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        IL-12B基因多態(tài)性及單倍型與克羅恩病的關系研究

        2018-06-14 02:59:54郭茂東王群英陳燕萍滕衛(wèi)軍馬擁軍楊小云韋煒丁進
        浙江醫(yī)學 2018年9期
        關鍵詞:研究

        郭茂東 王群英 陳燕萍 滕衛(wèi)軍 馬擁軍 楊小云 韋煒 丁進

        克羅恩病(Crohn′s disease,CD)是一種累及全消化道的慢性非特異性腸道炎癥性疾病,病因至今未明。遺傳免疫學因素在其發(fā)病中的作用一直備受關注[1]。以Th1細胞亞群異常極化為特點的細胞免疫應答失衡已被證實是CD的重要發(fā)病機制之一[2]。IL-12可促進原始T淋巴細胞向Th1細胞分化,并誘導Th1細胞分泌干擾素γ、TNF-α等炎癥因子,在調(diào)節(jié)細胞免疫反應中起重要作用[3]。研究發(fā)現(xiàn),CD患者腸黏膜IL-12 mRNA表達上調(diào)[4]。同時,動物實驗表明給予外源性IL-12不僅會使小鼠結(jié)腸炎癥加重,且更易發(fā)生爆發(fā)性結(jié)腸炎,甚至死亡[5],而采用特異性抗體封閉IL-12則能明顯減輕小鼠結(jié)腸炎癥癥狀[6]。這些研究表明,IL-12可能在CD的發(fā)生、發(fā)展中起關鍵作用。IL-12由p40和p35 2個亞基組成,其中p40亞基的表達只局限于巨噬細胞、單核細胞、樹突狀細胞,對IL-12的表達水平具有決定性作用[7]。IL-12 p40表達受其IL-12B遺傳多態(tài)性影響[8]。目前,日本及部分高加索人群的研究證實IL-12B基因多態(tài)性與CD易感性相關[9-10],我國漢族人群CD與IL-12B基因多態(tài)性的相關性報道少見。一項關于亞洲人群的研究表明rs3212227和rs6887695是IL-12B的2個常見功能性單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點[11]。本研究探討這2個SNP位點與CD易感性的關系,旨在為進一步闡明CD的遺傳免疫學發(fā)病機制提供理論參考,現(xiàn)報道如下。

        1 對象和方法

        1.1 對象 選取2013年1月至2017年12月金華市中心醫(yī)院、金華市人民醫(yī)院消化內(nèi)科收治的CD患者94例(CD組)。CD診斷標準參照“炎癥性腸病診斷與治療的共識意見(2012年,廣州)”[12]?;颊呔?jīng)臨床、實驗室、電子結(jié)腸鏡、放射影像學及病理組織學檢查等明確診斷;按結(jié)腸鏡下CD病變范圍分為回腸型40例、結(jié)腸型12例、回結(jié)腸型42例,其中結(jié)腸型和回結(jié)腸型合并為結(jié)腸病變CD組;按疾病類型分為非狹窄非穿透型35例、狹窄型32例,穿透型27例。另擇同期在金華市中心醫(yī)院體檢的106例健康體檢者作為對照組。CD組與對照組均排除哮喘、類風濕性關節(jié)炎、系統(tǒng)性紅斑狼瘡、多發(fā)性硬化等自身免疫性疾病以及肺癌、肝癌、胃癌等腫瘤病史。兩組受檢者性別、年齡、吸煙史比較差異均無統(tǒng)計學意義(均P>0.05),見表1,且為無血緣關系的浙江漢族人群。本研究經(jīng)金華市中心醫(yī)院醫(yī)學倫理委員會批準,受檢者均知情同意并簽署知情同意書。

        1.2 方法

        1.2.1 DNA提取 取受檢者外周靜脈血約3ml,乙二胺四乙酸(EDTA)-Na2抗凝。用血液基因組DNA提取試劑盒(北京天根生化科技有限公司)提取全基因組DNA。采用1%瓊脂糖電泳對所獲得的DNA樣本進行質(zhì)量檢查及濃度檢測,然后根據(jù)檢測的濃度將樣本稀釋到工作濃度10ng/μl后置于-20℃冰箱凍存。

        表1 兩組受檢者性別、年齡、吸煙史比較

        1.2.2 改良多重高溫連接酶檢測反應(iMLDR)技術(shù)檢測IL-12B基因多態(tài)性(rs3212227和rs6887695)

