潘潔明 張榮意 鄧加艾 譚志瓊
(海南大學(xué)熱帶農(nóng)林學(xué)院,???570228)
耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(Methicillin-resistant Staphylococcus aureus,MRSA)耐藥性強(qiáng),能夠引起致死性感染,危害性十分嚴(yán)重,已經(jīng)成為臨床抗菌感染治療的首要難題,并與乙型肝炎、艾滋病一起被稱為當(dāng)今世界三大感染頑疾,給人類帶來了極大危害[1-2]。自1961年英國Jevons發(fā)現(xiàn)首例耐甲氧西林金黃色葡萄球菌MRSA以來[3],在歐美、亞洲等各地相繼出現(xiàn)MRSA所致的感染,到20世紀(jì)80年代,有關(guān)MRSA的感染幾乎遍及全球,成為臨床上最常見的病原菌之一。MRSA本在醫(yī)院重癥監(jiān)護(hù)室和外科手術(shù)室中泛濫,但據(jù)最近報道,其已從醫(yī)院擴(kuò)散到社區(qū)人群和食用動物之中[4-5]。自Saravolatz等[6]首次報道社區(qū)獲得性耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(Community-acquired methicillinresistant Staphylococcus aureus,CA-MRSA)感染后,CA-MRSA感染病例在全球陸續(xù)被報道,MRSA已嚴(yán)重威脅人類的健康。
MRSA一般具有多重耐藥特征,MRSA感染已引起世界范圍的廣泛關(guān)注,目前治療MRSA感染的抗生素十分有限,僅有萬古霉素和利奈唑胺[7]。但最近的研究結(jié)果表明,新的抗萬古霉素和利奈唑胺的MRSA已經(jīng)出現(xiàn)[8]。因此,面對MRSA耐藥性的日趨嚴(yán)重,尋找和開發(fā)高效抑制MRSA的抗生素顯得相當(dāng)重要[9-10]。放線菌(Actinomycetes)是產(chǎn)生抗生素最多的一類微生物,目前世界上已經(jīng)發(fā)現(xiàn)的抗生素80%是由放線菌產(chǎn)生的[11]。鸚歌嶺位于海南省樂東縣,海拔1 811 m,山高坡陡,交通閉塞,人煙稀少,絕大部分從未有過正規(guī)和大規(guī)模的開發(fā)利用,表現(xiàn)出非常明顯的原始特征,生物多樣性極其豐富[12],目前對放線菌的研究未見報道。其中可能蘊(yùn)藏著抗MRSA的豐富放線菌資源。本研究從鸚歌嶺土壤中分離、篩選抗MRSA的放線菌,并對其進(jìn)行初步鑒定和抗菌活性物質(zhì)研究,目的是從中發(fā)現(xiàn)新的抗MRSA的放線菌及其活性物質(zhì)。
1.1.1 樣品土壤 本實驗所用的土壤采自海南省樂東縣原始熱帶雨林鸚歌嶺。采樣深度為20 cm,土壤表面覆蓋茂盛的喬木(表1)。
1.1.2 供試菌株 MRSA ATCC 9551由海南省藥監(jiān)所提供。
1.1.3 培養(yǎng)基 高氏一號培養(yǎng)基用于分離培養(yǎng)土壤放線菌,牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基用于MRSA的培養(yǎng)和測定,高氏一號液體培養(yǎng)基用于菌株發(fā)酵[13]。
表1 土壤樣品
1.2.1 土壤中拮抗放線菌的分離與篩選 采用平板稀釋法分離各土壤樣本中的放線菌[14]。取濃度為10-3、10-4和10-5的土壤懸浮液200 μL加入至高氏一號培養(yǎng)基(加入70 μg/mL重鉻酸鉀來抑制細(xì)菌和真菌)上,并用無菌的涂布棒涂布均勻,貼好標(biāo)簽,28℃培養(yǎng)7-10 d。待長出放線菌菌落后,挑取不同類型的菌落在高氏一號試管斜面上保存。采用瓊脂塊法篩選抗MRSA的菌株:將斜面上的MRSA用無菌水制成懸浮液,并與45℃牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基充分混勻后倒平板,將高氏1號平板上已經(jīng)培養(yǎng)好的放線菌打菌塊(6 mm),然后挑取至含MRSA培養(yǎng)基上,28℃培養(yǎng)24-48 h,觀察拮抗效果[15-16]。挑取拮抗性好的放線菌進(jìn)行純化,復(fù)篩,保存。
