。

        縱向研究通常涉及到重復(fù)測(cè)量設(shè)計(jì)[4]。REDCap設(shè)計(jì)了縱向模塊以便能夠在特定的時(shí)間段內(nèi)多次捕獲相同的變量。這一模塊在結(jié)構(gòu)上類似于傳統(tǒng)的項(xiàng)目類型,通常會(huì)定義多個(gè)數(shù)據(jù)采集工具,并且在登錄REDCap時(shí)輸入所有數(shù)據(jù)。但是,啟用縱向模塊后,數(shù)據(jù)采集工具將以網(wǎng)格顯示以指明收集某一變量的不同時(shí)間點(diǎn)。臨床試驗(yàn)經(jīng)常使用這個(gè)模塊,所有患者都在明確的時(shí)間段內(nèi)提供同樣的變量數(shù)據(jù)。因此,REDCap系統(tǒng)可通過(guò)縱向模塊輕松實(shí)現(xiàn)重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)的管理。本研究以一篇已經(jīng)發(fā)表的臨床試驗(yàn)文章中的數(shù)據(jù)為例,介紹REDCap實(shí)現(xiàn)重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)的相關(guān)設(shè)置要點(diǎn)及數(shù)據(jù)錄入方法。

        1 材料簡(jiǎn)介

        本研究以Gommoll等2015年發(fā)表的Ⅲ期臨床試驗(yàn)“固定劑量的維拉唑酮治療廣泛焦慮障礙(GAD)的有效性和安全性”[5]為例,介紹REDCap實(shí)現(xiàn)重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)的錄入、設(shè)定方法。該研究的數(shù)據(jù)采集情況(簡(jiǎn)化版)如下:

        (1)篩選期(week -1):HAMA評(píng)分、HDRS17評(píng)分、CGI-S評(píng)分、不良反應(yīng)(AEs)、C-SSRS評(píng)分、物理檢查(心電圖)、實(shí)驗(yàn)室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)。

        (2)基線期(week 0):年齡、性別、種族、體重、BMI、GAD病史(GAD病程、GAD發(fā)病年齡、GAD既往治療、GAD既往治療是否有效)、HAMA評(píng)分、SDS評(píng)分、HDRS17評(píng)分、CGI-S評(píng)分、不良反應(yīng)(AEs)、物理檢查(心電圖)、實(shí)驗(yàn)室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)C-SSRS評(píng)分、CSF-Q評(píng)分。

        (3)試驗(yàn)階段:

        ①week 1:HAMA評(píng)分、CGI-S評(píng)分、CGI-I評(píng)分、C-SSRS評(píng)分、不良反應(yīng)(AEs)、物理檢查(心電圖)、實(shí)驗(yàn)室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)。

        ②week 2:HAMA評(píng)分、SDS評(píng)分、CGI-S評(píng)分、CGI-I評(píng)分、C-SSRS評(píng)分、不良反應(yīng)(AEs)、物理檢查(心電圖)、實(shí)驗(yàn)室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)。

        ③week 3:CGI-S評(píng)分、C-SSRS評(píng)分、不良反應(yīng)(AEs)、物理檢查(心電圖)、實(shí)驗(yàn)室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)。

        ④week 4:HAMA評(píng)分、SDS評(píng)分、CGI-S評(píng)分、CGI-I評(píng)分、C-SSRS評(píng)分、CSF-Q評(píng)分、不良反應(yīng)(AEs)、物理檢查(心電圖)、實(shí)驗(yàn)室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)。

        ⑤week 5:CGI-S評(píng)分、C-SSRS評(píng)分、不良反應(yīng)(AEs)、物理檢查(心電圖)、實(shí)驗(yàn)室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)。

        ⑥week 6:HAMA評(píng)分、SDS評(píng)分、CGI-S評(píng)分、CGI評(píng)分、C-SSRS評(píng)分、不良反應(yīng)(AEs)、物理檢查(心電圖)、實(shí)驗(yàn)室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)。

