劉進生 黃良祥 李建黨 吳健生 夏浩沄
miRNAs可能參與細胞發(fā)育、增殖、分化及腫瘤發(fā)生等多種生理病理過程[1-3],被認(rèn)為是結(jié)腸癌耐藥的重要調(diào)節(jié)分子[4]。核因子NF-E2相關(guān)因子2(NF-E2-related factor 2,Nrf2)蛋白是一種亮氨酸拉鏈(leucine zipper,bZIP)蛋白,其高表達與腫瘤細胞耐藥性有密切聯(lián)系[5-8]。前期工作中,我們采用miRNA靶標(biāo)預(yù)測數(shù)據(jù)庫等預(yù)測并篩選以Nrf2為靶標(biāo)的miRNA,認(rèn)為miR-140-5p極可能靶向Nrf2而發(fā)揮其生物學(xué)功能。miR-140p-5p被報道與非小細胞肺癌、食管鱗癌等腫瘤發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)[9-10]。本研究探討miR-140-5p在結(jié)腸癌細胞5-FU耐藥中的調(diào)控作用及Nrf2基因參與此過程的可能作用機制。
人結(jié)腸癌細胞株SW480購于中國科學(xué)院上海細胞庫。5-FU購于美國Sigmal公司;miR-140-5p的mimic、INH及其分別對照vector、NC均購于廣州市銳博生物科技有限公司;兔抗Nrf2多克隆抗體、鼠抗β-actin多克隆抗體、二抗羊抗兔IgG、二抗兔抗鼠IgG購于美國Cell Signaling Technology公司;雙熒光素酶報告分析試劑盒購于美國Promega公司。倒置顯微鏡系統(tǒng)購于德國Leica公司;7500Fast實時熒光定量PCR儀購于美國ABI公司;化學(xué)發(fā)光顯影儀購于美國GE公司。
1.2.1 細胞培養(yǎng)與結(jié)腸癌SW480/5-FU耐藥細胞模型的構(gòu)建 SW480/5-FU、SW480細胞培養(yǎng)于含10%FBS RPMI 1640完全培養(yǎng)基,置于37℃、5%CO2細胞培養(yǎng)箱。待細胞長至對數(shù)增長期,0.25%胰酶消化,重懸計數(shù)細胞,以0.8×105/mL細胞密度接種于96孔板中,待細胞長至匯合度為30%~40%時予不同濃度(1μmol/L、10μmol/L、50μmol/L、100μmol/L、500 μmol/L、5 000 μmol/L、10 000 μmol/L)5-FU 干預(yù) 48 h,每孔加入10 μL CCK-8,孵育2 h,采用酶標(biāo)儀于450 nm處檢測吸光度值。GraphPad軟件計算IC50,并計算耐藥指數(shù)(resistance index,RI),RI=IC50(SW480/SW480-5-FU)/IC50(SW480)。SW480/5-FU耐藥細胞模型的構(gòu)建方法參考文獻[11]。
1.2.2 質(zhì)粒構(gòu)建 將WT-Nrf2-3'UTR片段和Mut-Nrf2-3'UTR片段克隆至熒光素酶報告載體(pGL4.22-luc2CP/Puro),合成WT-Nrf2-3'UTR熒光素酶報告質(zhì)粒和Mut-Nrf2-3'UTR熒光素酶報告質(zhì)粒。將WT-Nrf2片段和Mut-Nrf2片段克隆至pcDNA3.1質(zhì)粒,構(gòu)建WT-Nrf2質(zhì)粒和Mut-Nrf2質(zhì)粒。上述質(zhì)粒均通過一代測序驗證后進行大抽,用于后續(xù)實驗。