        1.2.2.1 多重PCR獲取目的基因片段 所需PCR擴增引物由上海生物工程技術(shù)有限公司合成。rs3212227上游引物:5′-GAAGGCCCATGGCAACTTGAG-3′,下游物:5′-CAATGTCACCCCACATCAACTTTTG-3′。rs6887695上游引物:5′-ACCCAGGGAAGGTGTGCTTCTC-3′,下游引物:5′-CACCCCTGAAGCGAGGTCAAAT-3′。總反應體系20μl,包含1×HotStarTaq緩沖液(大連寶生物工程有限公司),3.0mmol/L Mg2+(大連寶生物工程有限公司),0.3mmol/L dNTP(上海捷瑞生物工程有限公司),1U HotStarTaq聚合酶(德國Qiagen公司),1μl模板DNA和1μl多重PCR引物(引物濃度:rs3212227 1mmol/L,rs6887695 2mmol/L)。反應條件:95℃ 2min;94℃ 20s,65℃ 40s(每個循環(huán)減0.5℃),72℃ 1.5min,共11個循環(huán);94℃ 20s,59℃ 30s,72℃ 1.5min,共 24 個循環(huán);72℃2min;置于 4℃保存。

        1.2.2.2 多重PCR產(chǎn)物純化 在10μl PCR產(chǎn)物中加入5 U蝦堿性磷酸酶(SAP,美國Promega公司)和2U核酸外切酶(Exo I,美國Epicentre公司),37℃溫浴1h,然后75℃滅活15min。

        1.2.2.3 iMLDR連接反應 連接反應體系包含10×連接緩沖液 1μl,純化后多重 PCR 產(chǎn)物 2μl,雙蒸水 6μl,高溫連 接 酶 0.25μl,5′連接 引物 混 合液(1μmol/L)0.4μl,3′連接引物混合液(2μmol/L)0.4μl,連接酶引物序列分別為 rs3212227:FG5′-TTCCGCGTTCGGACTGATATGCTGATTGTTTCAATGAGCATTTAGCAACG-3′;FP5′-AACTATACAAATACAGCAAAGATATCATTGTGATC-3′;FT5′-TACGGTTATTCGGGCTCCTGTGCTGATTGTTTCAATGAGCATTTAGCAGCT-3′。rs6887695:FC 5′-TGTTCGTGGGCCGGATTAGTCAGTTTGAGAGA-AGCAGTGTAGTGTAGTGTTC-3′;FG5′-TCTCTCGGGTCAATTCGTCCTTCAGTTTGAGAGAAGCAGTGTAGTGTAGTGTTG-3′;FP5′-AATAGTCTGGATTTACATCTTTGATCTTCCA-3′。連接反應條件:94℃ 1min,56℃ 4min,共38個循環(huán);置于4℃保存。

        1.2.2.4 基因型判讀 取0.5μl稀釋后的連接反應產(chǎn)物,與 9μl甲酰胺、0.5μl內(nèi)標混勻,95℃變性 5min 后用ABI 3730XL測序儀(美國ABI公司)測序。最后采用GeneMapper 4.1軟件(美國ABI公司)判讀基因型。

        1.3 觀察指標 觀察并比較兩組受檢者的IL-12B基因多態(tài)性;分析IL-12B基因連鎖不平衡關系和單倍型,以及IL-12B基因多態(tài)性與CD患者病變部位、疾病類型的關系。

        1.4 統(tǒng)計學處理 應用SPSS19.0統(tǒng)計軟件;計量資料以表示,組間比較采用兩獨立樣本t檢驗;計數(shù)資料以頻數(shù)和構(gòu)成比表示,組間比較采用χ2檢驗;采用χ2檢驗分析IL-12B 2個SNP位點(rs3212227和rs6887695)的基因型分布是否符合Hardy-Weinberg平衡定律。采用logistic回歸分析比較兩組間IL-12B 2個SNP位點的等位基因和基因型頻率的分布差異,以及IL-12B基因多態(tài)性與CD病變部位、類型的相關性。采用Haploview 4.2軟件進行連鎖不平衡關系與單倍型分析。P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。