        ⑦week 7:CGI-S評(píng)分、C-SSRS評(píng)分、不良反應(yīng)(AEs)、物理檢查(心電圖)、實(shí)驗(yàn)室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)。

        ⑧week 8:HAMA評(píng)分、SDS評(píng)分、HDRS17評(píng)分、CGI-S評(píng)分、CGI-I評(píng)分、C-SSRS評(píng)分、CSF-Q評(píng)分、不良反應(yīng)(AEs)、物理檢查(心電圖)、實(shí)驗(yàn)室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)。

        (4)Down-taper期(week 9):C-SSRS評(píng)分、不良反應(yīng)(AEs)、物理檢查(心電圖)、實(shí)驗(yàn)室檢查(肝功、腎功、血常規(guī)、電解質(zhì))、生命體征(呼吸、心率、體溫)。

        2 REDCap實(shí)現(xiàn)重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)的錄入

        使用REDCap錄入重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)前,必須定義時(shí)間點(diǎn)和數(shù)據(jù)采集工具。也可使用REDCap的Schedule模塊為測(cè)量時(shí)間和測(cè)量事件提供日歷提醒。

        2.1 建立數(shù)據(jù)采集工具 在建立數(shù)據(jù)采集工具前,應(yīng)充分研究研究方案。根據(jù)方案中每個(gè)時(shí)間點(diǎn)收集的數(shù)據(jù)情況設(shè)計(jì)數(shù)據(jù)采集工具。每個(gè)量表應(yīng)為單獨(dú)的數(shù)據(jù)采集模塊?;颊呋拘畔?、物理檢查、實(shí)驗(yàn)室檢查、生命體征、不良反應(yīng)應(yīng)為單獨(dú)的數(shù)據(jù)采集模塊。

        數(shù)據(jù)采集工具的設(shè)置參考文獻(xiàn)“如何利用REDCap數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)病例報(bào)告表的設(shè)計(jì)”。具體操作是:在主頁(yè)面上點(diǎn)擊“Design your data collection instrument”下的“Online Designer”。隨后設(shè)計(jì)數(shù)據(jù)采集工具,點(diǎn)擊“Create”創(chuàng)建新的工具(時(shí)間點(diǎn)),點(diǎn)擊“Choose action”可對(duì)工具進(jìn)行重命名、復(fù)制、刪除等。建立好的數(shù)據(jù)采集工具(簡(jiǎn)化版)見(jiàn)圖1。

        圖1 簡(jiǎn)化版數(shù)據(jù)采集工具

        2.2 時(shí)間點(diǎn)和事件的設(shè)置 臨床研究中,往往要在研究方案中指明指標(biāo)測(cè)量的時(shí)間。在REDCap中,時(shí)間點(diǎn)、事件的設(shè)置至關(guān)重要。

        首先在REDCap項(xiàng)目設(shè)置界面的“Main project settings”中,點(diǎn)擊 “Use longitudinal data collection with repeating forms?”前的“Enable”,允許項(xiàng)目使用重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)。此時(shí)會(huì)出現(xiàn)定義事件選項(xiàng)“Define your events and designate instruments for them”,點(diǎn)擊“Define My Events”即可定義事件并設(shè)置事件。此外,在實(shí)際的實(shí)驗(yàn)方案執(zhí)行過(guò)程中,當(dāng)患者納入時(shí),往往要設(shè)定好該患者指標(biāo)測(cè)量的時(shí)間點(diǎn)。點(diǎn)擊“Enable optional modules and customizations”下“Scheduling module(longitudinal only)”前的“Enable”即可設(shè)置事件執(zhí)行的時(shí)間(測(cè)量時(shí)間點(diǎn))(圖2)。