1.2.3 細胞轉(zhuǎn)染 SW480/5-FU、SW480細胞以4×105/mL細胞密度接種到6孔板,待細胞長至匯合度達70%~80%時轉(zhuǎn)染。CCK-8、細胞集落形成實驗檢測細胞5-FU耐藥性實驗和qRT-PCR、Westernblot中,將SW480/5-FU細胞分為2組,分別轉(zhuǎn)染25 pmol miR-140-5p mimic(mimic)和 25 pmol mimic 的模擬物 miR-140-5p vector(vector);將SW480細胞分為2組,分別轉(zhuǎn)染25 pmol miR-140-5p inhibitor(INH)和 25 pmol INH 的模擬物miR-140-5p NC(NC)。在熒光素酶報告基因檢測實驗中,將SW480/5-FU細胞分為4組,分別轉(zhuǎn)染25pmol mimic+20 ng WT-Nrf2-3'UTR質(zhì)粒、25 pmol vector+20 ng WT-Nrf2-3'UTR質(zhì)粒、25 pmol mimic+20 ng Mut-Nrf2-3'UTR質(zhì)粒、25 pmol vector+20 ng Mut-Nrf2-3'UTR質(zhì)粒;將SW480細胞分為4組,分別轉(zhuǎn)染25 pmol INH+20 ng WT-Nrf2-3'UTR質(zhì)粒、25 pmol NC+20 ng WT-Nrf-3'UTR質(zhì)粒、25 pmol INH+20 ng Mut-Nrf2-3'UTR質(zhì)粒、25 pmol NC+20 ng Mut-Nrf2-3'UTR質(zhì)粒;以表達海腎熒光素酶的質(zhì)粒作為內(nèi)參照,轉(zhuǎn)染48 h后檢測。CCK-8和細胞集落形成實驗檢測Nrf2對miR-140-5p調(diào)控SW480/5-FU細胞5-FU敏感性實驗中,將SW480/5-FU細胞分為4組,分別轉(zhuǎn)染25 pmol mimic+20 ng WT-Nrf2質(zhì)粒、25 pmol vector+20 ng WTNrf2質(zhì)粒、25 pmol mimic+20 ng Mut-Nrf2質(zhì)粒、25 pmol vector+20 ng Mut-Nrf2質(zhì)粒;將SW480細胞分為4組,分別轉(zhuǎn)染25 pmol INH+20 ng WT-Nrf2質(zhì)粒、25 pmol NC+20 ng WT-Nrf2質(zhì)粒、25 pmol INH+20 ng Mut-Nrf2質(zhì)粒、25 pmol NC+20 ng Mut-Nrf2質(zhì)粒;以表達海腎熒光素酶的質(zhì)粒作為內(nèi)參照。
1.2.4 CCK-8法檢測細胞活力 細胞接種于96孔板干預(yù)后,每孔加入10 μL CCK-8溶液,繼續(xù)培養(yǎng)2 h,用酶標(biāo)儀在450 nm波長處檢測各孔吸光度值,并計算各組細胞活力。
1.2.5 細胞集落形成實驗 將上述干預(yù)后的細胞消化,按照500個細胞/孔重新接種于12孔板中,置于細胞培養(yǎng)箱中培養(yǎng),隔天換液,待細胞長至肉眼看見集落,棄上清液,PBS清洗,4%多聚甲醛固定細胞20 min,結(jié)晶紫染色液染色15 min,PBS清洗后拍照并觀察集落形成情況。
1.2.6 qRT-PCR法檢測相關(guān)基因的表達水平 將上述干預(yù)后的細胞裂解并抽提miRNA,抽提總RNA,紫外線分光光度儀測定RNA的濃度和純度。miR-140-5p表達檢測參考試劑盒說明說書進行操作,以U6作為內(nèi)參,miR-140-5p的逆轉(zhuǎn)錄引物序列:5'-GTCGTATCCAGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACTGGATACGACCTACCATA-3',上游引物序列:5'-GAGTGTCAGTGGTTTTACCCT-3',下游引物序列:5'-GCAGGGTCCGAGGTATTC-3';取 2 μg RNA 逆轉(zhuǎn)錄成 cDNA,按照每20 μL PCR反應(yīng)體系中含有2 μg cDNA進行PCR反應(yīng),條件:95 ℃ 10 s,60 ℃ 20 s,循環(huán) 40次;72 ℃60 s。