1.2.2 抗MRSA菌株發(fā)酵粗提物的制備 將篩選出的菌株接種到高氏一號固體培養(yǎng)基上,28℃培養(yǎng)8 d,取分生孢子制備孢子懸浮液,采用搖瓶發(fā)酵培養(yǎng)法,將懸浮液接種到裝有100 mL高氏一號液體培養(yǎng)基的錐形瓶(100 mL/250 mL)中,于28℃、200 r/min搖瓶培養(yǎng)7 d,然后用8層滅菌紗布過濾,濾液用乙酸乙酯萃取3次,合并萃取液,菌絲體用70%的乙醇浸泡48 h,減壓濃縮后,用水溶解,再用乙酸乙酯萃取3次,合并萃取液,減壓蒸餾濃縮可得到乙酸乙酯粗提物,用甲醇溶解,4℃冰箱中保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.3 粗提液對MRSA的抑菌作用 采用濾紙片法測定粗提液對MRSA的抑菌活性。將MRSA與牛肉膏蛋白胨培養(yǎng)基混合后倒平板,用移液槍分別吸取5 μL粗提液加到滅菌濾紙片(6 mm)上,將該加樣的濾紙片放置到帶MRSA的平板上,每個平皿3個重復(fù),然后置于28℃培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)24-48 h,觀察拮抗效果,同時用甲醇作對照。
1.2.4 抗MRSA菌株的16S rDNA序列測定及其系統(tǒng)發(fā)育分析 采用OMEGA公司細(xì)菌DNA提取試劑盒(D3350-01)提取菌株基因組DNA[17]。引物序列 如 下 :27f:5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′,1492r:5′-TACGGCTACCTTGTTACGACTT-3′。 擴(kuò) 增反應(yīng)體系總體積為25 μL,其中包括Genomic DNA 1μL,Primer F 1 μL,Primer R 1 μL,PCR-Mixture 12.5 μL,dd H2O 9.5 μL。PCR應(yīng)條件:預(yù)變性,94℃,5 min;變性,94℃,30 s;退火,52℃,30 s;延伸,72℃,1 min;35個循環(huán);終止延伸,72℃,10 min;4℃保存[18]。將PCR測序產(chǎn)物送上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)公司測序,結(jié)果用BLAST軟件比對,查找相似性最高的同源菌株,并利用Mega6.0[19]構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
1.2.5 HPLC指紋圖譜的建立 用安捷倫高效液相色譜儀(Agilent Technologies 1260 Infinity HPLC)檢測分析發(fā)酵液粗提物的指紋圖譜,安捷倫DADG1315D檢測器,色譜柱YMC-packed C 18(5 mm,250 mm× 4.6 mm)。在HPLC上以相同的條件進(jìn)行梯度洗脫(1 mL/min,10%甲醇10 min,10%-100%甲醇,20min,100%甲醇5 min,總時間35 min)。
從10份土壤樣本中共分離到168株放線菌,其中10株具有較強(qiáng)的抗MRSA活性(表2)。由表2可知,放線菌菌塊的抑菌直徑在17-31 mm之間,抗MRSA能力強(qiáng)。根據(jù)《消毒技術(shù)規(guī)范》可知,抑菌效果主要有3個等級,抑菌直徑在20 mm以上為抑菌效果強(qiáng),在10-20 mm為抑菌效果中等,在10 mm以下為抑菌效果弱。由此可見,該10株放線菌中有4株為強(qiáng)抑菌菌株,6株為中等抑菌菌株。
液體發(fā)酵的乙酸乙酯粗提物對MRSA抑菌結(jié)果見表2。菌株7抑菌直徑達(dá)到25 mm,抑菌能力強(qiáng),表明產(chǎn)生了高活性的抗菌物質(zhì);菌株5抑菌直徑為15 mm,抑菌能力僅次于菌株7;菌株8-1、8-4抑菌直徑分別為10 mm和11 mm,抑菌能力中等,而菌株8-3、9-1、4-1、4-2、3-13和3-14抑菌直徑小于10 mm,抑菌能力弱。由此可見,菌株7、菌株5值得進(jìn)一步深入研究。
表2 放線菌對MRSA的抑菌效果
表3 抗MRSA放線菌分離菌株的分子鑒定
獲得10株具有抗MRSA菌株16S rDNA序列均在1 400 bp左右,其在NCBI進(jìn)行BLAST分析,發(fā)現(xiàn)與這10株菌相似率最高的均為鏈霉菌(Streptomyces),均達(dá)到99%(表3),初步判斷這10株放線菌均為鏈霉菌。用Mega 6.0中的N-J法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖1),其中菌株9-1、8-4、8-1和4-2與Streptomyces lunalinharesii strain RCQ 1071T聚在一支,相似率98%;菌株7與Streptomyces yunnanensis strainT聚為一支,相似率84%;菌株8-3和菌株5與Streptomyces aureofaciens strain KACC 20180T聚為一支,相似率96%-99%;菌株3-13、3-14、4-1與Streptomyces lateritius strain LMG 19372T聚為一支,相似率95%。
