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        小貫小綠葉蟬半胱氨酸蛋白酶基因的克隆與表達(dá)

        2018-06-21 03:01:58于永晨肖斌孫曉玲
        茶葉科學(xué) 2018年3期
        關(guān)鍵詞:若蟲(chóng)綠葉半胱氨酸

        于永晨,肖斌,孫曉玲

        1. 西北農(nóng)林科技大學(xué),陜西 楊凌 712100;2. 中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所,浙江 杭州310008;3. 農(nóng)業(yè)部茶樹(shù)生物學(xué)與資源利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,浙江 杭州 310008

        半胱氨酸蛋白酶(Cysteine protease,CYP)廣泛分布于植物、動(dòng)物、病原微生物、寄生線蟲(chóng)和哺乳動(dòng)物等生物體內(nèi),是一類(lèi)以半胱氨酸殘基為活性中心的蛋白水解酶,可參與細(xì)胞內(nèi)外蛋白質(zhì)水解與加工、組織再生、個(gè)體發(fā)育、免疫防御,以及細(xì)胞凋亡等許多生理過(guò)程[1-3]。在植食性昆蟲(chóng)體內(nèi),CYP是不可或缺的重要水解蛋白之一,主要參與食物消化、生長(zhǎng)發(fā)育、生殖、蛻皮變態(tài)、免疫調(diào)節(jié)和種群防御等重要生命過(guò)程,目前在鱗翅目和鞘翅目等完全變態(tài)發(fā)育的昆蟲(chóng)中研究得已較為透徹[4-9]。例如,家蠶(Bombyx mori)中已報(bào)道了 13條 CYP基因全長(zhǎng)序列,它們?cè)诓煌M織和不同發(fā)育時(shí)期的表達(dá)譜也已明確,進(jìn)一步研究還發(fā)現(xiàn)CYP不僅參與了家蠶蛻皮與變態(tài)過(guò)程中的組織降解與重構(gòu),而且也參與了家蠶血細(xì)胞發(fā)育或輔助血細(xì)胞執(zhí)行造血功能等生理過(guò)程[10-14]。Peter等[15]從馬鈴薯甲蟲(chóng)(Leptinotarsa decemlineataSay)中克隆獲得了兩條與消化相關(guān)的 CYP基因全長(zhǎng)序列,并發(fā)現(xiàn)其中一條可被植物的誘導(dǎo)防御上調(diào)。棉鈴蟲(chóng)(Helicoverpa armigeraHübner)CYP不僅參與 5~6齡幼蟲(chóng)的蛻皮過(guò)程,而且參與胚胎發(fā)育過(guò)程中卵黃蛋白的降解[6-7]。迄今,關(guān)于不完全變態(tài)發(fā)育昆蟲(chóng)CYP的研究?jī)H在豆長(zhǎng)管蚜(Acyrthosiphon pisum)等個(gè)別昆蟲(chóng)中有少量報(bào)道[4]。