Nrf2表達檢測:以GAPDH為內(nèi)參,Nrf2上游引物序列:5'-CTTGGCCTGAGTGATTCTGAAGTG-3',下游引物序列:5'-CCGAGATGGTGACAAGGGTTGTA-3';取1 μg RNA逆轉(zhuǎn)錄成cDNA,PCR反應(yīng)體系同上,條件:95 ℃ 10 min;95 ℃ 5 s,60 ℃ 30 s,循環(huán) 40 次;72℃ 60 s。收集各孔循環(huán)閾值(Ct值)。所得的結(jié)果按照2-ΔΔCt相對定量法計算目的基因的相對表達量。每個樣品設(shè)置3個復(fù)孔,3次實驗取均值。
1.2.7 Western blot法檢測相關(guān)蛋白的表達水平 裂解細胞,獲取細胞總蛋白,BCA法檢測蛋白濃度,取30 μg樣品調(diào)整統(tǒng)一上樣體積。用10%SDS-PAGE凝膠電泳分離蛋白樣品并轉(zhuǎn)印至PVDF膜上,電泳條件:80 V 30 min,120 V 1.5 h;轉(zhuǎn)膜條件:90 V 1.5 h。TBST(含吐溫的Tris-HCL緩沖液)洗滌后5% 脫脂牛奶室溫封閉1 h,再次TBST洗滌;兔抗小鼠Nrf2多克隆抗體(1:1 000)4℃孵育過夜。TBST洗滌后用羊抗兔IgG二抗(1:1 000)室溫孵育1 h,電化學(xué)發(fā)光顯影液將膜孵勻,熒光成像系統(tǒng)進行化學(xué)發(fā)光成像,保存圖片數(shù)據(jù)。
1.2.8 預(yù)測并篩選可能以Nrf2為靶標(biāo)的miRNA 通過NCBI數(shù)據(jù)庫搜尋Nrf2轉(zhuǎn)錄本3'UTR序列,采用miRNA靶標(biāo)預(yù)測數(shù)據(jù)庫 TargetScan(http://www.targetscan.org/)、PicTar(http://pictar.mdc-berlin.de/cgibin/PicTar_vertebrate.cgi)和 microRNA.org(http://www.microrna.org/microrna/home.do)預(yù)測Nrf2 3'UTR可能的miRNA和結(jié)合位點。通過PubMed檢索上述數(shù)據(jù)庫預(yù)測出的有關(guān)miRNA在腫瘤發(fā)生發(fā)展中的研究,確定本研究感興趣的靶基因。
1.2.9 熒光素酶報告基因檢測 參照說明書操作。裂解細胞20 min,移出10 μL于96孔熒光檢測板內(nèi),加入35 μL LARII工作液迅速混勻,于多功能酶標(biāo)儀中讀取螢火蟲螢光素酶激發(fā)熒光強度F值;取出檢測板加入35 μL Stop&Glo工作液混勻,讀取海腎螢光素酶激發(fā)熒光強度R值。根據(jù)公式計算相對熒光素酶活性:相對熒光酶活性=F值/R值。
采用SPSS 17.0軟件進行統(tǒng)計分析。多組數(shù)據(jù)間比較使用單因素方差分析,兩組數(shù)據(jù)之間比較采用獨立樣本t檢驗。以P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
細胞的5-FU耐藥性驗證結(jié)果顯示,5-FU能明顯抑制 SW480細胞活力,其 IC50為 45.8 μmol/L;與SW480相比,SW480/5-FU對5-FU的敏感性顯著降低,在100 μmol/L濃度以內(nèi)的5-FU干預(yù)下,SW480/5-FU細胞活力無明顯影響,其IC50為499.3 μmol/L(圖1)。基于上述結(jié)果計算,SW480/5-FU的耐藥指數(shù)為 10.9(RI>1.5),說明本實驗所構(gòu)建的 SW480/5-FU細胞模型具有較高的耐藥性。