        2 結(jié)果

        2.1 兩組受檢者IL-12B基因多態(tài)性比較 對照組受檢者IL-12B rs3212227、rs6887695位點的基因型分布符合Hardy-Weinberg平衡定律(均P>0.05)。CD組患者與對照組受檢者IL-12B rs3212227、rs6887695位點的基因型與等位基因頻率比較均無統(tǒng)計學差異(均P>0.05),見表2。

        表2 兩組受檢者IL-12B基因多態(tài)性比較[頻次(%)]

        2.2 IL-12B基因連鎖不平衡關系和單倍型分析 連鎖不平衡分析發(fā)現(xiàn)rs3212227和rs6887695 2個SNP位點之間存在中等強度的連鎖不平衡關系(D′=0.545,r2=0.235),見圖1。應用Haploview 4.2軟件共構(gòu)建4種單倍型,在兩組受檢者間分析上述4種單倍型,結(jié)果發(fā)現(xiàn)各單倍型頻率在兩組間分布均無統(tǒng)計學差異(均P>0.05),見表3。

        圖1 IL-12B基因連鎖不平衡模式圖(方塊中數(shù)字代表2個SNP位點間的D′值;Block 1代表IL-12B基因各個SNP位點間存在連鎖不平衡)

        表3 兩組受檢者IL-12B基因rs3212227、rs6887695位點4種單倍型比較[頻次(%)]

        2.3 IL-12B基因多態(tài)性與CD病變部位、類型的關系采用非條件logistic回歸分析IL-12B基因rs3212227和rs6887695位點的等位基因和基因型頻率與CD病變部位的關系,結(jié)果發(fā)現(xiàn)IL-12B rs6887695位點的基因多態(tài)性與CD的病變部位有關(均P<0.05)。與對照組相比,回腸型CD組患者rs6887695位點的C等位基因和GC+CC基因型頻率均明顯降低(28.75%vs 44.34%,P<0.05,OR=0.507,95%CI:0.291~0.882;50.00%vs 71.70%,P<0.05,OR=0.395,95%CI:0.186~0.836);而 rs3212227和rs6887695位點的等位基因及基因型頻率分布在結(jié)腸病變CD組和對照組間比較均無統(tǒng)計學差異(均P>0.05)。進一步CD組內(nèi)分層比較發(fā)現(xiàn),與結(jié)腸病變CD組比較,回腸型CD組患者rs6887695位點的C等位基因、GC+CC基因型以及CC基因型頻率亦均降低(28.75%vs 50.00%,P<0.05,OR=0.404,95%CI:0.218~0.745;50.00%vs 72.22%,P<0.05,OR=0.385,95%CI:0.163~0.908;7.50%vs 27.78%,P<0.05,OR=0.150,95%CI:0.037~0.613),見表4。根據(jù)疾病行為進行分層分析,結(jié)果顯示IL-12B基因多態(tài)性與CD疾病類型無關(P >0.05),見表5。

        表4 IL-12B基因多態(tài)性與CD病變部位的關系[頻次(%)]

        表5 IL-12B基因多態(tài)性與CD疾病類型的關系[頻次(%)]

        3 討論

        IL-12B基因定位于第5號染色體5q31-33區(qū)域,全長15kb,包含8個外顯子,編碼相對分子量為40KD的細胞因子受體樣亞基p40。p40與IL-12A基因編碼的細胞因子受體樣亞基p35通過二硫鍵連接形成具有生物學活性IL-12。由于人類p35為組成性表達,而p40為調(diào)節(jié)性表達,因此IL-12B基因?qū)L-12的表達水平及生物學功能影響意義更大[13]。rs3212227和rs6887695是IL-12B的2個SNP位點,其中rs3212227位于3′非翻譯區(qū)(UTR)。研究表明該多態(tài)性位點可能影響IL-12B mRNA穩(wěn)定性及IL-12蛋白表達水平[14]。來自健康人群的研究發(fā)現(xiàn)rs3212227位點純合子突變CC基因型攜帶者外周血單個核細胞活化后所表達的IL-12蛋白水平顯著高于AA基因型或AC基因攜帶者[14]。rs6887695位于IL-12B基因5′上游調(diào)控區(qū)域,有研究顯示該多態(tài)性位點可能影響轉(zhuǎn)錄因子 TSF1、MZF1、Oct-1、RORα 與DNA片段的親和力,因此是潛在的功能性位點[10]。迄今的研究已經(jīng)證實IL-12B(rs3212227和rs6887695)基因多態(tài)性與哮喘[15]、銀屑病[16]、類風濕性關節(jié)炎[17]、Ⅱ型糖尿病[18]等多種免疫系統(tǒng)疾病相關。