        小貫小綠葉蟬(Empoasca onukiiMatsuda)的發(fā)育類(lèi)型為不完全變態(tài),以成蟲(chóng)、若蟲(chóng)刺吸茶樹(shù)芽、葉及嫩梢汁液為害,是我國(guó)茶園的頭號(hào)害蟲(chóng)。雌成蟲(chóng)陸續(xù)孕卵和分批產(chǎn)卵的習(xí)性導(dǎo)致其在田間世代重疊嚴(yán)重而難于防治,據(jù)統(tǒng)計(jì),小貫小綠葉蟬大爆發(fā)可引起 30%~50%的茶葉產(chǎn)量損失,為害葉制成茶葉后品質(zhì)嚴(yán)重下降[16]。長(zhǎng)期以來(lái),對(duì)小貫小綠葉蟬的有效防治主要依賴于化學(xué)農(nóng)藥。然而,化學(xué)農(nóng)藥的大量使用導(dǎo)致的環(huán)境污染、農(nóng)藥殘留、害蟲(chóng)抗藥性等問(wèn)題日益凸顯。王念武等[17]和莊家祥等[18]的研究結(jié)果表明,福建福安茶場(chǎng)的小貫小綠葉蟬對(duì)吡蟲(chóng)啉、啶蟲(chóng)脒和聯(lián)苯菊酯的抗性指數(shù)已達(dá)到中抗至高抗的水平。因此,利用新型抗蟲(chóng)分子標(biāo)靶開(kāi)發(fā)小貫小綠葉蟬的調(diào)控劑已成為當(dāng)務(wù)之急。如前所述,CYP在昆蟲(chóng)的整個(gè)生命過(guò)程中發(fā)揮著重要作用,因此干擾半胱氨酸蛋白酶的生理功能,將會(huì)對(duì)目標(biāo)害蟲(chóng)的生理機(jī)能造成嚴(yán)重阻礙,并最終導(dǎo)致死亡。目前,CYP已作為靶蛋白在一些鱗翅目昆蟲(chóng)進(jìn)行了相關(guān)研究[19]。本文從小貫小綠葉蟬的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫(kù)中獲得CYP的基因片段的轉(zhuǎn)錄本序列,利用RACE技術(shù)對(duì)其全長(zhǎng)進(jìn)行克隆,繼而采用熒光定量PCR(qRT-PCR)技術(shù)對(duì)Eocyp在小貫小綠葉蟬的不同發(fā)育時(shí)期、不同組織部位,以及不同溫度和不同光照條件處理后的表達(dá)量變化情況進(jìn)行研究,擬為該基因的利用提供基礎(chǔ)理論依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 供試?yán)ハx(chóng)與樣品采集

        小貫小綠葉蟬成蟲(chóng)捕于中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院茶葉研究所試驗(yàn)茶場(chǎng),并在網(wǎng)籠中用離體茶枝飼喂[(25±2)℃,(70±5)%,14L︰10D]。繁殖一代后用于實(shí)驗(yàn)。不同發(fā)育時(shí)期(5個(gè)不同齡期若蟲(chóng)及雌、雄成蟲(chóng))及不同部位(頭、胸、腹)的樣品在體視顯微鏡(SZ60,奧林巴斯,日本)下進(jìn)行采集。選取 5齡新羽化若蟲(chóng),分別于 4、26、36℃下飼養(yǎng) 1 h,并于26℃下恢復(fù)1 h后采集,作為不同溫度處理的樣品備用。選取 4齡新生若蟲(chóng),分別于不同光照時(shí)間(0L︰24D,14L︰10D,24L︰0D)下飼養(yǎng)2 d后采集,作為不同光照處理的樣品備用。上述樣品均保存于–80℃冰箱中。每個(gè)處理3個(gè)生物學(xué)重復(fù)。

        1.2 總RNA提取與cDNA的合成

        使用 Promega總 RNA提取試劑盒(SV Total RNA Isolation System,Progema)提取總RNA。使用NANODROP 2000c測(cè)定RNA的濃度及質(zhì)量。利用反轉(zhuǎn)錄試劑盒(PrimeScript? RT Master Mix,TaKaRa)反轉(zhuǎn)錄獲得 cDNA 第一鏈。利用 SMARTer?RACE 5′/3′ Kit(TaKaRa)試劑盒進(jìn)行 RACE所用cDNA的合成。