圖1 CCK-8法檢測5-FU對SW480細胞、SW480/5-FU細胞5-FU敏感性的影響
qRT-PCR結(jié)果顯示,SW480/5-FU細胞中miR-140-5p表達水平為SW480細胞的0.7倍(P<0.05)。提示miR-140-5p表達水平可能與結(jié)腸癌5-FU耐藥有關(guān)。
CCK-8檢測結(jié)果顯示,與轉(zhuǎn)染miR-140-5p vector的對照組比較,轉(zhuǎn)染miR-140-5p mimic可降低不同濃度5-FU干預(yù)48 h后SW480/5-FU的細胞活力,并明顯抑制300 μmol/L 5-FU干預(yù)下SW480/5-FU細胞的增殖能力(圖2A)。在SW480細胞中,與轉(zhuǎn)染miR-140-5p NC的對照組相比,轉(zhuǎn)染miR-140-5p INH能增加SW480細胞不同濃度5-FU干預(yù)48 h后的細胞活力(圖2B)。此外,細胞集落實驗結(jié)果發(fā)現(xiàn),與轉(zhuǎn)染miR-140-5p vector的對照組相比,轉(zhuǎn)染miR-140-5p mimic能減少SW480/5-FU細胞的集落形成能力(P<0.05)(圖2C)。
圖2 CCK-8法檢測過表達miR-140-5p對SW480/5-FU細胞、SW480細胞5-FU敏感性的影響
通過對公共數(shù)據(jù)庫進行挖掘,推測miR-140-5p能結(jié)合于Nrf2的3'UTR(WT-3'UTR)第347-354個堿基對,提示Nrf2可能是miR-140-5p的靶基因(圖3A)。實驗結(jié)果表明,在SW480/5-FU細胞中,與轉(zhuǎn)染miR-140-5p vector的對照組比較,轉(zhuǎn)染miR-140-5p mimic能顯著抑制Nrf2的 mRNA及蛋白的表達(P<0.05,圖3B);在SW480細胞中,與轉(zhuǎn)染miR-140-5p NC的對照組相比,轉(zhuǎn)染miR-140-5p INH能上調(diào)Nrf2 mRNA及蛋白的表達水平(P<0.05,圖3C)。進一步將Nrf2的3'UTR與miR-140-5p結(jié)合的位點設(shè)計突變(Mut-3'UTR),使其失去與miR-140-5p結(jié)合的能力(圖3 A),并構(gòu)建了帶有野生型Nrf2 3'UTR的WT-Nrf2-3'UTR熒光素酶報告質(zhì)粒(WT-Nrf-3'UTR質(zhì)粒)和帶有Nrf2 3'UTR突變的Mut-Nrf2-3'UTR熒光素酶報告質(zhì)粒(Mut-Nrf-3'UTR質(zhì)粒),用于熒光素酶報告基因檢測。檢測結(jié)果顯示,在SW480/5-FU細胞中,與共轉(zhuǎn)染miR-140-5p vector的對照組相比,共轉(zhuǎn)染miR-140-5p mimic能顯著下調(diào)WT-Nrf2-3'UTR的相對熒光素酶活性(P<0.05),而對Mut-Nrf2-3'UTR的熒光素酶活性無明顯影響(P>0.05,圖 3D);在 SW480細胞中,與共轉(zhuǎn)染miR-140-5p NC的對照組相比,共轉(zhuǎn)染miR-140-5p INH能顯著下調(diào)WT-Nrf2-3'UTR的相對熒光素酶活性(P<0.05),而對Mut-Nrf2-3'UTR的熒光素酶活性無明顯影響(P>0.05,圖3E)。以上結(jié)果共同說明,miR-140-5p可通過與Nrf2的3'UTR結(jié)合,下調(diào)Nrf2表達。