        在事件設(shè)定界面,可根據(jù)實(shí)驗(yàn)方案設(shè)定事件的名稱和執(zhí)行的時(shí)間點(diǎn)(圖3)。其中,“Event”列是自動(dòng)產(chǎn)生,不可編輯?!癉ays Offset”列指每個(gè)事件進(jìn)行的時(shí)間點(diǎn)(即測(cè)量時(shí)間點(diǎn))。“Offset Range”列指時(shí)間點(diǎn)的前后范圍。通常情況下,時(shí)間點(diǎn)范圍的設(shè)置要考慮周末雙休日,因此通常設(shè)置為時(shí)間點(diǎn)的前后2 d,即-2和+2。“Event name”列指事件名稱,可自行定義。在本例中,每周都會(huì)測(cè)量一些指標(biāo),隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn)共8周,開(kāi)始前有患者篩選期和基線數(shù)據(jù)收集期,分別定義為Screening(week -1)和Baseline(week 0)。隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn)結(jié)束后有一周的Down-taper,共11個(gè)事件。本研究重點(diǎn)介紹重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)的錄入設(shè)置,因此我們僅用Arm 1,后續(xù)介紹隨機(jī)對(duì)照試驗(yàn)時(shí)會(huì)詳細(xì)介紹不同的arm的設(shè)定。

        圖2 項(xiàng)目主頁(yè)關(guān)于重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)的設(shè)定

        圖3 事件設(shè)置及時(shí)間點(diǎn)設(shè)定

        2.4 為事件添加變量 當(dāng)事件和數(shù)據(jù)采集工具設(shè)計(jì)好后,可為不同的事件(測(cè)量時(shí)間)添加該時(shí)期需要采集的變量。在定義事件界面,點(diǎn)擊“Designate Instruments for My Events”,將會(huì)出現(xiàn)事件-變量網(wǎng)格,點(diǎn)擊“Begin editing”,即可在不同的事件下根據(jù)需要檢測(cè)的指標(biāo)選擇數(shù)據(jù)采集工具,如圖4所示。點(diǎn)擊“Save”保存設(shè)置。

        2.5 Schedule功能的應(yīng)用 計(jì)劃模塊(The scheduling module)是一個(gè)可選的附加功能,只在縱向項(xiàng)目中可用。計(jì)劃模塊主要用于維護(hù)項(xiàng)目日歷。這一功能將允許用戶根據(jù)“Define My Events”頁(yè)面上定義的事件及其時(shí)間開(kāi)始的天數(shù)和范圍生成時(shí)間表,為用戶提供日歷提醒。 用戶可通過(guò)選擇開(kāi)始日期來(lái)生成時(shí)間表以方便后續(xù)的隨訪計(jì)劃。設(shè)定好的時(shí)間計(jì)劃可在日歷上查看。計(jì)劃生成器可以在納入新的患者時(shí)使用,也可對(duì)已存在的患者進(jìn)行設(shè)置。

        具體操作:點(diǎn)擊主頁(yè)左側(cè)的“Schedule”,根據(jù)實(shí)際情況選擇新納入的患者或已收錄的患者,“Start Date”是指第一個(gè)事件(本文為Screening)開(kāi)始的時(shí)間,可根據(jù)實(shí)際情況選擇。點(diǎn)擊“Generate Schedule”,可創(chuàng)建日歷計(jì)劃(圖5)。

        圖6顯示了患者1的日歷計(jì)劃,從圖中可以看出,生成日歷計(jì)劃后,REDCap會(huì)自動(dòng)將周末的時(shí)間標(biāo)紅,已提醒某一事件的計(jì)劃時(shí)間是節(jié)假日。如果用戶不改變隨訪計(jì)劃,則不必理會(huì)這一提醒。如想改變隨訪時(shí)間,則可對(duì)紅色提醒前方的日期根據(jù)實(shí)際情況修改。修改好后點(diǎn)擊下方的“Create Schedule”即可完成患者1的錄入、隨訪計(jì)劃時(shí)間表。