        1.3 Eocyp基因序列全長(zhǎng)克隆

        根據(jù)本實(shí)驗(yàn)室小貫小綠葉蟬轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),得到 1個(gè)小貫小綠葉蟬半胱氨酸蛋白酶基因片段轉(zhuǎn)錄本序列,根據(jù)此序列分別設(shè)計(jì)RACE引物(表1),以RACE所用cDNA為模板進(jìn)行 PCR,反應(yīng)體系為:2×PrimerSTAR Max Premix( TaKaRa, Tokyo, Japan) 20 μL ,10×Universal Primer A Mix(UPM)4 μL,5′或 3′基因特異引物(GSP)1 μL,cDNA模板1 μL,補(bǔ)充ddH2O至40 μL。克隆采用巢式PCR技術(shù),反應(yīng)條件為:94℃變性 30 s,68℃退火30 s,72℃延伸90 s,25個(gè)循環(huán)。之后進(jìn)行PCR產(chǎn)物的純化與回收,并以PMD-19T為載體進(jìn)行連接,成功轉(zhuǎn)化到大腸桿菌后委托南京金斯銳科技有限公司進(jìn)行測(cè)序。將測(cè)序得到的結(jié)果使用 DNAman進(jìn)行序列拼接,獲得全長(zhǎng)后對(duì)其開(kāi)放閱讀框(ORF)設(shè)計(jì)引物(表1),進(jìn)行 PCR重復(fù)上述實(shí)驗(yàn)步驟,驗(yàn)證所獲得的全長(zhǎng)序列。

        1.4 生物信息學(xué)分析

        推導(dǎo)得到的氨基酸序列在 NCBI上進(jìn)行同源比對(duì)(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast);利用ProtParam(http://web.expasy.org/ protparam)進(jìn)行蛋白理化性質(zhì)預(yù)測(cè),利用 ScanProsite(http://prosite.expasy.org/prosite.html)預(yù)測(cè)蛋白功能結(jié)構(gòu)域;利用SignalP(http://www.cbs.dtu.dk/services/SignalP)進(jìn)行信號(hào)肽的預(yù)測(cè);利用DNAman進(jìn)行多序列比對(duì);使用MEGA7軟件,采用鄰接法(Neighbor-Joining,NJ)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(shù),各分支重復(fù)檢驗(yàn)次數(shù)均為1 000。

        1.5 小貫小綠葉蟬Eocyp表達(dá)特征分析

        使用 FastStart Essential DNA Green Master(Roche)試劑盒進(jìn)行熒光定量分析。定量檢測(cè)引物詳見(jiàn)表1,以小貫小綠葉蟬18 S基因?yàn)閮?nèi)參基因。相對(duì)表達(dá)量通過(guò) 2-ΔΔCT法進(jìn)行計(jì)算。利用SPSS 22.0軟件,采用單因素方差分析法對(duì)差異顯著性進(jìn)行分析。

        表1 引物信息Table 1 Information of Primers

        2 結(jié)果與分析

        2.1 Eocyp基因克隆、序列驗(yàn)證及分析

        利用 RACE技術(shù)對(duì)Eocyp(GenBank登錄號(hào):MH036890)的 3′和 5′端進(jìn)行擴(kuò)增,分別得到800 bp和1 600 bp左右(圖1)的特異性條帶,使用DNAman軟件將測(cè)序結(jié)果與轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)進(jìn)行拼接得到長(zhǎng)為 2 144 bp的cDNA序列,根據(jù)拼接序列設(shè)計(jì)引物(表1)擴(kuò)增出1條1 772 bp的片段(圖1)。該片段包含 ORF 1 656 bp(圖2),編碼 551個(gè)氨基酸,具有由24個(gè)氨基酸殘基組成的信號(hào)肽。預(yù)測(cè)其分子式為 C2782H4163N737O835S25;相對(duì)分子量為 62 094.59;理論等電點(diǎn)為 6.02;不穩(wěn)定系數(shù)為 36.10,表明該蛋白狀態(tài)穩(wěn)定;總平均親水系數(shù)為–0.493,表明該蛋白為疏水性蛋白。由MotifScan分析表明,該蛋白具有半胱氨酸蛋白酶基因的催化三聯(lián)體結(jié)構(gòu),即半胱氨酸活性位點(diǎn) Cys357(351~362 QSVCGS CWSFGT),組氨酸活性位點(diǎn) His499(497~507 LDHAVLLVGYG)和天冬酰胺活性位點(diǎn) Asn519(514~533 YWLVKNSW SNYWGNDGYILM),同時(shí)具有GCDGG簇等保守結(jié)構(gòu)域。