圖3 miR-140-5p與Nrf2的關(guān)系
與共轉(zhuǎn)染vector和WT-Nrf2相比,SW480/5-FU細胞共轉(zhuǎn)染mimic和WT-Nrf2的細胞增殖能力明顯下降(P<0.05),提示 miR-140-5p能抑制 Nrf2過表達所導(dǎo)致的SW480/5-FU細胞對5-FU較強的耐藥性(圖4A)。細胞集落形成實驗結(jié)果表明,過表達WT-Nrf2使SW480/5-FU細胞的集落形成能力明顯增強,且能逆轉(zhuǎn)miR-140-5p mimic干預(yù)下SW480-5FU細胞的5-FU敏感性(圖4B)。
圖4 miR-140-5p通過調(diào)控Nrf2影響SW480/5-FU細胞的5-FU敏感性
耐藥一直是結(jié)直腸癌臨床治療面臨的棘手問題,從miRNAs中尋求其耐藥靶點成為目前結(jié)直腸癌耐藥性研究的熱點。我們前期研究通過公共數(shù)據(jù)庫的數(shù)據(jù)挖掘,推測miR-140-5p可能與腫瘤耐藥性相關(guān)基因Nrf2結(jié)合,可能參與腫瘤耐藥調(diào)控機制。為進一步探究miR-140-5p在結(jié)腸癌耐藥研究中的潛在價值,本研究通過構(gòu)建人結(jié)腸癌細胞株SW480的5-FU穩(wěn)定耐藥細胞株SW480/5-FU,并驗證了miR-140-5p在耐藥細胞SW480/5-FU中高表達,提示miR-140-5p可能參與調(diào)控結(jié)腸癌5-FU耐藥。本研究還發(fā)現(xiàn)miR-140-5p能顯著增加耐藥細胞株SW480/5-FU對5-FU的敏感性,提示miR-140-5p可能在抑制細胞對5-FU的耐藥中有重要作用。
miR-140-5p已被證實與結(jié)直腸癌生長、侵襲及預(yù)后有關(guān)[12-14]。以往研究更多將Nrf2視為細胞氧化應(yīng)激反應(yīng)過程中的關(guān)鍵因子,可通過調(diào)控抗氧化相關(guān)蛋白,抑制損傷和炎癥中氧化應(yīng)激損傷發(fā)生[15]。近年研究發(fā)現(xiàn),Nrf2基因激活可能促進新的癌變發(fā)生,且Nrf2能通過調(diào)節(jié)腫瘤微環(huán)境調(diào)控腫瘤對化療藥物的耐藥性[5-6,15]。因此,抑制腫瘤細胞中 Nrf2的表達是克服腫瘤細胞耐藥的重要策略。為進一步分析miR-140-5p對結(jié)腸癌細胞5-FU耐藥性的調(diào)控是否與其結(jié)合Nrf2的互作作用有關(guān),本研究首先通過雙熒光素酶報告基因和Western blot實驗進行驗證,結(jié)果發(fā)現(xiàn)miR-140-5p可與Nrf2結(jié)合,并抑制耐藥基因Nrf2表達;進一步探究miR-140-5p調(diào)控結(jié)腸癌細胞耐藥性與miR-140-5p結(jié)合并抑制Nrf2之間的相關(guān)性,發(fā)現(xiàn)Nrf2可影響miR-140-5p對SW480/5-FU細胞的5-FU敏感性,即miR-140-5p能通過調(diào)控Nrf2表達影響SW480/5-FU細胞對5-FU的敏感性,進一步研究miR-140-5p靶向抑制Nrf2功能而在結(jié)腸癌細胞耐藥性中的作用提供依據(jù),有關(guān)方面值得深入探討。
綜上,本研究發(fā)現(xiàn)miR-140-5p可通過靶向抑制Nrf2表達而降低結(jié)腸癌細胞對5-FU的耐藥性,為防治結(jié)直腸癌耐藥提供了新方向,miR-140-5p有望成為逆轉(zhuǎn)結(jié)直腸癌耐藥的靶點。
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