        時(shí)間表創(chuàng)建好后,打開(kāi)日歷模塊,同樣可看到患者1的錄入、隨訪時(shí)間(圖7)。

        圖6 患者1的日歷計(jì)劃

        2.6 數(shù)據(jù)錄入 數(shù)據(jù)錄入的設(shè)置參考文獻(xiàn)“如何利用REDCap數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)實(shí)現(xiàn)病例報(bào)告表的設(shè)計(jì)”。具體操作是:點(diǎn)擊左側(cè)“Add/Edit Records”,選擇已添加好的患者“Choose an existing Study ID”或添加新的患者“Add new record”,此處我們選擇已在Schedule模塊添加的患者1。此時(shí)會(huì)出現(xiàn)患者1的事件-變量網(wǎng)格(圖8),與圖4一致。錄入某一事件的某個(gè)數(shù)據(jù)時(shí),可點(diǎn)擊此事件下針對(duì)的數(shù)據(jù)采集工具的圓圈。

        例:錄入患者1在“Baseline(week 0)”時(shí)期的“Demogreaphis”數(shù)據(jù)時(shí),點(diǎn)擊上圖“Baseline(week 0)”列、“Demogreaphis”行對(duì)應(yīng)的圓圈。在數(shù)據(jù)錄入界面的上方會(huì)再次提醒患者的編號(hào)、事件、數(shù)據(jù)采集工具(圖9)。數(shù)據(jù)錄入完成后,“Baseline(week 0)”列、“Demogreaphis”行對(duì)應(yīng)的圓圈會(huì)變成不同顏色(紅色表示數(shù)據(jù)錄入未完成,黃色表示數(shù)據(jù)未被驗(yàn)證,綠色表示數(shù)據(jù)錄入已完成)。

        圖7 日歷中患者1的數(shù)據(jù)采集計(jì)劃

        圖8 患者1的事件-變量網(wǎng)格

        3 討論

        醫(yī)學(xué)研究常涉及到重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù),簡(jiǎn)單、快捷、方便的數(shù)據(jù)管理軟件能夠輔助此類研究的順利進(jìn)行[6]。REDCap數(shù)據(jù)采集系統(tǒng)具有數(shù)據(jù)安全、免費(fèi)使用、簡(jiǎn)單易學(xué)、可多用戶多地點(diǎn)同時(shí)輸入及訪問(wèn)、數(shù)據(jù)可直接導(dǎo)出到常用統(tǒng)計(jì)軟件的優(yōu)點(diǎn),已受到醫(yī)學(xué)科研工作者的青睞[7]。其獨(dú)特的縱向研究的模塊能夠?qū)崿F(xiàn)事件-變量網(wǎng)格,顯示不同時(shí)間點(diǎn)的變量采集情況,為重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)的管理提供便利。

        圖9 患者1 的數(shù)據(jù)采集頁(yè)面

        本文主要介紹了REDCap實(shí)現(xiàn)重復(fù)測(cè)量數(shù)據(jù)的管理的具體操作。實(shí)際應(yīng)用中需要注意以下幾個(gè)問(wèn)題:①項(xiàng)目設(shè)置時(shí),應(yīng)點(diǎn)擊Enable optional modules and customizations下Scheduling module (longitudinal only)前的Enable,否則事件設(shè)定時(shí)無(wú)法設(shè)定事件執(zhí)行的時(shí)間;②計(jì)劃模塊(Schedule)是提前設(shè)置好的,在日歷中為某一患者添加提醒時(shí)不會(huì)出現(xiàn)在Schedule里;③為患者創(chuàng)建日歷計(jì)劃時(shí),應(yīng)注意雙休、節(jié)假日的提醒;④項(xiàng)目主頁(yè)中(Project Home)會(huì)出現(xiàn)日歷提醒,項(xiàng)目管理者或者數(shù)據(jù)錄入者可以看到未來(lái)一周需做的工作。

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