        圖1 Eocyp基因RACE克隆及全長(zhǎng)驗(yàn)證Fig. 1 RACE and full-length cDNA clone of Eocyp

        2.2 Eocyp基因進(jìn)化樹(shù)分析

        將Eocyp編碼的氨基酸序列在 GenBank中進(jìn)行檢索,并與其他已登錄的昆蟲(chóng)Cyp序列進(jìn)行比對(duì),通過(guò)MEGA7軟件采用鄰接法構(gòu)建進(jìn)化樹(shù)。結(jié)果表明(圖 3),小貫小綠葉蟬Eocyp與半翅目昆蟲(chóng)茶翅蝽(H. halys)和溫帶臭蟲(chóng)(Cimex lectularius)聚為一支,膜翅目昆蟲(chóng)小蜜蜂(Apis florea),北美大黃蜂(Bombus impatiens)等聚為一支。等翅目昆蟲(chóng)古白蟻(Zootermopsis nevadensis)單獨(dú)聚為一支,而鞘翅目昆蟲(chóng)(Nicrophorus vespilloides)與雙翅目果蠅屬等昆蟲(chóng)聚為一支。

        2.3 Eocyp基因在不同發(fā)育時(shí)期的表達(dá)分析

        Eocyp基因在小貫小綠葉蟬不同發(fā)育時(shí)期的表達(dá)結(jié)果詳見(jiàn)圖4。結(jié)果表明,Eocyp在小貫小綠葉蟬所有發(fā)育時(shí)期均有表達(dá),從若蟲(chóng)到成蟲(chóng)的發(fā)育過(guò)程中,Eocyp的表達(dá)量表現(xiàn)為先升高后降低的趨勢(shì),5齡若蟲(chóng)表達(dá)量顯著高于其他齡期,而 1齡若蟲(chóng)和雄成蟲(chóng)表達(dá)量最低,顯著低于其他若蟲(chóng)生長(zhǎng)階段。由此推測(cè)Eocyp基因可能在小貫小綠葉蟬的若蟲(chóng)發(fā)育階段發(fā)揮作用。

        圖2 小貫小綠葉蟬Eocyp基因的cDNA序列及推導(dǎo)的氨基酸序列Fig. 2 The cDNA and deduced amino acid sequence of Eocyp in E. onukii

        2.4 Eocyp基因在不同部位的表達(dá)分析

        Eocyp在小貫小綠葉蟬雌成蟲(chóng)頭部的表達(dá)量顯著低于胸部和腹部(圖5-A),而Eocyp在雄成蟲(chóng)胸部的表達(dá)量顯著低于頭部和腹部(圖5-B)。

        2.5 光照和溫度對(duì)Eocyp基因表達(dá)量的影響

        不同溫度和不同光照處理對(duì)Eocyp的相對(duì)表達(dá)量都沒(méi)有顯著影響(圖6)。

        3 討論

        圖3 Eocyp系統(tǒng)發(fā)育分析Fig. 3 Phylogenetic analysis of Eocyp

        圖4 Eocyp在小貫小綠葉蟬不同發(fā)育階段的相對(duì)表達(dá)量Fig. 4 Relative expression levels of Eocyp in different developmental stages of E. onukii

        圖5 小貫小綠葉蟬Eocyp不同部位的相對(duì)表達(dá)量Fig. 5 Relative expression levels of Eocyp in different parts of adults of E. onukii

        圖6 小貫小綠葉蟬Eocyp在不同溫度(A)和不同光照(B)條件下的相對(duì)表達(dá)量Fig. 6 Expression levels of Eocyp under different temperatures (A) and different photoperiods (B)