圖1 10株放線菌16S rDNA序列的系統(tǒng)發(fā)育樹
根據(jù)10株放線菌發(fā)酵液粗提物的HPLC指紋圖譜(圖2)發(fā)現(xiàn),菌株7、菌株5和菌株9-1的主峰出峰時間主要集中在12-27 min,在220-340 nm波長處均有吸收。由圖2可見,發(fā)酵液50%甲醇-水洗脫部分有明顯的次級代物產(chǎn)物峰,顯示3株菌代謝產(chǎn)物均豐富,但是3株菌株的代謝產(chǎn)物有區(qū)別。菌株7在21.6-23.6 min為系列化合物,紫外吸收主要在250 nm左右有強(qiáng)吸收峰;菌株5在23-26 min之間為系列化合物,從紫外吸收圖譜上看,在250 nm,300 nm,440 nm有強(qiáng)吸收峰;菌株9-1在21-26 min有強(qiáng)吸收,從紫外吸收圖譜看,有不同系列的化合物。3株菌株有不同類型的化合物,但3株菌對MRSA均有活性。菌株5的系列化合物最豐富,有可能是抗MRSA的主要成分,有利于構(gòu)效關(guān)系的分析。
海南素有“天然大溫室”的美稱,溫高少寒,蘊(yùn)藏著極其豐富的放線菌資源,至今仍未被充分開發(fā)利用[20]。樣品土壤來源于海南省樂東縣鸚歌嶺,該地處熱帶,氣候適宜,微生物豐富。在海南有關(guān)放線菌的分離來源報道主要有霸王嶺和紅樹林土壤[21-22],而對于鸚歌嶺土壤報道甚少,因此很有可能從這一土壤中得到新的抑菌活性化合物,從而研發(fā)出新型的抗MRSA藥物??姵卸牛?3]從海南文昌紅樹林保護(hù)區(qū)分離到608株真菌,其中7株具有較強(qiáng)的抗MRSA活性;宓偉等[24]發(fā)現(xiàn)黃連、黃柏、大黃、銀柴胡與石榴皮5種中藥具有較高的抗MRSA作用;唐依莉[25]從清瀾港頭苑村紅樹林保護(hù)區(qū)分離到138株內(nèi)生放線菌,其中27株具有抗MRSA活性;高正航[26]從海南省霸王嶺土壤共分離到287株放線菌,得到抗MRSA活性放線菌35株;黃惠琴[27]從海南、湛江和北海沿海地區(qū)采樣分離獲得放線菌395株,43株有抗MRSA活性。
圖2 菌株7、5、9-1的紫外吸收圖譜(從上到下依次為菌株7、5、9-1)
本研究通過平板稀釋法分離獲得放線菌168株,從中篩選到10株具有抗MRSA的活性菌株,并對篩選菌株進(jìn)行16S rDNA序列測定、對比,初步確定該放線菌是鏈霉菌屬;采用濾紙片法和高效液相色譜儀檢測粗提液的活性物質(zhì),發(fā)現(xiàn)10株放線菌對MRSA的生長均有明顯的抑制作用。HPLC指紋圖譜顯示菌株7、菌株5、菌株9-1的次級代謝產(chǎn)物十分豐富,且存在系列化合物,其豐富化合物的生物活性很有研究價值,為探尋新的抗MRSA藥物提供依據(jù)。此外分離到的168株放線菌中,對MRSA有拮抗作用的放線菌就高達(dá)10株,說明鸚歌嶺放線菌資源豐富。其特殊的原始森林環(huán)境可能會賦予其特殊的代謝途徑,進(jìn)而獲得新穎的代謝產(chǎn)物。而且,鸚歌嶺不同海拔高度,不同植被覆蓋情況的土壤可能存在更多尚未發(fā)現(xiàn)和利用的抗MRSA放線菌,值得對其開展系統(tǒng)而全面的研究。下一步研究將對具有抗MRSA活性的放線菌的次級代謝產(chǎn)物進(jìn)行分離純化,尋找結(jié)構(gòu)新穎的生物活性物質(zhì),探尋新的抗生素。
在研究中我們發(fā)現(xiàn)如3-14菌株,其瓊脂塊的抑菌活性很好,可液體發(fā)酵或固體發(fā)酵后,乙酸乙脂粗提物的抑菌活性卻較弱,可能與乙酸乙酯只提取脂溶性活性成分有關(guān)。另外,本研究分離篩選的菌株經(jīng)鑒定為鏈霉菌屬,對MRSA有拮抗作用,但對農(nóng)業(yè)病原菌的作用如何需要進(jìn)一步研究。
從10份鸚歌嶺土壤中分離、篩選到10株具有抗MRSA活性的放線菌,經(jīng)16S rDNA測序比對分析,10株均屬于鏈霉菌屬(Streptomyces)。7號菌抑菌效果最強(qiáng),乙酸乙酯粗提物的抑菌圈直徑高達(dá)25 mm,屬強(qiáng)抑菌,其余9株的抑菌直徑在8-15 mm,對MRSA有一定的抑制作用。HPLC指紋圖譜顯示,菌株7、菌株5、菌株9-1在220-340 nm均有吸收,330 nm上存在最大吸收峰,發(fā)酵液次級代謝產(chǎn)物豐富。
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