        本研究對照組受檢者IL-12B的突變等位基因G、C的頻率分別為49.53%、44.34%,與數(shù)據(jù)庫中千人基因組計劃所報道的中國南方人群的最小等位基因頻率(MAF)基本相符(rs3212227:47.4%,rs6887695:44.2%)。整體比較結(jié)果顯示,IL-12B 2個SNP位點(rs3212227和rs6887695)的等位基因和基因型頻率在對照組和CD組之間的分布均無統(tǒng)計學差異,表明IL-12B基因多態(tài)性與浙江漢族人群CD的易感性無關,這一結(jié)論與來自西班牙[19]、瑞典[20]以及新西蘭人群[21]的研究發(fā)現(xiàn)基本一致,而有學者報道盡管rs3212227多態(tài)性與CD易感性無關,但rs6887695突變后增加德國人群CD的發(fā)病風險[10]。在亞洲人群的研究中,日本學者在一項納入484例CD患者的研究結(jié)果中首次報道rs6887695純合子突變CC基因型攜帶者罹患CD的風險是其他基因型攜帶者的1.42倍[9]。本研究結(jié)果與日本人群及德國人群的研究報道相悖,推測可能與納入的樣本數(shù)量及種族遺傳背景差異有關。

        目前認為,自身遺傳多態(tài)性與CD患者的疾病表型密切相關。例如Wu等[22]報道芳香烴受體(AhR)基因多態(tài)性與回腸型CD密切相關,而與病變累及結(jié)腸的CD無關。這一研究結(jié)果提示病變局限于回腸的CD和病變累及結(jié)腸的CD兩者的遺傳免疫學發(fā)病機制可能存在一定差異。本研究結(jié)果表明,rs6887695在對照組和回腸型CD組患者之間有統(tǒng)計學差異。回腸型CD患者中突變C等位基因以及GC+CC基因型頻率明顯低于對照組,提示rs6887695基因突變可能是浙江漢族回腸型CD的保護因素。此外,組內(nèi)分層分析亦發(fā)現(xiàn),回腸型CD組患者中rs6887695突變C等位基因和GC+CC基因型以及CC基因型頻率均低于結(jié)腸病變CD組患者,提示該位點基因突變可能導致CD患者更易累及結(jié)腸。國外學者亦曾探討IL-12B基因多態(tài)性與CD疾病部位的關系。Márque[19]等報道IL-12B基因rs3212227和rs6887695位點與西班牙人群CD病變部位及疾病行為均無關。而Ferguson等[21]報道rs6887695位點突變T等位基因是新西蘭小腸型CD的保護因素。另有研究表明rs3212227位點多態(tài)性可能與結(jié)腸型CD相關[10]。目前有關IL-12B基因多態(tài)性影響CD疾病部位的分子機制尚不明確。有研究發(fā)現(xiàn)盡管單核細胞分泌IL-12水平受其遺傳多態(tài)性影響,但外源性抗原激活單核細胞是促發(fā)IL-12表達的先決條件。有意思的是,IL-12B基因多態(tài)性對IL-12表達的影響只在某些特定的抗原如結(jié)核菌素、脂多糖誘導下呈現(xiàn),而在其他抗原如葡萄球菌菌體蛋白誘導下,其基因多態(tài)性對IL-12表達無影響[14],這表明IL-12B基因?qū)L-12表達的影響與環(huán)境菌群抗原種類密切相關。由于人類回、結(jié)腸中腸道菌群構(gòu)成迥然各異,筆者推測IL-12B基因?qū)D病變部位的影響可能是其遺傳多態(tài)性和腸道菌群抗原差異等多方面因素綜合作用的結(jié)果。

        綜上所述,本研究結(jié)果顯示IL-12B基因rs6887695位點多態(tài)性與浙江漢族人群CD的臨床表型可能相關,該位點的突變C等位基因、GC+CC基因型可能是回腸型CD的保護因素。由于體內(nèi)IL-12信號所介導的炎癥反應和免疫應答錯綜復雜,本研究尚不能完全詮釋IL-12B對CD臨床表型影響的潛在機制,這有待于后續(xù)研究進一步探討。

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