        本研究克隆到 1條小貫小綠葉蟬半胱氨酸蛋白酶基因的全長(zhǎng)序列,命名為Eocyp,由該基因編碼的蛋白具有半胱氨酸蛋白酶基因的催化三聯(lián)體結(jié)構(gòu)和 GCDGG簇等保守結(jié)構(gòu)域(圖 2)。將由該基因編碼的氨基酸序列與已報(bào)道的其他昆蟲(chóng)半胱氨酸蛋白酶的蛋白進(jìn)行同源性比對(duì)分析,我們發(fā)現(xiàn)Eocyp與同為半翅目的茶翅蝽(Halyomorpha halys)(GenBank登錄號(hào):XP_014283673.1)半胱氨酸蛋白酶1同源性最高為65%;與麥莖蜂(Cephus cinctus)(XP_015586901.1)、內(nèi)華達(dá)古白蟻(Zootermopsis nevadensis)(XP_021934297.1)及造紙胡蜂(Polistes dominula)(XP_015182850.1)中的 CYP同源率分別為63%、63%和61%,該結(jié)果進(jìn)一步證明我們克隆獲得的Eocyp為半胱氨酸蛋白酶基因。

        Eocyp在小貫小綠葉蟬的整個(gè)發(fā)育過(guò)程中均有表達(dá),且Eocyp在不同發(fā)育時(shí)期轉(zhuǎn)錄水平上的表達(dá)量存在一定差異,暗示Eocyp在葉蟬的不同發(fā)育階段可能發(fā)揮著不同的作用,這一現(xiàn)象在其他昆蟲(chóng)中已見(jiàn)報(bào)道。例如,甘藍(lán)地種蠅(Delia radicum)的半胱氨酸蛋白酶DrCP1在幼蟲(chóng)向蛹轉(zhuǎn)化時(shí)期的表達(dá)量顯著升高,說(shuō)明該基因可能與幼蟲(chóng)變態(tài)化蛹有關(guān)[7]。有研究發(fā)現(xiàn)橘小實(shí)蠅Bdcyp在不同發(fā)育階段皆有表達(dá),但是主要集中在蛹期,由此推測(cè)Bdcyp在其變態(tài)發(fā)育過(guò)程中可能具有重要作用[20]。與之相似,本研究發(fā)現(xiàn)Eocyp的表達(dá)量由 1齡若蟲(chóng)發(fā)育到 5齡若蟲(chóng)的過(guò)程中逐步升高,這說(shuō)明Eocyp對(duì)小貫小綠葉蟬若蟲(chóng)的生長(zhǎng)發(fā)育具有重要作用;Eocyp在5齡若蟲(chóng)期的表達(dá)量顯著高于雌、雄成蟲(chóng)的現(xiàn)象,說(shuō)明該基因在小貫小綠葉蟬由若蟲(chóng)向成蟲(chóng)發(fā)育轉(zhuǎn)變的過(guò)程中亦具有重要作用。Eocyp在成蟲(chóng)頭部的表達(dá)量顯著低于胸部和腹部,而Eocyp在雄成蟲(chóng)胸部的表達(dá)量顯著低于頭部和腹部,這說(shuō)明該基因可能在小貫小綠葉蟬不同雌、雄成蟲(chóng)中具有相似且不同的功能。這與花絨寄甲(Dastarcus helophoroidesFairmaire)中發(fā)現(xiàn)的現(xiàn)象基本一致[21],但是Dahel caspase-1還被發(fā)現(xiàn)與老細(xì)胞凋亡和新細(xì)胞形成及成蟲(chóng)衰老相關(guān),Eocyp是否具有上述功能還需進(jìn)一步研究。但是,光照及溫度變化不影響Eocyp的相對(duì)表達(dá)量。需要說(shuō)明的是,本文僅從轉(zhuǎn)錄水平上對(duì)Eocyp在小貫小綠葉蟬不同發(fā)育階段、不同組織部位,以及不同非生物脅迫處理下的表達(dá)量進(jìn)行分析,并在此基礎(chǔ)上進(jìn)行功能推測(cè),但是該基因到底具有何種生物學(xué)功能尚需利用 RNAi技術(shù)進(jìn)行深入研究。

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